RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000001226.9

Sh3bp1-201, Transcript of SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

TSL 5 BASIC

Gene Sh3bp1, Length 2,510 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 PtprgQ05909 1442 aa23.1■■□□□ 1.29
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Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Adgrl2Q8JZZ7 1487 aa23.08■■□□□ 1.29
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Rock2P70336 1388 aa23.08■■□□□ 1.29
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ssh2Q5SW75 1423 aa23.08■■□□□ 1.28
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Rusc2Q80U22 1514 aa23.06■■□□□ 1.28
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Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Kcnh8P59111 1102 aa23.06■■□□□ 1.28
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Egfem1Q8C088 590 aa23.06■■□□□ 1.28
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Setd1aE9PYH6 1716 aa23.05■■□□□ 1.28
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Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Kdm5cP41230 1554 aa23.05■■□□□ 1.28
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Rock1P70335 1354 aa23.05■■□□□ 1.28
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Slc4a3P16283 1227 aa23.05■■□□□ 1.28
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gapvd1Q6PAR5 1458 aa23.03■■□□□ 1.28
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Tarbp1E9Q368 1579 aa23.02■■□□□ 1.28
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Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Mast1Q9R1L5 1570 aa22.99■■□□□ 1.27
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Zbtb7cQ8VCZ7 619 aa22.99■■□□□ 1.27
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Atp7aQ64430 1491 aa22.98■■□□□ 1.27
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Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Bcl11aQ9QYE3 773 aa22.97■■□□□ 1.27
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Trappc8E9PWG2 1437 aa22.97■■□□□ 1.27
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Kank1E9Q238 1360 aa22.96■■□□□ 1.27
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Rnf17Q99MV7 1640 aa22.96■■□□□ 1.27
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Arhgap5P97393 1501 aa22.95■■□□□ 1.27
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Cd109Q8R422 1442 aa22.95■■□□□ 1.26
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Rrp7aQ9D1C9 280 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
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Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ttbk1Q6PCN3 1308 aa22.9■■□□□ 1.26
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Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Adamts13Q769J6 1426 aa22.9■■□□□ 1.26
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Cdc42bpbQ7TT50 1713 aa22.88■■□□□ 1.25
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Neurl4Q5NCX5 1563 aa22.88■■□□□ 1.25
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Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ifnlr1Q8CGK5 535 aa22.87■■□□□ 1.25
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Clstn2Q9ER65 966 aa22.87■■□□□ 1.25
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Plch2A2AP18 1501 aa22.86■■□□□ 1.25
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Zscan21Q07231 555 aa22.86■■□□□ 1.25
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Sart1Q9Z315 806 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Hecw1Q8K4P8 1604 aa22.85■■□□□ 1.25
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Tcerg1Q8CGF7 1100 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ppip5k1A2ARP1 1436 aa22.84■■□□□ 1.25
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Zmym4A2A791 1549 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 PrxO55103 1391 aa22.84■■□□□ 1.25
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ak9G3UYQ4 1894 aa22.83■■□□□ 1.25
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Cfap74Q3UY96 1578 aa22.83■■□□□ 1.25
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Mak16Q8BGS0 296 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Mink1Q9JM52 1308 aa22.83■■□□□ 1.24
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Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Cep170Q6A065 1588 aa22.81■■□□□ 1.24
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Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Robo2Q7TPD3 1470 aa22.81■■□□□ 1.24
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Pank3Q8R2W9 370 aa22.8■■□□□ 1.24
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Abcc3B2RX12 1523 aa22.78■■□□□ 1.24
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Inpp5dQ9ES52 1191 aa22.77■■□□□ 1.24
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 NhsB1AV60 1647 aa22.77■■□□□ 1.24
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Anp32bQ9EST5 272 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
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Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Fgd6Q69ZL1 1399 aa22.75■■□□□ 1.23
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Tulp4Q9JIL5 1547 aa22.75■■□□□ 1.23
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 AI481877A2ALV5 1481 aa22.75■■□□□ 1.23
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Tex14Q7M6U3 1450 aa22.75■■□□□ 1.23
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Rad21Q61550 635 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Kiaa1210E9Q0C6 1637 aa22.74■■□□□ 1.23
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ipo9Q91YE6 1041 aa22.73■■□□□ 1.23
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 ShprhQ7TPQ3 1674 aa22.73■■□□□ 1.23
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Spag9Q58A65 1321 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Kif1bQ60575 1816 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Zscan10Q3URR7 782 aa22.71■■□□□ 1.23
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gm14025A2AP89 1413 aa22.71■■□□□ 1.23
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Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Pde4cQ3UEI1 686 aa22.7■■□□□ 1.22
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Abca17E9PX95 1733 aa22.7■■□□□ 1.22
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Upf2A2AT37 1269 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Prkrip1Q9CWV6 186 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Chd1P40201 1711 aa22.68■■□□□ 1.22
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Abca8bQ8K440 1620 aa22.67■■□□□ 1.22
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 TnikP83510 1323 aa22.67■■□□□ 1.22
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Map3k5O35099 1380 aa22.67■■□□□ 1.22
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Kidins220E9Q9B7 1793 aa22.67■■□□□ 1.22
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Xrn1P97789 1719 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Sbno1Q689Z5 1390 aa22.66■■□□□ 1.22
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Mroh3A0A1D5RM54 893 aa22.65■■□□□ 1.22
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gm16486A0A1D5RMD1 1434 aa22.64■■□□□ 1.22
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Esx1O88933 382 aa22.64■■□□□ 1.22
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Pola1P33609 1465 aa22.64■■□□□ 1.21
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Prdm16A2A935 1275 aa22.64■■□□□ 1.21
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Tmf1B9EKI3 1091 aa22.63■■□□□ 1.21
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Clasp1Q80TV8 1535 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Abcc6Q9R1S7 1498 aa22.61■■□□□ 1.21
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 NeflP08551 543 aa22.61■■□□□ 1.21
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Kif16bB1AVY7 1312 aa22.6■■□□□ 1.21
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