RNA–Protein interactions for RNA: YPL153C

RAD53, Transcript of DNA damage response protein kinase, yeast

Gene RAD53, Length 2,466 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RAD53	YPL153C	GPI14	P47088	403 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RAD53	YPL153C	GET1	P53192	235 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RAD53	YPL153C	SWC4	P53201	476 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RAD53	YPL153C	YGR079W	P53249	370 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RAD53	YPL153C	YLR460C	P54007	376 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RAD53	YPL153C	CYK3	Q07533	885 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RAD53	YPL153C	FCY22	Q12119	530 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RAD53	YPL153C	YPR014C	Q6B0W2	109 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RAD53	YPL153C	THP2	O13539	261 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RAD53	YPL153C	SEC53	P07283	254 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RAD53	YPL153C	CUP2	P15315	225 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RAD53	YPL153C	EXG1	P23776	448 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RAD53	YPL153C	YSP3	P25036	478 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RAD53	YPL153C	CPR3	P25719	182 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RAD53	YPL153C	ARO7	P32178	256 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RAD53	YPL153C	ADD66	P36040	267 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RAD53	YPL153C	FLO10	P36170	1169 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RAD53	YPL153C	TCM62	P38228	572 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RAD53	YPL153C	RRT2	P38332	387 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RAD53	YPL153C	CRG1	P38892	291 aa	RIP-Chip data	4.95	□□□□□ -1.62	RIP-Chip
RAD53	YPL153C	COG3	P40094	801 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RAD53	YPL153C	LAS21	P40367	830 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RAD53	YPL153C	SLS1	P42900	643 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RAD53	YPL153C	YFR057W	P43625	151 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RAD53	YPL153C	YPT32	P51996	222 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RAD53	YPL153C	PMT5	P52867	743 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RAD53	YPL153C	TPN1	P53099	579 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RAD53	YPL153C	YNL115C	P53925	644 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RAD53	YPL153C	ERG5	P54781	538 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RAD53	YPL153C	PFA5	Q03289	374 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RAD53	YPL153C	RKM2	Q03942	479 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RAD53	YPL153C	NAT4	Q04751	285 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RAD53	YPL153C	YLR225C	Q05948	407 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RAD53	YPL153C	IZH3	Q07959	543 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RAD53	YPL153C	NDJ1	Q12366	352 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RAD53	YPL153C	GTT2	Q12390	233 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RAD53	YPL153C	PRM4	Q12498	284 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RAD53	YPL153C	YHR213W-A	Q8TGT4	77 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RAD53	YPL153C	GPM1	P00950	247 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RAD53	YPL153C	RPL24A	P04449	155 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RAD53	YPL153C	HAP2	P06774	265 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAD53	YPL153C	PUT1	P09368	476 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAD53	YPL153C	VPS33	P20795	691 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAD53	YPL153C	PRE1	P22141	198 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RAD53	YPL153C	UGA4	P32837	571 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAD53	YPL153C	YAR028W	P39548	234 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAD53	YPL153C	PAC2	P39937	518 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAD53	YPL153C	OXA1	P39952	402 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAD53	YPL153C	YPT11	P48559	417 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAD53	YPL153C	RMD9	P53140	646 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RAD53	YPL153C	YPR003C	P53394	754 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAD53	YPL153C	HCH1	P53834	153 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAD53	YPL153C	TPS1	Q00764	495 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RAD53	YPL153C	SYC1	Q08553	188 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RAD53	YPL153C	DCI1	Q08558	271 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAD53	YPL153C	YPR027C	Q12079	277 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAD53	YPL153C	TPT1	Q12272	230 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RAD53	YPL153C	YGL194C-A	Q2V2P6	80 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAD53	YPL153C	STE18	P18852	110 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAD53	YPL153C	AEP1	P32493	518 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAD53	YPL153C	CYS4	P32582	507 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RAD53	YPL153C	YPT7	P32939	208 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAD53	YPL153C	WBP1	P33767	430 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RAD53	YPL153C	PPE1	P38796	400 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAD53	YPL153C	MIC19	P43594	170 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAD53	YPL153C	ERV14	P53173	138 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAD53	YPL153C	PEX31	P53203	462 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAD53	YPL153C	ODC1	Q03028	310 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAD53	YPL153C	TVP18	Q04767	167 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAD53	YPL153C	HRD3	Q05787	833 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAD53	YPL153C	YPR196W	Q06595	470 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAD53	YPL153C	BTS1	Q12051	335 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAD53	YPL153C	YLR046C	Q12253	270 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RAD53	YPL153C	NTE1	Q04958	1679 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RAD53	YPL153C	COX2	P00410	251 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RAD53	YPL153C	ADE4	P04046	510 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RAD53	YPL153C	NAM2	P11325	894 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RAD53	YPL153C	SAG1	P20840	650 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RAD53	YPL153C	CCA1	P21269	546 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RAD53	YPL153C	EHD3	P28817	500 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RAD53	YPL153C	PEX4	P29340	183 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RAD53	YPL153C	NRP1	P32770	719 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.93	□□□□□ -1.62	not detected
RAD53	YPL153C	MRPL4	P36517	319 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RAD53	YPL153C	ARA1	P38115	344 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RAD53	YPL153C	GOS1	P38736	223 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RAD53	YPL153C	SET5	P38890	526 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RAD53	YPL153C	COX15	P40086	486 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RAD53	YPL153C	COA1	P40452	197 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RAD53	YPL153C	MRX5	P47007	382 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RAD53	YPL153C	FLC3	P53121	802 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RAD53	YPL153C	VPS73	P53142	486 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RAD53	YPL153C	TIM8	P57744	87 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RAD53	YPL153C	FRK1	Q03002	865 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RAD53	YPL153C	DAL4	Q04895	635 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RAD53	YPL153C	YDR278C	Q05612	105 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RAD53	YPL153C	NOC4	Q06512	552 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RAD53	YPL153C	ATX2	Q12067	313 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RAD53	YPL153C	RKI1	Q12189	258 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RAD53	YPL153C	PKH2	Q12236	1081 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RAD53	YPL153C	SAS5	Q99314	248 aa		4.93	□□□□□ -1.62

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