RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000074721.5

Hoxd8-202, Transcript of Homeobox protein Hox-D8, mousemouse

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxd8, Length 1,758 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 NpatQ8BMA5 1420 aa45.21■■■■■ 4.83
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 ShprhQ7TPQ3 1674 aa45.21■■■■■ 4.83
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Map4P27546 1125 aaKnown RBP45.19■■■■■ 4.82
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Plch2A2AP18 1501 aa45.19■■■■■ 4.82
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Ttll5Q8CHB8 1328 aa45.17■■■■■ 4.82
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Mphosph9A6H5Y1 991 aa45.15■■■■■ 4.82
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Asxl1P59598 1514 aa45.14■■■■■ 4.82
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Uggt2E9Q4X2 1504 aa45.13■■■■■ 4.82
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Pde4cQ3UEI1 686 aa45.11■■■■■ 4.81
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Supt6hQ62383 1726 aaKnown RBP45.11■■■■■ 4.81
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Clstn2Q9ER65 966 aa45.1■■■■■ 4.81
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Cfap65Q3V0B4 1847 aa45.09■■■■■ 4.81
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Lamc1P02468 1607 aaKnown RBP45.09■■■■■ 4.81
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Kif1bQ60575 1816 aaKnown RBP45.07■■■■■ 4.81
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Myo5cE9Q1F5 1742 aa45.05■■■■■ 4.8
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Robo2Q7TPD3 1470 aa45.02■■■■■ 4.8
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Eid3Q3V124 375 aa45.01■■■■■ 4.8
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Hnrnpul2Q00PI9 745 aaKnown RBP45■■■■■ 4.79
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Adamtsl3G3UXC7 1706 aa45■■■■■ 4.79
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Kif21bQ9QXL1 1668 aa45■■■■■ 4.79
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Ankrd36D3Z4K0 1415 aa44.96■■■■■ 4.79
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 PtprgQ05909 1442 aa44.96■■■■■ 4.79
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Trak1Q6PD31 939 aa44.94■■■■■ 4.79
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Abca6Q8K441 1624 aa44.9■■■■■ 4.78
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Naip5Q9R016 1403 aa44.89■■■■■ 4.78
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Camsap2Q8C1B1 1461 aa44.88■■■■■ 4.78
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Prex1Q69ZK0 1650 aa44.86■■■■■ 4.77
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Cd109Q8R422 1442 aa44.86■■■■■ 4.77
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 NefmP08553 848 aa44.86■■■■■ 4.77
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Alpk3Q924C5 1678 aa44.86■■■■■ 4.77
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Afap1Q80YS6 731 aa44.82■■■■■ 4.76
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Pkd2O35245 966 aa44.81■■■■■ 4.76
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Tmem131lQ3U3D7 1597 aa44.8■■■■■ 4.76
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Myom3A2ABU4 1439 aa44.8■■■■■ 4.76
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Dhx9O70133 1380 aaKnown RBP44.76■■■■■ 4.76
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Ylpm1Q9R0I7 1386 aaKnown RBP44.74■■■■■ 4.75
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Nsd2Q8BVE8 1365 aa44.73■■■■■ 4.75
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 AnkarA2RT91 1465 aa44.71■■■■■ 4.75
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Atp7aQ64430 1491 aa44.69■■■■■ 4.75
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Ttc21bQ0HA38 1315 aa44.67■■■■■ 4.74
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 CltcQ68FD5 1675 aaKnown RBP44.64■■■■■ 4.74
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Adamts7Q68SA9 1657 aa44.59■■■■■ 4.73
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Hspa5P20029 655 aaKnown RBP44.59■■■■■ 4.73
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Rsph4aQ8BYM7 716 aa44.58■■■■■ 4.73
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 RictorQ6QI06 1708 aa44.57■■■■■ 4.72
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Arhgap23Q69ZH9 1483 aa44.55■■■■■ 4.72
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Myom2Q14BI5 1463 aa44.54■■■■■ 4.72
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Safb2Q80YR5 991 aaKnown RBP44.53■■■■■ 4.72
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Pik3c2gO70167 1506 aa44.52■■■■■ 4.72
