RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496246.5

TTLL3-231, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

TSL 4

Gene TTLL3, Length 507 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-231	ENST00000496246	ANKEF1	Q9NU02	776 aa		12.65	□□□□□ -0.38
TTLL3-231	ENST00000496246	SZT2	Q5T011	3432 aa		12.65	□□□□□ -0.38
TTLL3-231	ENST00000496246	LCHN	A4D1U4	455 aa		12.64	□□□□□ -0.39
TTLL3-231	ENST00000496246	CARNS1	A5YM72	827 aa		12.64	□□□□□ -0.39
TTLL3-231	ENST00000496246	FAM205C	A6NFA0	338 aa		12.64	□□□□□ -0.39
TTLL3-231	ENST00000496246	GPR32	O75388	356 aa		12.64	□□□□□ -0.39
TTLL3-231	ENST00000496246	HSP90AA1	P07900	732 aa	Known RBP	12.64	□□□□□ -0.39
TTLL3-231	ENST00000496246	ST3GAL1	Q11201	340 aa		12.64	□□□□□ -0.39
TTLL3-231	ENST00000496246	PCBP1	Q15365	356 aa	Known RBP eCLIP	12.64	□□□□□ -0.39	6e-14	■■■■■ 38.6
TTLL3-231	ENST00000496246	TARBP2	Q15633	366 aa	Known RBP	12.64	□□□□□ -0.39
TTLL3-231	ENST00000496246	CSPP1	Q1MSJ5	1256 aa		12.64	□□□□□ -0.39
TTLL3-231	ENST00000496246	TCTN1	Q2MV58	587 aa		12.64	□□□□□ -0.39
TTLL3-231	ENST00000496246	PLA2G4F	Q68DD2	849 aa		12.64	□□□□□ -0.39
TTLL3-231	ENST00000496246	ANO5	Q75V66	913 aa		12.64	□□□□□ -0.39
TTLL3-231	ENST00000496246	CATSPER4	Q7RTX7	472 aa		12.64	□□□□□ -0.39
TTLL3-231	ENST00000496246	TMEM192	Q8IY95	271 aa		12.64	□□□□□ -0.39
TTLL3-231	ENST00000496246	SP7	Q8TDD2	431 aa	Predicted RBP	12.64	□□□□□ -0.39
TTLL3-231	ENST00000496246	NACC1	Q96RE7	527 aa		12.64	□□□□□ -0.39
TTLL3-231	ENST00000496246	PLVAP	Q9BX97	442 aa		12.64	□□□□□ -0.39
TTLL3-231	ENST00000496246	ELAC1	Q9H777	363 aa	Known RBP	12.64	□□□□□ -0.39
TTLL3-231	ENST00000496246	THEG	Q9P2T0	379 aa		12.64	□□□□□ -0.39
TTLL3-231	ENST00000496246	PCDHB12	Q9Y5F1	795 aa		12.64	□□□□□ -0.39
TTLL3-231	ENST00000496246	COL4A3BP	Q9Y5P4	624 aa		12.64	□□□□□ -0.39
TTLL3-231	ENST00000496246	WDR81	Q562E7	1941 aa		12.64	□□□□□ -0.39
TTLL3-231	ENST00000496246	DGKI	O75912	1065 aa		12.63	□□□□□ -0.39
TTLL3-231	ENST00000496246	ERLIN2	O94905	339 aa		12.63	□□□□□ -0.39
TTLL3-231	ENST00000496246	SLITRK3	O94933	977 aa		12.63	□□□□□ -0.39
TTLL3-231	ENST00000496246	DARS	P14868	501 aa	Known RBP	12.63	□□□□□ -0.39
TTLL3-231	ENST00000496246	POU3F3	P20264	500 aa	Predicted RBP	12.63	□□□□□ -0.39
TTLL3-231	ENST00000496246	MUT	P22033	750 aa		12.63	□□□□□ -0.39
TTLL3-231	ENST00000496246	U2AF2	P26368	475 aa	Known RBP eCLIP	12.63	□□□□□ -0.39
