RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439415.1

CBX1P4-201, Transcript of chromobox 1 pseudogene 4, humanhuman

BASIC

Gene CBX1P4, Length 457 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P4-201ENST00000439415 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP7.78□□□□□ -1.16
CBX1P4-201ENST00000439415 GPCPD1Q9NPB8 672 aa7.78□□□□□ -1.16
CBX1P4-201ENST00000439415 COG6Q9Y2V7 657 aa7.78□□□□□ -1.16
CBX1P4-201ENST00000439415 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP7.77□□□□□ -1.17
CBX1P4-201ENST00000439415 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP7.77□□□□□ -1.17
CBX1P4-201ENST00000439415 PDE4CQ08493 712 aa7.77□□□□□ -1.17
CBX1P4-201ENST00000439415 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP7.77□□□□□ -1.17
CBX1P4-201ENST00000439415 PHF12Q96QT6 1004 aa7.77□□□□□ -1.17
CBX1P4-201ENST00000439415 MTMR7Q9Y216 660 aa7.77□□□□□ -1.17
CBX1P4-201ENST00000439415 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP7.77□□□□□ -1.17
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CBX1P4-201ENST00000439415 IRF5Q13568 498 aa7.75□□□□□ -1.17
CBX1P4-201ENST00000439415 BANK1Q8NDB2 785 aa7.75□□□□□ -1.17
CBX1P4-201ENST00000439415 TRPC6Q9Y210 931 aa7.75□□□□□ -1.17
CBX1P4-201ENST00000439415 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP7.75□□□□□ -1.17
CBX1P4-201ENST00000439415 C2orf72A6NCS6 295 aa7.74□□□□□ -1.17
CBX1P4-201ENST00000439415 KIF3CO14782 793 aa7.74□□□□□ -1.17
CBX1P4-201ENST00000439415 TBC1D12O60347 775 aa7.74□□□□□ -1.17
CBX1P4-201ENST00000439415 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP7.74□□□□□ -1.17
CBX1P4-201ENST00000439415 BEGAINQ9BUH8 593 aa7.74□□□□□ -1.17
CBX1P4-201ENST00000439415 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP7.74□□□□□ -1.17
CBX1P4-201ENST00000439415 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP7.73□□□□□ -1.17
CBX1P4-201ENST00000439415 TIE1P35590 1138 aa7.73□□□□□ -1.17
CBX1P4-201ENST00000439415 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP7.73□□□□□ -1.17
CBX1P4-201ENST00000439415 DPY19L2Q6NUT2 758 aa7.73□□□□□ -1.17
CBX1P4-201ENST00000439415 POLR3EQ9NVU0 708 aa7.73□□□□□ -1.17
CBX1P4-201ENST00000439415 WWC1Q8IX03 1113 aa7.72□□□□□ -1.17
CBX1P4-201ENST00000439415 MS4A3Q96HJ5 214 aa7.72□□□□□ -1.17
CBX1P4-201ENST00000439415 FBXW7Q969H0 707 aa7.71□□□□□ -1.18
CBX1P4-201ENST00000439415 OTUD5Q96G74 571 aa7.71□□□□□ -1.18
CBX1P4-201ENST00000439415 SNRKQ9NRH2 765 aa7.71□□□□□ -1.18
CBX1P4-201ENST00000439415 TTLL13PA6NNM8 815 aa7.7□□□□□ -1.18
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CBX1P4-201ENST00000439415 MYSM1Q5VVJ2 828 aa7.7□□□□□ -1.18
CBX1P4-201ENST00000439415 EVI5O60447 810 aa7.69□□□□□ -1.18
CBX1P4-201ENST00000439415 RFC5P40937 340 aa7.69□□□□□ -1.18
CBX1P4-201ENST00000439415 RBM25P49756 843 aaKnown RBP7.69□□□□□ -1.18
CBX1P4-201ENST00000439415 CLK2P49760 499 aaKnown RBP7.69□□□□□ -1.18
CBX1P4-201ENST00000439415 TMEM259Q4ZIN3 620 aa7.69□□□□□ -1.18
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CBX1P4-201ENST00000439415 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP7.69□□□□□ -1.18
CBX1P4-201ENST00000439415 PHOX2BQ99453 314 aa7.69□□□□□ -1.18
CBX1P4-201ENST00000439415 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP7.69□□□□□ -1.18
CBX1P4-201ENST00000439415 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP7.68□□□□□ -1.18
CBX1P4-201ENST00000439415 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP7.68□□□□□ -1.18
CBX1P4-201ENST00000439415 DIXDC1Q155Q3 683 aa7.67□□□□□ -1.18
CBX1P4-201ENST00000439415 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP7.67□□□□□ -1.18
CBX1P4-201ENST00000439415 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa7.66□□□□□ -1.18
