RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000311101.9

PARL-201, Transcript of presenilin associated rhomboid like, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PARL, Length 1,240 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARL-201ENST00000311101 CRIPAKQ8N1N5 446 aa22.23■■□□□ 1.15
PARL-201ENST00000311101 SCLT1Q96NL6 688 aa22.23■■□□□ 1.15
PARL-201ENST00000311101 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
PARL-201ENST00000311101 MED24O75448 989 aa22.22■■□□□ 1.15
PARL-201ENST00000311101 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
PARL-201ENST00000311101 DARSP14868 501 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
PARL-201ENST00000311101 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
PARL-201ENST00000311101 PTGDRQ13258 359 aa22.22■■□□□ 1.15
PARL-201ENST00000311101 RHPN2Q8IUC4 686 aa22.22■■□□□ 1.15
PARL-201ENST00000311101 KSR1Q8IVT5 923 aa22.22■■□□□ 1.15
PARL-201ENST00000311101 ZNF710Q8N1W2 664 aa22.22■■□□□ 1.15
PARL-201ENST00000311101 NLRP7Q8WX94 980 aa22.22■■□□□ 1.15
PARL-201ENST00000311101 SLC7A3Q8WY07 619 aa22.22■■□□□ 1.15
PARL-201ENST00000311101 TMEM143Q96AN5 459 aa22.22■■□□□ 1.15
PARL-201ENST00000311101 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
PARL-201ENST00000311101 MTUS1Q9ULD2 1270 aa22.22■■□□□ 1.15
PARL-201ENST00000311101 PPME1Q9Y570 386 aa22.22■■□□□ 1.15
PARL-201ENST00000311101 FGFR4P22455 802 aa22.21■■□□□ 1.15
PARL-201ENST00000311101 RFC5P40937 340 aa22.21■■□□□ 1.15
PARL-201ENST00000311101 ERVK-21P61565 698 aa22.21■■□□□ 1.15
PARL-201ENST00000311101 ODR4Q5SWX8 454 aa22.21■■□□□ 1.15
PARL-201ENST00000311101 CATSPER3Q86XQ3 398 aa22.21■■□□□ 1.15
PARL-201ENST00000311101 PIGOQ8TEQ8 1089 aa22.21■■□□□ 1.15
PARL-201ENST00000311101 ADAM2Q99965 735 aa22.21■■□□□ 1.15
PARL-201ENST00000311101 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
PARL-201ENST00000311101 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
PARL-201ENST00000311101 ANKEF1Q9NU02 776 aa22.21■■□□□ 1.15
PARL-201ENST00000311101 A0A087WZ62 844 aa22.2■■□□□ 1.14
PARL-201ENST00000311101 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
PARL-201ENST00000311101 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP22.2■■□□□ 1.14
PARL-201ENST00000311101 DSC3Q14574 896 aa22.2■■□□□ 1.14
PARL-201ENST00000311101 EMC2Q15006 297 aa22.2■■□□□ 1.14
PARL-201ENST00000311101 IL17AQ16552 155 aa22.2■■□□□ 1.14
PARL-201ENST00000311101 RILPL1Q5EBL4 403 aa22.2■■□□□ 1.14
PARL-201ENST00000311101 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
PARL-201ENST00000311101 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
PARL-201ENST00000311101 C17orf80Q9BSJ5 609 aa22.2■■□□□ 1.14
PARL-201ENST00000311101 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
PARL-201ENST00000311101 TUFT1Q9NNX1 390 aa22.2■■□□□ 1.14
PARL-201ENST00000311101 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa22.2■■□□□ 1.14
PARL-201ENST00000311101 COL4A6Q14031 1691 aa22.2■■□□□ 1.14
PARL-201ENST00000311101 ARID2Q68CP9 1835 aa22.2■■□□□ 1.14
PARL-201ENST00000311101 TTC3P53804 2025 aa22.19■■□□□ 1.14
PARL-201ENST00000311101 DENND3A2RUS2 1198 aa22.19■■□□□ 1.14
PARL-201ENST00000311101 DGKIO75912 1065 aa22.19■■□□□ 1.14
PARL-201ENST00000311101 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
PARL-201ENST00000311101 SARSP49591 514 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
PARL-201ENST00000311101 RARRES1P49788 294 aa22.19■■□□□ 1.14
PARL-201ENST00000311101 NPAS4Q8IUM7 802 aa22.19■■□□□ 1.14