TTLL3-231	ENST00000496246	PHKA2	P46019	1235 aa		12.63	□□□□□ -0.39
TTLL3-231	ENST00000496246	GRB10	Q13322	594 aa		12.63	□□□□□ -0.39
TTLL3-231	ENST00000496246	GPM6B	Q13491	265 aa		12.63	□□□□□ -0.39
TTLL3-231	ENST00000496246	BMS1	Q14692	1282 aa	Known RBP	12.63	□□□□□ -0.39
TTLL3-231	ENST00000496246	EMC2	Q15006	297 aa		12.63	□□□□□ -0.39
TTLL3-231	ENST00000496246	EPC2	Q52LR7	807 aa		12.63	□□□□□ -0.39
TTLL3-231	ENST00000496246	TIGD5	Q53EQ6	642 aa		12.63	□□□□□ -0.39
TTLL3-231	ENST00000496246	NAALADL2	Q58DX5	795 aa		12.63	□□□□□ -0.39
TTLL3-231	ENST00000496246	KRT79	Q5XKE5	535 aa		12.63	□□□□□ -0.39
TTLL3-231	ENST00000496246	TWF2	Q6IBS0	349 aa	Known RBP	12.63	□□□□□ -0.39
TTLL3-231	ENST00000496246	DTHD1	Q6ZMT9	781 aa		12.63	□□□□□ -0.39
TTLL3-231	ENST00000496246	SRGAP1	Q7Z6B7	1085 aa		12.63	□□□□□ -0.39
TTLL3-231	ENST00000496246	FAM228A	Q86W67	206 aa		12.63	□□□□□ -0.39
TTLL3-231	ENST00000496246	HACE1	Q8IYU2	909 aa		12.63	□□□□□ -0.39
TTLL3-231	ENST00000496246	MCPH1	Q8NEM0	835 aa		12.63	□□□□□ -0.39
TTLL3-231	ENST00000496246	MTMR9	Q96QG7	549 aa		12.63	□□□□□ -0.39
TTLL3-231	ENST00000496246	BACH2	Q9BYV9	841 aa		12.63	□□□□□ -0.39
TTLL3-231	ENST00000496246	TMEM161A	Q9NX61	479 aa		12.63	□□□□□ -0.39
TTLL3-231	ENST00000496246	RGL1	Q9NZL6	768 aa		12.63	□□□□□ -0.39
TTLL3-231	ENST00000496246	LRWD1	Q9UFC0	647 aa		12.63	□□□□□ -0.39
TTLL3-231	ENST00000496246	COG5	Q9UP83	839 aa		12.63	□□□□□ -0.39
TTLL3-231	ENST00000496246		A0A087WZ62	844 aa		12.62	□□□□□ -0.39
TTLL3-231	ENST00000496246	IGKV6-21	A0A0C4DH24	114 aa		12.62	□□□□□ -0.39
TTLL3-231	ENST00000496246	ARHGEF35	A5YM69	484 aa		12.62	□□□□□ -0.39
TTLL3-231	ENST00000496246	POTEM	A6NI47	508 aa		12.62	□□□□□ -0.39
TTLL3-231	ENST00000496246	NCK2	O43639	380 aa		12.62	□□□□□ -0.39
TTLL3-231	ENST00000496246	LYPLA2	O95372	231 aa		12.62	□□□□□ -0.39
TTLL3-231	ENST00000496246	EOMES	O95936	686 aa		12.62	□□□□□ -0.39
TTLL3-231	ENST00000496246	BMP15	O95972	392 aa		12.62	□□□□□ -0.39
TTLL3-231	ENST00000496246	SRGAP2C	P0DJJ0	459 aa		12.62	□□□□□ -0.39
TTLL3-231	ENST00000496246	RAB27A	P51159	221 aa		12.62	□□□□□ -0.39
TTLL3-231	ENST00000496246	NPEPPS	P55786	919 aa		12.62	□□□□□ -0.39
TTLL3-231	ENST00000496246	MKRN4P	Q13434	485 aa	Predicted RBP	12.62	□□□□□ -0.39
TTLL3-231	ENST00000496246	PDIA5	Q14554	519 aa		12.62	□□□□□ -0.39
TTLL3-231	ENST00000496246	TMEM132A	Q24JP5	1023 aa		12.62	□□□□□ -0.39
