RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517049.1

RNU6-1271P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1271, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1271P, Length 105 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
RNU6-1271P-201ENST00000517049 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
RNU6-1271P-201ENST00000517049 WBP1LQ9NX94 342 aa8.54□□□□□ -1.04
RNU6-1271P-201ENST00000517049 MAP3K9P80192 1104 aa8.52□□□□□ -1.05
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TRAF7Q6Q0C0 670 aa8.52□□□□□ -1.05
RNU6-1271P-201ENST00000517049 FBXW7Q969H0 707 aa8.51□□□□□ -1.05
RNU6-1271P-201ENST00000517049 KIAA1468Q9P260 1216 aa8.51□□□□□ -1.05
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CHGAP10645 457 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TYW1BQ6NUM6 668 aa8.5□□□□□ -1.05
RNU6-1271P-201ENST00000517049 GFRA3O60609 400 aa8.49□□□□□ -1.05
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PHF14O94880 888 aa8.49□□□□□ -1.05
RNU6-1271P-201ENST00000517049 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
RNU6-1271P-201ENST00000517049 MFSD10Q14728 455 aa8.48□□□□□ -1.05
RNU6-1271P-201ENST00000517049 EMILIN3Q9NT22 766 aa8.47□□□□□ -1.05
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
RNU6-1271P-201ENST00000517049 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
RNU6-1271P-201ENST00000517049 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa8.44□□□□□ -1.06
RNU6-1271P-201ENST00000517049 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
RNU6-1271P-201ENST00000517049 HPS5Q9UPZ3 1129 aa8.44□□□□□ -1.06
RNU6-1271P-201ENST00000517049 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa8.43□□□□□ -1.06
RNU6-1271P-201ENST00000517049 LRCH3Q96II8 777 aa8.43□□□□□ -1.06
RNU6-1271P-201ENST00000517049 EPAS1Q99814 870 aa8.42□□□□□ -1.06
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PRKD2Q9BZL6 878 aa8.4□□□□□ -1.06
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TJAP1Q5JTD0 557 aa8.39□□□□□ -1.07
RNU6-1271P-201ENST00000517049 V9GY48 417 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
RNU6-1271P-201ENST00000517049 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PPP4CP60510 307 aa8.36□□□□□ -1.07
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ZNF787Q6DD87 383 aa8.35□□□□□ -1.07
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PPP1R18Q6NYC8 613 aa8.34□□□□□ -1.07
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PACS2Q86VP3 889 aa8.33□□□□□ -1.08
RNU6-1271P-201ENST00000517049 IL21Q9HBE4 155 aa8.33□□□□□ -1.08
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CAMK2BQ13554 666 aa8.32□□□□□ -1.08
RNU6-1271P-201ENST00000517049 MTRQ99707 1265 aa8.32□□□□□ -1.08
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TSKSQ9UJT2 592 aa8.32□□□□□ -1.08
RNU6-1271P-201ENST00000517049 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ZNF775Q96BV0 537 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
RNU6-1271P-201ENST00000517049 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SAMD7Q7Z3H4 446 aa8.29□□□□□ -1.08
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa8.29□□□□□ -1.08
RNU6-1271P-201ENST00000517049 DPYSL4O14531 572 aa8.28□□□□□ -1.08
RNU6-1271P-201ENST00000517049 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CADPS2Q86UW7 1296 aa8.26□□□□□ -1.09
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ZNF516Q92618 1163 aa8.26□□□□□ -1.09
RNU6-1271P-201ENST00000517049 DDX12PQ92771 950 aa8.26□□□□□ -1.09
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SMAPO00193 183 aa8.23□□□□□ -1.09
RNU6-1271P-201ENST00000517049 MAP3K7O43318 606 aa8.23□□□□□ -1.09
