RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516122.1

RNU6-871P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 871, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-871P, Length 100 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-871P-201ENST00000516122 KCNH8Q96L42 1107 aa3.72□□□□□ -1.81
RNU6-871P-201ENST00000516122 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP3.72□□□□□ -1.81
RNU6-871P-201ENST00000516122 CRIPAKQ8N1N5 446 aa3.71□□□□□ -1.82
RNU6-871P-201ENST00000516122 PHF8Q9UPP1 1060 aa3.71□□□□□ -1.82
RNU6-871P-201ENST00000516122 GSE1Q14687 1217 aa3.7□□□□□ -1.82
RNU6-871P-201ENST00000516122 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa3.7□□□□□ -1.82
RNU6-871P-201ENST00000516122 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP3.7□□□□□ -1.82
RNU6-871P-201ENST00000516122 FAM187AA6NFU0 413 aa3.69□□□□□ -1.82
RNU6-871P-201ENST00000516122 BTBD11A6QL63 1104 aa3.69□□□□□ -1.82
RNU6-871P-201ENST00000516122 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP3.69□□□□□ -1.82
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RNU6-871P-201ENST00000516122 SPRYD7Q5W111 196 aa3.63□□□□□ -1.83
RNU6-871P-201ENST00000516122 TMEM151AQ8N4L1 468 aa3.63□□□□□ -1.83
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RNU6-871P-201ENST00000516122 ZNF454Q8N9F8 522 aa3.62□□□□□ -1.83
RNU6-871P-201ENST00000516122 HPS5Q9UPZ3 1129 aa3.62□□□□□ -1.83
RNU6-871P-201ENST00000516122 TNFRSF10AO00220 468 aa3.61□□□□□ -1.83
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RNU6-871P-201ENST00000516122 GDF11O95390 407 aa3.61□□□□□ -1.83
RNU6-871P-201ENST00000516122 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP3.61□□□□□ -1.83
RNU6-871P-201ENST00000516122 IL21Q9HBE4 155 aa3.61□□□□□ -1.83
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RNU6-871P-201ENST00000516122 SLC19A1P41440 591 aa3.59□□□□□ -1.83
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RNU6-871P-201ENST00000516122 Q8N3U1 123 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-871P-201ENST00000516122 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
RNU6-871P-201ENST00000516122 ERBB4Q15303 1308 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-871P-201ENST00000516122 TMUB1Q9BVT8 246 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-871P-201ENST00000516122 ZNF697Q5TEC3 545 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-871P-201ENST00000516122 GPAT2Q6NUI2 795 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-871P-201ENST00000516122 TMC2Q8TDI7 906 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-871P-201ENST00000516122 TRIM47Q96LD4 638 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-871P-201ENST00000516122 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
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RNU6-871P-201ENST00000516122 CTC1Q2NKJ3 1217 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-871P-201ENST00000516122 PKD2L1Q9P0L9 805 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-871P-201ENST00000516122 KIAA1468Q9P260 1216 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-871P-201ENST00000516122 LRCH3Q96II8 777 aa3.53□□□□□ -1.84
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RNU6-871P-201ENST00000516122 IRF7Q92985 503 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-871P-201ENST00000516122 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-871P-201ENST00000516122 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa3.52□□□□□ -1.85
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RNU6-871P-201ENST00000516122 PPP4CP60510 307 aa3.48□□□□□ -1.85
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RNU6-871P-201ENST00000516122 PLA2G2CQ5R387 149 aa3.46□□□□□ -1.86
RNU6-871P-201ENST00000516122 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP3.46□□□□□ -1.86
RNU6-871P-201ENST00000516122 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa3.46□□□□□ -1.86
RNU6-871P-201ENST00000516122 FOXK2Q01167 660 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-871P-201ENST00000516122 DSG2Q14126 1118 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-871P-201ENST00000516122 LMOD2Q6P5Q4 547 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-871P-201ENST00000516122 ANKLE1Q8NAG6 615 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-871P-201ENST00000516122 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-871P-201ENST00000516122 SENP2Q9HC62 589 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-871P-201ENST00000516122 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP3.44□□□□□ -1.86
RNU6-871P-201ENST00000516122 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP3.43□□□□□ -1.86
RNU6-871P-201ENST00000516122 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP3.43□□□□□ -1.86
RNU6-871P-201ENST00000516122 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa3.42□□□□□ -1.86
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