RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000029773.12

Cnn3-201, Transcript of Calponin-3, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Cnn3, Length 2,049 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Rpl13P47963 211 aaKnown RBP20.64■□□□□ 0.89
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Tpm4Q6IRU2 248 aa20.64■□□□□ 0.89
Cnn3-201ENSMUST00000029773 TbataQ7TSD4 393 aa20.64■□□□□ 0.89
Cnn3-201ENSMUST00000029773 SrcapA0A087WQ44 3271 aa20.64■□□□□ 0.89
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Znf568E9PYI1 671 aa20.63■□□□□ 0.89
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Heatr4E9Q357 955 aa20.63■□□□□ 0.89
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Clk2O35491 499 aa20.63■□□□□ 0.89
Cnn3-201ENSMUST00000029773 GmnnO88513 206 aa20.63■□□□□ 0.89
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Pdia4P08003 638 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Rbp3P49194 1234 aa20.63■□□□□ 0.89
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Evi5P97366 809 aa20.63■□□□□ 0.89
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Panx2Q6IMP4 677 aa20.63■□□□□ 0.89
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Ddx10Q80Y44 875 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Pym1Q8CHP5 203 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Bclaf1Q8K019 919 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Plcb4Q91UZ1 1175 aa20.63■□□□□ 0.89
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Tnpo2Q99LG2 887 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Lcmt1A0A0U1RNF2 332 aa20.63■□□□□ 0.89
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Skor2A7M7C7 1008 aa20.63■□□□□ 0.89
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Fam129cD3YZB0 591 aa20.63■□□□□ 0.89
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Surf1P09925 306 aa20.63■□□□□ 0.89
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Pbx1P41778 430 aa20.63■□□□□ 0.89
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Gtf2bP62915 316 aa20.63■□□□□ 0.89
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Capn13Q3UW68 665 aa20.63■□□□□ 0.89
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Ctnna3Q65CL1 895 aa20.63■□□□□ 0.89
Cnn3-201ENSMUST00000029773 D130040H23RikQ8BII3 405 aa20.63■□□□□ 0.89
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Map1sQ8C052 973 aa20.63■□□□□ 0.89
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Q8C5C9 218 aa20.63■□□□□ 0.89
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Tspan8Q8R3G9 235 aa20.63■□□□□ 0.89
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Tas1r1Q99PG6 842 aa20.63■□□□□ 0.89
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Kdm8Q9CXT6 414 aa20.63■□□□□ 0.89
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Klhl10Q9D5V2 608 aa20.63■□□□□ 0.89
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Etnk2A7MCT6 385 aa20.62■□□□□ 0.89
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Gm4841E9QAA8 417 aa20.62■□□□□ 0.89
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Psmc4P54775 418 aa20.62■□□□□ 0.89
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Adamts19P59509 1210 aa20.62■□□□□ 0.89
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Ogfod1Q3U0K8 545 aa20.62■□□□□ 0.89
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Sema5bQ60519 1093 aa20.62■□□□□ 0.89
Cnn3-201ENSMUST00000029773 E2f7Q6S7F2 904 aa20.62■□□□□ 0.89
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Atp6v0d2Q80SY3 350 aa20.62■□□□□ 0.89
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Ppme1Q8BVQ5 386 aa20.62■□□□□ 0.89
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Dnm3Q8BZ98 863 aa20.62■□□□□ 0.89
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Rps6ka5Q8C050 863 aa20.62■□□□□ 0.89
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Med15Q924H2 789 aa20.62■□□□□ 0.89
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Smtnl1Q99LM3 459 aa20.62■□□□□ 0.89
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Ccdc89Q9DA73 370 aa20.62■□□□□ 0.89
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Leng1Q9DB98 261 aa20.62■□□□□ 0.89
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Robo3Q9Z2I4 1366 aa20.62■□□□□ 0.89
