RNA–Protein interactions for RNA: Q0050

AI1, Reverse transcriptase required for splicing of the COX1 pre-mRNA, yeast

Gene AI1, Length 2,505 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
AI1	Q0050	THP3	Q12049	470 aa	Known RBP	0.36	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	ATG29	Q12092	213 aa		0.36	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	YLR108C	Q12259	485 aa		0.36	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	YDL180W	Q12301	547 aa		0.36	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	FOL3	Q12676	427 aa	Predicted RBP	0.36	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	YBL111C	Q3E7Y5	667 aa		0.36	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	NBL1	Q3E7Y6	73 aa		0.36	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	AAC1	P04710	309 aa		0.36	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	ARD1	P07347	238 aa	Predicted RBP	0.36	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	SSC1	P0CS90	654 aa	Known RBP	0.36	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	SEN2	P16658	377 aa		0.36	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	MET16	P18408	261 aa	Predicted RBP	0.36	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	ARE1	P25628	610 aa		0.36	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	MGT1	P26188	188 aa		0.36	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	HXT3	P32466	567 aa	Known RBP	0.36	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	GSH1	P32477	678 aa		0.36	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	TOA1	P32773	286 aa		0.36	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	CNS1	P33313	385 aa		0.36	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	SLC1	P33333	303 aa		0.36	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	TIP20	P33891	701 aa		0.36	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	YKL100C	P34248	587 aa		0.36	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	ZTA1	P38230	334 aa	Known RBP	0.36	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	YBR138C	P38277	524 aa		0.36	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	SPP381	P38282	291 aa	Predicted RBP	0.36	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	GRE3	P38715	327 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.36	□□□□□ -2.35	not detected
AI1	Q0050	YHR035W	P38769	630 aa		0.36	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	BZZ1	P38822	633 aa		0.36	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	YER034W	P40022	185 aa	Known RBP	0.36	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	YER121W	P40076	114 aa		0.36	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	RGI2	P40188	164 aa		0.36	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	PRE5	P40302	234 aa	Known RBP	0.36	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	ALG5	P40350	334 aa		0.36	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	RPS29B	P41058	56 aa	Known RBP	0.36	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	YGR237C	P50089	785 aa		0.36	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	BIO3	P50277	480 aa		0.36	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	MDM34	P53083	459 aa		0.36	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	YGR067C	P53243	804 aa		0.36	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	YGR126W	P53274	230 aa		0.36	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	OGG1	P53397	376 aa	Predicted RBP	0.36	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	TIM8	P57744	87 aa		0.36	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	SKO1	Q02100	647 aa		0.36	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	MRPL13	Q02204	264 aa		0.36	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	APC4	Q04601	652 aa		0.36	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	ROY1	Q04847	553 aa		0.36	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	ARR1	Q06596	294 aa		0.36	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	YPR091C	Q06833	770 aa		0.36	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	RDS3	Q06835	107 aa	Predicted RBP	0.36	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	YDL144C	Q07589	356 aa		0.36	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	AIM6	Q07716	390 aa		0.36	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	AAD15	Q08361	143 aa		0.36	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	FMP40	Q08968	688 aa	Predicted RBP	0.36	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	RRP42	Q12277	265 aa	Predicted RBP	0.36	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	AHA1	Q12449	350 aa	Known RBP	0.36	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	DFM1	Q12743	341 aa	Known RBP	0.36	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	TDH2	P00358	332 aa	Known RBP	0.35	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	HSP82	P02829	709 aa	Known RBP	0.35	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	MSW1	P04803	379 aa		0.35	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	RPL22A	P05749	121 aa	Known RBP	0.35	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	YSF3	P0C074	85 aa	Predicted RBP	0.35	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	PHO85	P17157	305 aa		0.35	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	SPB1	P25582	841 aa	Predicted RBP	0.35	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	PCL2	P25693	308 aa		0.35	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	MSK1	P32048	576 aa		0.35	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	ACH1	P32316	526 aa		0.35	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	YPS1	P32329	569 aa		0.35	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	MRP20	P32387	263 aa		0.35	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	MEI5	P32489	222 aa		0.35	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	SAC6	P32599	642 aa	Known RBP	0.35	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	ARC19	P33204	171 aa	Known RBP	0.35	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	PRP18	P33411	251 aa	Predicted RBP	0.35	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	SRB2	P34162	210 aa		0.35	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	PRX1	P34227	261 aa	Known RBP	0.35	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	CSG2	P35206	410 aa		0.35	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	RRP14	P36080	434 aa	Known RBP	0.35	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	APT2	P36973	181 aa		0.35	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	MNN2	P38069	597 aa		0.35	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	YHR127W	P38833	243 aa	Known RBP	0.35	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	YEL028W	P39989	153 aa		0.35	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	PRM2	P40534	656 aa		0.35	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	REE1	P40893	198 aa		0.35	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	MOB2	P43563	287 aa		0.35	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	TRS85	P46944	698 aa		0.35	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	AAD10	P47182	288 aa		0.35	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	SIP18	P50263	79 aa		0.35	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	PEX8	P53248	589 aa		0.35	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	PCP1	P53259	346 aa		0.35	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	DCP2	P53550	970 aa	Known RBP	0.35	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	ACT1	P60010	375 aa	Known RBP	0.35	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	YDR274C	P87283	123 aa		0.35	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	SED1	Q01589	338 aa		0.35	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	OAZ1	Q02803	292 aa		0.35	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	YML119W	Q03208	357 aa		0.35	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	CEF1	Q03654	590 aa	Predicted RBP	0.35	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	URC2	Q04411	772 aa		0.35	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	COG8	Q04632	607 aa		0.35	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	BCH1	Q05029	724 aa		0.35	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	MSC3	Q05812	728 aa		0.35	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	YLR407W	Q06070	228 aa		0.35	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	DIA2	Q08496	732 aa	Predicted RBP	0.35	□□□□□ -2.35
AI1	Q0050	TMA16	Q08687	178 aa		0.35	□□□□□ -2.35

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