RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000028972.8

Pdrg1-201, Transcript of p53 and DNA damage-regulated protein 1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pdrg1, Length 1,273 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdrg1-201ENSMUST00000028972 Myom2Q14BI5 1463 aa25.33■■□□□ 1.65
Pdrg1-201ENSMUST00000028972 Rsph4aQ8BYM7 716 aa25.32■■□□□ 1.64
Pdrg1-201ENSMUST00000028972 Rfx7F8VPJ6 1459 aa25.32■■□□□ 1.64
Pdrg1-201ENSMUST00000028972 Abca6Q8K441 1624 aa25.31■■□□□ 1.64
Pdrg1-201ENSMUST00000028972 Usp54Q8BL06 1588 aaKnown RBP25.31■■□□□ 1.64
Pdrg1-201ENSMUST00000028972 Cyb5rlB1AS42 316 aa25.3■■□□□ 1.64
Pdrg1-201ENSMUST00000028972 Trpm2Q91YD4 1506 aa25.3■■□□□ 1.64
Pdrg1-201ENSMUST00000028972 Zbtb7cQ8VCZ7 619 aa25.29■■□□□ 1.64
Pdrg1-201ENSMUST00000028972 Ehmt2Q9Z148 1263 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
Pdrg1-201ENSMUST00000028972 CltcQ68FD5 1675 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
Pdrg1-201ENSMUST00000028972 Naip5Q9R016 1403 aa25.24■■□□□ 1.63
Pdrg1-201ENSMUST00000028972 Vps8Q0P5W1 1427 aa25.22■■□□□ 1.63
Pdrg1-201ENSMUST00000028972 Mia2Q91ZV0 1396 aa25.21■■□□□ 1.63
Pdrg1-201ENSMUST00000028972 Hnrnpul2Q00PI9 745 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
Pdrg1-201ENSMUST00000028972 RictorQ6QI06 1708 aa25.19■■□□□ 1.62
Pdrg1-201ENSMUST00000028972 ShprhQ7TPQ3 1674 aa25.19■■□□□ 1.62
Pdrg1-201ENSMUST00000028972 Ahdc1Q6PAL7 1594 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
Pdrg1-201ENSMUST00000028972 Clstn2Q9ER65 966 aa25.16■■□□□ 1.62
Pdrg1-201ENSMUST00000028972 Knl1Q66JQ7 1612 aa25.15■■□□□ 1.62
Pdrg1-201ENSMUST00000028972 Myo5cE9Q1F5 1742 aa25.15■■□□□ 1.62
Pdrg1-201ENSMUST00000028972 Dip2bQ3UH60 1574 aa25.15■■□□□ 1.62
Pdrg1-201ENSMUST00000028972 Kif1bQ60575 1816 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
Pdrg1-201ENSMUST00000028972 Pde4cQ3UEI1 686 aa25.15■■□□□ 1.62
Pdrg1-201ENSMUST00000028972 4930407I10RikD3Z5T8 1512 aa25.14■■□□□ 1.62
Pdrg1-201ENSMUST00000028972 Gm13697A2AK42 830 aa25.12■■□□□ 1.61
Pdrg1-201ENSMUST00000028972 Nup155Q99P88 1391 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
Pdrg1-201ENSMUST00000028972 Ube2uB1AUC4 352 aa25.11■■□□□ 1.61
Pdrg1-201ENSMUST00000028972 Fhad1A6PWD2 1420 aa25.11■■□□□ 1.61
Pdrg1-201ENSMUST00000028972 AlkP97793 1621 aa25.1■■□□□ 1.61
Pdrg1-201ENSMUST00000028972 Arhgap23Q69ZH9 1483 aa25.09■■□□□ 1.61
