RNA–Protein interactions for RNA: YKR063C

LAS1, Transcript of Protein required for pre-rRNA processing at both ends of ITS2, yeast

Gene LAS1, Length 1,509 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
LAS1	YKR063C	MEI5	P32489	222 aa		3.99	□□□□□ -1.77
LAS1	YKR063C	UTP11	P34247	250 aa	Predicted RBP	3.99	□□□□□ -1.77
LAS1	YKR063C	ASC1	P38011	319 aa	Known RBP	3.99	□□□□□ -1.77
LAS1	YKR063C	ZTA1	P38230	334 aa	Known RBP	3.99	□□□□□ -1.77
LAS1	YKR063C	YEL020C	P39994	560 aa		3.99	□□□□□ -1.77
LAS1	YKR063C	AVT6	P40074	448 aa		3.99	□□□□□ -1.77
LAS1	YKR063C	MPM1	P40364	252 aa		3.99	□□□□□ -1.77
LAS1	YKR063C	AZF1	P41696	914 aa		3.99	□□□□□ -1.77
LAS1	YKR063C	YGR201C	P42936	225 aa		3.99	□□□□□ -1.77
LAS1	YKR063C	YFR020W	P43600	232 aa		3.99	□□□□□ -1.77
LAS1	YKR063C	IRC5	P43610	853 aa		3.99	□□□□□ -1.77
LAS1	YKR063C	PAC10	P48363	199 aa		3.99	□□□□□ -1.77
LAS1	YKR063C	ROG1	P53118	685 aa		3.99	□□□□□ -1.77
LAS1	YKR063C	YGR250C	P53316	781 aa	Known RBP	3.99	□□□□□ -1.77
LAS1	YKR063C	YNL181W	P53878	407 aa		3.99	□□□□□ -1.77
LAS1	YKR063C	IGO1	P53897	168 aa		3.99	□□□□□ -1.77
LAS1	YKR063C	COG5	P53951	403 aa		3.99	□□□□□ -1.77
LAS1	YKR063C	ARP10	Q04549	284 aa		3.99	□□□□□ -1.77
LAS1	YKR063C	PDR8	Q06149	701 aa		3.99	□□□□□ -1.77
LAS1	YKR063C	SWA2	Q06677	668 aa		3.99	□□□□□ -1.77
LAS1	YKR063C	TEN1	Q07921	160 aa		3.99	□□□□□ -1.77
LAS1	YKR063C	REX4	Q08237	289 aa		3.99	□□□□□ -1.77
LAS1	YKR063C	MSH5	Q12175	901 aa		3.99	□□□□□ -1.77
LAS1	YKR063C	HER1	Q12276	1246 aa		3.99	□□□□□ -1.77
LAS1	YKR063C	NAG1	Q8TGN9	163 aa		3.99	□□□□□ -1.77
LAS1	YKR063C	STT4	P37297	1900 aa		3.99	□□□□□ -1.77
LAS1	YKR063C	CCH1	P50077	2039 aa		3.98	□□□□□ -1.77
LAS1	YKR063C	MF(ALPHA)1	P01149	165 aa		3.98	□□□□□ -1.77
LAS1	YKR063C	REP1	P03871	373 aa		3.98	□□□□□ -1.77
LAS1	YKR063C	MET17	P06106	444 aa		3.98	□□□□□ -1.77
LAS1	YKR063C	PUT2	P07275	575 aa		3.98	□□□□□ -1.77
LAS1	YKR063C	RPS1B	P23248	255 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
LAS1	YKR063C	YCL049C	P25577	312 aa		3.98	□□□□□ -1.77
LAS1	YKR063C	YJU2	P28320	278 aa	Predicted RBP	3.98	□□□□□ -1.77
LAS1	YKR063C	SSH4	P32343	579 aa		3.98	□□□□□ -1.77
LAS1	YKR063C	NPL6	P32832	435 aa		3.98	□□□□□ -1.77
LAS1	YKR063C	LOT5	P34234	306 aa		3.98	□□□□□ -1.77
LAS1	YKR063C	TOR1	P35169	2470 aa		3.98	□□□□□ -1.77
LAS1	YKR063C	MRPL37	P36532	105 aa		3.98	□□□□□ -1.77
LAS1	YKR063C	MNN2	P38069	597 aa		3.98	□□□□□ -1.77
LAS1	YKR063C	SCO2	P38072	301 aa		3.98	□□□□□ -1.77
LAS1	YKR063C	STP2	P38704	541 aa		3.98	□□□□□ -1.77
LAS1	YKR063C	MET30	P39014	640 aa		3.98	□□□□□ -1.77
LAS1	YKR063C	KRE29	P40026	464 aa		3.98	□□□□□ -1.77
LAS1	YKR063C	SPO73	P40031	143 aa		3.98	□□□□□ -1.77
LAS1	YKR063C	TPA1	P40032	644 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
LAS1	YKR063C	LYS12	P40495	371 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
LAS1	YKR063C	SSU1	P41930	458 aa		3.98	□□□□□ -1.77
LAS1	YKR063C	PSA1	P41940	361 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
LAS1	YKR063C	PRM10	P42946	383 aa		3.98	□□□□□ -1.77
