RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348564.10

PTPRC-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 4,626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-201ENST00000348564 ADGRL1O94910 1474 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRC-201ENST00000348564 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRC-201ENST00000348564 WDR7Q9Y4E6 1490 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRC-201ENST00000348564 TRAK1Q9UPV9 953 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRC-201ENST00000348564 PTPN23Q9H3S7 1636 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRC-201ENST00000348564 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP6.12□□□□□ -1.43
PTPRC-201ENST00000348564 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
PTPRC-201ENST00000348564 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
PTPRC-201ENST00000348564 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
PTPRC-201ENST00000348564 ADCY10Q96PN6 1610 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRC-201ENST00000348564 FANCAO15360 1455 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRC-201ENST00000348564 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
PTPRC-201ENST00000348564 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRC-201ENST00000348564 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRC-201ENST00000348564 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRC-201ENST00000348564 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRC-201ENST00000348564 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP6.1□□□□□ -1.43
PTPRC-201ENST00000348564 CERKQ8TCT0 537 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRC-201ENST00000348564 STRN4Q9NRL3 753 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRC-201ENST00000348564 SLC52A1Q9NWF4 448 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRC-201ENST00000348564 PLCH2O75038 1416 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRC-201ENST00000348564 DAPK1P53355 1430 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRC-201ENST00000348564 KIF15Q9NS87 1388 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRC-201ENST00000348564 ABCC10Q5T3U5 1492 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRC-201ENST00000348564 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
PTPRC-201ENST00000348564 ABCC5O15440 1437 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRC-201ENST00000348564 PTPRKQ15262 1439 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRC-201ENST00000348564 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP6.09□□□□□ -1.43
PTPRC-201ENST00000348564 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.44
PTPRC-201ENST00000348564 NUTM2GQ5VZR2 741 aa6.09□□□□□ -1.44
PTPRC-201ENST00000348564 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.44
PTPRC-201ENST00000348564 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.44
PTPRC-201ENST00000348564 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa6.09□□□□□ -1.44
PTPRC-201ENST00000348564 CARD11Q9BXL7 1154 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRC-201ENST00000348564 BCL11AQ9H165 835 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRC-201ENST00000348564 C8orf37Q96NL8 207 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRC-201ENST00000348564 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP6.08□□□□□ -1.44
PTPRC-201ENST00000348564 ITSN2Q9NZM3 1697 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRC-201ENST00000348564 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP6.08□□□□□ -1.44
PTPRC-201ENST00000348564 CADPS2Q86UW7 1296 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRC-201ENST00000348564 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRC-201ENST00000348564 C9orf84Q5VXU9 1444 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRC-201ENST00000348564 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP6.07□□□□□ -1.44
PTPRC-201ENST00000348564 TTC37Q6PGP7 1564 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRC-201ENST00000348564 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRC-201ENST00000348564 HFM1A2PYH4 1435 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRC-201ENST00000348564 PDE3BQ13370 1112 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRC-201ENST00000348564 TMEM132EQ6IEE7 984 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
PTPRC-201ENST00000348564 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
PTPRC-201ENST00000348564 NAIPQ13075 1403 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRC-201ENST00000348564 CCDC141Q6ZP82 1450 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRC-201ENST00000348564 FOXO3O43524 673 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRC-201ENST00000348564 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
PTPRC-201ENST00000348564 PRDM11Q9NQV5 511 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRC-201ENST00000348564 TNRQ92752 1358 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRC-201ENST00000348564 IDI1Q13907 227 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRC-201ENST00000348564 SIN3AQ96ST3 1273 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRC-201ENST00000348564 MPHOSPH9Q99550 1183 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRC-201ENST00000348564 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRC-201ENST00000348564 SYCP2Q9BX26 1530 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRC-201ENST00000348564 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRC-201ENST00000348564 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP6.05□□□□□ -1.44
PTPRC-201ENST00000348564 ROCK1Q13464 1354 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRC-201ENST00000348564 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRC-201ENST00000348564 AMPHP49418 695 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRC-201ENST00000348564 MSH6P52701 1360 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRC-201ENST00000348564 NCOA1Q15788 1441 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRC-201ENST00000348564 TSPOAP1O95153 1857 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-201ENST00000348564 ZMYM3Q14202 1370 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-201ENST00000348564 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-201ENST00000348564 MYO5CQ9NQX4 1742 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-201ENST00000348564 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-201ENST00000348564 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-201ENST00000348564 CDCA8Q53HL2 280 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-201ENST00000348564 FBXO41Q8TF61 875 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-201ENST00000348564 CLSPNQ9HAW4 1339 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-201ENST00000348564 PREX2Q70Z35 1606 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-201ENST00000348564 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-201ENST00000348564 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-201ENST00000348564 GPRASP1Q5JY77 1395 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-201ENST00000348564 NLRP2Q9NX02 1062 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-201ENST00000348564 KDM6BO15054 1643 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-201ENST00000348564 MBD5Q9P267 1494 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-201ENST00000348564 NLRP6P59044 892 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-201ENST00000348564 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-201ENST00000348564 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-201ENST00000348564 ABTB2Q8N961 1025 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-201ENST00000348564 MAPKBP1O60336 1514 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRC-201ENST00000348564 ABCA9Q8IUA7 1624 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRC-201ENST00000348564 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRC-201ENST00000348564 FAM135AQ9P2D6 1515 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRC-201ENST00000348564 KNSTRNQ9Y448 316 aa6□□□□□ -1.45
PTPRC-201ENST00000348564 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa6□□□□□ -1.45
PTPRC-201ENST00000348564 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
PTPRC-201ENST00000348564 SHANK2Q9UPX8 1470 aa6□□□□□ -1.45
PTPRC-201ENST00000348564 CCDC144AA2RUR9 1427 aa6□□□□□ -1.45
PTPRC-201ENST00000348564 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
PTPRC-201ENST00000348564 C19orf44Q9H6X5 657 aa6□□□□□ -1.45
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