Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCD6

Reep2, Receptor expression-enhancing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Reep2Q8VCD6 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC40.54■■■■■ 4.08
Reep2Q8VCD6 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
Reep2Q8VCD6 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
Reep2Q8VCD6 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
Reep2Q8VCD6 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
Reep2Q8VCD6 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
Reep2Q8VCD6 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC35.86■■■■□ 3.33
Reep2Q8VCD6 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC35.17■■■■□ 3.22
Reep2Q8VCD6 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC34.94■■■■□ 3.18
Reep2Q8VCD6 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Reep2Q8VCD6 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Reep2Q8VCD6 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC34.57■■■■□ 3.12
Reep2Q8VCD6 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
Reep2Q8VCD6 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Reep2Q8VCD6 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Reep2Q8VCD6 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Reep2Q8VCD6 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
Reep2Q8VCD6 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Reep2Q8VCD6 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Reep2Q8VCD6 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Reep2Q8VCD6 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Reep2Q8VCD6 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Reep2Q8VCD6 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Reep2Q8VCD6 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Reep2Q8VCD6 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Reep2Q8VCD6 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Reep2Q8VCD6 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
Reep2Q8VCD6 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.93
Reep2Q8VCD6 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Reep2Q8VCD6 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Reep2Q8VCD6 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC33.01■■■□□ 2.88
Reep2Q8VCD6 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.86
Reep2Q8VCD6 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
Reep2Q8VCD6 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Reep2Q8VCD6 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Reep2Q8VCD6 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Reep2Q8VCD6 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Reep2Q8VCD6 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Reep2Q8VCD6 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Reep2Q8VCD6 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
Reep2Q8VCD6 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC32.3■■■□□ 2.76
Reep2Q8VCD6 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Reep2Q8VCD6 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
Reep2Q8VCD6 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Reep2Q8VCD6 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Reep2Q8VCD6 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Reep2Q8VCD6 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Reep2Q8VCD6 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
Reep2Q8VCD6 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Reep2Q8VCD6 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC31.89■■■□□ 2.69
Reep2Q8VCD6 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC31.86■■■□□ 2.69
Reep2Q8VCD6 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Reep2Q8VCD6 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Reep2Q8VCD6 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
Reep2Q8VCD6 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Reep2Q8VCD6 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Reep2Q8VCD6 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
Reep2Q8VCD6 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Reep2Q8VCD6 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Reep2Q8VCD6 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
Reep2Q8VCD6 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Reep2Q8VCD6 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
Reep2Q8VCD6 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
Reep2Q8VCD6 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC31.38■■■□□ 2.61
Reep2Q8VCD6 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC31.37■■■□□ 2.61
Reep2Q8VCD6 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Reep2Q8VCD6 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC31.33■■■□□ 2.61
Reep2Q8VCD6 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC31.33■■■□□ 2.61
Reep2Q8VCD6 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Reep2Q8VCD6 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Reep2Q8VCD6 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
Reep2Q8VCD6 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC31.23■■■□□ 2.59
Reep2Q8VCD6 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
Reep2Q8VCD6 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Reep2Q8VCD6 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Reep2Q8VCD6 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Reep2Q8VCD6 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
Reep2Q8VCD6 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC30.94■■■□□ 2.54
Reep2Q8VCD6 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Reep2Q8VCD6 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Reep2Q8VCD6 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
Reep2Q8VCD6 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Reep2Q8VCD6 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
Reep2Q8VCD6 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Reep2Q8VCD6 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
Reep2Q8VCD6 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Reep2Q8VCD6 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Reep2Q8VCD6 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
Reep2Q8VCD6 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Reep2Q8VCD6 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Reep2Q8VCD6 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Reep2Q8VCD6 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Reep2Q8VCD6 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
Reep2Q8VCD6 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Reep2Q8VCD6 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Reep2Q8VCD6 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Reep2Q8VCD6 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Reep2Q8VCD6 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Reep2Q8VCD6 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
Reep2Q8VCD6 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.4 ms