RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560971.1

GCSHP2-201, Transcript of glycine cleavage system protein H pseudogene 2, humanhuman

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Gene GCSHP2, Length 527 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSHP2-201ENST00000560971 CYP26B1Q9NR63 512 aa20.84■□□□□ 0.93
GCSHP2-201ENST00000560971 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP20.83■□□□□ 0.93
GCSHP2-201ENST00000560971 GPR32O75388 356 aa20.83■□□□□ 0.93
GCSHP2-201ENST00000560971 AMHP03971 560 aa20.83■□□□□ 0.93
GCSHP2-201ENST00000560971 TMOD1P28289 359 aa20.83■□□□□ 0.93
GCSHP2-201ENST00000560971 YWHABP31946 246 aaKnown RBP20.83■□□□□ 0.93
GCSHP2-201ENST00000560971 PTGDRQ13258 359 aa20.83■□□□□ 0.93
GCSHP2-201ENST00000560971 MYOCDQ8IZQ8 938 aa20.83■□□□□ 0.93
GCSHP2-201ENST00000560971 SNX21Q969T3 373 aa20.83■□□□□ 0.93
GCSHP2-201ENST00000560971 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP20.83■□□□□ 0.93
GCSHP2-201ENST00000560971 CEP170P1Q96L14 293 aa20.83■□□□□ 0.93
GCSHP2-201ENST00000560971 MAP7D2Q96T17 732 aa20.83■□□□□ 0.93
GCSHP2-201ENST00000560971 OSMRQ99650 979 aa20.83■□□□□ 0.93
GCSHP2-201ENST00000560971 ZBED2Q9BTP6 218 aa20.83■□□□□ 0.93
GCSHP2-201ENST00000560971 PADI3Q9ULW8 664 aa20.83■□□□□ 0.93
GCSHP2-201ENST00000560971 SQORQ9Y6N5 450 aa20.83■□□□□ 0.93
GCSHP2-201ENST00000560971 GBF1Q92538 1859 aa20.83■□□□□ 0.92
GCSHP2-201ENST00000560971 EVPLQ92817 2033 aa20.83■□□□□ 0.92
GCSHP2-201ENST00000560971 PTPRSQ13332 1948 aa20.82■□□□□ 0.92
GCSHP2-201ENST00000560971 TMEM265A0A087WTH1 108 aa20.82■□□□□ 0.92
GCSHP2-201ENST00000560971 A0A087WWV3 80 aa20.82■□□□□ 0.92
GCSHP2-201ENST00000560971 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa20.82■□□□□ 0.92
GCSHP2-201ENST00000560971 TLL1O43897 1013 aa20.82■□□□□ 0.92
GCSHP2-201ENST00000560971 MAFO75444 373 aaPredicted RBP20.82■□□□□ 0.92
GCSHP2-201ENST00000560971 CA3P07451 260 aa20.82■□□□□ 0.92
GCSHP2-201ENST00000560971 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP20.82■□□□□ 0.92
GCSHP2-201ENST00000560971 PAK2Q13177 524 aa20.82■□□□□ 0.92
GCSHP2-201ENST00000560971 GRIN2CQ14957 1233 aa20.82■□□□□ 0.92
GCSHP2-201ENST00000560971 USP38Q8NB14 1042 aa20.82■□□□□ 0.92
GCSHP2-201ENST00000560971 ADAMTS10Q9H324 1103 aa20.82■□□□□ 0.92
GCSHP2-201ENST00000560971 SLC28A3Q9HAS3 691 aa20.82■□□□□ 0.92
GCSHP2-201ENST00000560971 CHD7Q9P2D1 2997 aa20.82■□□□□ 0.92
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GCSHP2-201ENST00000560971 ENPP3O14638 875 aa20.81■□□□□ 0.92
GCSHP2-201ENST00000560971 ARHGEF15O94989 841 aa20.81■□□□□ 0.92
GCSHP2-201ENST00000560971 GJB5O95377 273 aa20.81■□□□□ 0.92
GCSHP2-201ENST00000560971 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa20.81■□□□□ 0.92
GCSHP2-201ENST00000560971 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP20.81■□□□□ 0.92
GCSHP2-201ENST00000560971 RILPL1Q5EBL4 403 aa20.81■□□□□ 0.92
GCSHP2-201ENST00000560971 XKR9Q5GH70 373 aa20.81■□□□□ 0.92
GCSHP2-201ENST00000560971 OTUD6AQ7L8S5 288 aa20.81■□□□□ 0.92
GCSHP2-201ENST00000560971 NEK9Q8TD19 979 aa20.81■□□□□ 0.92
GCSHP2-201ENST00000560971 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP20.81■□□□□ 0.92
GCSHP2-201ENST00000560971 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP20.81■□□□□ 0.92
GCSHP2-201ENST00000560971 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP20.81■□□□□ 0.92
GCSHP2-201ENST00000560971 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP20.81■□□□□ 0.92
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GCSHP2-201ENST00000560971 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP20.8■□□□□ 0.92
