RNA–Protein interactions for RNA: YKL195W

MIA40, Transcript of Mitochondrial oxidoreductase, yeast

Gene MIA40, Length 1,212 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MIA40	YKL195W	JLP2	P40206	208 aa		6.15	□□□□□ -1.42
MIA40	YKL195W	YJL068C	P40363	299 aa		6.15	□□□□□ -1.42
MIA40	YKL195W	MET28	P40573	187 aa		6.15	□□□□□ -1.42
MIA40	YKL195W	ZIM17	P42844	174 aa		6.15	□□□□□ -1.42
MIA40	YKL195W	YGR079W	P53249	370 aa		6.15	□□□□□ -1.42
MIA40	YKL195W	TPS1	Q00764	495 aa	Known RBP	6.15	□□□□□ -1.42
MIA40	YKL195W	MTQ2	Q03920	221 aa	Predicted RBP	6.15	□□□□□ -1.42
MIA40	YKL195W	ARO10	Q06408	635 aa		6.15	□□□□□ -1.42
MIA40	YKL195W	MDM36	Q06820	579 aa		6.15	□□□□□ -1.42
MIA40	YKL195W	GSH2	Q08220	491 aa		6.15	□□□□□ -1.42
MIA40	YKL195W	PFA4	Q12006	378 aa		6.15	□□□□□ -1.42
MIA40	YKL195W	YTM1	Q12024	460 aa	Predicted RBP	6.15	□□□□□ -1.42
MIA40	YKL195W	NFI1	Q12216	726 aa		6.15	□□□□□ -1.42
MIA40	YKL195W	RBD2	Q12270	262 aa		6.15	□□□□□ -1.42
MIA40	YKL195W	SKS1	Q12505	502 aa		6.15	□□□□□ -1.42
MIA40	YKL195W	RPC40	P07703	335 aa	Known RBP	6.14	□□□□□ -1.43
MIA40	YKL195W	SAM35	P14693	329 aa		6.14	□□□□□ -1.43
MIA40	YKL195W	RPL24B	P24000	155 aa	Known RBP	6.14	□□□□□ -1.43
MIA40	YKL195W	YIM1	P28625	365 aa		6.14	□□□□□ -1.43
MIA40	YKL195W	NTH1	P32356	751 aa		6.14	□□□□□ -1.43
MIA40	YKL195W	ASF2	P32448	525 aa	Predicted RBP	6.14	□□□□□ -1.43
MIA40	YKL195W	RML2	P32611	393 aa		6.14	□□□□□ -1.43
MIA40	YKL195W	MRPL37	P36532	105 aa		6.14	□□□□□ -1.43
MIA40	YKL195W	MGE1	P38523	228 aa		6.14	□□□□□ -1.43
MIA40	YKL195W	RRG9	P40156	214 aa		6.14	□□□□□ -1.43
MIA40	YKL195W	PRE6	P40303	254 aa	Known RBP	6.14	□□□□□ -1.43
MIA40	YKL195W	SLS1	P42900	643 aa		6.14	□□□□□ -1.43
MIA40	YKL195W	CSL4	P53859	292 aa	Predicted RBP	6.14	□□□□□ -1.43
MIA40	YKL195W	RRP17	Q04031	235 aa	Predicted RBP	6.14	□□□□□ -1.43
MIA40	YKL195W	SPR28	Q04921	423 aa		6.14	□□□□□ -1.43
MIA40	YKL195W	XYL2	Q07993	356 aa		6.14	□□□□□ -1.43
MIA40	YKL195W	PUS9	Q12069	462 aa		6.14	□□□□□ -1.43
MIA40	YKL195W	MED2	Q12124	431 aa		6.14	□□□□□ -1.43
MIA40	YKL195W	PNS1	Q12412	539 aa		6.14	□□□□□ -1.43
MIA40	YKL195W	DCP1	Q12517	231 aa	Predicted RBP	6.14	□□□□□ -1.43
MIA40	YKL195W	PNO1	Q99216	274 aa	Known RBP	6.14	□□□□□ -1.43
MIA40	YKL195W	CDC31	P06704	161 aa	Known RBP	6.13	□□□□□ -1.43
MIA40	YKL195W	TFS1	P14306	219 aa		6.13	□□□□□ -1.43
MIA40	YKL195W	AGP1	P25376	633 aa		6.13	□□□□□ -1.43
MIA40	YKL195W	SBA1	P28707	216 aa	Known RBP	6.13	□□□□□ -1.43
MIA40	YKL195W	OAR1	P35731	278 aa		6.13	□□□□□ -1.43
MIA40	YKL195W	YKL077W	P36081	392 aa		6.13	□□□□□ -1.43
MIA40	YKL195W	TUL1	P36096	758 aa		6.13	□□□□□ -1.43
MIA40	YKL195W	TCD2	P36101	447 aa	Known RBP	6.13	□□□□□ -1.43
MIA40	YKL195W	FMP23	P38231	175 aa		6.13	□□□□□ -1.43
MIA40	YKL195W	EHT1	P38295	451 aa		6.13	□□□□□ -1.43
MIA40	YKL195W	YHR112C	P38716	378 aa		6.13	□□□□□ -1.43
MIA40	YKL195W	PLB1	P39105	664 aa		6.13	□□□□□ -1.43
MIA40	YKL195W	RPS26A	P39938	119 aa	Known RBP	6.13	□□□□□ -1.43
