RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000212015.10

SIRT1-201, Transcript of sirtuin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SIRT1, Length 4,094 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1-201ENST00000212015 PDS5BQ9NTI5 1447 aa22.55■■□□□ 1.2
SIRT1-201ENST00000212015 HMGXB3Q12766 1538 aa22.55■■□□□ 1.2
SIRT1-201ENST00000212015 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
SIRT1-201ENST00000212015 HSCBQ8IWL3 235 aa22.54■■□□□ 1.2
SIRT1-201ENST00000212015 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.19
SIRT1-201ENST00000212015 CDCA8Q53HL2 280 aa22.51■■□□□ 1.19
SIRT1-201ENST00000212015 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
SIRT1-201ENST00000212015 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
SIRT1-201ENST00000212015 GAPVD1Q14C86 1478 aa22.5■■□□□ 1.19
SIRT1-201ENST00000212015 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa22.5■■□□□ 1.19
SIRT1-201ENST00000212015 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP22.49■■□□□ 1.19
SIRT1-201ENST00000212015 MYH16Q9H6N6 1097 aa22.49■■□□□ 1.19
SIRT1-201ENST00000212015 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP22.48■■□□□ 1.19
SIRT1-201ENST00000212015 PTPN23Q9H3S7 1636 aa22.46■■□□□ 1.19
SIRT1-201ENST00000212015 MORC1Q86VD1 984 aa22.46■■□□□ 1.19
SIRT1-201ENST00000212015 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa22.46■■□□□ 1.19
SIRT1-201ENST00000212015 ITPRIPQ8IWB1 547 aa22.45■■□□□ 1.18
SIRT1-201ENST00000212015 GOLGA6L22H0YM25 854 aa22.45■■□□□ 1.18
SIRT1-201ENST00000212015 TOPBP1Q92547 1522 aa22.44■■□□□ 1.18
SIRT1-201ENST00000212015 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa22.43■■□□□ 1.18
SIRT1-201ENST00000212015 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
SIRT1-201ENST00000212015 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP22.42■■□□□ 1.18
SIRT1-201ENST00000212015 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
SIRT1-201ENST00000212015 APBB1O00213 710 aa22.41■■□□□ 1.18
SIRT1-201ENST00000212015 CFAP53Q96M91 514 aa22.41■■□□□ 1.18
SIRT1-201ENST00000212015 ERCC6Q03468 1493 aa22.4■■□□□ 1.18
SIRT1-201ENST00000212015 MAP3K1Q13233 1512 aa22.4■■□□□ 1.18
SIRT1-201ENST00000212015 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
SIRT1-201ENST00000212015 CCDC144AA2RUR9 1427 aa22.38■■□□□ 1.17
SIRT1-201ENST00000212015 PTMAP06454 111 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
SIRT1-201ENST00000212015 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa22.36■■□□□ 1.17
SIRT1-201ENST00000212015 FAM43AQ8N2R8 423 aa22.36■■□□□ 1.17
SIRT1-201ENST00000212015 SMC4Q9NTJ3 1288 aa22.36■■□□□ 1.17
SIRT1-201ENST00000212015 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
SIRT1-201ENST00000212015 PPP2R1AP30153 589 aa22.36■■□□□ 1.17
SIRT1-201ENST00000212015 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa22.35■■□□□ 1.17
SIRT1-201ENST00000212015 MSNP26038 577 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
SIRT1-201ENST00000212015 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa22.35■■□□□ 1.17
SIRT1-201ENST00000212015 E9PSI1 815 aa22.34■■□□□ 1.17
SIRT1-201ENST00000212015 PLCB2Q00722 1185 aa22.34■■□□□ 1.17
SIRT1-201ENST00000212015 CGNL1Q0VF96 1302 aa22.33■■□□□ 1.17
SIRT1-201ENST00000212015 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
SIRT1-201ENST00000212015 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
SIRT1-201ENST00000212015 JPH4Q96JJ6 628 aa22.32■■□□□ 1.16
SIRT1-201ENST00000212015 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
SIRT1-201ENST00000212015 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
SIRT1-201ENST00000212015 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
SIRT1-201ENST00000212015 DAPK1P53355 1430 aa22.29■■□□□ 1.16
