RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000638552.1

GABRG2-208, Transcript of gamma-aminobutyric acid type A receptor gamma2 subunit, human

TSL 5 BASIC

Gene GABRG2, Length 3,710 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GABRG2-208	ENST00000638552	SNRK	Q9NRH2	765 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GABRG2-208	ENST00000638552	RBM27	Q9P2N5	1060 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
GABRG2-208	ENST00000638552	NAP1L5	Q96NT1	182 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
GABRG2-208	ENST00000638552	BIN2	Q9UBW5	565 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
GABRG2-208	ENST00000638552	PBXIP1	Q96AQ6	731 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GABRG2-208	ENST00000638552	DNAJC2	Q99543	621 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
GABRG2-208	ENST00000638552	MYH16	Q9H6N6	1097 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GABRG2-208	ENST00000638552	PRDM16	Q9HAZ2	1276 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GABRG2-208	ENST00000638552	DPYSL4	O14531	572 aa		4.9	□□□□□ -1.62
GABRG2-208	ENST00000638552	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
GABRG2-208	ENST00000638552	ZNF467	Q7Z7K2	595 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.62
GABRG2-208	ENST00000638552	FNBP4	Q8N3X1	1017 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.62
GABRG2-208	ENST00000638552	CSPP1	Q1MSJ5	1256 aa		4.9	□□□□□ -1.62
GABRG2-208	ENST00000638552	MICAL1	Q8TDZ2	1067 aa		4.9	□□□□□ -1.62
GABRG2-208	ENST00000638552	ARIH1	Q9Y4X5	557 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.62
GABRG2-208	ENST00000638552	PEX14	O75381	377 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GABRG2-208	ENST00000638552	TSR1	Q2NL82	804 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
GABRG2-208	ENST00000638552	KIAA1522	Q9P206	1035 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
GABRG2-208	ENST00000638552	MS4A1	P11836	297 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GABRG2-208	ENST00000638552	CANX	P27824	592 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
GABRG2-208	ENST00000638552	HIRIP3	Q9BW71	556 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
GABRG2-208	ENST00000638552	MFRP	Q9BY79	579 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GABRG2-208	ENST00000638552	VRTN	Q9H8Y1	702 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GABRG2-208	ENST00000638552	MINK1	Q8N4C8	1332 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
GABRG2-208	ENST00000638552	IRF6	O14896	467 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GABRG2-208	ENST00000638552	PDE4A	P27815	886 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GABRG2-208	ENST00000638552	MAP2K5	Q13163	448 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GABRG2-208	ENST00000638552	CC2D2B	Q6DHV5	1058 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GABRG2-208	ENST00000638552	RASEF	Q8IZ41	740 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GABRG2-208	ENST00000638552	SPDYE2B	A6NHP3	402 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GABRG2-208	ENST00000638552	SPDYE6	P0CI01	402 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GABRG2-208	ENST00000638552	SPDYE2	Q495Y8	402 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GABRG2-208	ENST00000638552	TSNAXIP1	Q2TAA8	658 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GABRG2-208	ENST00000638552	ZNF662	Q6ZS27	426 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GABRG2-208	ENST00000638552	PCDHB8	Q9UN66	801 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GABRG2-208	ENST00000638552	PCDHB13	Q9Y5F0	798 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GABRG2-208	ENST00000638552	LMOD1	P29536	600 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
GABRG2-208	ENST00000638552	WDR3	Q9UNX4	943 aa	Known RBP eCLIP	4.87	□□□□□ -1.63
GABRG2-208	ENST00000638552	CENPB	P07199	599 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
GABRG2-208	ENST00000638552	FECH	P22830	423 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GABRG2-208	ENST00000638552	MDM2	Q00987	491 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
GABRG2-208	ENST00000638552	C9orf131	Q5VYM1	1079 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GABRG2-208	ENST00000638552	PLCD4	Q9BRC7	762 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GABRG2-208	ENST00000638552	NAALADL2	Q58DX5	795 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GABRG2-208	ENST00000638552	PKNOX2	Q96KN3	472 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GABRG2-208	ENST00000638552	HDGFL1	Q5TGJ6	251 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GABRG2-208	ENST00000638552	GIMAP6	Q6P9H5	292 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GABRG2-208	ENST00000638552	NCKAP5L	Q9HCH0	1330 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GABRG2-208	ENST00000638552	RAB11FIP3	O75154	756 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GABRG2-208	ENST00000638552	EXOC8	Q8IYI6	725 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GABRG2-208	ENST00000638552	FAM9B	Q8IZU0	186 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GABRG2-208	ENST00000638552	TSPYL2	Q9H2G4	693 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