GCSHP2-201ENST00000560971 MED24O75448 989 aa20.8■□□□□ 0.92
GCSHP2-201ENST00000560971 RPS6KA5O75582 802 aa20.8■□□□□ 0.92
GCSHP2-201ENST00000560971 UPP2O95045 317 aa20.8■□□□□ 0.92
GCSHP2-201ENST00000560971 LYPLA2O95372 231 aa20.8■□□□□ 0.92
GCSHP2-201ENST00000560971 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP20.8■□□□□ 0.92
GCSHP2-201ENST00000560971 PPP2R2DQ66LE6 453 aa20.8■□□□□ 0.92
GCSHP2-201ENST00000560971 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP20.8■□□□□ 0.92
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GCSHP2-201ENST00000560971 CATSPER3Q86XQ3 398 aa20.8■□□□□ 0.92
GCSHP2-201ENST00000560971 LINC01599Q8WXQ3 324 aa20.8■□□□□ 0.92
GCSHP2-201ENST00000560971 TMX1Q9H3N1 280 aa20.8■□□□□ 0.92
GCSHP2-201ENST00000560971 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP20.8■□□□□ 0.92
GCSHP2-201ENST00000560971 COL6A3P12111 3177 aa20.8■□□□□ 0.92
GCSHP2-201ENST00000560971 MICAL3Q7RTP6 2002 aa20.8■□□□□ 0.92
GCSHP2-201ENST00000560971 SYT1P21579 422 aa20.79■□□□□ 0.92
GCSHP2-201ENST00000560971 DNM2P50570 870 aa20.79■□□□□ 0.92
GCSHP2-201ENST00000560971 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP20.79■□□□□ 0.92
GCSHP2-201ENST00000560971 GPC3P51654 580 aa20.79■□□□□ 0.92
GCSHP2-201ENST00000560971 IL17AQ16552 155 aa20.79■□□□□ 0.92
GCSHP2-201ENST00000560971 PIGOQ8TEQ8 1089 aa20.79■□□□□ 0.92
GCSHP2-201ENST00000560971 TOP1MTQ969P6 601 aa20.79■□□□□ 0.92
GCSHP2-201ENST00000560971 RAD9AQ99638 391 aa20.79■□□□□ 0.92
GCSHP2-201ENST00000560971 ERVK-5Q9HDB9 667 aa20.79■□□□□ 0.92
GCSHP2-201ENST00000560971 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa20.79■□□□□ 0.92
GCSHP2-201ENST00000560971 PDCP20941 246 aa20.78■□□□□ 0.92
GCSHP2-201ENST00000560971 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP20.78■□□□□ 0.92
GCSHP2-201ENST00000560971 FAM228AQ86W67 206 aa20.78■□□□□ 0.92
GCSHP2-201ENST00000560971 KSR1Q8IVT5 923 aa20.78■□□□□ 0.92
GCSHP2-201ENST00000560971 HSCBQ8IWL3 235 aa20.78■□□□□ 0.92
GCSHP2-201ENST00000560971 NLRP7Q8WX94 980 aa20.78■□□□□ 0.92
GCSHP2-201ENST00000560971 SLC7A3Q8WY07 619 aa20.78■□□□□ 0.92
GCSHP2-201ENST00000560971 MYLIPQ8WY64 445 aa20.78■□□□□ 0.92
GCSHP2-201ENST00000560971 TMEM143Q96AN5 459 aa20.78■□□□□ 0.92
GCSHP2-201ENST00000560971 SCLT1Q96NL6 688 aa20.78■□□□□ 0.92
GCSHP2-201ENST00000560971 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP20.78■□□□□ 0.92
GCSHP2-201ENST00000560971 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP20.78■□□□□ 0.92
GCSHP2-201ENST00000560971 TUFT1Q9NNX1 390 aa20.78■□□□□ 0.92
GCSHP2-201ENST00000560971 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa20.78■□□□□ 0.92
GCSHP2-201ENST00000560971 RFC5P40937 340 aa20.77■□□□□ 0.92
GCSHP2-201ENST00000560971 TAP1Q03518 808 aa20.77■□□□□ 0.92
GCSHP2-201ENST00000560971 EMC2Q15006 297 aa20.77■□□□□ 0.92
GCSHP2-201ENST00000560971 SPRED2Q7Z698 418 aa20.77■□□□□ 0.92
GCSHP2-201ENST00000560971 RHPN2Q8IUC4 686 aa20.77■□□□□ 0.92
GCSHP2-201ENST00000560971 ERMNQ8TAM6 284 aa20.77■□□□□ 0.92
GCSHP2-201ENST00000560971 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP20.77■□□□□ 0.92
GCSHP2-201ENST00000560971 FTHL17Q9BXU8 183 aa20.77■□□□□ 0.92
GCSHP2-201ENST00000560971 PRDM12Q9H4Q4 367 aa20.77■□□□□ 0.92
GCSHP2-201ENST00000560971 CERS4Q9HA82 394 aa20.77■□□□□ 0.92
GCSHP2-201ENST00000560971 ANKEF1Q9NU02 776 aa20.77■□□□□ 0.92
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GCSHP2-201ENST00000560971 PPME1Q9Y570 386 aa20.77■□□□□ 0.92
GCSHP2-201ENST00000560971 EYSQ5T1H1 3165 aa20.76■□□□□ 0.91
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