Pdrg1-201ENSMUST00000028972 Ercc6l2Q9JIM3 1537 aa25.09■■□□□ 1.61
Pdrg1-201ENSMUST00000028972 Map4P27546 1125 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
Pdrg1-201ENSMUST00000028972 Prex1Q69ZK0 1650 aa25.09■■□□□ 1.61
Pdrg1-201ENSMUST00000028972 Zfp644E9QA22 1323 aa25.06■■□□□ 1.6
Pdrg1-201ENSMUST00000028972 Med14A2ABV5 1459 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
Pdrg1-201ENSMUST00000028972 Adamts7Q68SA9 1657 aa25.04■■□□□ 1.6
Pdrg1-201ENSMUST00000028972 Hfm1D3Z4R1 1434 aa25.03■■□□□ 1.6
Pdrg1-201ENSMUST00000028972 Bcl9Q9D219 1425 aa25.03■■□□□ 1.6
Pdrg1-201ENSMUST00000028972 Topaz1E5FYH1 1653 aa25.02■■□□□ 1.6
Pdrg1-201ENSMUST00000028972 Abcc6Q9R1S7 1498 aa25■■□□□ 1.59
Pdrg1-201ENSMUST00000028972 Asxl1P59598 1514 aa24.96■■□□□ 1.59
Pdrg1-201ENSMUST00000028972 Robo2Q7TPD3 1470 aa24.96■■□□□ 1.59
Pdrg1-201ENSMUST00000028972 Ylpm1Q9R0I7 1386 aaKnown RBP24.96■■□□□ 1.59
Pdrg1-201ENSMUST00000028972 Nsd2Q8BVE8 1365 aa24.95■■□□□ 1.59
Pdrg1-201ENSMUST00000028972 Ttc21bQ0HA38 1315 aa24.94■■□□□ 1.58
Pdrg1-201ENSMUST00000028972 Ttll5Q8CHB8 1328 aa24.93■■□□□ 1.58
Pdrg1-201ENSMUST00000028972 Myom3A2ABU4 1439 aa24.93■■□□□ 1.58
Pdrg1-201ENSMUST00000028972 Tmem131lQ3U3D7 1597 aa24.92■■□□□ 1.58
Pdrg1-201ENSMUST00000028972 Akap12Q9WTQ5 1684 aa24.91■■□□□ 1.58
Pdrg1-201ENSMUST00000028972 AnkarA2RT91 1465 aa24.9■■□□□ 1.58
Pdrg1-201ENSMUST00000028972 Cd109Q8R422 1442 aa24.9■■□□□ 1.58
Pdrg1-201ENSMUST00000028972 GphnQ8BUV3 769 aaKnown RBP24.88■■□□□ 1.57
Pdrg1-201ENSMUST00000028972 Dip2aQ8BWT5 1523 aa24.87■■□□□ 1.57
Pdrg1-201ENSMUST00000028972 Scn4aQ9ER60 1841 aa24.86■■□□□ 1.57
Pdrg1-201ENSMUST00000028972 Adgrb3Q80ZF8 1522 aa24.86■■□□□ 1.57
Pdrg1-201ENSMUST00000028972 PtprgQ05909 1442 aa24.86■■□□□ 1.57
Pdrg1-201ENSMUST00000028972 Trak1Q6PD31 939 aa24.84■■□□□ 1.57
Pdrg1-201ENSMUST00000028972 Lamc1P02468 1607 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
Pdrg1-201ENSMUST00000028972 Mphosph9A6H5Y1 991 aa24.78■■□□□ 1.56
Pdrg1-201ENSMUST00000028972 Erich6D3Z6S9 713 aa24.78■■□□□ 1.56
Pdrg1-201ENSMUST00000028972 Ccer2J3QPU5 274 aa24.78■■□□□ 1.56
Pdrg1-201ENSMUST00000028972 Ino80Q6ZPV2 1559 aa24.78■■□□□ 1.56
Pdrg1-201ENSMUST00000028972 Skint5A7XUY5 1461 aa24.77■■□□□ 1.56
Pdrg1-201ENSMUST00000028972 Chd2E9PZM4 1827 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
Pdrg1-201ENSMUST00000028972 Rimbp3Q3V0F0 1606 aa24.75■■□□□ 1.55
