RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590694.5

NEDD4L-231, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 4-like, E3 ubiquitin protein ligase, human

TSL 5

Gene NEDD4L, Length 165 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NEDD4L-231	ENST00000590694	FOSB	P53539	338 aa		10.51	□□□□□ -0.73
NEDD4L-231	ENST00000590694	RIMBP2	O15034	1052 aa		10.5	□□□□□ -0.73
NEDD4L-231	ENST00000590694	TTLL12	Q14166	644 aa	Predicted RBP	10.5	□□□□□ -0.73
NEDD4L-231	ENST00000590694	FAM117A	Q9C073	453 aa		10.5	□□□□□ -0.73
NEDD4L-231	ENST00000590694	HOXB3	P14651	431 aa	Predicted RBP	10.49	□□□□□ -0.73
NEDD4L-231	ENST00000590694	DDRGK1	Q96HY6	314 aa		10.49	□□□□□ -0.73
NEDD4L-231	ENST00000590694	POTEB2	H3BUK9	544 aa		10.48	□□□□□ -0.73
NEDD4L-231	ENST00000590694	NUDT7	P0C024	238 aa		10.48	□□□□□ -0.73
NEDD4L-231	ENST00000590694	ZNF454	Q8N9F8	522 aa		10.48	□□□□□ -0.73
NEDD4L-231	ENST00000590694	ZSWIM6	Q9HCJ5	1215 aa		10.48	□□□□□ -0.73
NEDD4L-231	ENST00000590694	SCUBE2	Q9NQ36	999 aa		10.48	□□□□□ -0.73
NEDD4L-231	ENST00000590694	ARSI	Q5FYB1	569 aa		10.47	□□□□□ -0.73
NEDD4L-231	ENST00000590694	KHSRP	Q92945	711 aa	Known RBP eCLIP	10.47	□□□□□ -0.73	1e-12	■■□□□ 14.2
NEDD4L-231	ENST00000590694	ZDHHC16	Q969W1	377 aa		10.47	□□□□□ -0.73
NEDD4L-231	ENST00000590694	MAMSTR	Q6ZN01	415 aa		10.46	□□□□□ -0.73
NEDD4L-231	ENST00000590694	CERK	Q8TCT0	537 aa		10.46	□□□□□ -0.73
NEDD4L-231	ENST00000590694	C6orf132	Q5T0Z8	1188 aa		10.45	□□□□□ -0.74
NEDD4L-231	ENST00000590694	PLEKHG3	A1L390	1219 aa		10.44	□□□□□ -0.74
NEDD4L-231	ENST00000590694	GPR153	Q6NV75	609 aa		10.44	□□□□□ -0.74
NEDD4L-231	ENST00000590694	GIGYF2	Q6Y7W6	1299 aa	Known RBP	10.44	□□□□□ -0.74
NEDD4L-231	ENST00000590694	ZNF710	Q8N1W2	664 aa		10.44	□□□□□ -0.74
NEDD4L-231	ENST00000590694	ADAM33	Q9BZ11	813 aa		10.42	□□□□□ -0.74
NEDD4L-231	ENST00000590694	CLCN1	P35523	988 aa		10.41	□□□□□ -0.74
NEDD4L-231	ENST00000590694	PADI6	Q6TGC4	694 aa		10.41	□□□□□ -0.74
NEDD4L-231	ENST00000590694	REPIN1	Q9BWE0	567 aa	Known RBP	10.41	□□□□□ -0.74
NEDD4L-231	ENST00000590694	MS4A1	P11836	297 aa		10.4	□□□□□ -0.74
NEDD4L-231	ENST00000590694	RBM27	Q9P2N5	1060 aa	Known RBP	10.4	□□□□□ -0.74
NEDD4L-231	ENST00000590694	OAT	P04181	439 aa		10.39	□□□□□ -0.75
NEDD4L-231	ENST00000590694	MDM2	Q00987	491 aa	Predicted RBP	10.39	□□□□□ -0.75
NEDD4L-231	ENST00000590694	PHOX2B	Q99453	314 aa		10.39	□□□□□ -0.75
NEDD4L-231	ENST00000590694	TMUB1	Q9BVT8	246 aa		10.39	□□□□□ -0.75