CBX1P4-201ENST00000439415 G3V3G9 751 aa7.66□□□□□ -1.18
CBX1P4-201ENST00000439415 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP7.66□□□□□ -1.18
CBX1P4-201ENST00000439415 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP7.66□□□□□ -1.18
CBX1P4-201ENST00000439415 TRIM35Q9UPQ4 493 aa7.66□□□□□ -1.18
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CBX1P4-201ENST00000439415 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP7.65□□□□□ -1.18
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CBX1P4-201ENST00000439415 PPP2R2DQ66LE6 453 aa7.65□□□□□ -1.18
CBX1P4-201ENST00000439415 CDHR5Q9HBB8 845 aa7.65□□□□□ -1.18
CBX1P4-201ENST00000439415 PRM3Q9NNZ6 103 aa7.65□□□□□ -1.18
CBX1P4-201ENST00000439415 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa7.65□□□□□ -1.18
CBX1P4-201ENST00000439415 E9PSI1 815 aa7.64□□□□□ -1.19
CBX1P4-201ENST00000439415 BRD1O95696 1058 aa7.64□□□□□ -1.19
CBX1P4-201ENST00000439415 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP7.64□□□□□ -1.19
CBX1P4-201ENST00000439415 ZNF428Q96B54 188 aa7.64□□□□□ -1.19
CBX1P4-201ENST00000439415 EPAS1Q99814 870 aa7.64□□□□□ -1.19
CBX1P4-201ENST00000439415 GDPD2Q9HCC8 539 aa7.64□□□□□ -1.19
CBX1P4-201ENST00000439415 OATP04181 439 aa7.63□□□□□ -1.19
CBX1P4-201ENST00000439415 GLMNQ92990 594 aa7.63□□□□□ -1.19
CBX1P4-201ENST00000439415 TBC1D2Q9BYX2 928 aa7.63□□□□□ -1.19
CBX1P4-201ENST00000439415 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP7.63□□□□□ -1.19
CBX1P4-201ENST00000439415 SOCS7O14512 581 aa7.62□□□□□ -1.19
CBX1P4-201ENST00000439415 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP7.62□□□□□ -1.19
CBX1P4-201ENST00000439415 MAP3K7O43318 606 aa7.62□□□□□ -1.19
CBX1P4-201ENST00000439415 IGSF3O75054 1194 aa7.62□□□□□ -1.19
CBX1P4-201ENST00000439415 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP7.62□□□□□ -1.19
CBX1P4-201ENST00000439415 MTMR14Q8NCE2 650 aa7.62□□□□□ -1.19
CBX1P4-201ENST00000439415 PHF14O94880 888 aa7.61□□□□□ -1.19
CBX1P4-201ENST00000439415 ABL2P42684 1182 aa7.61□□□□□ -1.19
CBX1P4-201ENST00000439415 PBXIP1Q96AQ6 731 aa7.61□□□□□ -1.19
CBX1P4-201ENST00000439415 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP7.61□□□□□ -1.19
CBX1P4-201ENST00000439415 USTQ9Y2C2 406 aa7.61□□□□□ -1.19
CBX1P4-201ENST00000439415 C7P10643 843 aa7.6□□□□□ -1.19
CBX1P4-201ENST00000439415 SLC39A7Q92504 469 aa7.6□□□□□ -1.19
CBX1P4-201ENST00000439415 METRNQ9UJH8 293 aa7.6□□□□□ -1.19
CBX1P4-201ENST00000439415 POM121CA8CG34 1229 aa7.59□□□□□ -1.19
CBX1P4-201ENST00000439415 TUSC1Q2TAM9 212 aa7.59□□□□□ -1.19
CBX1P4-201ENST00000439415 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP7.59□□□□□ -1.19
CBX1P4-201ENST00000439415 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa7.58□□□□□ -1.2
CBX1P4-201ENST00000439415 RIC3Q7Z5B4 369 aa7.58□□□□□ -1.2
CBX1P4-201ENST00000439415 PXYLP1Q8TE99 480 aa7.58□□□□□ -1.2
CBX1P4-201ENST00000439415 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
CBX1P4-201ENST00000439415 OCEL1Q9H607 264 aa7.58□□□□□ -1.2
CBX1P4-201ENST00000439415 LIMD1Q9UGP4 676 aa7.58□□□□□ -1.2
CBX1P4-201ENST00000439415 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa7.58□□□□□ -1.2
CBX1P4-201ENST00000439415 POTEJP0CG39 1038 aa7.57□□□□□ -1.2
CBX1P4-201ENST00000439415 FAM161AQ3B820 660 aa7.57□□□□□ -1.2
CBX1P4-201ENST00000439415 NLRP7Q8WX94 980 aa7.57□□□□□ -1.2
CBX1P4-201ENST00000439415 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
CBX1P4-201ENST00000439415 POTEMA6NI47 508 aa7.56□□□□□ -1.2
CBX1P4-201ENST00000439415 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
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