RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000391970.3

PTPRC-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 408 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-205ENST00000391970 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP4.13□□□□□ -1.75
PTPRC-205ENST00000391970 PF4V1P10720 104 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPRC-205ENST00000391970 OSMP13725 252 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPRC-205ENST00000391970 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP4.13□□□□□ -1.75
PTPRC-205ENST00000391970 LIMS1P48059 325 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPRC-205ENST00000391970 SLC5A3P53794 718 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPRC-205ENST00000391970 LGALS4P56470 323 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPRC-205ENST00000391970 DLG4P78352 724 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPRC-205ENST00000391970 HTRA3P83110 453 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPRC-205ENST00000391970 ACAP2Q15057 778 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPRC-205ENST00000391970 MUM1Q2TAK8 710 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPRC-205ENST00000391970 CXXC5Q7LFL8 322 aaKnown RBP4.13□□□□□ -1.75
PTPRC-205ENST00000391970 MYO1HQ8N1T3 1032 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPRC-205ENST00000391970 STPG3Q8N7X2 389 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPRC-205ENST00000391970 MAGEB6Q8N7X4 407 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPRC-205ENST00000391970 TTLL6Q8N841 843 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPRC-205ENST00000391970 OR5AN1Q8NGI8 311 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPRC-205ENST00000391970 TSPEARQ8WU66 669 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPRC-205ENST00000391970 RELTQ969Z4 430 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPRC-205ENST00000391970 HSPBAP1Q96EW2 488 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPRC-205ENST00000391970 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP4.13□□□□□ -1.75
PTPRC-205ENST00000391970 HAPLN2Q9GZV7 340 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPRC-205ENST00000391970 KCMF1Q9P0J7 381 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPRC-205ENST00000391970 DPP7Q9UHL4 492 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPRC-205ENST00000391970 PRSS50Q9UI38 385 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPRC-205ENST00000391970 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP4.13□□□□□ -1.75
PTPRC-205ENST00000391970 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP4.13□□□□□ -1.75
PTPRC-205ENST00000391970 MAFGO15525 162 aa4.12□□□□□ -1.75
PTPRC-205ENST00000391970 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
PTPRC-205ENST00000391970 COL6A1P12109 1028 aa4.12□□□□□ -1.75
PTPRC-205ENST00000391970 C5AR1P21730 350 aa4.12□□□□□ -1.75
PTPRC-205ENST00000391970 GPR15P49685 360 aa4.12□□□□□ -1.75
PTPRC-205ENST00000391970 CD83Q01151 205 aa4.12□□□□□ -1.75
PTPRC-205ENST00000391970 PPARAQ07869 468 aa4.12□□□□□ -1.75
PTPRC-205ENST00000391970 MAP3K12Q12852 859 aa4.12□□□□□ -1.75
PTPRC-205ENST00000391970 SPIDRQ14159 915 aa4.12□□□□□ -1.75
PTPRC-205ENST00000391970 MLC1Q15049 377 aa4.12□□□□□ -1.75
PTPRC-205ENST00000391970 MBNL2Q5VZF2 373 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
PTPRC-205ENST00000391970 TMEM200BQ69YZ2 307 aa4.12□□□□□ -1.75
PTPRC-205ENST00000391970 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
PTPRC-205ENST00000391970 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP4.12□□□□□ -1.75
PTPRC-205ENST00000391970 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa4.12□□□□□ -1.75
PTPRC-205ENST00000391970 TPH2Q8IWU9 490 aa4.12□□□□□ -1.75
