RNA–Protein interactions for RNA: YJL218W

YJL218W, Transcript of Putative acetyltransferase, yeast

Gene YJL218W, Length 591 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YJL218W	YJL218W	GEP3	Q08622	556 aa		4.16	□□□□□ -1.74
YJL218W	YJL218W	SLF1	Q12034	447 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
YJL218W	YJL218W	RGT2	Q12300	763 aa		4.16	□□□□□ -1.74
YJL218W	YJL218W	YPL247C	Q12523	523 aa		4.16	□□□□□ -1.74
YJL218W	YJL218W	SUS1	Q6WNK7	96 aa		4.16	□□□□□ -1.74
YJL218W	YJL218W	RAD52	P06778	471 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
YJL218W	YJL218W	SPS2	P08459	502 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YJL218W	YJL218W	YML003W	P0CF16	290 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YJL218W	YJL218W	BAR1	P12630	587 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YJL218W	YJL218W	HPR1	P17629	752 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
YJL218W	YJL218W	IDP1	P21954	428 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
YJL218W	YJL218W	AAT2	P23542	418 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
YJL218W	YJL218W	ERG9	P29704	444 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YJL218W	YJL218W	ARC19	P33204	171 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
YJL218W	YJL218W	PXA2	P34230	853 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YJL218W	YJL218W	CPR5	P35176	225 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YJL218W	YJL218W	RSM22	P36056	628 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YJL218W	YJL218W	CAF4	P36130	643 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YJL218W	YJL218W	RIB1	P38066	345 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YJL218W	YJL218W	RRF1	P38771	230 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YJL218W	YJL218W	RRP4	P38792	359 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
YJL218W	YJL218W	FLO5	P38894	1075 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YJL218W	YJL218W	BFR1	P38934	470 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.15	□□□□□ -1.75	not detected
YJL218W	YJL218W	SEN34	P39707	275 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YJL218W	YJL218W	SSO2	P39926	295 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YJL218W	YJL218W	ISC1	P40015	477 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
YJL218W	YJL218W	RGI1	P40043	161 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
YJL218W	YJL218W	COG3	P40094	801 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YJL218W	YJL218W	GTT1	P40582	234 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YJL218W	YJL218W	SKP2	P42843	763 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YJL218W	YJL218W	UBX6	P47049	396 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YJL218W	YJL218W	YJR154W	P47181	346 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YJL218W	YJL218W	TOM22	P49334	152 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YJL218W	YJL218W	YGL039W	P53183	348 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
YJL218W	YJL218W	EFM5	P53200	248 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
YJL218W	YJL218W	LSM7	P53905	115 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
YJL218W	YJL218W	YNL146W	P53906	100 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YJL218W	YJL218W	YML131W	Q03102	365 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YJL218W	YJL218W	PRM15	Q03262	622 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YJL218W	YJL218W	YMR279C	Q03263	540 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YJL218W	YJL218W	GAS3	Q03655	524 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YJL218W	YJL218W	YMD8	Q03697	442 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YJL218W	YJL218W	RRN11	Q04712	507 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YJL218W	YJL218W	CRN1	Q06440	651 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YJL218W	YJL218W	ARV1	Q06541	321 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YJL218W	YJL218W	SHS1	Q07657	551 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YJL218W	YJL218W	MFG1	Q07684	458 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YJL218W	YJL218W	YLL007C	Q07799	665 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YJL218W	YJL218W	THP1	Q08231	455 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YJL218W	YJL218W	YOL131W	Q08270	108 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YJL218W	YJL218W	SKI7	Q08491	747 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
YJL218W	YJL218W	YLR049C	Q12110	428 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YJL218W	YJL218W	YOR012W	Q12351	137 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YJL218W	YJL218W	WTM1	Q12363	437 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
YJL218W	YJL218W	RTN2	Q12443	393 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YJL218W	YJL218W	EFG1	Q3E705	233 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
YJL218W	YJL218W	RIF1	P29539	1916 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YJL218W	YJL218W	REP2	P03872	296 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YJL218W	YJL218W	ARG81	P05085	880 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YJL218W	YJL218W	ASP3-2	P0CX77	362 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YJL218W	YJL218W	ASP3-3	P0CX78	362 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YJL218W	YJL218W	ASP3-4	P0CX79	362 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YJL218W	YJL218W	YER190C-B	P0CX94	160 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YJL218W	YJL218W	YEL077W-A	P0CX95	160 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YJL218W	YJL218W	YGR296C-B	P0CX96	160 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YJL218W	YJL218W	YPL283W-B	P0CX97	160 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YJL218W	YJL218W	YPR204C-A	P0CX98	160 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YJL218W	YJL218W	ASP3-1	P0CZ17	362 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YJL218W	YJL218W	MDH1	P17505	334 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.14	□□□□□ -1.75	not detected
YJL218W	YJL218W	YCK1	P23291	538 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YJL218W	YJL218W	PGS1	P25578	521 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YJL218W	YJL218W	TAH1	P25638	111 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
YJL218W	YJL218W	DBF20	P32328	564 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YJL218W	YJL218W	ACP1	P32463	125 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YJL218W	YJL218W	SDH3	P33421	198 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YJL218W	YJL218W	UIP5	P36137	443 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YJL218W	YJL218W	GEX2	P36173	615 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YJL218W	YJL218W	MMS4	P38257	691 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YJL218W	YJL218W	PHO88	P38264	188 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
YJL218W	YJL218W	SBE22	P38814	852 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YJL218W	YJL218W	HAT2	P39984	401 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YJL218W	YJL218W	HMF1	P40037	129 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
YJL218W	YJL218W	BUR6	P40096	142 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YJL218W	YJL218W	SWM2	P40342	146 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YJL218W	YJL218W	CDC1	P40986	491 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YJL218W	YJL218W	SNM1	P40993	198 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YJL218W	YJL218W	ARF3	P40994	183 aa	RIP-Chip data	4.14	□□□□□ -1.75	not detected
YJL218W	YJL218W	PTR3	P43606	678 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YJL218W	YJL218W	GTO1	P48239	356 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YJL218W	YJL218W	MSY1	P48527	492 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YJL218W	YJL218W	MNP1	P53163	194 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
YJL218W	YJL218W	PRM8	P53174	237 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YJL218W	YJL218W	JAC1	P53193	184 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YJL218W	YJL218W	YMR010W	Q03687	405 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YJL218W	YJL218W	RPN9	Q04062	393 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
YJL218W	YJL218W	YMR034C	Q05131	434 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
YJL218W	YJL218W	YHC1	Q05900	231 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
YJL218W	YJL218W	BUR2	Q05949	395 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YJL218W	YJL218W	PHO92	Q06390	306 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YJL218W	YJL218W	ARR2	Q06597	130 aa		4.14	□□□□□ -1.75

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 95.4 ms