PARL-201ENST00000311101 EXOC8Q8IYI6 725 aa22.19■■□□□ 1.14
PARL-201ENST00000311101 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
PARL-201ENST00000311101 NLRP4Q96MN2 994 aa22.19■■□□□ 1.14
PARL-201ENST00000311101 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
PARL-201ENST00000311101 RGS18Q9NS28 235 aa22.19■■□□□ 1.14
PARL-201ENST00000311101 FOXD4L1Q9NU39 408 aa22.19■■□□□ 1.14
PARL-201ENST00000311101 C9IYK1 514 aa22.18■■□□□ 1.14
PARL-201ENST00000311101 LPXNO60711 386 aa22.18■■□□□ 1.14
PARL-201ENST00000311101 RPA1P27694 616 aa22.18■■□□□ 1.14
PARL-201ENST00000311101 CDC42EP1Q00587 391 aa22.18■■□□□ 1.14
PARL-201ENST00000311101 POTEGQ6S5H5 508 aa22.18■■□□□ 1.14
PARL-201ENST00000311101 ZNF410Q86VK4 478 aa22.18■■□□□ 1.14
PARL-201ENST00000311101 MICALL1Q8N3F8 863 aa22.18■■□□□ 1.14
PARL-201ENST00000311101 ERMNQ8TAM6 284 aa22.18■■□□□ 1.14
PARL-201ENST00000311101 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
PARL-201ENST00000311101 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
PARL-201ENST00000311101 MTRQ99707 1265 aa22.18■■□□□ 1.14
PARL-201ENST00000311101 C1orf112Q9NSG2 853 aa22.18■■□□□ 1.14
PARL-201ENST00000311101 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa22.18■■□□□ 1.14
PARL-201ENST00000311101 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
PARL-201ENST00000311101 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa22.17■■□□□ 1.14
PARL-201ENST00000311101 LINC00271P0C7V0 271 aa22.17■■□□□ 1.14
PARL-201ENST00000311101 GATMP50440 423 aa22.17■■□□□ 1.14
PARL-201ENST00000311101 GRB10Q13322 594 aa22.17■■□□□ 1.14
PARL-201ENST00000311101 ECM1Q16610 540 aa22.17■■□□□ 1.14
PARL-201ENST00000311101 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
PARL-201ENST00000311101 SLC24A5Q71RS6 500 aa22.17■■□□□ 1.14
PARL-201ENST00000311101 IGSF22Q8N9C0 903 aa22.17■■□□□ 1.14
PARL-201ENST00000311101 GDPD5Q8WTR4 605 aa22.17■■□□□ 1.14
PARL-201ENST00000311101 SNX21Q969T3 373 aa22.17■■□□□ 1.14
PARL-201ENST00000311101 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
PARL-201ENST00000311101 IFT122Q9HBG6 1241 aa22.17■■□□□ 1.14
PARL-201ENST00000311101 LRWD1Q9UFC0 647 aa22.17■■□□□ 1.14
PARL-201ENST00000311101 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
PARL-201ENST00000311101 PP2D1A8MPX8 630 aa22.16■■□□□ 1.14
PARL-201ENST00000311101 LAD1O00515 517 aa22.16■■□□□ 1.14
PARL-201ENST00000311101 GAS2O43903 313 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
PARL-201ENST00000311101 STAG3L1P0CL83 205 aa22.16■■□□□ 1.14
PARL-201ENST00000311101 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP22.16■■□□□ 1.14
PARL-201ENST00000311101 PRPHP41219 470 aa22.16■■□□□ 1.14
PARL-201ENST00000311101 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
PARL-201ENST00000311101 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa22.16■■□□□ 1.14
PARL-201ENST00000311101 PDIA5Q14554 519 aa22.16■■□□□ 1.14
PARL-201ENST00000311101 FERMT3Q86UX7 667 aa22.16■■□□□ 1.14
PARL-201ENST00000311101 TCP11Q8WWU5 503 aa22.16■■□□□ 1.14
PARL-201ENST00000311101 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa22.16■■□□□ 1.14
PARL-201ENST00000311101 LRFN2Q9ULH4 789 aa22.16■■□□□ 1.14
PARL-201ENST00000311101 USO1O60763 962 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
PARL-201ENST00000311101 DGAT1O75907 488 aa22.15■■□□□ 1.14
PARL-201ENST00000311101 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa22.15■■□□□ 1.14
PARL-201ENST00000311101 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.4 ms