RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471023.1

NOP56-211, Transcript of NOP56 ribonucleoprotein, humanhuman

TSL 2

Gene NOP56, Length 592 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP56-211ENST00000471023 MYLIPQ8WY64 445 aa8.46□□□□□ -1.06
NOP56-211ENST00000471023 TIFAQ96CG3 184 aa8.46□□□□□ -1.06
NOP56-211ENST00000471023 GPRASP2Q96D09 838 aa8.46□□□□□ -1.06
NOP56-211ENST00000471023 C8orf76Q96K31 380 aa8.46□□□□□ -1.06
NOP56-211ENST00000471023 ZFP42Q96MM3 310 aa8.46□□□□□ -1.06
NOP56-211ENST00000471023 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
NOP56-211ENST00000471023 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
NOP56-211ENST00000471023 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
NOP56-211ENST00000471023 RTEL1Q9NZ71 1219 aa8.46□□□□□ -1.06
NOP56-211ENST00000471023 MTMR6Q9Y217 621 aa8.46□□□□□ -1.06
NOP56-211ENST00000471023 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa8.45□□□□□ -1.06
NOP56-211ENST00000471023 SPDYE3A6NKU9 549 aa8.45□□□□□ -1.06
NOP56-211ENST00000471023 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
NOP56-211ENST00000471023 SLC37A4O43826 429 aa8.45□□□□□ -1.06
NOP56-211ENST00000471023 STAM2O75886 525 aa8.45□□□□□ -1.06
NOP56-211ENST00000471023 SYT1P21579 422 aa8.45□□□□□ -1.06
NOP56-211ENST00000471023 KRT2P35908 639 aa8.45□□□□□ -1.06
NOP56-211ENST00000471023 USP11P51784 963 aa8.45□□□□□ -1.06
NOP56-211ENST00000471023 EPHB4P54760 987 aa8.45□□□□□ -1.06
NOP56-211ENST00000471023 PKP1Q13835 747 aa8.45□□□□□ -1.06
NOP56-211ENST00000471023 INF2Q27J81 1249 aa8.45□□□□□ -1.06
NOP56-211ENST00000471023 EML3Q32P44 896 aa8.45□□□□□ -1.06
NOP56-211ENST00000471023 Q4G0T1 1027 aa8.45□□□□□ -1.06
NOP56-211ENST00000471023 TMEM240Q5SV17 173 aa8.45□□□□□ -1.06
NOP56-211ENST00000471023 RASIP1Q5U651 963 aa8.45□□□□□ -1.06
NOP56-211ENST00000471023 MCTP2Q6DN12 878 aa8.45□□□□□ -1.06
NOP56-211ENST00000471023 MOXD1Q6UVY6 613 aa8.45□□□□□ -1.06
NOP56-211ENST00000471023 SEPT14Q6ZU15 432 aa8.45□□□□□ -1.06
NOP56-211ENST00000471023 KRT25Q7Z3Z0 450 aa8.45□□□□□ -1.06
NOP56-211ENST00000471023 FAM126BQ8IXS8 530 aa8.45□□□□□ -1.06
NOP56-211ENST00000471023 C4orf32Q8N8J7 132 aa8.45□□□□□ -1.06
NOP56-211ENST00000471023 SLC43A3Q8NBI5 491 aa8.45□□□□□ -1.06
NOP56-211ENST00000471023 ETNPPLQ8TBG4 499 aa8.45□□□□□ -1.06
NOP56-211ENST00000471023 BICD2Q8TD16 824 aa8.45□□□□□ -1.06
NOP56-211ENST00000471023 SCFD2Q8WU76 684 aa8.45□□□□□ -1.06
NOP56-211ENST00000471023 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
NOP56-211ENST00000471023 HERVK_113Q902F9 699 aa8.45□□□□□ -1.06
NOP56-211ENST00000471023 HAS1Q92839 578 aa8.45□□□□□ -1.06
NOP56-211ENST00000471023 SENP7Q9BQF6 1050 aa8.45□□□□□ -1.06
NOP56-211ENST00000471023 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP8.45□□□□□ -1.066e-21■□□□□ 10.7
NOP56-211ENST00000471023 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
NOP56-211ENST00000471023 SLC28A3Q9HAS3 691 aa8.45□□□□□ -1.06
NOP56-211ENST00000471023 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
NOP56-211ENST00000471023 IL23AQ9NPF7 189 aa8.45□□□□□ -1.06
NOP56-211ENST00000471023 KCNH7Q9NS40 1196 aa8.45□□□□□ -1.06
NOP56-211ENST00000471023 SMC3Q9UQE7 1217 aa8.45□□□□□ -1.06
NOP56-211ENST00000471023 ZDHHC9Q9Y397 364 aa8.45□□□□□ -1.06
NOP56-211ENST00000471023 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
NOP56-211ENST00000471023 NCOR1O75376 2440 aa8.45□□□□□ -1.06
