RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564630.5

CCNDBP1-205, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene CCNDBP1, Length 2,079 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-205ENST00000564630 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa28.38■■■□□ 2.13
CCNDBP1-205ENST00000564630 ATP10AO60312 1499 aa28.34■■■□□ 2.13
CCNDBP1-205ENST00000564630 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP28.32■■■□□ 2.12
CCNDBP1-205ENST00000564630 RSPH4AQ5TD94 716 aa28.31■■■□□ 2.12
CCNDBP1-205ENST00000564630 C9orf84Q5VXU9 1444 aa28.31■■■□□ 2.12
CCNDBP1-205ENST00000564630 ADGBQ8N7X0 1667 aa28.31■■■□□ 2.12
CCNDBP1-205ENST00000564630 CROCC2H7BZ55 1655 aa28.3■■■□□ 2.12
CCNDBP1-205ENST00000564630 TSPY4P0CV99 314 aa28.29■■■□□ 2.12
CCNDBP1-205ENST00000564630 TSPY10P0CW01 314 aa28.29■■■□□ 2.12
CCNDBP1-205ENST00000564630 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP28.29■■■□□ 2.12
CCNDBP1-205ENST00000564630 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa28.29■■■□□ 2.12
CCNDBP1-205ENST00000564630 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP28.28■■■□□ 2.12
CCNDBP1-205ENST00000564630 FOXD1Q16676 465 aa28.27■■■□□ 2.12
CCNDBP1-205ENST00000564630 L3MBTL2Q969R5 705 aa28.27■■■□□ 2.12
CCNDBP1-205ENST00000564630 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa28.26■■■□□ 2.12
CCNDBP1-205ENST00000564630 MAST1Q9Y2H9 1570 aa28.25■■■□□ 2.11
CCNDBP1-205ENST00000564630 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP28.24■■■□□ 2.11
CCNDBP1-205ENST00000564630 WASHC2AQ641Q2 1341 aa28.24■■■□□ 2.11
CCNDBP1-205ENST00000564630 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa28.22■■■□□ 2.11
CCNDBP1-205ENST00000564630 REREQ9P2R6 1566 aa28.22■■■□□ 2.11
CCNDBP1-205ENST00000564630 MLECQ14165 292 aa28.22■■■□□ 2.11
CCNDBP1-205ENST00000564630 FKBP8Q14318 412 aa28.22■■■□□ 2.11
CCNDBP1-205ENST00000564630 A2MP01023 1474 aa28.2■■■□□ 2.11
CCNDBP1-205ENST00000564630 BCORL1Q5H9F3 1711 aa28.2■■■□□ 2.11
CCNDBP1-205ENST00000564630 SHANK2Q9UPX8 1470 aa28.2■■■□□ 2.11
CCNDBP1-205ENST00000564630 PLXNC1O60486 1568 aa28.18■■■□□ 2.1
CCNDBP1-205ENST00000564630 ADGRL2O95490 1459 aa28.18■■■□□ 2.1
CCNDBP1-205ENST00000564630 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP28.17■■■□□ 2.1
CCNDBP1-205ENST00000564630 NCOA1Q15788 1441 aa28.17■■■□□ 2.1
CCNDBP1-205ENST00000564630 PZPP20742 1482 aa28.17■■■□□ 2.1
CCNDBP1-205ENST00000564630 NEFLP07196 543 aa28.15■■■□□ 2.1
CCNDBP1-205ENST00000564630 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP28.13■■■□□ 2.09
CCNDBP1-205ENST00000564630 CNTLNQ9NXG0 1405 aa28.13■■■□□ 2.09
CCNDBP1-205ENST00000564630 AGLP35573 1532 aa28.13■■■□□ 2.09
CCNDBP1-205ENST00000564630 ADAMTSL3P82987 1691 aa28.12■■■□□ 2.09
CCNDBP1-205ENST00000564630 MADDQ8WXG6 1647 aa28.12■■■□□ 2.09
CCNDBP1-205ENST00000564630 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP28.11■■■□□ 2.09
CCNDBP1-205ENST00000564630 NBPF8Q3BBV2 869 aa28.1■■■□□ 2.09
CCNDBP1-205ENST00000564630 KIF15Q9NS87 1388 aa28.1■■■□□ 2.09
CCNDBP1-205ENST00000564630 CCDC7Q96M83 1385 aa28.07■■■□□ 2.08
CCNDBP1-205ENST00000564630 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa28.07■■■□□ 2.08
CCNDBP1-205ENST00000564630 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP28.07■■■□□ 2.08
CCNDBP1-205ENST00000564630 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa28.06■■■□□ 2.08
CCNDBP1-205ENST00000564630 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP28.05■■■□□ 2.08
CCNDBP1-205ENST00000564630 DUOX2Q9NRD8 1548 aa28.04■■■□□ 2.08
CCNDBP1-205ENST00000564630 KIF3BO15066 747 aa28.04■■■□□ 2.08
CCNDBP1-205ENST00000564630 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa28.03■■■□□ 2.08
CCNDBP1-205ENST00000564630 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP28.03■■■□□ 2.08
CCNDBP1-205ENST00000564630 GGT6Q6P531 493 aa28.03■■■□□ 2.08
CCNDBP1-205ENST00000564630 BCANQ96GW7 911 aa28.03■■■□□ 2.08
