RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519143.5

MRPS27-208, Transcript of mitochondrial ribosomal protein S27, human

TSL 5

Gene MRPS27, Length 298 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MRPS27-208	ENST00000519143	TYW1B	Q6NUM6	668 aa		5.21	□□□□□ -1.58
MRPS27-208	ENST00000519143	COL9A1	P20849	921 aa		5.2	□□□□□ -1.58
MRPS27-208	ENST00000519143	CAMK2B	Q13554	666 aa		5.2	□□□□□ -1.58
MRPS27-208	ENST00000519143	NYAP1	Q6ZVC0	841 aa		5.2	□□□□□ -1.58
MRPS27-208	ENST00000519143	ANKK1	Q8NFD2	765 aa		5.2	□□□□□ -1.58
MRPS27-208	ENST00000519143	SOWAHB	A6NEL2	793 aa		5.19	□□□□□ -1.58
MRPS27-208	ENST00000519143	PROX2	Q3B8N5	592 aa		5.19	□□□□□ -1.58
MRPS27-208	ENST00000519143	EPAS1	Q99814	870 aa		5.19	□□□□□ -1.58
MRPS27-208	ENST00000519143	IRX2	Q9BZI1	471 aa	Predicted RBP	5.19	□□□□□ -1.58
MRPS27-208	ENST00000519143	CADPS2	Q86UW7	1296 aa		5.18	□□□□□ -1.58
MRPS27-208	ENST00000519143	C6orf132	Q5T0Z8	1188 aa		5.17	□□□□□ -1.58
MRPS27-208	ENST00000519143	ZFR	Q96KR1	1074 aa	Known RBP	5.17	□□□□□ -1.58
MRPS27-208	ENST00000519143	KIAA1468	Q9P260	1216 aa		5.17	□□□□□ -1.58
MRPS27-208	ENST00000519143	TRIM6-TRIM34	B2RNG4	842 aa		5.15	□□□□□ -1.59
MRPS27-208	ENST00000519143	BCAM	P50895	628 aa		5.15	□□□□□ -1.59
MRPS27-208	ENST00000519143	FAM98C	Q17RN3	349 aa	Known RBP	5.14	□□□□□ -1.59
MRPS27-208	ENST00000519143	KCNC4	Q03721	635 aa		5.13	□□□□□ -1.59
MRPS27-208	ENST00000519143	WBP1L	Q9NX94	342 aa		5.13	□□□□□ -1.59
MRPS27-208	ENST00000519143	DPYSL4	O14531	572 aa		5.12	□□□□□ -1.59
MRPS27-208	ENST00000519143	TSR3	Q9UJK0	312 aa	Known RBP	5.12	□□□□□ -1.59
MRPS27-208	ENST00000519143	CDKN2AIP	Q9NXV6	580 aa	Predicted RBP	5.11	□□□□□ -1.59
MRPS27-208	ENST00000519143	SEPT9	Q9UHD8	586 aa	Predicted RBP	5.11	□□□□□ -1.59
MRPS27-208	ENST00000519143	EN1	Q05925	392 aa	Predicted RBP	5.1	□□□□□ -1.59
MRPS27-208	ENST00000519143	PDIA6	Q15084	440 aa		5.1	□□□□□ -1.59
MRPS27-208	ENST00000519143	LRCH3	Q96II8	777 aa		5.1	□□□□□ -1.59
MRPS27-208	ENST00000519143	SPDYE16	A6NNV3	312 aa	Predicted RBP	5.09	□□□□□ -1.59
MRPS27-208	ENST00000519143	PACS2	Q86VP3	889 aa		5.09	□□□□□ -1.59
MRPS27-208	ENST00000519143	DDX12P	Q92771	950 aa		5.09	□□□□□ -1.59
MRPS27-208	ENST00000519143	TSKS	Q9UJT2	592 aa		5.09	□□□□□ -1.59
MRPS27-208	ENST00000519143	ARIH1	Q9Y4X5	557 aa	Predicted RBP	5.09	□□□□□ -1.59
MRPS27-208	ENST00000519143	LAPTM4A	Q15012	233 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MRPS27-208	ENST00000519143	CERK	Q8TCT0	537 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MRPS27-208	ENST00000519143	RBM33	Q96EV2	1170 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
MRPS27-208	ENST00000519143	HPS5	Q9UPZ3	1129 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MRPS27-208	ENST00000519143	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MRPS27-208	ENST00000519143	NBR1	Q14596	966 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MRPS27-208	ENST00000519143	TSR1	Q2NL82	804 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
MRPS27-208	ENST00000519143	BBX	Q8WY36	941 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
MRPS27-208	ENST00000519143	MAP3K7	O43318	606 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MRPS27-208	ENST00000519143	PRSS12	P56730	875 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MRPS27-208	ENST00000519143	PPP4C	P60510	307 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MRPS27-208	ENST00000519143	TJAP1	Q5JTD0	557 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MRPS27-208	ENST00000519143		Q6ZNB5	142 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MRPS27-208	ENST00000519143	CDCA7L	Q96GN5	454 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MRPS27-208	ENST00000519143	FAM198A	Q9UFP1	575 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MRPS27-208	ENST00000519143	RBM27	Q9P2N5	1060 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
MRPS27-208	ENST00000519143	SAMD7	Q7Z3H4	446 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MRPS27-208	ENST00000519143	TATDN2	Q93075	761 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MRPS27-208	ENST00000519143	IL21	Q9HBE4	155 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MRPS27-208	ENST00000519143	NBPF26	B4DH59	902 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MRPS27-208	ENST00000519143	C3orf80	F5H4A9	247 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MRPS27-208	ENST00000519143	PRIM1	P49642	420 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
