RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602338.1

TTLL3-233, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

Gene TTLL3, Length 693 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-233	ENST00000602338	FAM86B2	P0C5J1	330 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TTLL3-233	ENST00000602338	STAG3L1	P0CL83	205 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TTLL3-233	ENST00000602338	ATP4A	P20648	1035 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TTLL3-233	ENST00000602338	KLRC1	P26715	233 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TTLL3-233	ENST00000602338	SARS	P49591	514 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
TTLL3-233	ENST00000602338	CLK2	P49760	499 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
TTLL3-233	ENST00000602338	NFX1	Q12986	1120 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
TTLL3-233	ENST00000602338	RTN1	Q16799	776 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TTLL3-233	ENST00000602338	NAALADL2	Q58DX5	795 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TTLL3-233	ENST00000602338	ABHD15	Q6UXT9	468 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TTLL3-233	ENST00000602338	SKAP1	Q86WV1	359 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TTLL3-233	ENST00000602338	KIAA0319L	Q8IZA0	1049 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TTLL3-233	ENST00000602338	VN1R2	Q8NFZ6	395 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TTLL3-233	ENST00000602338	ATP8B4	Q8TF62	1192 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TTLL3-233	ENST00000602338	PPP1R16B	Q96T49	567 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TTLL3-233	ENST00000602338	UPF3B	Q9BZI7	483 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
TTLL3-233	ENST00000602338	FAM217B	Q9NTX9	383 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
TTLL3-233	ENST00000602338	IGLV3-22	A0A075B6J6	115 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TTLL3-233	ENST00000602338	BACH1	O14867	736 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TTLL3-233	ENST00000602338	DHX15	O43143	795 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
TTLL3-233	ENST00000602338	PPFIA3	O75145	1194 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TTLL3-233	ENST00000602338	FOS	P01100	380 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
TTLL3-233	ENST00000602338	CDC27	P30260	824 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TTLL3-233	ENST00000602338	MRE11	P49959	708 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TTLL3-233	ENST00000602338	SLC26A2	P50443	739 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TTLL3-233	ENST00000602338	COASY	Q13057	564 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TTLL3-233	ENST00000602338	FAM102B	Q5T8I3	360 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TTLL3-233	ENST00000602338	CRYGN	Q8WXF5	182 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TTLL3-233	ENST00000602338	PPP2R3C	Q969Q6	453 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TTLL3-233	ENST00000602338	ADAM2	Q99965	735 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TTLL3-233	ENST00000602338	RBM28	Q9NW13	759 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
TTLL3-233	ENST00000602338	BARHL2	Q9NY43	387 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TTLL3-233	ENST00000602338	LRFN2	Q9ULH4	789 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TTLL3-233	ENST00000602338	USP15	Q9Y4E8	981 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
TTLL3-233	ENST00000602338		V9GY48	417 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
TTLL3-233	ENST00000602338	MYO15A	Q9UKN7	3530 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TTLL3-233	ENST00000602338	COL1A2	P08123	1366 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TTLL3-233	ENST00000602338	SMCO2	A6NFE2	343 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TTLL3-233	ENST00000602338	TBKBP1	A7MCY6	615 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TTLL3-233	ENST00000602338	LOC730098	B7Z3J9	87 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TTLL3-233	ENST00000602338		C9IYK1	514 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TTLL3-233	ENST00000602338	PER2	O15055	1255 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TTLL3-233	ENST00000602338	ZBTB43	O43298	467 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TTLL3-233	ENST00000602338	HBP1	O60381	514 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TTLL3-233	ENST00000602338	RPS6KA5	O75582	802 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TTLL3-233	ENST00000602338	C22orf31	O95567	290 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TTLL3-233	ENST00000602338	FGFR1	P11362	822 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TTLL3-233	ENST00000602338	EXOSC10	Q01780	885 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
