RNA–Protein interactions for RNA: YMR117C

SPC24, Transcript of Component of the kinetochore-associated Ndc80 complex, yeast

Gene SPC24, Length 642 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SPC24	YMR117C	EFM3	P47163	339 aa		3.9	□□□□□ -1.79
SPC24	YMR117C	CDH1	P53197	566 aa		3.9	□□□□□ -1.79
SPC24	YMR117C	TRM82	Q03774	444 aa		3.9	□□□□□ -1.79
SPC24	YMR117C	RRB1	Q04225	511 aa	Known RBP	3.9	□□□□□ -1.79
SPC24	YMR117C	SLM3	Q12093	417 aa		3.9	□□□□□ -1.79
SPC24	YMR117C	SAG1	P20840	650 aa		3.89	□□□□□ -1.79
SPC24	YMR117C	PDC2	P32896	925 aa		3.89	□□□□□ -1.79
SPC24	YMR117C	IST2	P38250	946 aa		3.89	□□□□□ -1.79
SPC24	YMR117C	MOB2	P43563	287 aa		3.89	□□□□□ -1.79
SPC24	YMR117C	YJR054W	P47114	497 aa		3.89	□□□□□ -1.79
SPC24	YMR117C	NAT4	Q04751	285 aa		3.89	□□□□□ -1.79
SPC24	YMR117C	ARR1	Q06596	294 aa		3.89	□□□□□ -1.79
SPC24	YMR117C	FRE8	Q12209	686 aa		3.89	□□□□□ -1.79
SPC24	YMR117C	TPI1	P00942	248 aa	Known RBP	3.88	□□□□□ -1.79
SPC24	YMR117C	TAL1	P15019	335 aa	Known RBP	3.88	□□□□□ -1.79
SPC24	YMR117C	EPT1	P22140	391 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SPC24	YMR117C	HXT2	P23585	541 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SPC24	YMR117C	MXR2	P25566	168 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SPC24	YMR117C	YEL043W	P32618	956 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SPC24	YMR117C	ECM34	P38728	170 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SPC24	YMR117C	YMR134W	P40207	237 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SPC24	YMR117C	VEL1	P53058	206 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SPC24	YMR117C	PDR16	P53860	351 aa	Known RBP	3.88	□□□□□ -1.79
SPC24	YMR117C	CSM3	Q04659	317 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SPC24	YMR117C	RPS19A	P07280	144 aa	Known RBP	3.87	□□□□□ -1.79
SPC24	YMR117C	RPS19B	P07281	144 aa	Predicted RBP	3.87	□□□□□ -1.79
SPC24	YMR117C	PUT4	P15380	627 aa		3.87	□□□□□ -1.79
SPC24	YMR117C	YER184C	P39961	794 aa		3.87	□□□□□ -1.79
SPC24	YMR117C	STB1	P42845	420 aa		3.87	□□□□□ -1.79
SPC24	YMR117C	SUR7	P54003	302 aa		3.87	□□□□□ -1.79
SPC24	YMR117C	RMI1	Q02685	241 aa		3.87	□□□□□ -1.79
SPC24	YMR117C	MRX11	Q03079	207 aa		3.87	□□□□□ -1.79
SPC24	YMR117C	PML1	Q07930	204 aa	Predicted RBP	3.87	□□□□□ -1.79
SPC24	YMR117C	RPS14A	P06367	137 aa	Known RBP	3.86	□□□□□ -1.79
SPC24	YMR117C	MKK1	P32490	508 aa		3.86	□□□□□ -1.79
SPC24	YMR117C	RCK2	P38623	610 aa		3.86	□□□□□ -1.79
SPC24	YMR117C	RPS14B	P39516	138 aa	Known RBP	3.86	□□□□□ -1.79
SPC24	YMR117C	YIL089W	P40500	205 aa		3.86	□□□□□ -1.79
SPC24	YMR117C	LSG1	P53145	640 aa	Known RBP	3.86	□□□□□ -1.79
SPC24	YMR117C	PIN3	Q06449	215 aa		3.86	□□□□□ -1.79
SPC24	YMR117C	ALE1	Q08548	619 aa		3.86	□□□□□ -1.79
SPC24	YMR117C	RAX2	Q12465	1220 aa		3.86	□□□□□ -1.79
SPC24	YMR117C	RGS2	Q99188	309 aa		3.86	□□□□□ -1.79
SPC24	YMR117C	YLL053C	P0CD98	152 aa		3.85	□□□□□ -1.79
SPC24	YMR117C	SMI1	P32566	505 aa		3.85	□□□□□ -1.79
SPC24	YMR117C	SPS19	P32573	292 aa	Known RBP	3.85	□□□□□ -1.79
