RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423112.2

RFX3-AS1-201, RFX3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene RFX3-AS1, Length 552 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX3-AS1-201ENST00000423112 GNAQP50148 359 aa18.84■□□□□ 0.61
RFX3-AS1-201ENST00000423112 LETM2Q2VYF4 491 aa18.84■□□□□ 0.61
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CLLU1OSQ5K130 101 aa18.84■□□□□ 0.61
RFX3-AS1-201ENST00000423112 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa18.84■□□□□ 0.61
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP18.84■□□□□ 0.61
RFX3-AS1-201ENST00000423112 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP18.84■□□□□ 0.61
RFX3-AS1-201ENST00000423112 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP18.84■□□□□ 0.61
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RNF169Q8NCN4 708 aa18.84■□□□□ 0.61
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PPP1R16BQ96T49 567 aa18.84■□□□□ 0.61
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CEP250Q9BV73 2442 aa18.83■□□□□ 0.61
RFX3-AS1-201ENST00000423112 A0A0U1RQF3 1178 aa18.83■□□□□ 0.6
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KRBA1A5PL33 1030 aa18.83■□□□□ 0.6
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa18.83■□□□□ 0.6
RFX3-AS1-201ENST00000423112 VTNP04004 478 aa18.83■□□□□ 0.6
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SP9P0CG40 484 aa18.83■□□□□ 0.6
RFX3-AS1-201ENST00000423112 UBE2SQ16763 222 aa18.83■□□□□ 0.6
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa18.83■□□□□ 0.6
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NXPE3Q969Y0 559 aa18.83■□□□□ 0.6
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TBC1D17Q9HA65 648 aa18.83■□□□□ 0.6
RFX3-AS1-201ENST00000423112 STK39Q9UEW8 545 aa18.83■□□□□ 0.6
RFX3-AS1-201ENST00000423112 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP18.83■□□□□ 0.6
RFX3-AS1-201ENST00000423112 DENND4AQ7Z401 1863 aa18.83■□□□□ 0.6
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TPRP12270 2363 aaKnown RBP18.83■□□□□ 0.6
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NARSO43776 548 aaKnown RBP18.82■□□□□ 0.6
RFX3-AS1-201ENST00000423112 C22orf31O95567 290 aa18.82■□□□□ 0.6
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PDXDC2PQ6P474 469 aa18.82■□□□□ 0.6
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ABHD15Q6UXT9 468 aa18.82■□□□□ 0.6
RFX3-AS1-201ENST00000423112 C1orf210Q8IVY1 113 aa18.82■□□□□ 0.6
RFX3-AS1-201ENST00000423112 DCLK2Q8N568 766 aa18.82■□□□□ 0.6
RFX3-AS1-201ENST00000423112 METTL13Q8N6R0 699 aa18.82■□□□□ 0.6
RFX3-AS1-201ENST00000423112 HELQQ8TDG4 1101 aa18.82■□□□□ 0.6
RFX3-AS1-201ENST00000423112 AUTS2Q8WXX7 1259 aa18.82■□□□□ 0.6
RFX3-AS1-201ENST00000423112 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa18.82■□□□□ 0.6
RFX3-AS1-201ENST00000423112 LNPKQ9C0E8 428 aa18.82■□□□□ 0.6
RFX3-AS1-201ENST00000423112 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP18.82■□□□□ 0.6
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ZNF302Q9NR11 478 aa18.82■□□□□ 0.6
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SIT1Q9Y3P8 196 aa18.82■□□□□ 0.6
RFX3-AS1-201ENST00000423112 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa18.82■□□□□ 0.6
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ZBTB42B2RXF5 422 aa18.81■□□□□ 0.6
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KINO60870 393 aaKnown RBP18.81■□□□□ 0.6
RFX3-AS1-201ENST00000423112 DDAH1O94760 285 aa18.81■□□□□ 0.6
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SRFP11831 508 aa18.81■□□□□ 0.6
RFX3-AS1-201ENST00000423112 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP18.81■□□□□ 0.6
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP18.81■□□□□ 0.6
RFX3-AS1-201ENST00000423112 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP18.81■□□□□ 0.6
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CEP55Q53EZ4 464 aa18.81■□□□□ 0.6
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KIAA0319Q5VV43 1072 aa18.81■□□□□ 0.6
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP18.81■□□□□ 0.6
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NCOA7Q8NI08 942 aa18.81■□□□□ 0.6