TTLL3-233	ENST00000602338	AP3B2	Q13367	1082 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TTLL3-233	ENST00000602338	KIZ	Q2M2Z5	673 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TTLL3-233	ENST00000602338	ADCK5	Q3MIX3	580 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TTLL3-233	ENST00000602338	FAM228A	Q86W67	206 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TTLL3-233	ENST00000602338	RASEF	Q8IZ41	740 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TTLL3-233	ENST00000602338	NME8	Q8N427	588 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TTLL3-233	ENST00000602338	TNPO1	Q92973	898 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
TTLL3-233	ENST00000602338	OSMR	Q99650	979 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TTLL3-233	ENST00000602338	ST3GAL5	Q9UNP4	418 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TTLL3-233	ENST00000602338	DENND3	A2RUS2	1198 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TTLL3-233	ENST00000602338	GOLGA8A	A7E2F4	631 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TTLL3-233	ENST00000602338	GOLGA8B	A8MQT2	603 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TTLL3-233	ENST00000602338	hCG_1984214	I3L0E3	225 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TTLL3-233	ENST00000602338	FGF18	O76093	207 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TTLL3-233	ENST00000602338	VTN	P04004	478 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TTLL3-233	ENST00000602338	ERVFC1	P60507	584 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TTLL3-233	ENST00000602338	JAKMIP3	Q5VZ66	844 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TTLL3-233	ENST00000602338	FAM160B1	Q5W0V3	765 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TTLL3-233	ENST00000602338	SWSAP1	Q6NVH7	229 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TTLL3-233	ENST00000602338	PDXDC2P	Q6P474	469 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TTLL3-233	ENST00000602338	SYNE3	Q6ZMZ3	975 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TTLL3-233	ENST00000602338	NIPA1	Q7RTP0	329 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TTLL3-233	ENST00000602338	PLA2G4D	Q86XP0	818 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TTLL3-233	ENST00000602338	TEX2	Q8IWB9	1127 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TTLL3-233	ENST00000602338	ZNF713	Q8N859	430 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
TTLL3-233	ENST00000602338	COLGALT1	Q8NBJ5	622 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TTLL3-233	ENST00000602338	EDA	Q92838	391 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TTLL3-233	ENST00000602338	NEK1	Q96PY6	1258 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TTLL3-233	ENST00000602338	KCNH6	Q9H252	994 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TTLL3-233	ENST00000602338	TLE6	Q9H808	572 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TTLL3-233	ENST00000602338	ZNF302	Q9NR11	478 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TTLL3-233	ENST00000602338	TLR9	Q9NR96	1032 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TTLL3-233	ENST00000602338	RGS18	Q9NS28	235 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TTLL3-233	ENST00000602338	PCDHB7	Q9Y5E2	793 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TTLL3-233	ENST00000602338	KLF18	A0A0U1RQI7	1052 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TTLL3-233	ENST00000602338	IPO5	O00410	1097 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
TTLL3-233	ENST00000602338	FSCN2	O14926	492 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TTLL3-233	ENST00000602338	GPR32	O75388	356 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TTLL3-233	ENST00000602338	ZNF76	P36508	570 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TTLL3-233	ENST00000602338	UBE3A	Q05086	875 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TTLL3-233	ENST00000602338	APOBR	Q0VD83	1088 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TTLL3-233	ENST00000602338	DSC3	Q14574	896 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TTLL3-233	ENST00000602338	CBX2	Q14781	532 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
TTLL3-233	ENST00000602338	SPOUT1	Q5T280	376 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
TTLL3-233	ENST00000602338	SLC24A5	Q71RS6	500 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TTLL3-233	ENST00000602338	PRSS33	Q8NF86	280 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TTLL3-233	ENST00000602338	PHOX2B	Q99453	314 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TTLL3-233	ENST00000602338	CWH43	Q9H720	699 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TTLL3-233	ENST00000602338	C1orf112	Q9NSG2	853 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TTLL3-233	ENST00000602338	RNF19A	Q9NV58	838 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TTLL3-233	ENST00000602338	TYW1	Q9NV66	732 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
TTLL3-233	ENST00000602338	PCDHB12	Q9Y5F1	795 aa		13.57	□□□□□ -0.24

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