RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000391970.3

PTPRC-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 408 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-205ENST00000391970 KDM4CQ9H3R0 1056 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRC-205ENST00000391970 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
PTPRC-205ENST00000391970 NUDT7P0C024 238 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRC-205ENST00000391970 AMHR2Q16671 573 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRC-205ENST00000391970 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
PTPRC-205ENST00000391970 ARSIQ5FYB1 569 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRC-205ENST00000391970 GPR153Q6NV75 609 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRC-205ENST00000391970 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP6.57□□□□□ -1.365e-7■■□□□ 12.4
PTPRC-205ENST00000391970 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
PTPRC-205ENST00000391970 ZNF454Q8N9F8 522 aa6.56□□□□□ -1.36
PTPRC-205ENST00000391970 ZDHHC16Q969W1 377 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRC-205ENST00000391970 PARP9Q8IXQ6 854 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRC-205ENST00000391970 ZNF710Q8N1W2 664 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRC-205ENST00000391970 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRC-205ENST00000391970 ADAM33Q9BZ11 813 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRC-205ENST00000391970 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
PTPRC-205ENST00000391970 CERKQ8TCT0 537 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRC-205ENST00000391970 LHX6Q9UPM6 363 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRC-205ENST00000391970 SNPHO15079 494 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRC-205ENST00000391970 IL27Q8NEV9 243 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRC-205ENST00000391970 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
PTPRC-205ENST00000391970 ST18O60284 1047 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRC-205ENST00000391970 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
PTPRC-205ENST00000391970 PADI6Q6TGC4 694 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRC-205ENST00000391970 FAM117AQ9C073 453 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRC-205ENST00000391970 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRC-205ENST00000391970 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
PTPRC-205ENST00000391970 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
PTPRC-205ENST00000391970 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRC-205ENST00000391970 TTC13Q8NBP0 860 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRC-205ENST00000391970 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
PTPRC-205ENST00000391970 DDRGK1Q96HY6 314 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRC-205ENST00000391970 PHOX2BQ99453 314 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRC-205ENST00000391970 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
PTPRC-205ENST00000391970 BCL2L12Q9HB09 334 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRC-205ENST00000391970 PLEKHG3A1L390 1219 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRC-205ENST00000391970 POTEMA6NI47 508 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRC-205ENST00000391970 PRSS12P56730 875 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRC-205ENST00000391970 POTEGQ6S5H5 508 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRC-205ENST00000391970 ERICH6Q7L0X2 663 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRC-205ENST00000391970 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
PTPRC-205ENST00000391970 MARVELD3Q96A59 401 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRC-205ENST00000391970 TMUB1Q9BVT8 246 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRC-205ENST00000391970 ADGRG1Q9Y653 693 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRC-205ENST00000391970 OATP04181 439 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRC-205ENST00000391970 CLCN1P35523 988 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRC-205ENST00000391970 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
PTPRC-205ENST00000391970 FAM161AQ3B820 660 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRC-205ENST00000391970 CDCA7LQ96GN5 454 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRC-205ENST00000391970 GPCPD1Q9NPB8 672 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRC-205ENST00000391970 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRC-205ENST00000391970 MS4A1P11836 297 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRC-205ENST00000391970 COL9A1P20849 921 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRC-205ENST00000391970 PXYLP1Q8TE99 480 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRC-205ENST00000391970 PTPREP23469 700 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRC-205ENST00000391970 FAM198AQ9UFP1 575 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRC-205ENST00000391970 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
PTPRC-205ENST00000391970 NLRP7Q8WX94 980 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRC-205ENST00000391970 TSKSQ9UJT2 592 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRC-205ENST00000391970 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
PTPRC-205ENST00000391970 C14orf37Q86TY3 774 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRC-205ENST00000391970 GOPCQ9HD26 462 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRC-205ENST00000391970 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
PTPRC-205ENST00000391970 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRC-205ENST00000391970 EMP3P54852 163 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRC-205ENST00000391970 EYA1Q99502 592 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRC-205ENST00000391970 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
PTPRC-205ENST00000391970 KCNK17Q96T54 332 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRC-205ENST00000391970 POTEB3A0JP26 581 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRC-205ENST00000391970 RCCD1A6NED2 376 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRC-205ENST00000391970 FAM205CA6NFA0 338 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRC-205ENST00000391970 NBPF26B4DH59 902 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRC-205ENST00000391970 C3orf80F5H4A9 247 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRC-205ENST00000391970 POTEBQ6S5H4 581 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRC-205ENST00000391970 BEGAINQ9BUH8 593 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRC-205ENST00000391970 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
PTPRC-205ENST00000391970 PROX2Q3B8N5 592 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRC-205ENST00000391970 SH3D19Q5HYK7 790 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRC-205ENST00000391970 NUDT18Q6ZVK8 323 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRC-205ENST00000391970 PACS2Q86VP3 889 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRC-205ENST00000391970 TATDN2Q93075 761 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRC-205ENST00000391970 KCNH8Q96L42 1107 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRC-205ENST00000391970 PNMA3Q9UL41 463 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRC-205ENST00000391970 ERBB3P21860 1342 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRC-205ENST00000391970 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
PTPRC-205ENST00000391970 ZBED2Q9BTP6 218 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRC-205ENST00000391970 DNAJB2P25686 324 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRC-205ENST00000391970 PSEN2P49810 448 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRC-205ENST00000391970 POTEEQ6S8J3 1075 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRC-205ENST00000391970 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
PTPRC-205ENST00000391970 RSPH6AQ9H0K4 717 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRC-205ENST00000391970 ARHGAP33O14559 1287 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRC-205ENST00000391970 CDAN1Q8IWY9 1227 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRC-205ENST00000391970 HS3ST6Q96QI5 342 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRC-205ENST00000391970 TMEM134Q9H6X4 195 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRC-205ENST00000391970 SMAPO00193 183 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRC-205ENST00000391970 CD46P15529 392 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRC-205ENST00000391970 PBX2P40425 430 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRC-205ENST00000391970 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
PTPRC-205ENST00000391970 SULF1Q8IWU6 871 aa6.33□□□□□ -1.4
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