SIRT1-201ENST00000212015 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa22.29■■□□□ 1.16
SIRT1-201ENST00000212015 TRAK2O60296 914 aa22.29■■□□□ 1.16
SIRT1-201ENST00000212015 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa22.28■■□□□ 1.16
SIRT1-201ENST00000212015 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
SIRT1-201ENST00000212015 IGHDP01880 384 aa22.27■■□□□ 1.16
SIRT1-201ENST00000212015 C8orf34Q49A92 452 aa22.27■■□□□ 1.16
SIRT1-201ENST00000212015 GBP4Q96PP9 640 aa22.27■■□□□ 1.16
SIRT1-201ENST00000212015 MIA2Q96PC5 1412 aa22.27■■□□□ 1.16
SIRT1-201ENST00000212015 RNF123Q5XPI4 1314 aa22.27■■□□□ 1.16
SIRT1-201ENST00000212015 C22orf23Q9BZE7 217 aa22.26■■□□□ 1.15
SIRT1-201ENST00000212015 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa22.26■■□□□ 1.15
SIRT1-201ENST00000212015 SEC24BO95487 1268 aa22.26■■□□□ 1.15
SIRT1-201ENST00000212015 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
SIRT1-201ENST00000212015 TRAK1Q9UPV9 953 aa22.25■■□□□ 1.15
SIRT1-201ENST00000212015 EFCAB5A4FU69 1503 aa22.25■■□□□ 1.15
SIRT1-201ENST00000212015 DUSP27Q5VZP5 1158 aa22.25■■□□□ 1.15
SIRT1-201ENST00000212015 PKNOX2Q96KN3 472 aa22.25■■□□□ 1.15
SIRT1-201ENST00000212015 PANK2Q9BZ23 570 aa22.25■■□□□ 1.15
SIRT1-201ENST00000212015 LNPKQ9C0E8 428 aa22.24■■□□□ 1.15
SIRT1-201ENST00000212015 CHMP5Q9NZZ3 219 aa22.24■■□□□ 1.15
SIRT1-201ENST00000212015 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa22.24■■□□□ 1.15
SIRT1-201ENST00000212015 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
SIRT1-201ENST00000212015 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
SIRT1-201ENST00000212015 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa22.23■■□□□ 1.15
SIRT1-201ENST00000212015 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
SIRT1-201ENST00000212015 ABCC5O15440 1437 aa22.22■■□□□ 1.15
SIRT1-201ENST00000212015 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
SIRT1-201ENST00000212015 STK26Q9P289 416 aa22.21■■□□□ 1.15
SIRT1-201ENST00000212015 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa22.21■■□□□ 1.15
SIRT1-201ENST00000212015 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
SIRT1-201ENST00000212015 FAM13BQ9NYF5 915 aa22.2■■□□□ 1.14
SIRT1-201ENST00000212015 SLFN5Q08AF3 891 aa22.19■■□□□ 1.14
SIRT1-201ENST00000212015 ANKRD45Q5TZF3 282 aa22.18■■□□□ 1.14
SIRT1-201ENST00000212015 DNMBPQ6XZF7 1577 aa22.18■■□□□ 1.14
SIRT1-201ENST00000212015 MCM4P33991 863 aa22.18■■□□□ 1.14
SIRT1-201ENST00000212015 TCP11L2Q8N4U5 519 aa22.17■■□□□ 1.14
SIRT1-201ENST00000212015 TBC1D2Q9BYX2 928 aa22.17■■□□□ 1.14
SIRT1-201ENST00000212015 DDX11L8A8MPP1 907 aa22.16■■□□□ 1.14
SIRT1-201ENST00000212015 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
SIRT1-201ENST00000212015 RBM10P98175 930 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
SIRT1-201ENST00000212015 PRDM2Q13029 1718 aa22.16■■□□□ 1.14
SIRT1-201ENST00000212015 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa22.16■■□□□ 1.14
SIRT1-201ENST00000212015 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
SIRT1-201ENST00000212015 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
SIRT1-201ENST00000212015 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
SIRT1-201ENST00000212015 STAG3Q9UJ98 1225 aa22.15■■□□□ 1.14
SIRT1-201ENST00000212015 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
SIRT1-201ENST00000212015 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
SIRT1-201ENST00000212015 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
SIRT1-201ENST00000212015 MRE11P49959 708 aa22.13■■□□□ 1.13
SIRT1-201ENST00000212015 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
SIRT1-201ENST00000212015 TNNQ9UQP3 1299 aa22.13■■□□□ 1.13
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