GABRG2-208	ENST00000638552	PHF8	Q9UPP1	1060 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GABRG2-208	ENST00000638552	CLEC11A	Q9Y240	323 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GABRG2-208	ENST00000638552	UST	Q9Y2C2	406 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GABRG2-208	ENST00000638552	BEGAIN	Q9BUH8	593 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GABRG2-208	ENST00000638552	TBC1D2B	Q9UPU7	963 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GABRG2-208	ENST00000638552	LOC102724159	A0A0B4J2E5	919 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GABRG2-208	ENST00000638552	SPDYE5	A6NIY4	337 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GABRG2-208	ENST00000638552	ZNF16	P17020	682 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
GABRG2-208	ENST00000638552	PWP2	Q15269	919 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
GABRG2-208	ENST00000638552	NLRP7	Q8WX94	980 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GABRG2-208	ENST00000638552	UBXN4	Q92575	508 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GABRG2-208	ENST00000638552	VTI1A	Q96AJ9	217 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GABRG2-208	ENST00000638552	CABP2	Q9NPB3	220 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GABRG2-208	ENST00000638552	GOPC	Q9HD26	462 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GABRG2-208	ENST00000638552	PPME1	Q9Y570	386 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GABRG2-208	ENST00000638552	GNPAT	O15228	680 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GABRG2-208	ENST00000638552	SOX12	O15370	315 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GABRG2-208	ENST00000638552	PRM3	Q9NNZ6	103 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GABRG2-208	ENST00000638552	TPD52L2	O43399	206 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
GABRG2-208	ENST00000638552	PDAP1	Q13442	181 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
GABRG2-208	ENST00000638552	AMHR2	Q16671	573 aa		4.84	□□□□□ -1.63
GABRG2-208	ENST00000638552	SH3D19	Q5HYK7	790 aa		4.84	□□□□□ -1.63
GABRG2-208	ENST00000638552	TANGO6	Q9C0B7	1094 aa		4.84	□□□□□ -1.63
GABRG2-208	ENST00000638552	ANAPC15	P60006	121 aa		4.84	□□□□□ -1.64
GABRG2-208	ENST00000638552	FOXD4L6	Q3SYB3	417 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.64
GABRG2-208	ENST00000638552	FOXD4L3	Q6VB84	417 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.64
GABRG2-208	ENST00000638552	ZC3H6	P61129	1189 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
GABRG2-208	ENST00000638552	EFCAB3	Q8N7B9	438 aa		4.83	□□□□□ -1.64
GABRG2-208	ENST00000638552	RIPOR2	Q9Y4F9	1068 aa		4.83	□□□□□ -1.64
GABRG2-208	ENST00000638552	RBM47	A0AV96	593 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
GABRG2-208	ENST00000638552	GTF2F1	P35269	517 aa	Known RBP eCLIP	4.83	□□□□□ -1.64
GABRG2-208	ENST00000638552	SSUH2	Q9Y2M2	353 aa		4.83	□□□□□ -1.64
GABRG2-208	ENST00000638552	hCG_2014768	A0A024R1R8	64 aa		4.83	□□□□□ -1.64
GABRG2-208	ENST00000638552	ERCC5	P28715	1186 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
GABRG2-208	ENST00000638552	REPIN1	Q9BWE0	567 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
GABRG2-208	ENST00000638552	KLHL42	Q9P2K6	505 aa		4.83	□□□□□ -1.64
GABRG2-208	ENST00000638552	IQSEC3	Q9UPP2	1182 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
GABRG2-208	ENST00000638552	NLRP6	P59044	892 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GABRG2-208	ENST00000638552	SGIP1	Q9BQI5	828 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GABRG2-208	ENST00000638552	TMA7	Q9Y2S6	64 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
GABRG2-208	ENST00000638552	SF3A1	Q15459	793 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
GABRG2-208	ENST00000638552	DPH6	Q7L8W6	267 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GABRG2-208	ENST00000638552	PMFBP1	Q8TBY8	1022 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GABRG2-208	ENST00000638552	AP1G2	O75843	785 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GABRG2-208	ENST00000638552	MARS	P56192	900 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
GABRG2-208	ENST00000638552	SIRT1	Q96EB6	747 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GABRG2-208	ENST00000638552	TMX4	Q9H1E5	349 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
GABRG2-208	ENST00000638552	PSEN1	P49768	467 aa		4.81	□□□□□ -1.64

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