RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472398.5

TTC3-214, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 3, human

TSL 1 (best)

Gene TTC3, Length 2,305 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTC3-214	ENST00000472398	CADPS2	Q86UW7	1296 aa		4.66	□□□□□ -1.66
TTC3-214	ENST00000472398	PPP1R37	O75864	691 aa		4.66	□□□□□ -1.66
TTC3-214	ENST00000472398	CENPB	P07199	599 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
TTC3-214	ENST00000472398	KDM4A	O75164	1064 aa		4.65	□□□□□ -1.66
TTC3-214	ENST00000472398	RBM10	P98175	930 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.66
TTC3-214	ENST00000472398	CCDC27	Q2M243	656 aa		4.65	□□□□□ -1.66
TTC3-214	ENST00000472398	TMCO4	Q5TGY1	634 aa		4.65	□□□□□ -1.66
TTC3-214	ENST00000472398	ASTL	Q6HA08	431 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.66
TTC3-214	ENST00000472398	ARID4B	Q4LE39	1312 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
TTC3-214	ENST00000472398	IER5L	Q5T953	404 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TTC3-214	ENST00000472398	CNPY4	Q8N129	248 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TTC3-214	ENST00000472398	ATMIN	O43313	823 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
TTC3-214	ENST00000472398	MKRN3	Q13064	507 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
TTC3-214	ENST00000472398	SLC24A3	Q9HC58	644 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TTC3-214	ENST00000472398	NCL	P19338	710 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
TTC3-214	ENST00000472398	GOLGA2	Q08379	1002 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TTC3-214	ENST00000472398	TEX2	Q8IWB9	1127 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TTC3-214	ENST00000472398	ZNF316	A6NFI3	1004 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
TTC3-214	ENST00000472398		E9PSI1	815 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TTC3-214	ENST00000472398	MFSD10	Q14728	455 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TTC3-214	ENST00000472398	P3H3	Q8IVL6	736 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TTC3-214	ENST00000472398	GZF1	Q9H116	711 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
TTC3-214	ENST00000472398	TRIM35	Q9UPQ4	493 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TTC3-214	ENST00000472398	CRISPLD2	Q9H0B8	497 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TTC3-214	ENST00000472398	ATN1	P54259	1190 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
TTC3-214	ENST00000472398	IRX5	P78411	483 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
TTC3-214	ENST00000472398	CCDC125	Q86Z20	511 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TTC3-214	ENST00000472398	TRAIP	Q9BWF2	469 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TTC3-214	ENST00000472398	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TTC3-214	ENST00000472398	PDCD7	Q8N8D1	485 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
TTC3-214	ENST00000472398	NCKAP5L	Q9HCH0	1330 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TTC3-214	ENST00000472398	FAM43B	Q6ZT52	329 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
TTC3-214	ENST00000472398	BCLAF1	Q9NYF8	920 aa	Known RBP eCLIP	4.6	□□□□□ -1.67	1e-9	■■■■■ 29.4
TTC3-214	ENST00000472398	ST18	O60284	1047 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TTC3-214	ENST00000472398	ARIH1	Q9Y4X5	557 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
TTC3-214	ENST00000472398	PTGER2	P43116	358 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TTC3-214	ENST00000472398	KCNG1	Q9UIX4	513 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TTC3-214	ENST00000472398	PDE4A	P27815	886 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TTC3-214	ENST00000472398	KCNV2	Q8TDN2	545 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TTC3-214	ENST00000472398	GPBP1L1	Q9HC44	474 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
TTC3-214	ENST00000472398	WDR70	Q9NW82	654 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TTC3-214	ENST00000472398	SALL2	Q9Y467	1007 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
TTC3-214	ENST00000472398	CAMK2B	Q13554	666 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TTC3-214	ENST00000472398	IRF5	Q13568	498 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TTC3-214	ENST00000472398	ZC3H15	Q8WU90	426 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
TTC3-214	ENST00000472398	ARHGEF1	Q92888	912 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
