RNA–Protein interactions for RNA: YMR196W

YMR196W, Transcript of Putative protein of unknown function, yeastyeast

Gene YMR196W, Length 3,267 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YMR196WYMR196W NTH2P35172 780 aa5.84□□□□□ -1.48
YMR196WYMR196W DEF1P35732 738 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
YMR196WYMR196W XKS1P42826 600 aa5.83□□□□□ -1.48
YMR196WYMR196W ENT1Q12518 454 aa5.83□□□□□ -1.48
YMR196WYMR196W YNL050CP53952 270 aa5.83□□□□□ -1.48
YMR196WYMR196W RCR1P38212 213 aa5.82□□□□□ -1.48
YMR196WYMR196W APP1P53933 587 aa5.82□□□□□ -1.48
YMR196WYMR196W HSP104P31539 908 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
YMR196WYMR196W YAH1Q12184 172 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
YMR196WYMR196W YIL092WP40497 633 aa5.81□□□□□ -1.48
YMR196WYMR196W ENV9Q08651 330 aa5.81□□□□□ -1.48
YMR196WYMR196W PSH1Q12161 406 aa5.81□□□□□ -1.48
YMR196WYMR196W CTF4Q01454 927 aa5.8□□□□□ -1.48
YMR196WYMR196W RLP24Q07915 199 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
YMR196WYMR196W AOS1Q06624 347 aa5.79□□□□□ -1.48
YMR196WYMR196W INP54Q08227 384 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
YMR196WYMR196W GYP7P48365 746 aa5.79□□□□□ -1.48
YMR196WYMR196W NUP145P49687 1317 aa5.79□□□□□ -1.48
YMR196WYMR196W MAM1P40065 302 aa5.79□□□□□ -1.48
YMR196WYMR196W IES2P40154 320 aa5.79□□□□□ -1.48
YMR196WYMR196W RRT14P40470 206 aa5.79□□□□□ -1.48
YMR196WYMR196W ZDS1P50111 915 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
YMR196WYMR196W YPR148CQ06523 435 aa5.79□□□□□ -1.48
YMR196WYMR196W DAL5P15365 543 aa5.78□□□□□ -1.48
YMR196WYMR196W EDE1P34216 1381 aa5.78□□□□□ -1.48
YMR196WYMR196W RAD2P07276 1031 aa5.77□□□□□ -1.49
YMR196WYMR196W ADE16P54113 591 aaKnown RBP5.77□□□□□ -1.49
YMR196WYMR196W SRT1Q03175 343 aa5.77□□□□□ -1.49
YMR196WYMR196W MAK21Q12176 1025 aaKnown RBP5.77□□□□□ -1.49
YMR196WYMR196W COQ4O13525 335 aa5.76□□□□□ -1.49
YMR196WYMR196W BMS1Q08965 1183 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
YMR196WYMR196W IMH1Q06704 911 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
YMR196WYMR196W LYS2P07702 1392 aa5.75□□□□□ -1.49
YMR196WYMR196W KCC4P25389 1037 aa5.75□□□□□ -1.49
YMR196WYMR196W UGA3P26370 528 aa5.75□□□□□ -1.49
YMR196WYMR196W BUD27P43573 796 aaKnown RBP RIP-Chip data5.75□□□□□ -1.49not detected
YMR196WYMR196W YKL133CP36066 463 aa5.75□□□□□ -1.49
YMR196WYMR196W YBR287WP38355 427 aa5.75□□□□□ -1.49
YMR196WYMR196W GIN4Q12263 1142 aa5.75□□□□□ -1.49
YMR196WYMR196W BRL1P38770 471 aa5.75□□□□□ -1.49
YMR196WYMR196W POL32P47110 350 aa5.75□□□□□ -1.49
YMR196WYMR196W ROM2P51862 1356 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
YMR196WYMR196W OSM1P21375 501 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
YMR196WYMR196W SWE1P32944 819 aa5.74□□□□□ -1.49
YMR196WYMR196W DMA2P53924 522 aa5.74□□□□□ -1.49
YMR196WYMR196W MEC3Q02574 474 aa5.74□□□□□ -1.49
YMR196WYMR196W FRK1Q03002 865 aaPredicted RBP5.74□□□□□ -1.49
YMR196WYMR196W RIM15P43565 1770 aa5.74□□□□□ -1.49
YMR196WYMR196W FPR3P38911 411 aaKnown RBP5.73□□□□□ -1.49