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Rprd2Q6NXI6 1469 aaKnown RBP44.48■■■■■ 4.71
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Talpid3E9PV87 1520 aa44.47■■■■■ 4.71
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Dot1lQ6XZL8 1540 aa44.47■■■■■ 4.71
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Edc4Q3UJB9 1406 aaKnown RBP44.47■■■■■ 4.71
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 MlecQ6ZQI3 291 aaKnown RBP44.46■■■■■ 4.71
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Tarbp1E9Q368 1579 aa44.45■■■■■ 4.71
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Knl1Q66JQ7 1612 aa44.45■■■■■ 4.71
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Hfm1D3Z4R1 1434 aa44.45■■■■■ 4.71
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Usp47Q8BY87 1376 aa44.45■■■■■ 4.71
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Iqgap3F8VQ29 1632 aa44.43■■■■■ 4.7
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Akap12Q9WTQ5 1684 aa44.42■■■■■ 4.7
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Ino80Q6ZPV2 1559 aa44.37■■■■■ 4.69
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Erich6D3Z6S9 713 aa44.37■■■■■ 4.69
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Rpgrip1Q9EPQ2 1331 aa44.37■■■■■ 4.69
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 DroshaQ5HZJ0 1373 aaKnown RBP44.36■■■■■ 4.69
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 TonslQ6NZL6 1363 aa44.35■■■■■ 4.69
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Tecpr2Q3UH45 1423 aa44.33■■■■■ 4.69
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Med14A2ABV5 1459 aaKnown RBP44.3■■■■■ 4.68
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Ppip5k1A2ARP1 1436 aa44.29■■■■■ 4.68
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Prdm2A2A7B5 1709 aaKnown RBP44.28■■■■■ 4.68
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Rock1P70335 1354 aa44.24■■■■■ 4.67
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Dip2bQ3UH60 1574 aa44.23■■■■■ 4.67
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Abca8aQ8K442 1620 aa44.22■■■■■ 4.67
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Sall3Q62255 1320 aa44.21■■■■■ 4.67
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Adgrb3Q80ZF8 1522 aa44.19■■■■■ 4.67
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 ErbinQ80TH2 1402 aa44.19■■■■■ 4.66
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Ahdc1Q6PAL7 1594 aaKnown RBP44.19■■■■■ 4.66
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Skint5A7XUY5 1461 aa44.18■■■■■ 4.66
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Stk24Q99KH8 431 aa44.18■■■■■ 4.66
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Hdac5Q9Z2V6 1113 aa44.18■■■■■ 4.66
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Washc2Q6PGL7 1334 aa44.17■■■■■ 4.66
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Gm13697A2AK42 830 aa44.17■■■■■ 4.66
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Abcc6Q9R1S7 1498 aa44.16■■■■■ 4.66
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 MyclP10166 368 aa44.15■■■■■ 4.66
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Rgl3Q3UYI5 709 aa44.14■■■■■ 4.66
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Ercc6l2Q9JIM3 1537 aa44.13■■■■■ 4.66
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Efcab6Q6P1E8 1516 aa44.13■■■■■ 4.65
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 4930407I10RikD3Z5T8 1512 aa44.12■■■■■ 4.65
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Uggt1Q6P5E4 1551 aa44.09■■■■■ 4.65
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Ehbp1l1Q99MS7 1716 aa44.08■■■■■ 4.65
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 AatkQ80YE4 1365 aa44.06■■■■■ 4.64
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 PtprmP28828 1452 aa44■■■■■ 4.63
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Kif13aQ9EQW7 1749 aa43.99■■■■■ 4.63
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Itsn1Q9Z0R4 1714 aa43.99■■■■■ 4.63
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Mroh3A0A1D5RM54 893 aa43.97■■■■■ 4.63
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Mroh1E0CZ22 1640 aa43.97■■■■■ 4.63
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Adamts13Q769J6 1426 aa43.97■■■■■ 4.63
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Bcl9Q9D219 1425 aa43.95■■■■■ 4.63
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Tulp4Q9JIL5 1547 aa43.91■■■■■ 4.62
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Naip7Q9JIB3 1402 aa43.88■■■■■ 4.62
Hoxd8-202ENSMUST00000074721 Chd2E9PZM4 1827 aaKnown RBP43.88■■■■■ 4.62
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 10.5 ms