TTLL3-231	ENST00000496246	LINC01465	Q8N7H1	131 aa		12.62	□□□□□ -0.39
TTLL3-231	ENST00000496246	RNF169	Q8NCN4	708 aa		12.62	□□□□□ -0.39
TTLL3-231	ENST00000496246	GDPD5	Q8WTR4	605 aa		12.62	□□□□□ -0.39
TTLL3-231	ENST00000496246	ATXN2L	Q8WWM7	1075 aa	Known RBP	12.62	□□□□□ -0.39
TTLL3-231	ENST00000496246	PGBD4	Q96DM1	585 aa		12.62	□□□□□ -0.39
TTLL3-231	ENST00000496246	CDK5RAP3	Q96JB5	506 aa		12.62	□□□□□ -0.39
TTLL3-231	ENST00000496246	HSD17B14	Q9BPX1	270 aa		12.62	□□□□□ -0.39
TTLL3-231	ENST00000496246	SH2D3A	Q9BRG2	576 aa		12.62	□□□□□ -0.39
TTLL3-231	ENST00000496246	FDXACB1	Q9BRP7	624 aa	Predicted RBP	12.62	□□□□□ -0.39
TTLL3-231	ENST00000496246	POLR3C	Q9BUI4	534 aa	Predicted RBP	12.62	□□□□□ -0.39
TTLL3-231	ENST00000496246	MRPL9	Q9BYD2	267 aa	Known RBP	12.62	□□□□□ -0.39
TTLL3-231	ENST00000496246	LMAN2L	Q9H0V9	348 aa		12.62	□□□□□ -0.39
TTLL3-231	ENST00000496246	ADAMTS10	Q9H324	1103 aa		12.62	□□□□□ -0.39
TTLL3-231	ENST00000496246	DHX33	Q9H6R0	707 aa	Known RBP	12.62	□□□□□ -0.39
TTLL3-231	ENST00000496246	PIN4	Q9Y237	131 aa	Known RBP	12.62	□□□□□ -0.39
TTLL3-231	ENST00000496246	GTF3C3	Q9Y5Q9	886 aa		12.62	□□□□□ -0.39
TTLL3-231	ENST00000496246	MTCH2	Q9Y6C9	303 aa		12.62	□□□□□ -0.39
TTLL3-231	ENST00000496246	LAMA2	P24043	3122 aa	Known RBP	12.62	□□□□□ -0.39
TTLL3-231	ENST00000496246	LOXHD1	Q8IVV2	1947 aa		12.62	□□□□□ -0.39
TTLL3-231	ENST00000496246	TMEM150B	A6NC51	233 aa		12.61	□□□□□ -0.39
TTLL3-231	ENST00000496246	TBKBP1	A7MCY6	615 aa		12.61	□□□□□ -0.39
TTLL3-231	ENST00000496246		H3BNC9	293 aa		12.61	□□□□□ -0.39
TTLL3-231	ENST00000496246	RFXAP	O00287	272 aa		12.61	□□□□□ -0.39
TTLL3-231	ENST00000496246	RPA1	P27694	616 aa		12.61	□□□□□ -0.39
TTLL3-231	ENST00000496246	BMPR1A	P36894	532 aa		12.61	□□□□□ -0.39
TTLL3-231	ENST00000496246	CCT6A	P40227	531 aa	Known RBP	12.61	□□□□□ -0.39
TTLL3-231	ENST00000496246	MRPS5	P82675	430 aa	Known RBP	12.61	□□□□□ -0.39
TTLL3-231	ENST00000496246	SPIRE1	Q08AE8	756 aa		12.61	□□□□□ -0.39
TTLL3-231	ENST00000496246	PTGDR	Q13258	359 aa		12.61	□□□□□ -0.39
TTLL3-231	ENST00000496246	ADGRE1	Q14246	886 aa		12.61	□□□□□ -0.39
TTLL3-231	ENST00000496246	PAN2	Q504Q3	1202 aa	Known RBP	12.61	□□□□□ -0.39
TTLL3-231	ENST00000496246	BRAP	Q7Z569	592 aa		12.61	□□□□□ -0.39
TTLL3-231	ENST00000496246	HSCB	Q8IWL3	235 aa		12.61	□□□□□ -0.39
TTLL3-231	ENST00000496246	ZBTB8OS	Q8IWT0	167 aa		12.61	□□□□□ -0.39

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