RFX3-AS1-201ENST00000423112 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP18.81■□□□□ 0.6
RFX3-AS1-201ENST00000423112 STAMQ92783 540 aa18.81■□□□□ 0.6
RFX3-AS1-201ENST00000423112 IGSF21Q96ID5 467 aa18.81■□□□□ 0.6
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MAP7D2Q96T17 732 aa18.81■□□□□ 0.6
RFX3-AS1-201ENST00000423112 OSBPL3Q9H4L5 887 aa18.81■□□□□ 0.6
RFX3-AS1-201ENST00000423112 DACT1Q9NYF0 836 aa18.81■□□□□ 0.6
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CEP131Q9UPN4 1083 aa18.81■□□□□ 0.6
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ACACBO00763 2458 aa18.81■□□□□ 0.6
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP18.8■□□□□ 0.6
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TMOD1P28289 359 aa18.8■□□□□ 0.6
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP18.8■□□□□ 0.6
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SPECC1Q5M775 1068 aa18.8■□□□□ 0.6
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa18.8■□□□□ 0.6
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CYP26C1Q6V0L0 522 aa18.8■□□□□ 0.6
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP18.8■□□□□ 0.6
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TEX2Q8IWB9 1127 aa18.8■□□□□ 0.6
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CKAP2LQ8IYA6 745 aa18.8■□□□□ 0.6
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SUMF1Q8NBK3 374 aa18.8■□□□□ 0.6
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CA14Q9ULX7 337 aa18.8■□□□□ 0.6
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MAGEB2O15479 319 aa18.79■□□□□ 0.6
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CCNE2O96020 404 aa18.79■□□□□ 0.6
RFX3-AS1-201ENST00000423112 DCNP07585 359 aaKnown RBP18.79■□□□□ 0.6
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KLRC2P26717 231 aa18.79■□□□□ 0.6
RFX3-AS1-201ENST00000423112 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP18.79■□□□□ 0.6
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa18.79■□□□□ 0.6
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ZNF654Q8IZM8 581 aa18.79■□□□□ 0.6
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SLC44A3Q8N4M1 653 aa18.79■□□□□ 0.6
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP18.79■□□□□ 0.6
RFX3-AS1-201ENST00000423112 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa18.79■□□□□ 0.6
RFX3-AS1-201ENST00000423112 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa18.79■□□□□ 0.6
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NCDNQ9UBB6 729 aa18.79■□□□□ 0.6
RFX3-AS1-201ENST00000423112 DPP7Q9UHL4 492 aa18.79■□□□□ 0.6
RFX3-AS1-201ENST00000423112 AKT3Q9Y243 479 aa18.79■□□□□ 0.6
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa18.78■□□□□ 0.6
RFX3-AS1-201ENST00000423112 FOSP01100 380 aaPredicted RBP18.78■□□□□ 0.6
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CYP21A2P08686 494 aa18.78■□□□□ 0.6
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CLCN4P51793 760 aa18.78■□□□□ 0.6
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ARHGAP8P85298 464 aa18.78■□□□□ 0.6
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PTPN14Q15678 1187 aa18.78■□□□□ 0.6
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ST3GAL2Q16842 350 aa18.78■□□□□ 0.6
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SWSAP1Q6NVH7 229 aa18.78■□□□□ 0.6
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP18.78■□□□□ 0.6
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP18.78■□□□□ 0.6
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa18.78■□□□□ 0.6
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ADAMTS10Q9H324 1103 aa18.78■□□□□ 0.6
RFX3-AS1-201ENST00000423112 EPS15L1Q9UBC2 864 aa18.78■□□□□ 0.6
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MEIS1O00470 390 aa18.77■□□□□ 0.6
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SPTLC1O15269 473 aa18.77■□□□□ 0.6
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ZNF528Q3MIS6 628 aa18.77■□□□□ 0.6
RFX3-AS1-201ENST00000423112 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP18.77■□□□□ 0.6
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa18.77■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.1 ms