LAS1	YKR063C	PRM8	P53174	237 aa		3.98	□□□□□ -1.77
LAS1	YKR063C	ERG26	P53199	349 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
LAS1	YKR063C	APM1	Q00776	475 aa	Predicted RBP	3.98	□□□□□ -1.77
LAS1	YKR063C	SED5	Q01590	340 aa		3.98	□□□□□ -1.77
LAS1	YKR063C	KRE28	Q04431	385 aa		3.98	□□□□□ -1.77
LAS1	YKR063C	FMP42	Q04991	504 aa		3.98	□□□□□ -1.77
LAS1	YKR063C	DAP1	Q12091	152 aa		3.98	□□□□□ -1.77
LAS1	YKR063C	MSB2	P32334	1306 aa		3.97	□□□□□ -1.77
LAS1	YKR063C	ZWF1	P11412	505 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
LAS1	YKR063C	RED1	P14291	827 aa		3.97	□□□□□ -1.77
LAS1	YKR063C	ASF2	P32448	525 aa	Predicted RBP	3.97	□□□□□ -1.77
LAS1	YKR063C	SFC1	P33303	322 aa		3.97	□□□□□ -1.77
LAS1	YKR063C	TEF4	P36008	412 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
LAS1	YKR063C	FES1	P38260	290 aa		3.97	□□□□□ -1.77
LAS1	YKR063C	BIG1	P38813	335 aa		3.97	□□□□□ -1.77
LAS1	YKR063C	YHR177W	P38867	453 aa		3.97	□□□□□ -1.77
LAS1	YKR063C	SOP4	P39543	234 aa	Predicted RBP	3.97	□□□□□ -1.77
LAS1	YKR063C	COG3	P40094	801 aa		3.97	□□□□□ -1.77
LAS1	YKR063C	YJL068C	P40363	299 aa		3.97	□□□□□ -1.77
LAS1	YKR063C	PAC11	P40960	533 aa		3.97	□□□□□ -1.77
LAS1	YKR063C	CAK1	P43568	368 aa	Predicted RBP	3.97	□□□□□ -1.77
LAS1	YKR063C	RAD17	P48581	401 aa		3.97	□□□□□ -1.77
LAS1	YKR063C	NQM1	P53228	333 aa	Predicted RBP	3.97	□□□□□ -1.77
LAS1	YKR063C	TRM82	Q03774	444 aa		3.97	□□□□□ -1.77
LAS1	YKR063C	RIM13	Q03792	727 aa		3.97	□□□□□ -1.77
LAS1	YKR063C	RRP45	Q05636	305 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
LAS1	YKR063C	RRP40	Q08285	240 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
LAS1	YKR063C	RPN8	Q08723	338 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
LAS1	YKR063C	PFA4	Q12006	378 aa		3.97	□□□□□ -1.77
LAS1	YKR063C	TRM10	Q12400	293 aa		3.97	□□□□□ -1.77
LAS1	YKR063C	MRX4	Q12467	430 aa		3.97	□□□□□ -1.77
LAS1	YKR063C	YPR064W	Q12492	139 aa		3.97	□□□□□ -1.77
LAS1	YKR063C	FAB1	P34756	2278 aa		3.97	□□□□□ -1.77
LAS1	YKR063C	COX3	P00420	269 aa		3.96	□□□□□ -1.78
LAS1	YKR063C	PET9	P18239	318 aa	Known RBP	3.96	□□□□□ -1.78
LAS1	YKR063C	BUD5	P25300	642 aa	Predicted RBP	3.96	□□□□□ -1.78
LAS1	YKR063C	RRP7	P25368	297 aa	Predicted RBP	3.96	□□□□□ -1.78
LAS1	YKR063C	RHB1	P25378	209 aa		3.96	□□□□□ -1.78
LAS1	YKR063C	ERG1	P32476	496 aa	Known RBP	3.96	□□□□□ -1.78
LAS1	YKR063C	RML2	P32611	393 aa		3.96	□□□□□ -1.78
LAS1	YKR063C	LHP1	P33399	275 aa	Known RBP	3.96	□□□□□ -1.78
LAS1	YKR063C	PIM1	P36775	1133 aa		3.96	□□□□□ -1.78
LAS1	YKR063C	BNA4	P38169	460 aa		3.96	□□□□□ -1.78
LAS1	YKR063C	YHR033W	P38690	423 aa		3.96	□□□□□ -1.78
LAS1	YKR063C	IPT1	P38954	527 aa		3.96	□□□□□ -1.78
LAS1	YKR063C	PCF11	P39081	626 aa	Predicted RBP	3.96	□□□□□ -1.78
LAS1	YKR063C	AIM2	P39721	246 aa		3.96	□□□□□ -1.78
LAS1	YKR063C	YAL037W	P39728	267 aa		3.96	□□□□□ -1.78
LAS1	YKR063C	ISC1	P40015	477 aa	Known RBP	3.96	□□□□□ -1.78
LAS1	YKR063C	FAU1	P40099	211 aa		3.96	□□□□□ -1.78

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 29.1 ms