MRPS27-208	ENST00000519143	E2F4	Q16254	413 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MRPS27-208	ENST00000519143		V9GY48	417 aa	Predicted RBP	5.02	□□□□□ -1.61
MRPS27-208	ENST00000519143	LCE2B	O14633	110 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MRPS27-208	ENST00000519143	GFRA3	O60609	400 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MRPS27-208	ENST00000519143	TTC13	Q8NBP0	860 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MRPS27-208	ENST00000519143	MTR	Q99707	1265 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MRPS27-208	ENST00000519143	PNMA3	Q9UL41	463 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MRPS27-208	ENST00000519143	SMAP	O00193	183 aa		5	□□□□□ -1.61
MRPS27-208	ENST00000519143	NRG2	O14511	850 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
MRPS27-208	ENST00000519143	OSBP	P22059	807 aa		5	□□□□□ -1.61
MRPS27-208	ENST00000519143	TRAF7	Q6Q0C0	670 aa		5	□□□□□ -1.61
MRPS27-208	ENST00000519143	SPRYD3	Q8NCJ5	442 aa		5	□□□□□ -1.61
MRPS27-208	ENST00000519143	NECTIN2	Q92692	538 aa		5	□□□□□ -1.61
MRPS27-208	ENST00000519143	PPP1R18	Q6NYC8	613 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MRPS27-208	ENST00000519143	PRKD2	Q9BZL6	878 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MRPS27-208	ENST00000519143	EIF4ENIF1	Q9NRA8	985 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
MRPS27-208	ENST00000519143	GRXCR2	A6NFK2	248 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MRPS27-208	ENST00000519143	APLP1	P51693	650 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MRPS27-208	ENST00000519143	HDGF	P51858	240 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
MRPS27-208	ENST00000519143	NUDT18	Q6ZVK8	323 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MRPS27-208	ENST00000519143	ZNF516	Q92618	1163 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MRPS27-208	ENST00000519143	TMUB1	Q9BVT8	246 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MRPS27-208	ENST00000519143	CDHR5	Q9HBB8	845 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MRPS27-208	ENST00000519143	NPDC1	Q9NQX5	325 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MRPS27-208	ENST00000519143	SLF2	Q8IX21	1173 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MRPS27-208	ENST00000519143	WDR70	Q9NW82	654 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MRPS27-208	ENST00000519143	ZBTB4	Q9P1Z0	1013 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
MRPS27-208	ENST00000519143	GGCX	P38435	758 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MRPS27-208	ENST00000519143	SWT1	Q5T5J6	900 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
MRPS27-208	ENST00000519143	NKX2-3	Q8TAU0	364 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MRPS27-208	ENST00000519143	EYA1	Q99502	592 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MRPS27-208	ENST00000519143	ZPR1	O75312	459 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MRPS27-208	ENST00000519143	PADI6	Q6TGC4	694 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MRPS27-208	ENST00000519143	PRR14	Q9BWN1	585 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MRPS27-208	ENST00000519143	RNF40	O75150	1001 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MRPS27-208	ENST00000519143	SLC4A3	P48751	1232 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MRPS27-208	ENST00000519143	PDZRN3	Q9UPQ7	1066 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MRPS27-208	ENST00000519143	COPS2	P61201	443 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MRPS27-208	ENST00000519143	ZNF787	Q6DD87	383 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MRPS27-208	ENST00000519143	TRIM67	Q6ZTA4	783 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MRPS27-208	ENST00000519143	PAXIP1	Q6ZW49	1069 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MRPS27-208	ENST00000519143	ARHGEF1	Q92888	912 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MRPS27-208	ENST00000519143	PCDHB3	Q9Y5E6	796 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MRPS27-208	ENST00000519143	RNF223	E7ERA6	249 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MRPS27-208	ENST00000519143	DNAJB2	P25686	324 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MRPS27-208	ENST00000519143	PRR20E	P86478	221 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MRPS27-208	ENST00000519143	PRR20C	P86479	221 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MRPS27-208	ENST00000519143	PRR20D	P86480	221 aa		4.88	□□□□□ -1.63

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