NEDD4L-231	ENST00000590694	GPCPD1	Q9NPB8	672 aa		10.39	□□□□□ -0.75
NEDD4L-231	ENST00000590694	FAM161A	Q3B820	660 aa		10.38	□□□□□ -0.75
NEDD4L-231	ENST00000590694	METTL3	Q86U44	580 aa	Known RBP	10.38	□□□□□ -0.75
NEDD4L-231	ENST00000590694	TTC13	Q8NBP0	860 aa		10.38	□□□□□ -0.75
NEDD4L-231	ENST00000590694	LHX6	Q9UPM6	363 aa		10.38	□□□□□ -0.75
NEDD4L-231	ENST00000590694	PPP4R3B	Q5MIZ7	849 aa		10.37	□□□□□ -0.75
NEDD4L-231	ENST00000590694	ADGRG1	Q9Y653	693 aa		10.37	□□□□□ -0.75
NEDD4L-231	ENST00000590694	PSD	A5PKW4	1024 aa	Predicted RBP	10.36	□□□□□ -0.75
NEDD4L-231	ENST00000590694	GOPC	Q9HD26	462 aa		10.36	□□□□□ -0.75
NEDD4L-231	ENST00000590694	SNPH	O15079	494 aa		10.35	□□□□□ -0.75
NEDD4L-231	ENST00000590694	PRSS12	P56730	875 aa		10.35	□□□□□ -0.75
NEDD4L-231	ENST00000590694	PXYLP1	Q8TE99	480 aa		10.35	□□□□□ -0.75
NEDD4L-231	ENST00000590694	CDCA7L	Q96GN5	454 aa		10.34	□□□□□ -0.75
NEDD4L-231	ENST00000590694	BCL2L12	Q9HB09	334 aa		10.33	□□□□□ -0.76
NEDD4L-231	ENST00000590694	SSTR3	P32745	418 aa	Predicted RBP	10.32	□□□□□ -0.76
NEDD4L-231	ENST00000590694	RBM46	Q8TBY0	533 aa	Known RBP	10.31	□□□□□ -0.76
NEDD4L-231	ENST00000590694	NLRP7	Q8WX94	980 aa		10.31	□□□□□ -0.76
NEDD4L-231	ENST00000590694	FAM217B	Q9NTX9	383 aa	Predicted RBP	10.31	□□□□□ -0.76
NEDD4L-231	ENST00000590694	HOXB1	P14653	301 aa	Predicted RBP	10.3	□□□□□ -0.76
NEDD4L-231	ENST00000590694	COL9A1	P20849	921 aa		10.3	□□□□□ -0.76
NEDD4L-231	ENST00000590694	PTPRE	P23469	700 aa		10.3	□□□□□ -0.76
NEDD4L-231	ENST00000590694	PPP1R3G	B7ZBB8	358 aa		10.29	□□□□□ -0.76
NEDD4L-231	ENST00000590694	BEGAIN	Q9BUH8	593 aa		10.29	□□□□□ -0.76
NEDD4L-231	ENST00000590694	SH3D19	Q5HYK7	790 aa		10.28	□□□□□ -0.76
NEDD4L-231	ENST00000590694	PCMTD1	Q96MG8	357 aa	Predicted RBP	10.28	□□□□□ -0.76
NEDD4L-231	ENST00000590694	FAM198A	Q9UFP1	575 aa		10.27	□□□□□ -0.77
NEDD4L-231	ENST00000590694	RPL17-C18orf32	A0A0A6YYL6	228 aa	Known RBP	10.26	□□□□□ -0.77
NEDD4L-231	ENST00000590694	RSPH6A	Q9H0K4	717 aa		10.26	□□□□□ -0.77
NEDD4L-231	ENST00000590694	TSKS	Q9UJT2	592 aa		10.25	□□□□□ -0.77
NEDD4L-231	ENST00000590694	EYA1	Q99502	592 aa		10.24	□□□□□ -0.77
NEDD4L-231	ENST00000590694	RCCD1	A6NED2	376 aa		10.23	□□□□□ -0.77
NEDD4L-231	ENST00000590694	SKIV2L	Q15477	1246 aa	Known RBP	10.23	□□□□□ -0.77
NEDD4L-231	ENST00000590694	TRIM6-TRIM34	B2RNG4	842 aa		10.22	□□□□□ -0.77
NEDD4L-231	ENST00000590694	NBPF26	B4DH59	902 aa		10.22	□□□□□ -0.77
NEDD4L-231	ENST00000590694	OTUD5	Q96G74	571 aa		10.22	□□□□□ -0.77