NOP56-211ENST00000471023 GRIN2DO15399 1336 aa8.45□□□□□ -1.06
NOP56-211ENST00000471023 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa8.44□□□□□ -1.06
NOP56-211ENST00000471023 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP8.44□□□□□ -1.06
NOP56-211ENST00000471023 MSH4O15457 936 aa8.44□□□□□ -1.06
NOP56-211ENST00000471023 FIBPO43427 364 aa8.44□□□□□ -1.06
NOP56-211ENST00000471023 CCNE2O96020 404 aa8.44□□□□□ -1.06
NOP56-211ENST00000471023 CD4P01730 458 aa8.44□□□□□ -1.06
NOP56-211ENST00000471023 PFKMP08237 780 aa8.44□□□□□ -1.06
NOP56-211ENST00000471023 TXNP10599 105 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
NOP56-211ENST00000471023 TGFB3P10600 412 aa8.44□□□□□ -1.06
NOP56-211ENST00000471023 BMP2P12643 396 aa8.44□□□□□ -1.06
NOP56-211ENST00000471023 CSF2RAP15509 400 aa8.44□□□□□ -1.06
NOP56-211ENST00000471023 PTGIRP43119 386 aa8.44□□□□□ -1.06
NOP56-211ENST00000471023 CPT1AP50416 773 aa8.44□□□□□ -1.06
NOP56-211ENST00000471023 USP4Q13107 963 aa8.44□□□□□ -1.06
NOP56-211ENST00000471023 RESTQ13127 1097 aa8.44□□□□□ -1.06
NOP56-211ENST00000471023 GRIN2CQ14957 1233 aa8.44□□□□□ -1.06
NOP56-211ENST00000471023 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP8.44□□□□□ -1.06
NOP56-211ENST00000471023 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
NOP56-211ENST00000471023 PPP4R3AQ6IN85 833 aa8.44□□□□□ -1.06
NOP56-211ENST00000471023 CXCL17Q6UXB2 119 aa8.44□□□□□ -1.06
NOP56-211ENST00000471023 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa8.44□□□□□ -1.06
NOP56-211ENST00000471023 ZNF365Q70YC5 407 aa8.44□□□□□ -1.06
NOP56-211ENST00000471023 C16orf59Q7L2K0 433 aa8.44□□□□□ -1.06
NOP56-211ENST00000471023 TLK2Q86UE8 772 aa8.44□□□□□ -1.06
NOP56-211ENST00000471023 KAT2BQ92831 832 aa8.44□□□□□ -1.06
NOP56-211ENST00000471023 SLC5A5Q92911 643 aa8.44□□□□□ -1.06
NOP56-211ENST00000471023 GJA10Q969M2 543 aa8.44□□□□□ -1.06
NOP56-211ENST00000471023 PCYT2Q99447 389 aa8.44□□□□□ -1.06
NOP56-211ENST00000471023 TMEM60Q9H2L4 133 aa8.44□□□□□ -1.06
NOP56-211ENST00000471023 HIPK3Q9H422 1215 aa8.44□□□□□ -1.06
NOP56-211ENST00000471023 KCNMB3Q9NPA1 279 aa8.44□□□□□ -1.06
NOP56-211ENST00000471023 RAB6BQ9NRW1 208 aa8.44□□□□□ -1.06
NOP56-211ENST00000471023 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa8.43□□□□□ -1.06
NOP56-211ENST00000471023 CDH23Q9H251 3354 aa8.43□□□□□ -1.06
NOP56-211ENST00000471023 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa8.43□□□□□ -1.06
NOP56-211ENST00000471023 MAFGO15525 162 aa8.43□□□□□ -1.06
NOP56-211ENST00000471023 PSMD10O75832 226 aa8.43□□□□□ -1.06
NOP56-211ENST00000471023 ATG7O95352 703 aa8.43□□□□□ -1.06
NOP56-211ENST00000471023 RFX1P22670 979 aa8.43□□□□□ -1.06
NOP56-211ENST00000471023 BEX3Q00994 111 aa8.43□□□□□ -1.06
NOP56-211ENST00000471023 SPIRE1Q08AE8 756 aa8.43□□□□□ -1.06
NOP56-211ENST00000471023 TTLL4Q14679 1199 aa8.43□□□□□ -1.06
NOP56-211ENST00000471023 HSDL1Q3SXM5 330 aa8.43□□□□□ -1.06
NOP56-211ENST00000471023 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
NOP56-211ENST00000471023 CYP2U1Q7Z449 544 aa8.43□□□□□ -1.06
NOP56-211ENST00000471023 NEK8Q86SG6 692 aa8.43□□□□□ -1.06
NOP56-211ENST00000471023 PLA2G4DQ86XP0 818 aa8.43□□□□□ -1.06
NOP56-211ENST00000471023 NOSTRINQ8IVI9 506 aa8.43□□□□□ -1.06
NOP56-211ENST00000471023 HSCBQ8IWL3 235 aa8.43□□□□□ -1.06
NOP56-211ENST00000471023 FAM184AQ8NB25 1140 aa8.43□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.4 ms