MIA40	YKL195W	RPS26B	P39939	119 aa	Known RBP	6.13	□□□□□ -1.43
MIA40	YKL195W	SNM1	P40993	198 aa		6.13	□□□□□ -1.43
MIA40	YKL195W	BIT61	P47041	543 aa		6.13	□□□□□ -1.43
MIA40	YKL195W	YJL049W	P47048	450 aa		6.13	□□□□□ -1.43
MIA40	YKL195W	YGR250C	P53316	781 aa	Known RBP	6.13	□□□□□ -1.43
MIA40	YKL195W	YSA1	Q01976	231 aa		6.13	□□□□□ -1.43
MIA40	YKL195W	SNZ1	Q03148	297 aa		6.13	□□□□□ -1.43
MIA40	YKL195W	MAK3	Q03503	176 aa		6.13	□□□□□ -1.43
MIA40	YKL195W	VPS36	Q06696	566 aa		6.13	□□□□□ -1.43
MIA40	YKL195W	MSB2	P32334	1306 aa		6.13	□□□□□ -1.43
MIA40	YKL195W	PPH21	P23594	369 aa		6.12	□□□□□ -1.43
MIA40	YKL195W	BUB3	P26449	341 aa		6.12	□□□□□ -1.43
MIA40	YKL195W	OAC1	P32332	324 aa		6.12	□□□□□ -1.43
MIA40	YKL195W	PRP19	P32523	503 aa	Known RBP	6.12	□□□□□ -1.43
MIA40	YKL195W	PIM1	P36775	1133 aa		6.12	□□□□□ -1.43
MIA40	YKL195W	SEA4	P38164	1038 aa		6.12	□□□□□ -1.43
MIA40	YKL195W	MDM31	P38880	579 aa		6.12	□□□□□ -1.43
MIA40	YKL195W	RCY1	P39531	840 aa		6.12	□□□□□ -1.43
MIA40	YKL195W	YAL037W	P39728	267 aa		6.12	□□□□□ -1.43
MIA40	YKL195W	GDI1	P39958	451 aa	Known RBP	6.12	□□□□□ -1.43
MIA40	YKL195W	ALR2	P43553	858 aa		6.12	□□□□□ -1.43
MIA40	YKL195W	SSY5	P47002	699 aa		6.12	□□□□□ -1.43
MIA40	YKL195W	YJL055W	P47044	245 aa		6.12	□□□□□ -1.43
MIA40	YKL195W	JHD2	P47156	728 aa	Predicted RBP	6.12	□□□□□ -1.43
MIA40	YKL195W	HMS2	P47175	358 aa		6.12	□□□□□ -1.43
MIA40	YKL195W	UBC9	P50623	157 aa	Predicted RBP	6.12	□□□□□ -1.43
MIA40	YKL195W	RHO4	Q00246	291 aa		6.12	□□□□□ -1.43
MIA40	YKL195W	NOG1	Q02892	647 aa	Known RBP	6.12	□□□□□ -1.43
MIA40	YKL195W	FIN1	Q03898	291 aa		6.12	□□□□□ -1.43
MIA40	YKL195W	RSM24	Q03976	319 aa		6.12	□□□□□ -1.43
MIA40	YKL195W	RQC1	Q05468	723 aa	Known RBP	6.12	□□□□□ -1.43
MIA40	YKL195W	RNH202	Q05635	350 aa		6.12	□□□□□ -1.43
MIA40	YKL195W	RTT10	Q08924	1013 aa		6.12	□□□□□ -1.43
MIA40	YKL195W	THP3	Q12049	470 aa	Known RBP	6.12	□□□□□ -1.43
MIA40	YKL195W	YPL066W	Q12194	479 aa		6.12	□□□□□ -1.43
MIA40	YKL195W	COX3	P00420	269 aa		6.11	□□□□□ -1.43
MIA40	YKL195W	SIR3	P06701	978 aa		6.11	□□□□□ -1.43
MIA40	YKL195W	FUR1	P18562	216 aa	Known RBP	6.11	□□□□□ -1.43
MIA40	YKL195W	KGD1	P20967	1014 aa	Known RBP	6.11	□□□□□ -1.43
MIA40	YKL195W	GIT1	P25346	518 aa		6.11	□□□□□ -1.43
MIA40	YKL195W	MGR1	P25573	417 aa		6.11	□□□□□ -1.43
MIA40	YKL195W	ARE1	P25628	610 aa		6.11	□□□□□ -1.43
MIA40	YKL195W	CMK1	P27466	446 aa	Known RBP	6.11	□□□□□ -1.43
MIA40	YKL195W	SSH4	P32343	579 aa		6.11	□□□□□ -1.43
MIA40	YKL195W	LYP1	P32487	611 aa		6.11	□□□□□ -1.43
MIA40	YKL195W	DHR2	P36009	735 aa	Predicted RBP	6.11	□□□□□ -1.43
MIA40	YKL195W	DOA1	P36037	715 aa		6.11	□□□□□ -1.43
MIA40	YKL195W	FMO1	P38866	432 aa		6.11	□□□□□ -1.43
MIA40	YKL195W	TAT2	P38967	592 aa		6.11	□□□□□ -1.43
MIA40	YKL195W	PIC2	P40035	300 aa		6.11	□□□□□ -1.43
MIA40	YKL195W	BUR6	P40096	142 aa		6.11	□□□□□ -1.43

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