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Gm10378F6XQQ1 160 aa20.61■□□□□ 0.89
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Zfp781Q0P5U5 243 aa20.61■□□□□ 0.89
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Fscn2Q32M02 492 aa20.61■□□□□ 0.89
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Gucy2cQ3UWA6 1072 aa20.61■□□□□ 0.89
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Samhd1Q60710 627 aa20.61■□□□□ 0.89
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Chtf18Q8BIW9 969 aa20.61■□□□□ 0.89
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Celf3Q8CIN6 465 aa20.61■□□□□ 0.89
Cnn3-201ENSMUST00000029773 H2-Q4Q8HWB2 354 aa20.61■□□□□ 0.89
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Galnt15Q9D2N8 638 aa20.61■□□□□ 0.89
Cnn3-201ENSMUST00000029773 PorcnQ9JJJ7 461 aa20.61■□□□□ 0.89
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Mdm4O35618 489 aa20.61■□□□□ 0.89
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Ccnd2P30280 289 aa20.61■□□□□ 0.89
Cnn3-201ENSMUST00000029773 MafP54843 370 aa20.6■□□□□ 0.89
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Zfp957Q3UT76 567 aa20.6■□□□□ 0.89
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Wrap53Q8VC51 532 aa20.6■□□□□ 0.89
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Tgs1Q923W1 853 aa20.6■□□□□ 0.89
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Xpo5Q924C1 1204 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Cmtr1Q9DBC3 837 aa20.6■□□□□ 0.89
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Cyp2s1Q9DBX6 501 aa20.6■□□□□ 0.89
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Ndst4Q9EQW8 872 aa20.6■□□□□ 0.89
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Irx4Q9QY61 515 aa20.6■□□□□ 0.89
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Sbf1Q6ZPE2 1867 aa20.6■□□□□ 0.89
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Tnni3P48787 211 aa20.6■□□□□ 0.89
Cnn3-201ENSMUST00000029773 ZbbxQ0P5X5 716 aa20.6■□□□□ 0.89
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Zc3h18Q0P678 948 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Ankrd24Q80VM7 985 aa20.6■□□□□ 0.89
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Reep2Q8VCD6 254 aa20.6■□□□□ 0.89
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Lpin2Q99PI5 893 aa20.6■□□□□ 0.89
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Tnfsf13bQ9WU72 309 aa20.6■□□□□ 0.89
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Dennd4aE9Q8V6 1869 aa20.59■□□□□ 0.89
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Gm44511A0A0N4SW10 223 aa20.59■□□□□ 0.89
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Myo1aO88329 1043 aa20.59■□□□□ 0.89
Cnn3-201ENSMUST00000029773 MybP06876 636 aa20.59■□□□□ 0.89
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Klrb1bP27812 223 aa20.59■□□□□ 0.89
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Tff2Q03404 129 aa20.59■□□□□ 0.89
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Srrm1Q52KI8 946 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Ahcyl2Q68FL4 613 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Nacc1Q7TSZ8 514 aa20.59■□□□□ 0.89
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Prpf40bQ80W14 870 aa20.59■□□□□ 0.89
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Usp6nlQ80XC3 819 aa20.59■□□□□ 0.89
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Nop9Q8BMC4 636 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Usp37Q8C0R0 979 aa20.59■□□□□ 0.89
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Rbm42Q91V81 474 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Grpel1Q99LP6 217 aa20.59■□□□□ 0.89
Cnn3-201ENSMUST00000029773 CutaQ9CQ89 177 aa20.59■□□□□ 0.89
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Smim10l2aA0A0B4J1F8 78 aa20.58■□□□□ 0.89
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Gm1993A6X8I0 212 aa20.58■□□□□ 0.89
Cnn3-201ENSMUST00000029773 SlxD3Z347 212 aa20.58■□□□□ 0.89
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Chrna9G3X8Z7 479 aa20.58■□□□□ 0.89
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Taf4bG5E8Z2 855 aa20.58■□□□□ 0.89
Cnn3-201ENSMUST00000029773 Adcy7P51829 1099 aa20.58■□□□□ 0.89
Cnn3-201ENSMUST00000029773 LxnP70202 222 aa20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 68.6 ms