SPC24	YMR117C	UIP5	P36137	443 aa		3.85	□□□□□ -1.79
SPC24	YMR117C	RNY1	Q02933	434 aa	Known RBP	3.85	□□□□□ -1.79
SPC24	YMR117C	IES4	Q08561	116 aa		3.85	□□□□□ -1.79
SPC24	YMR117C	PSY3	Q12318	242 aa		3.85	□□□□□ -1.79
SPC24	YMR117C	UTR1	P21373	530 aa		3.84	□□□□□ -1.79
SPC24	YMR117C	ERG9	P29704	444 aa		3.84	□□□□□ -1.79
SPC24	YMR117C	PCH2	P38126	564 aa		3.84	□□□□□ -1.79
SPC24	YMR117C	SMP1	P38128	452 aa		3.84	□□□□□ -1.79
SPC24	YMR117C	PEX32	P38292	413 aa		3.84	□□□□□ -1.79
SPC24	YMR117C	ALP1	P38971	573 aa		3.84	□□□□□ -1.79
SPC24	YMR117C	HST1	P53685	503 aa		3.84	□□□□□ -1.79
SPC24	YMR117C	YNL146W	P53906	100 aa		3.84	□□□□□ -1.79
SPC24	YMR117C	RAD1	P06777	1100 aa		3.83	□□□□□ -1.8
SPC24	YMR117C	CIN8	P27895	1000 aa		3.83	□□□□□ -1.8
SPC24	YMR117C	URA10	P30402	227 aa		3.83	□□□□□ -1.8
SPC24	YMR117C	YKL071W	P36086	256 aa		3.83	□□□□□ -1.8
SPC24	YMR117C	CAJ1	P39101	391 aa		3.83	□□□□□ -1.8
SPC24	YMR117C	PRP39	P39682	629 aa	Known RBP	3.83	□□□□□ -1.8
SPC24	YMR117C	YGR016W	P53209	190 aa		3.83	□□□□□ -1.8
SPC24	YMR117C	TIR4	Q12218	487 aa	Predicted RBP	3.83	□□□□□ -1.8
SPC24	YMR117C	BGL2	P15703	313 aa	Known RBP	3.82	□□□□□ -1.8
SPC24	YMR117C	DTR1	P38125	572 aa		3.82	□□□□□ -1.8
SPC24	YMR117C	RRT13	P40042	185 aa		3.82	□□□□□ -1.8
SPC24	YMR117C	YCH1	P42937	148 aa		3.82	□□□□□ -1.8
SPC24	YMR117C	ATP22	P50273	684 aa	Predicted RBP	3.82	□□□□□ -1.8
SPC24	YMR117C	YGL114W	P53134	725 aa		3.82	□□□□□ -1.8
SPC24	YMR117C	MMT2	Q08970	484 aa		3.82	□□□□□ -1.8
SPC24	YMR117C	SPO24	Q3E752	67 aa		3.82	□□□□□ -1.8
SPC24	YMR117C	STE2	D6VTK4	431 aa		3.81	□□□□□ -1.8
SPC24	YMR117C	OPI1	P21957	404 aa		3.81	□□□□□ -1.8
SPC24	YMR117C	MYO3	P36006	1272 aa		3.81	□□□□□ -1.8
SPC24	YMR117C	IML3	P38265	245 aa		3.81	□□□□□ -1.8
SPC24	YMR117C	EFM1	P38732	585 aa		3.81	□□□□□ -1.8
SPC24	YMR117C	GGC1	P38988	300 aa		3.81	□□□□□ -1.8
SPC24	YMR117C	COQ5	P49017	307 aa		3.81	□□□□□ -1.8
SPC24	YMR117C	YGR067C	P53243	804 aa		3.81	□□□□□ -1.8
SPC24	YMR117C	SED5	Q01590	340 aa		3.81	□□□□□ -1.8
SPC24	YMR117C	RPN8	Q08723	338 aa	Known RBP	3.81	□□□□□ -1.8
SPC24	YMR117C	DDC1	Q08949	612 aa		3.81	□□□□□ -1.8
SPC24	YMR117C	SCS7	Q03529	384 aa		3.8	□□□□□ -1.8
SPC24	YMR117C	API2	Q04413	109 aa		3.8	□□□□□ -1.8
SPC24	YMR117C	YOL085C	Q99345	113 aa		3.8	□□□□□ -1.8
SPC24	YMR117C	DCC1	P25559	380 aa		3.79	□□□□□ -1.8
SPC24	YMR117C	FHL1	P39521	936 aa		3.79	□□□□□ -1.8
SPC24	YMR117C	BTT1	P40314	149 aa	Predicted RBP	3.79	□□□□□ -1.8
SPC24	YMR117C	NAS2	P40555	220 aa		3.79	□□□□□ -1.8
SPC24	YMR117C	FYV8	P46949	817 aa	Known RBP	3.79	□□□□□ -1.8
SPC24	YMR117C	NAS6	P50086	228 aa		3.79	□□□□□ -1.8
SPC24	YMR117C	NRM1	P53718	249 aa		3.79	□□□□□ -1.8
SPC24	YMR117C	YDR286C	Q05530	114 aa		3.79	□□□□□ -1.8
SPC24	YMR117C	PGC1	Q08959	321 aa		3.79	□□□□□ -1.8
SPC24	YMR117C	RPN6	Q12377	434 aa		3.79	□□□□□ -1.8
SPC24	YMR117C	CCH1	P50077	2039 aa		3.78	□□□□□ -1.8
SPC24	YMR117C	RNR2	P09938	399 aa	Known RBP	3.78	□□□□□ -1.8

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