YMR196WYMR196W NSE3Q05541 303 aa5.73□□□□□ -1.49
YMR196WYMR196W ENV11P53246 860 aa5.73□□□□□ -1.49
YMR196WYMR196W HIF1Q12373 385 aa5.73□□□□□ -1.49
YMR196WYMR196W DOT5P40553 215 aa5.73□□□□□ -1.49
YMR196WYMR196W TRP5P00931 707 aaKnown RBP5.72□□□□□ -1.49
YMR196WYMR196W ALE1Q08548 619 aa5.72□□□□□ -1.49
YMR196WYMR196W FOX2Q02207 900 aaKnown RBP5.72□□□□□ -1.49
YMR196WYMR196W YOL057WQ08225 711 aa5.72□□□□□ -1.49
YMR196WYMR196W ILV3P39522 585 aaKnown RBP5.72□□□□□ -1.49
YMR196WYMR196W RAD4P14736 754 aa5.71□□□□□ -1.5
YMR196WYMR196W YPP1P46951 817 aa5.71□□□□□ -1.5
YMR196WYMR196W CSI1Q04368 295 aa5.71□□□□□ -1.5
YMR196WYMR196W PUF6Q04373 656 aaKnown RBP5.71□□□□□ -1.5
YMR196WYMR196W YIL055CP40523 627 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
YMR196WYMR196W YDR306CQ06640 478 aa5.7□□□□□ -1.5
YMR196WYMR196W COBP00163 385 aa5.7□□□□□ -1.5
YMR196WYMR196W RPS19AP07280 144 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
YMR196WYMR196W RPS19BP07281 144 aaPredicted RBP5.7□□□□□ -1.5
YMR196WYMR196W TOA1P32773 286 aa5.7□□□□□ -1.5
YMR196WYMR196W YGR122WP53272 402 aa5.7□□□□□ -1.5
YMR196WYMR196W ATG13Q06628 738 aa5.7□□□□□ -1.5
YMR196WYMR196W YKR075CP36155 307 aa5.7□□□□□ -1.5
YMR196WYMR196W ZDS2P54786 942 aa5.7□□□□□ -1.5
YMR196WYMR196W RAD24P32641 659 aa5.69□□□□□ -1.5
YMR196WYMR196W RPN1P38764 993 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
YMR196WYMR196W YBP2P53169 641 aa5.69□□□□□ -1.5
YMR196WYMR196W TUM1Q08686 304 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
YMR196WYMR196W RPC31P17890 251 aa5.68□□□□□ -1.5
YMR196WYMR196W NUG1P40010 520 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
YMR196WYMR196W MRP7P12687 371 aa5.68□□□□□ -1.5
YMR196WYMR196W RMT2Q03305 412 aa5.68□□□□□ -1.5
YMR196WYMR196W SPO1P53541 631 aa5.67□□□□□ -1.5
YMR196WYMR196W YNG2P38806 282 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
YMR196WYMR196W SWI1P09547 1314 aa5.67□□□□□ -1.5
YMR196WYMR196W YJR008WP47085 338 aa5.66□□□□□ -1.5
YMR196WYMR196W SUB1P54000 292 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
YMR196WYMR196W RLF2Q12495 606 aa5.66□□□□□ -1.5
YMR196WYMR196W UTP10P42945 1769 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
YMR196WYMR196W SWC3P31376 625 aa5.66□□□□□ -1.5
YMR196WYMR196W BOI2P39969 1040 aa5.66□□□□□ -1.5
YMR196WYMR196W DNM1P54861 757 aa5.66□□□□□ -1.5
YMR196WYMR196W VPS72Q03388 795 aa5.66□□□□□ -1.5
YMR196WYMR196W NOP53Q12080 455 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
YMR196WYMR196W TIF4632P39936 914 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
YMR196WYMR196W CST6P40535 587 aa5.65□□□□□ -1.5
YMR196WYMR196W PLP2Q12017 286 aa5.65□□□□□ -1.5
YMR196WYMR196W GRX1P25373 110 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.51
YMR196WYMR196W RPS0AP32905 252 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.51
YMR196WYMR196W YPR204WQ08995 1032 aa5.65□□□□□ -1.51
YMR196WYMR196W HSP82P02829 709 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.51
YMR196WYMR196W ARG8P18544 423 aa5.65□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 48.4 ms