RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000291906.4

PKN3-201, Transcript of protein kinase N3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PKN3, Length 3,375 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKN3-201ENST00000291906 NBPF1Q3BBV0 1214 aa23.25■■□□□ 1.31
PKN3-201ENST00000291906 ASXL2Q76L83 1435 aa23.25■■□□□ 1.31
PKN3-201ENST00000291906 SCAPERQ9BY12 1400 aa23.25■■□□□ 1.31
PKN3-201ENST00000291906 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa23.24■■□□□ 1.31
PKN3-201ENST00000291906 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
PKN3-201ENST00000291906 FANCAO15360 1455 aa23.23■■□□□ 1.31
PKN3-201ENST00000291906 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
PKN3-201ENST00000291906 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa23.22■■□□□ 1.31
PKN3-201ENST00000291906 KDM5DQ9BY66 1539 aa23.19■■□□□ 1.3
PKN3-201ENST00000291906 ABCC1P33527 1531 aa23.18■■□□□ 1.3
PKN3-201ENST00000291906 DUOX2Q9NRD8 1548 aa23.18■■□□□ 1.3
PKN3-201ENST00000291906 FKBP8Q14318 412 aa23.18■■□□□ 1.3
PKN3-201ENST00000291906 CYB5RLQ6IPT4 315 aa23.17■■□□□ 1.3
PKN3-201ENST00000291906 ADGRL1O94910 1474 aa23.16■■□□□ 1.3
PKN3-201ENST00000291906 PLA2R1Q13018 1463 aa23.15■■□□□ 1.3
PKN3-201ENST00000291906 MAST1Q9Y2H9 1570 aa23.14■■□□□ 1.29
PKN3-201ENST00000291906 NEFLP07196 543 aa23.13■■□□□ 1.29
PKN3-201ENST00000291906 CHGAP10645 457 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
PKN3-201ENST00000291906 GGT6Q6P531 493 aa23.12■■□□□ 1.29
PKN3-201ENST00000291906 ERBINQ96RT1 1412 aa23.12■■□□□ 1.29
PKN3-201ENST00000291906 RALGAPBQ86X10 1494 aa23.1■■□□□ 1.29
PKN3-201ENST00000291906 PLXNC1O60486 1568 aa23.1■■□□□ 1.29
PKN3-201ENST00000291906 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa23.09■■□□□ 1.29
PKN3-201ENST00000291906 KANK1Q14678 1352 aa23.09■■□□□ 1.29
PKN3-201ENST00000291906 RAPGEF3O95398 923 aa23.07■■□□□ 1.28
PKN3-201ENST00000291906 BCORL1Q5H9F3 1711 aa23.07■■□□□ 1.28
PKN3-201ENST00000291906 CD109Q6YHK3 1445 aa23.06■■□□□ 1.28
PKN3-201ENST00000291906 UNC13BO14795 1591 aa23.06■■□□□ 1.28
PKN3-201ENST00000291906 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP23.05■■□□□ 1.28
PKN3-201ENST00000291906 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP23.05■■□□□ 1.28
PKN3-201ENST00000291906 A2MP01023 1474 aa23.05■■□□□ 1.28
PKN3-201ENST00000291906 PRAG1Q86YV5 1406 aa23.04■■□□□ 1.28
PKN3-201ENST00000291906 KDM5CP41229 1560 aa23.03■■□□□ 1.28
PKN3-201ENST00000291906 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa23.03■■□□□ 1.28
PKN3-201ENST00000291906 ATP7AQ04656 1500 aa23.02■■□□□ 1.28
PKN3-201ENST00000291906 IQGAP3Q86VI3 1631 aa23.01■■□□□ 1.27
PKN3-201ENST00000291906 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa23.01■■□□□ 1.27
PKN3-201ENST00000291906 TMC1Q8TDI8 760 aa23■■□□□ 1.27
PKN3-201ENST00000291906 ABCA9Q8IUA7 1624 aa22.98■■□□□ 1.27
PKN3-201ENST00000291906 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
PKN3-201ENST00000291906 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.27
PKN3-201ENST00000291906 ARAP3Q8WWN8 1544 aa22.94■■□□□ 1.26
PKN3-201ENST00000291906 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
PKN3-201ENST00000291906 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
PKN3-201ENST00000291906 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
PKN3-201ENST00000291906 MAGI2Q86UL8 1455 aa22.91■■□□□ 1.26
PKN3-201ENST00000291906 TMF1P82094 1093 aa22.91■■□□□ 1.26
PKN3-201ENST00000291906 ATP10AO60312 1499 aa22.91■■□□□ 1.26
PKN3-201ENST00000291906 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa22.91■■□□□ 1.26
