RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000615445.4

PTPRJ-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRJ, Length 4,773 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-208ENST00000615445 AMPHP49418 695 aa26.21■■□□□ 1.79
PTPRJ-208ENST00000615445 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP26.21■■□□□ 1.79
PTPRJ-208ENST00000615445 STK31Q9BXU1 1019 aa26.21■■□□□ 1.79
PTPRJ-208ENST00000615445 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa26.2■■□□□ 1.79
PTPRJ-208ENST00000615445 TAOK2Q9UL54 1235 aa26.2■■□□□ 1.79
PTPRJ-208ENST00000615445 CGNL1Q0VF96 1302 aa26.2■■□□□ 1.78
PTPRJ-208ENST00000615445 TOPBP1Q92547 1522 aa26.18■■□□□ 1.78
PTPRJ-208ENST00000615445 HMGXB3Q12766 1538 aa26.18■■□□□ 1.78
PTPRJ-208ENST00000615445 PTMAP06454 111 aaKnown RBP26.18■■□□□ 1.78
PTPRJ-208ENST00000615445 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa26.18■■□□□ 1.78
PTPRJ-208ENST00000615445 TOP2BQ02880 1626 aa26.18■■□□□ 1.78
PTPRJ-208ENST00000615445 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP26.18■■□□□ 1.78
PTPRJ-208ENST00000615445 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP26.17■■□□□ 1.78
PTPRJ-208ENST00000615445 AFAP1Q8N556 730 aa26.17■■□□□ 1.78
PTPRJ-208ENST00000615445 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP26.16■■□□□ 1.78
PTPRJ-208ENST00000615445 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP26.16■■□□□ 1.78
PTPRJ-208ENST00000615445 KIF7Q2M1P5 1343 aa26.16■■□□□ 1.78
PTPRJ-208ENST00000615445 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa26.16■■□□□ 1.78
PTPRJ-208ENST00000615445 ZBED9Q6R2W3 1325 aa26.16■■□□□ 1.78
PTPRJ-208ENST00000615445 MCCP23508 829 aa26.15■■□□□ 1.78
PTPRJ-208ENST00000615445 LMOD3Q0VAK6 560 aa26.15■■□□□ 1.78
PTPRJ-208ENST00000615445 CFAP44Q96MT7 982 aa26.15■■□□□ 1.78
PTPRJ-208ENST00000615445 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa26.14■■□□□ 1.78
PTPRJ-208ENST00000615445 FAM69CQ0P6D2 419 aa26.14■■□□□ 1.77
PTPRJ-208ENST00000615445 CCDC7Q96M83 1385 aa26.13■■□□□ 1.77
PTPRJ-208ENST00000615445 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP26.13■■□□□ 1.77
PTPRJ-208ENST00000615445 CHMP4AQ9BY43 222 aa26.12■■□□□ 1.77
PTPRJ-208ENST00000615445 APAF1O14727 1248 aa26.11■■□□□ 1.77
PTPRJ-208ENST00000615445 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP26.11■■□□□ 1.77
PTPRJ-208ENST00000615445 SLC4A10Q6U841 1118 aa26.1■■□□□ 1.77
PTPRJ-208ENST00000615445 BCL2L13Q9BXK5 485 aa26.1■■□□□ 1.77
PTPRJ-208ENST00000615445 MRC2Q9UBG0 1479 aa26.1■■□□□ 1.77
PTPRJ-208ENST00000615445 PLIN1O60240 522 aa26.1■■□□□ 1.77
PTPRJ-208ENST00000615445 COG3Q96JB2 828 aa26.1■■□□□ 1.77
PTPRJ-208ENST00000615445 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP26.08■■□□□ 1.77
PTPRJ-208ENST00000615445 STAC3Q96MF2 364 aa26.08■■□□□ 1.77
PTPRJ-208ENST00000615445 PLCB2Q00722 1185 aa26.08■■□□□ 1.77
PTPRJ-208ENST00000615445 SYNJ2O15056 1496 aa26.06■■□□□ 1.76
PTPRJ-208ENST00000615445 E9PSI1 815 aa26.05■■□□□ 1.76
PTPRJ-208ENST00000615445 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa26.05■■□□□ 1.76
PTPRJ-208ENST00000615445 IFT140Q96RY7 1462 aa26.05■■□□□ 1.76
PTPRJ-208ENST00000615445 EFCAB5A4FU69 1503 aa26.05■■□□□ 1.76
PTPRJ-208ENST00000615445 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP26.04■■□□□ 1.76
PTPRJ-208ENST00000615445 HMMRO75330 724 aa26.03■■□□□ 1.76
PTPRJ-208ENST00000615445 WASHC2AQ641Q2 1341 aa26.03■■□□□ 1.76
PTPRJ-208ENST00000615445 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP26.02■■□□□ 1.76
PTPRJ-208ENST00000615445 RRP1P56182 461 aaKnown RBP26.02■■□□□ 1.76
PTPRJ-208ENST00000615445 EXOC6Q8TAG9 804 aa26.02■■□□□ 1.76
PTPRJ-208ENST00000615445 ARHGAP5Q13017 1502 aa26.01■■□□□ 1.75