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CDCA7LQ96GN5 454 aa8.23□□□□□ -1.09
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PRSS12P56730 875 aa8.22□□□□□ -1.09
RNU6-1271P-201ENST00000517049 NBR1Q14596 966 aa8.22□□□□□ -1.09
RNU6-1271P-201ENST00000517049 FAM198AQ9UFP1 575 aa8.22□□□□□ -1.09
RNU6-1271P-201ENST00000517049 GGCXP38435 758 aa8.21□□□□□ -1.1
RNU6-1271P-201ENST00000517049 APLP1P51693 650 aa8.21□□□□□ -1.1
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TMUB1Q9BVT8 246 aa8.21□□□□□ -1.1
RNU6-1271P-201ENST00000517049 C3orf80F5H4A9 247 aa8.2□□□□□ -1.1
RNU6-1271P-201ENST00000517049 NKX2-3Q8TAU0 364 aa8.2□□□□□ -1.1
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CERKQ8TCT0 537 aa8.2□□□□□ -1.1
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TATDN2Q93075 761 aa8.2□□□□□ -1.1
RNU6-1271P-201ENST00000517049 NBPF26B4DH59 902 aa8.19□□□□□ -1.1
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PDIA6Q15084 440 aa8.18□□□□□ -1.1
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TRIM67Q6ZTA4 783 aa8.18□□□□□ -1.1
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PNMA3Q9UL41 463 aa8.18□□□□□ -1.1
RNU6-1271P-201ENST00000517049 NECTIN2Q92692 538 aa8.16□□□□□ -1.1
RNU6-1271P-201ENST00000517049 DGAT1O75907 488 aa8.15□□□□□ -1.1
RNU6-1271P-201ENST00000517049 HDGFP51858 240 aaKnown RBP8.15□□□□□ -1.1
RNU6-1271P-201ENST00000517049 MYT1Q01538 1121 aa8.15□□□□□ -1.1
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP8.14□□□□□ -1.11
RNU6-1271P-201ENST00000517049 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP8.14□□□□□ -1.11
RNU6-1271P-201ENST00000517049 RNF40O75150 1001 aa8.13□□□□□ -1.11
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PKDCCQ504Y2 493 aa8.13□□□□□ -1.11
RNU6-1271P-201ENST00000517049 NUDT18Q6ZVK8 323 aa8.13□□□□□ -1.11
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ZPR1O75312 459 aa8.12□□□□□ -1.11
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SLC19A1P41440 591 aa8.12□□□□□ -1.11
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
RNU6-1271P-201ENST00000517049 COPS2P61201 443 aa8.12□□□□□ -1.11
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PRR20EP86478 221 aa8.12□□□□□ -1.11
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PRR20CP86479 221 aa8.12□□□□□ -1.11
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PRR20DP86480 221 aa8.12□□□□□ -1.11
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PRR20BP86481 221 aa8.12□□□□□ -1.11
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PRR20AP86496 221 aa8.12□□□□□ -1.11
RNU6-1271P-201ENST00000517049 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
RNU6-1271P-201ENST00000517049 POTECB2RU33 542 aa8.11□□□□□ -1.11
RNU6-1271P-201ENST00000517049 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP8.1□□□□□ -1.11
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SLF2Q8IX21 1173 aa8.1□□□□□ -1.11
RNU6-1271P-201ENST00000517049 RNF223E7ERA6 249 aa8.09□□□□□ -1.11
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SPRYD7Q5W111 196 aa8.09□□□□□ -1.11
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TTC13Q8NBP0 860 aa8.09□□□□□ -1.11
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TREML4Q6UXN2 200 aa8.08□□□□□ -1.12
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PRR14Q9BWN1 585 aa8.06□□□□□ -1.12
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CDHR5Q9HBB8 845 aa8.06□□□□□ -1.12
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ANKLE1Q8NAG6 615 aa8.05□□□□□ -1.12
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
RNU6-1271P-201ENST00000517049 GDF9O60383 454 aa8.04□□□□□ -1.12
RNU6-1271P-201ENST00000517049 OSBPP22059 807 aa8.04□□□□□ -1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 9.9 ms