PKN3-201ENST00000291906 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
PKN3-201ENST00000291906 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
PKN3-201ENST00000291906 DISP3Q9P2K9 1392 aa22.89■■□□□ 1.26
PKN3-201ENST00000291906 CFAP70Q5T0N1 1121 aa22.89■■□□□ 1.25
PKN3-201ENST00000291906 E9PCH4 1651 aa22.89■■□□□ 1.25
PKN3-201ENST00000291906 PANK3Q9H999 370 aa22.89■■□□□ 1.25
PKN3-201ENST00000291906 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa22.88■■□□□ 1.25
PKN3-201ENST00000291906 TESK2Q96S53 571 aa22.87■■□□□ 1.25
PKN3-201ENST00000291906 FAM69CQ0P6D2 419 aa22.87■■□□□ 1.25
PKN3-201ENST00000291906 UGGT1Q9NYU2 1555 aa22.86■■□□□ 1.25
PKN3-201ENST00000291906 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa22.86■■□□□ 1.25
PKN3-201ENST00000291906 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
PKN3-201ENST00000291906 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
PKN3-201ENST00000291906 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa22.84■■□□□ 1.25
PKN3-201ENST00000291906 GPRASP1Q5JY77 1395 aa22.8■■□□□ 1.24
PKN3-201ENST00000291906 POGZQ7Z3K3 1410 aa22.8■■□□□ 1.24
PKN3-201ENST00000291906 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa22.8■■□□□ 1.24
PKN3-201ENST00000291906 CLTCL1P53675 1640 aa22.79■■□□□ 1.24
PKN3-201ENST00000291906 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
PKN3-201ENST00000291906 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
PKN3-201ENST00000291906 RALBP1Q15311 655 aa22.78■■□□□ 1.24
PKN3-201ENST00000291906 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
PKN3-201ENST00000291906 TRPM2O94759 1503 aa22.78■■□□□ 1.24
PKN3-201ENST00000291906 PTPRTO14522 1441 aa22.78■■□□□ 1.24
PKN3-201ENST00000291906 ZBED9Q6R2W3 1325 aa22.77■■□□□ 1.24
PKN3-201ENST00000291906 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa22.76■■□□□ 1.23
PKN3-201ENST00000291906 TET3O43151 1660 aa22.75■■□□□ 1.23
PKN3-201ENST00000291906 TRAK1Q9UPV9 953 aa22.75■■□□□ 1.23
PKN3-201ENST00000291906 TMEM132EQ6IEE7 984 aa22.75■■□□□ 1.23
PKN3-201ENST00000291906 MLECQ14165 292 aa22.74■■□□□ 1.23
PKN3-201ENST00000291906 KNSTRNQ9Y448 316 aa22.74■■□□□ 1.23
PKN3-201ENST00000291906 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
PKN3-201ENST00000291906 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
PKN3-201ENST00000291906 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
PKN3-201ENST00000291906 NLRP13Q86W25 1043 aa22.71■■□□□ 1.23
PKN3-201ENST00000291906 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
PKN3-201ENST00000291906 DEPDC5O75140 1603 aa22.71■■□□□ 1.23
PKN3-201ENST00000291906 MROH1Q8NDA8 1641 aa22.69■■□□□ 1.22
PKN3-201ENST00000291906 NOS1P29475 1434 aa22.69■■□□□ 1.22
PKN3-201ENST00000291906 CEP152O94986 1710 aa22.69■■□□□ 1.22
PKN3-201ENST00000291906 NPATQ14207 1427 aa22.68■■□□□ 1.22
PKN3-201ENST00000291906 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP22.68■■□□□ 1.22
PKN3-201ENST00000291906 YEATS2Q9ULM3 1422 aa22.68■■□□□ 1.22
PKN3-201ENST00000291906 MLH3Q9UHC1 1453 aa22.67■■□□□ 1.22
PKN3-201ENST00000291906 CDCA8Q53HL2 280 aa22.67■■□□□ 1.22
PKN3-201ENST00000291906 STAC3Q96MF2 364 aa22.67■■□□□ 1.22
PKN3-201ENST00000291906 HECW2Q9P2P5 1572 aa22.66■■□□□ 1.22
PKN3-201ENST00000291906 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
PKN3-201ENST00000291906 VWDEQ8N2E2 1590 aa22.66■■□□□ 1.22
PKN3-201ENST00000291906 MADDQ8WXG6 1647 aa22.65■■□□□ 1.22
PKN3-201ENST00000291906 EFCAB6Q5THR3 1501 aa22.65■■□□□ 1.22
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