Pdrg1-201ENSMUST00000028972 Kdm5aQ3UXZ9 1690 aa24.75■■□□□ 1.55
Pdrg1-201ENSMUST00000028972 Tarbp1E9Q368 1579 aa24.74■■□□□ 1.55
Pdrg1-201ENSMUST00000028972 Iqgap3F8VQ29 1632 aa24.73■■□□□ 1.55
Pdrg1-201ENSMUST00000028972 Atp7aQ64430 1491 aa24.73■■□□□ 1.55
Pdrg1-201ENSMUST00000028972 Tecpr2Q3UH45 1423 aa24.73■■□□□ 1.55
Pdrg1-201ENSMUST00000028972 Ncoa1P70365 1447 aa24.72■■□□□ 1.55
Pdrg1-201ENSMUST00000028972 Pip4k2bQ80XI4 416 aa24.72■■□□□ 1.55
Pdrg1-201ENSMUST00000028972 Efcab6Q6P1E8 1516 aa24.71■■□□□ 1.55
Pdrg1-201ENSMUST00000028972 DroshaQ5HZJ0 1373 aaKnown RBP24.7■■□□□ 1.55
Pdrg1-201ENSMUST00000028972 Phlpp1Q8CHE4 1687 aa24.69■■□□□ 1.54
Pdrg1-201ENSMUST00000028972 Kif21bQ9QXL1 1668 aa24.69■■□□□ 1.54
Pdrg1-201ENSMUST00000028972 Scaf11E9PZM7 1456 aaKnown RBP24.69■■□□□ 1.54
Pdrg1-201ENSMUST00000028972 Kif13aQ9EQW7 1749 aa24.67■■□□□ 1.54
Pdrg1-201ENSMUST00000028972 Mier1Q5UAK0 511 aa24.67■■□□□ 1.54
Pdrg1-201ENSMUST00000028972 Stk24Q99KH8 431 aa24.67■■□□□ 1.54
Pdrg1-201ENSMUST00000028972 Uggt1Q6P5E4 1551 aa24.67■■□□□ 1.54
Pdrg1-201ENSMUST00000028972 Arid4bA2CG63 1314 aaKnown RBP24.66■■□□□ 1.54
Pdrg1-201ENSMUST00000028972 Prdm2A2A7B5 1709 aaKnown RBP24.66■■□□□ 1.54
Pdrg1-201ENSMUST00000028972 Itsn1Q9Z0R4 1714 aa24.66■■□□□ 1.54
Pdrg1-201ENSMUST00000028972 Rims2Q9EQZ7 1530 aa24.66■■□□□ 1.54
Pdrg1-201ENSMUST00000028972 ErbinQ80TH2 1402 aa24.65■■□□□ 1.54
Pdrg1-201ENSMUST00000028972 Hdac5Q9Z2V6 1113 aa24.65■■□□□ 1.54
Pdrg1-201ENSMUST00000028972 Ltbp4Q8K4G1 1666 aa24.64■■□□□ 1.53
Pdrg1-201ENSMUST00000028972 Naip7Q9JIB3 1402 aa24.63■■□□□ 1.53
Pdrg1-201ENSMUST00000028972 Txndc2Q6P902 515 aa24.62■■□□□ 1.53
Pdrg1-201ENSMUST00000028972 Edc4Q3UJB9 1406 aaKnown RBP24.61■■□□□ 1.53
Pdrg1-201ENSMUST00000028972 Pkd2O35245 966 aa24.61■■□□□ 1.53
Pdrg1-201ENSMUST00000028972 Dhx9O70133 1380 aaKnown RBP24.61■■□□□ 1.53
Pdrg1-201ENSMUST00000028972 Pik3c2gO70167 1506 aa24.56■■□□□ 1.52
Pdrg1-201ENSMUST00000028972 Gemin5Q8BX17 1502 aaKnown RBP24.56■■□□□ 1.52
Pdrg1-201ENSMUST00000028972 Abca8aQ8K442 1620 aa24.56■■□□□ 1.52
Pdrg1-201ENSMUST00000028972 Prrc2bQ7TPM1 1486 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
Pdrg1-201ENSMUST00000028972 P3h3Q8CG70 732 aa24.54■■□□□ 1.52
Pdrg1-201ENSMUST00000028972 Sall3Q62255 1320 aa24.54■■□□□ 1.52
Pdrg1-201ENSMUST00000028972 Gm13695A2AK44 830 aa24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 14.3 ms