TTC3-214	ENST00000472398	PLCD4	Q9BRC7	762 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TTC3-214	ENST00000472398	OCEL1	Q9H607	264 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TTC3-214	ENST00000472398	C7	P10643	843 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TTC3-214	ENST00000472398	MICALL2	Q8IY33	904 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TTC3-214	ENST00000472398	SECISBP2L	Q93073	1101 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
TTC3-214	ENST00000472398	ANP32E	Q9BTT0	268 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TTC3-214	ENST00000472398	SMARCA5	O60264	1052 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
TTC3-214	ENST00000472398	E2F4	Q16254	413 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TTC3-214	ENST00000472398	IL27	Q8NEV9	243 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TTC3-214	ENST00000472398	GPHN	Q9NQX3	736 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
TTC3-214	ENST00000472398	BRD1	O95696	1058 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TTC3-214	ENST00000472398	ANAPC15	P60006	121 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TTC3-214	ENST00000472398	DPY19L2	Q6NUT2	758 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TTC3-214	ENST00000472398	PLA2G2E	Q9NZK7	142 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TTC3-214	ENST00000472398	LOC102724159	A0A0B4J2E5	919 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TTC3-214	ENST00000472398	PWP2	Q15269	919 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
TTC3-214	ENST00000472398	RETREG2	Q8NC44	543 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TTC3-214	ENST00000472398	SLC39A7	Q92504	469 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TTC3-214	ENST00000472398	NAP1L2	Q9ULW6	460 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
TTC3-214	ENST00000472398	KIF3C	O14782	793 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TTC3-214	ENST00000472398	DDX27	Q96GQ7	796 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
TTC3-214	ENST00000472398	SGSM3	Q96HU1	749 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TTC3-214	ENST00000472398	LARP6	Q9BRS8	491 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
TTC3-214	ENST00000472398	DEK	P35659	375 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
TTC3-214	ENST00000472398	GRIPAP1	Q4V328	841 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TTC3-214	ENST00000472398	KRTAP9-9	Q9BYP9	154 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TTC3-214	ENST00000472398	KRTAP9-4	Q9BYQ2	154 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TTC3-214	ENST00000472398	BOLA1	Q9Y3E2	137 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TTC3-214	ENST00000472398	CLSPN	Q9HAW4	1339 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TTC3-214	ENST00000472398	POTEF	A5A3E0	1075 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TTC3-214	ENST00000472398	UNCX	A6NJT0	531 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TTC3-214	ENST00000472398	MAFG	O15525	162 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TTC3-214	ENST00000472398	PLCG2	P16885	1265 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TTC3-214	ENST00000472398	WWC1	Q8IX03	1113 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TTC3-214	ENST00000472398	CLUAP1	Q96AJ1	413 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TTC3-214	ENST00000472398	L3MBTL3	Q96JM7	780 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
TTC3-214	ENST00000472398	SET	Q01105	290 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
TTC3-214	ENST00000472398	RIPOR2	Q9Y4F9	1068 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TTC3-214	ENST00000472398	FOXK1	P85037	733 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TTC3-214	ENST00000472398	FBXW7	Q969H0	707 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TTC3-214	ENST00000472398	IGSF5	Q9NSI5	407 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TTC3-214	ENST00000472398	COLQ	Q9Y215	455 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
TTC3-214	ENST00000472398	TESPA1	A2RU30	521 aa	Predicted RBP	4.51	□□□□□ -1.69
TTC3-214	ENST00000472398	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
TTC3-214	ENST00000472398	PPP1R15B	Q5SWA1	713 aa		4.51	□□□□□ -1.69
TTC3-214	ENST00000472398	EXOC8	Q8IYI6	725 aa		4.51	□□□□□ -1.69
TTC3-214	ENST00000472398	DNAJC2	Q99543	621 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
TTC3-214	ENST00000472398	TMTC2	Q8N394	836 aa		4.5	□□□□□ -1.69
TTC3-214	ENST00000472398	LAS1L	Q9Y4W2	734 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
TTC3-214	ENST00000472398	PTMS	P20962	102 aa		4.5	□□□□□ -1.69
TTC3-214	ENST00000472398	DSG2	Q14126	1118 aa		4.5	□□□□□ -1.69
TTC3-214	ENST00000472398	GPATCH11	Q8N954	259 aa		4.5	□□□□□ -1.69
TTC3-214	ENST00000472398	BARGIN	Q6ZT62	677 aa		4.49	□□□□□ -1.69
TTC3-214	ENST00000472398	TMC2	Q8TDI7	906 aa		4.49	□□□□□ -1.69

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