NEDD4L-231	ENST00000590694	NUDT18	Q6ZVK8	323 aa		10.21	□□□□□ -0.77
NEDD4L-231	ENST00000590694	PACS2	Q86VP3	889 aa		10.21	□□□□□ -0.77
NEDD4L-231	ENST00000590694	KCNK17	Q96T54	332 aa		10.21	□□□□□ -0.77
NEDD4L-231	ENST00000590694	ZMYND15	Q9H091	742 aa		10.21	□□□□□ -0.77
NEDD4L-231	ENST00000590694	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	10.2	□□□□□ -0.78
NEDD4L-231	ENST00000590694	FLII	Q13045	1269 aa		10.2	□□□□□ -0.78
NEDD4L-231	ENST00000590694	KCNH8	Q96L42	1107 aa		10.2	□□□□□ -0.78
NEDD4L-231	ENST00000590694	C3orf80	F5H4A9	247 aa		10.19	□□□□□ -0.78
NEDD4L-231	ENST00000590694	DNAJB2	P25686	324 aa		10.19	□□□□□ -0.78
NEDD4L-231	ENST00000590694	TATDN2	Q93075	761 aa		10.19	□□□□□ -0.78
NEDD4L-231	ENST00000590694	PNMA3	Q9UL41	463 aa		10.19	□□□□□ -0.78
NEDD4L-231	ENST00000590694	DIXDC1	Q155Q3	683 aa		10.18	□□□□□ -0.78
NEDD4L-231	ENST00000590694	MYSM1	Q5VVJ2	828 aa		10.18	□□□□□ -0.78
NEDD4L-231	ENST00000590694	ONECUT3	O60422	494 aa	Predicted RBP	10.17	□□□□□ -0.78
NEDD4L-231	ENST00000590694	PROX2	Q3B8N5	592 aa		10.17	□□□□□ -0.78
NEDD4L-231	ENST00000590694	SULF1	Q8IWU6	871 aa		10.17	□□□□□ -0.78
NEDD4L-231	ENST00000590694	TBC1D2	Q9BYX2	928 aa		10.17	□□□□□ -0.78
NEDD4L-231	ENST00000590694	POLR3E	Q9NVU0	708 aa		10.17	□□□□□ -0.78
NEDD4L-231	ENST00000590694	ATP1B4	Q9UN42	357 aa	Predicted RBP	10.17	□□□□□ -0.78
NEDD4L-231	ENST00000590694	TMEM134	Q9H6X4	195 aa		10.16	□□□□□ -0.78
NEDD4L-231	ENST00000590694	PROCA1	Q8NCQ7	364 aa	Predicted RBP	10.15	□□□□□ -0.78
NEDD4L-231	ENST00000590694	CD46	P15529	392 aa		10.14	□□□□□ -0.79
NEDD4L-231	ENST00000590694	CLK2	P49760	499 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
NEDD4L-231	ENST00000590694	ZBED2	Q9BTP6	218 aa		10.14	□□□□□ -0.79
NEDD4L-231	ENST00000590694	DDX11L8	A8MPP1	907 aa		10.13	□□□□□ -0.79
NEDD4L-231	ENST00000590694	SMAP	O00193	183 aa		10.13	□□□□□ -0.79
NEDD4L-231	ENST00000590694	GNL3	Q9BVP2	549 aa	Known RBP eCLIP	10.13	□□□□□ -0.79
NEDD4L-231	ENST00000590694	ERBB3	P21860	1342 aa		10.12	□□□□□ -0.79
NEDD4L-231	ENST00000590694	ARX	Q96QS3	562 aa		10.12	□□□□□ -0.79
NEDD4L-231	ENST00000590694	KIAA1468	Q9P260	1216 aa		10.12	□□□□□ -0.79
NEDD4L-231	ENST00000590694	PSEN2	P49810	448 aa		10.11	□□□□□ -0.79
NEDD4L-231	ENST00000590694	VARS2	Q5ST30	1063 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
NEDD4L-231	ENST00000590694	SPIRE2	Q8WWL2	714 aa		10.11	□□□□□ -0.79
NEDD4L-231	ENST00000590694	ARHGAP33	O14559	1287 aa		10.1	□□□□□ -0.79

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