PTPRC-205ENST00000391970 CDYL2Q8N8U2 506 aa4.12□□□□□ -1.75
PTPRC-205ENST00000391970 OR14C36Q8NHC7 312 aa4.12□□□□□ -1.75
PTPRC-205ENST00000391970 WDR48Q8TAF3 677 aa4.12□□□□□ -1.75
PTPRC-205ENST00000391970 ZBTB8AQ96BR9 441 aa4.12□□□□□ -1.75
PTPRC-205ENST00000391970 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
PTPRC-205ENST00000391970 IFT122Q9HBG6 1241 aa4.12□□□□□ -1.75
PTPRC-205ENST00000391970 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
PTPRC-205ENST00000391970 FTSJ1Q9UET6 329 aa4.12□□□□□ -1.75
PTPRC-205ENST00000391970 CROTQ9UKG9 612 aa4.12□□□□□ -1.75
PTPRC-205ENST00000391970 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa4.12□□□□□ -1.75
PTPRC-205ENST00000391970 CDY2AQ9Y6F7 541 aa4.12□□□□□ -1.75
PTPRC-205ENST00000391970 CUTAO60888 179 aa4.11□□□□□ -1.75
PTPRC-205ENST00000391970 NDUFS2O75306 463 aa4.11□□□□□ -1.75
PTPRC-205ENST00000391970 CYP7B1O75881 506 aa4.11□□□□□ -1.75
PTPRC-205ENST00000391970 IL33O95760 270 aa4.11□□□□□ -1.75
PTPRC-205ENST00000391970 KNG1P01042 644 aa4.11□□□□□ -1.75
PTPRC-205ENST00000391970 CHGBP05060 677 aa4.11□□□□□ -1.75
PTPRC-205ENST00000391970 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP4.11□□□□□ -1.75
PTPRC-205ENST00000391970 ATF3P18847 181 aa4.11□□□□□ -1.75
PTPRC-205ENST00000391970 VCAM1P19320 739 aa4.11□□□□□ -1.75
PTPRC-205ENST00000391970 GLDCP23378 1020 aa4.11□□□□□ -1.75
PTPRC-205ENST00000391970 CYP2C19P33261 490 aa4.11□□□□□ -1.75
PTPRC-205ENST00000391970 ADKP55263 362 aaKnown RBP4.11□□□□□ -1.75
PTPRC-205ENST00000391970 TBX4P57082 545 aa4.11□□□□□ -1.75
PTPRC-205ENST00000391970 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP4.11□□□□□ -1.75
PTPRC-205ENST00000391970 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP4.11□□□□□ -1.75
PTPRC-205ENST00000391970 TCIRG1Q13488 830 aa4.11□□□□□ -1.75
PTPRC-205ENST00000391970 DGKDQ16760 1214 aa4.11□□□□□ -1.75
PTPRC-205ENST00000391970 ANO4Q32M45 955 aa4.11□□□□□ -1.75
PTPRC-205ENST00000391970 WDR72Q3MJ13 1102 aa4.11□□□□□ -1.75
PTPRC-205ENST00000391970 CCDC178Q5BJE1 867 aa4.11□□□□□ -1.75
PTPRC-205ENST00000391970 PRR31Q5SQ13 230 aa4.11□□□□□ -1.75
PTPRC-205ENST00000391970 GRAMD4Q6IC98 578 aa4.11□□□□□ -1.75
PTPRC-205ENST00000391970 C14orf80Q86SX3 495 aa4.11□□□□□ -1.75
PTPRC-205ENST00000391970 FAM129CQ86XR2 697 aa4.11□□□□□ -1.75
PTPRC-205ENST00000391970 TMEFF1Q8IYR6 380 aa4.11□□□□□ -1.75
PTPRC-205ENST00000391970 TTC8Q8TAM2 541 aa4.11□□□□□ -1.75
PTPRC-205ENST00000391970 GAB3Q8WWW8 586 aa4.11□□□□□ -1.75
PTPRC-205ENST00000391970 ZCCHC14Q8WYQ9 949 aaKnown RBP4.11□□□□□ -1.75
PTPRC-205ENST00000391970 KCNN1Q92952 543 aa4.11□□□□□ -1.75
PTPRC-205ENST00000391970 CCDC136Q96JN2 1154 aa4.11□□□□□ -1.75
PTPRC-205ENST00000391970 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa4.11□□□□□ -1.75
PTPRC-205ENST00000391970 SIGLEC10Q96LC7 697 aa4.11□□□□□ -1.75
PTPRC-205ENST00000391970 SLC2A13Q96QE2 648 aa4.11□□□□□ -1.75
PTPRC-205ENST00000391970 HIST1H2AJQ99878 128 aa4.11□□□□□ -1.75
PTPRC-205ENST00000391970 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP4.11□□□□□ -1.75
PTPRC-205ENST00000391970 TUBD1Q9UJT1 453 aa4.11□□□□□ -1.75
PTPRC-205ENST00000391970 USP18Q9UMW8 372 aa4.11□□□□□ -1.75
PTPRC-205ENST00000391970 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa4.11□□□□□ -1.75
PTPRC-205ENST00000391970 H0Y858 1186 aa4.1□□□□□ -1.75
PTPRC-205ENST00000391970 ETV2O00321 342 aaPredicted RBP4.1□□□□□ -1.75
PTPRC-205ENST00000391970 KIF3BO15066 747 aa4.1□□□□□ -1.75
PTPRC-205ENST00000391970 PRC1O43663 620 aa4.1□□□□□ -1.75
PTPRC-205ENST00000391970 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP4.1□□□□□ -1.75
PTPRC-205ENST00000391970 MED14OSP0DP75 135 aa4.1□□□□□ -1.75
PTPRC-205ENST00000391970 ZNF28P17035 718 aa4.1□□□□□ -1.75
PTPRC-205ENST00000391970 ADCY8P40145 1251 aa4.1□□□□□ -1.75
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