PTPRJ-208ENST00000615445 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP26■■□□□ 1.75
PTPRJ-208ENST00000615445 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa26■■□□□ 1.75
PTPRJ-208ENST00000615445 TMEM132EQ6IEE7 984 aa25.98■■□□□ 1.75
PTPRJ-208ENST00000615445 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP25.97■■□□□ 1.75
PTPRJ-208ENST00000615445 MIA2Q96PC5 1412 aa25.96■■□□□ 1.75
PTPRJ-208ENST00000615445 CNTLNQ9NXG0 1405 aa25.96■■□□□ 1.75
PTPRJ-208ENST00000615445 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP25.95■■□□□ 1.75
PTPRJ-208ENST00000615445 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa25.95■■□□□ 1.74
PTPRJ-208ENST00000615445 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP25.95■■□□□ 1.74
PTPRJ-208ENST00000615445 CFAP70Q5T0N1 1121 aa25.95■■□□□ 1.74
PTPRJ-208ENST00000615445 CRBNQ96SW2 442 aa25.95■■□□□ 1.74
PTPRJ-208ENST00000615445 HDAC5Q9UQL6 1122 aa25.95■■□□□ 1.74
PTPRJ-208ENST00000615445 COG6Q9Y2V7 657 aa25.95■■□□□ 1.74
PTPRJ-208ENST00000615445 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa25.94■■□□□ 1.74
PTPRJ-208ENST00000615445 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa25.94■■□□□ 1.74
PTPRJ-208ENST00000615445 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
PTPRJ-208ENST00000615445 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
PTPRJ-208ENST00000615445 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa25.92■■□□□ 1.74
PTPRJ-208ENST00000615445 DNMBPQ6XZF7 1577 aa25.92■■□□□ 1.74
PTPRJ-208ENST00000615445 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa25.92■■□□□ 1.74
PTPRJ-208ENST00000615445 CHMP3Q9Y3E7 222 aa25.92■■□□□ 1.74
PTPRJ-208ENST00000615445 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP25.92■■□□□ 1.74
PTPRJ-208ENST00000615445 TIAM1Q13009 1591 aa25.91■■□□□ 1.74
PTPRJ-208ENST00000615445 NBPF1Q3BBV0 1214 aa25.91■■□□□ 1.74
PTPRJ-208ENST00000615445 C9orf84Q5VXU9 1444 aa25.9■■□□□ 1.74
PTPRJ-208ENST00000615445 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP25.9■■□□□ 1.74
PTPRJ-208ENST00000615445 HFM1A2PYH4 1435 aa25.9■■□□□ 1.74
PTPRJ-208ENST00000615445 BICRAQ9NZM4 1560 aa25.9■■□□□ 1.74
PTPRJ-208ENST00000615445 NGEFQ8N5V2 710 aa25.9■■□□□ 1.74
PTPRJ-208ENST00000615445 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP25.9■■□□□ 1.74
PTPRJ-208ENST00000615445 NBPF8Q3BBV2 869 aa25.89■■□□□ 1.74
PTPRJ-208ENST00000615445 DNAJC5BQ9UF47 199 aa25.89■■□□□ 1.73
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PTPRJ-208ENST00000615445 GGNBP2Q9H3C7 697 aa25.88■■□□□ 1.73
PTPRJ-208ENST00000615445 RIPK4P57078 832 aa25.88■■□□□ 1.73
PTPRJ-208ENST00000615445 CABP2Q9NPB3 220 aa25.87■■□□□ 1.73
PTPRJ-208ENST00000615445 GBP4Q96PP9 640 aa25.86■■□□□ 1.73
PTPRJ-208ENST00000615445 GORABQ5T7V8 394 aa25.86■■□□□ 1.73
PTPRJ-208ENST00000615445 RUNDC1Q96C34 613 aa25.84■■□□□ 1.73
PTPRJ-208ENST00000615445 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa25.84■■□□□ 1.73
PTPRJ-208ENST00000615445 TEFQ10587 303 aa25.84■■□□□ 1.73
PTPRJ-208ENST00000615445 GPATCH3Q96I76 525 aa25.83■■□□□ 1.73
PTPRJ-208ENST00000615445 PDE4AP27815 886 aa25.83■■□□□ 1.73
PTPRJ-208ENST00000615445 TAF7LQ5H9L4 462 aa25.83■■□□□ 1.72
PTPRJ-208ENST00000615445 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa25.82■■□□□ 1.72
PTPRJ-208ENST00000615445 SCAPERQ9BY12 1400 aa25.81■■□□□ 1.72
PTPRJ-208ENST00000615445 ANKRD45Q5TZF3 282 aa25.81■■□□□ 1.72
PTPRJ-208ENST00000615445 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP25.81■■□□□ 1.72
PTPRJ-208ENST00000615445 C1orf141Q5JVX7 400 aa25.81■■□□□ 1.72
PTPRJ-208ENST00000615445 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP25.81■■□□□ 1.72
PTPRJ-208ENST00000615445 ADAMTS8Q9UP79 889 aa25.8■■□□□ 1.72
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