CCNDBP1-205ENST00000564630 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa27.98■■■□□ 2.07
CCNDBP1-205ENST00000564630 PLPPR3Q6T4P5 718 aa27.98■■■□□ 2.07
CCNDBP1-205ENST00000564630 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP27.97■■■□□ 2.07
CCNDBP1-205ENST00000564630 ERBINQ96RT1 1412 aa27.96■■■□□ 2.07
CCNDBP1-205ENST00000564630 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP27.95■■■□□ 2.07
CCNDBP1-205ENST00000564630 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP27.95■■■□□ 2.07
CCNDBP1-205ENST00000564630 PTPRMP28827 1452 aa27.95■■■□□ 2.06
CCNDBP1-205ENST00000564630 PKD2Q13563 968 aa27.92■■■□□ 2.06
CCNDBP1-205ENST00000564630 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP27.92■■■□□ 2.06
CCNDBP1-205ENST00000564630 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP27.92■■■□□ 2.06
CCNDBP1-205ENST00000564630 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP27.91■■■□□ 2.06
CCNDBP1-205ENST00000564630 KIF7Q2M1P5 1343 aa27.91■■■□□ 2.06
CCNDBP1-205ENST00000564630 ERICH6BQ5W0A0 696 aa27.91■■■□□ 2.06
CCNDBP1-205ENST00000564630 BCL11AQ9H165 835 aa27.91■■■□□ 2.06
CCNDBP1-205ENST00000564630 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP27.91■■■□□ 2.06
CCNDBP1-205ENST00000564630 MROH1Q8NDA8 1641 aa27.9■■■□□ 2.06
CCNDBP1-205ENST00000564630 KDM5DQ9BY66 1539 aa27.9■■■□□ 2.06
CCNDBP1-205ENST00000564630 FANCIQ9NVI1 1328 aa27.89■■■□□ 2.06
CCNDBP1-205ENST00000564630 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP27.87■■■□□ 2.05
CCNDBP1-205ENST00000564630 CCDC184Q52MB2 194 aa27.85■■■□□ 2.05
CCNDBP1-205ENST00000564630 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP27.85■■■□□ 2.055e-7■■□□□ 12.8
CCNDBP1-205ENST00000564630 C3P01024 1663 aa27.84■■■□□ 2.05
CCNDBP1-205ENST00000564630 DEPDC5O75140 1603 aa27.84■■■□□ 2.05
CCNDBP1-205ENST00000564630 NUP155O75694 1391 aa27.83■■■□□ 2.05
CCNDBP1-205ENST00000564630 CEP152O94986 1710 aa27.82■■■□□ 2.04
CCNDBP1-205ENST00000564630 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa27.82■■■□□ 2.04
CCNDBP1-205ENST00000564630 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP27.82■■■□□ 2.04
CCNDBP1-205ENST00000564630 MROH2AA6NES4 1674 aa27.81■■■□□ 2.04
CCNDBP1-205ENST00000564630 USP47Q96K76 1375 aa27.8■■■□□ 2.04
CCNDBP1-205ENST00000564630 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa27.8■■■□□ 2.04
CCNDBP1-205ENST00000564630 PPP6R1Q9UPN7 881 aa27.79■■■□□ 2.04
CCNDBP1-205ENST00000564630 ABCC3O15438 1527 aa27.79■■■□□ 2.04
CCNDBP1-205ENST00000564630 ZMYM3Q14202 1370 aa27.78■■■□□ 2.04
CCNDBP1-205ENST00000564630 RALGAPBQ86X10 1494 aa27.77■■■□□ 2.04
CCNDBP1-205ENST00000564630 MRS2Q9HD23 443 aa27.76■■■□□ 2.03
CCNDBP1-205ENST00000564630 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP27.76■■■□□ 2.03
CCNDBP1-205ENST00000564630 FAM135AQ9P2D6 1515 aa27.75■■■□□ 2.03
CCNDBP1-205ENST00000564630 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP27.74■■■□□ 2.03
CCNDBP1-205ENST00000564630 UNC13BO14795 1591 aa27.74■■■□□ 2.03
CCNDBP1-205ENST00000564630 KANK1Q14678 1352 aa27.72■■■□□ 2.03
CCNDBP1-205ENST00000564630 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa27.72■■■□□ 2.03
CCNDBP1-205ENST00000564630 MSH5O43196 834 aa27.71■■■□□ 2.03
CCNDBP1-205ENST00000564630 FAM9BQ8IZU0 186 aa27.71■■■□□ 2.03
CCNDBP1-205ENST00000564630 VWDEQ8N2E2 1590 aa27.71■■■□□ 2.03
CCNDBP1-205ENST00000564630 ZBED9Q6R2W3 1325 aa27.67■■■□□ 2.02
CCNDBP1-205ENST00000564630 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP27.66■■■□□ 2.02
CCNDBP1-205ENST00000564630 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP27.66■■■□□ 2.02
CCNDBP1-205ENST00000564630 LMTK2Q8IWU2 1503 aa27.63■■■□□ 2.01
CCNDBP1-205ENST00000564630 IQGAP3Q86VI3 1631 aa27.62■■■□□ 2.01
CCNDBP1-205ENST00000564630 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP27.61■■■□□ 2.01
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