Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW68

Capn13, Calpain-13, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn13Q3UW68 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC41.5■■■■■ 4.23
Capn13Q3UW68 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
Capn13Q3UW68 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
Capn13Q3UW68 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
Capn13Q3UW68 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC36.53■■■■□ 3.44
Capn13Q3UW68 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
Capn13Q3UW68 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
Capn13Q3UW68 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC35.84■■■■□ 3.33
Capn13Q3UW68 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC35.78■■■■□ 3.32
Capn13Q3UW68 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Capn13Q3UW68 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
Capn13Q3UW68 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Capn13Q3UW68 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
Capn13Q3UW68 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC34.69■■■■□ 3.14
Capn13Q3UW68 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Capn13Q3UW68 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
Capn13Q3UW68 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
Capn13Q3UW68 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Capn13Q3UW68 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Capn13Q3UW68 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Capn13Q3UW68 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Capn13Q3UW68 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Capn13Q3UW68 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Capn13Q3UW68 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Capn13Q3UW68 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC33.68■■■□□ 2.98
Capn13Q3UW68 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Capn13Q3UW68 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
Capn13Q3UW68 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Capn13Q3UW68 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
Capn13Q3UW68 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Capn13Q3UW68 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC33.17■■■□□ 2.9
Capn13Q3UW68 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Capn13Q3UW68 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
Capn13Q3UW68 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
Capn13Q3UW68 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Capn13Q3UW68 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Capn13Q3UW68 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Capn13Q3UW68 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Capn13Q3UW68 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Capn13Q3UW68 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
Capn13Q3UW68 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
Capn13Q3UW68 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
Capn13Q3UW68 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Capn13Q3UW68 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Capn13Q3UW68 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Capn13Q3UW68 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Capn13Q3UW68 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Capn13Q3UW68 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
Capn13Q3UW68 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Capn13Q3UW68 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Capn13Q3UW68 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
Capn13Q3UW68 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Capn13Q3UW68 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC32.06■■■□□ 2.72
Capn13Q3UW68 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
Capn13Q3UW68 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Capn13Q3UW68 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Capn13Q3UW68 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Capn13Q3UW68 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Capn13Q3UW68 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC31.82■■■□□ 2.69
Capn13Q3UW68 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
Capn13Q3UW68 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Capn13Q3UW68 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
Capn13Q3UW68 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC31.7■■■□□ 2.67
Capn13Q3UW68 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
Capn13Q3UW68 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Capn13Q3UW68 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Capn13Q3UW68 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
Capn13Q3UW68 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Capn13Q3UW68 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Capn13Q3UW68 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC31.55■■■□□ 2.64
Capn13Q3UW68 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Capn13Q3UW68 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
Capn13Q3UW68 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
Capn13Q3UW68 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC31.38■■■□□ 2.61
Capn13Q3UW68 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Capn13Q3UW68 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC31.3■■■□□ 2.6
Capn13Q3UW68 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC31.3■■■□□ 2.6
Capn13Q3UW68 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Capn13Q3UW68 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
Capn13Q3UW68 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Capn13Q3UW68 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Capn13Q3UW68 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Capn13Q3UW68 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
Capn13Q3UW68 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
Capn13Q3UW68 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Capn13Q3UW68 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Capn13Q3UW68 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC30.99■■■□□ 2.55
Capn13Q3UW68 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Capn13Q3UW68 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
Capn13Q3UW68 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Capn13Q3UW68 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC30.89■■■□□ 2.54
Capn13Q3UW68 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC30.88■■■□□ 2.53
Capn13Q3UW68 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Capn13Q3UW68 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Capn13Q3UW68 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Capn13Q3UW68 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Capn13Q3UW68 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Capn13Q3UW68 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Capn13Q3UW68 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Capn13Q3UW68 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 562.9 ms