RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485765.5

NISCH-209, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 4

Gene NISCH, Length 563 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-209ENST00000485765 ZNF576Q9H609 170 aa21.42■■□□□ 1.02
NISCH-209ENST00000485765 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
NISCH-209ENST00000485765 PSMC5P62195 406 aa21.41■■□□□ 1.02
NISCH-209ENST00000485765 DEFB103AP81534 67 aa21.41■■□□□ 1.02
NISCH-209ENST00000485765 EPHA7Q15375 998 aa21.41■■□□□ 1.02
NISCH-209ENST00000485765 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
NISCH-209ENST00000485765 LINC01465Q8N7H1 131 aa21.41■■□□□ 1.02
NISCH-209ENST00000485765 CEP89Q96ST8 783 aa21.41■■□□□ 1.02
NISCH-209ENST00000485765 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
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NISCH-209ENST00000485765 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa21.41■■□□□ 1.02
NISCH-209ENST00000485765 TRPV2Q9Y5S1 764 aa21.41■■□□□ 1.02
NISCH-209ENST00000485765 CHD9Q3L8U1 2897 aa21.4■■□□□ 1.02
NISCH-209ENST00000485765 MARCH6O60337 910 aa21.4■■□□□ 1.02
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NISCH-209ENST00000485765 GHRP10912 638 aa21.4■■□□□ 1.02
NISCH-209ENST00000485765 MYOGP15173 224 aa21.4■■□□□ 1.02
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NISCH-209ENST00000485765 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP21.4■■□□□ 1.02
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NISCH-209ENST00000485765 USP38Q8NB14 1042 aa21.4■■□□□ 1.02
NISCH-209ENST00000485765 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
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NISCH-209ENST00000485765 KIF3AQ9Y496 699 aa21.4■■□□□ 1.02
NISCH-209ENST00000485765 CDH23Q9H251 3354 aa21.4■■□□□ 1.02
NISCH-209ENST00000485765 WDR81Q562E7 1941 aa21.39■■□□□ 1.02
NISCH-209ENST00000485765 KIF28PB7ZC32 967 aa21.39■■□□□ 1.01
NISCH-209ENST00000485765 NEMFO60524 1076 aa21.39■■□□□ 1.01
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NISCH-209ENST00000485765 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
NISCH-209ENST00000485765 M0QZ92 97 aa21.38■■□□□ 1.01
NISCH-209ENST00000485765 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP21.38■■□□□ 1.01
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NISCH-209ENST00000485765 GRIN2CQ14957 1233 aa21.38■■□□□ 1.01
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NISCH-209ENST00000485765 TMEM60Q9H2L4 133 aa21.38■■□□□ 1.01
NISCH-209ENST00000485765 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
NISCH-209ENST00000485765 CDHR5Q9HBB8 845 aa21.38■■□□□ 1.01
NISCH-209ENST00000485765 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
NISCH-209ENST00000485765 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa21.37■■□□□ 1.01
NISCH-209ENST00000485765 DDX11L8A8MPP1 907 aa21.37■■□□□ 1.01
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NISCH-209ENST00000485765 RAD9AQ99638 391 aa21.37■■□□□ 1.01
NISCH-209ENST00000485765 HSD17B14Q9BPX1 270 aa21.37■■□□□ 1.01
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NISCH-209ENST00000485765 ENPP3O14638 875 aa21.36■■□□□ 1.01
NISCH-209ENST00000485765 TLL1O43897 1013 aa21.36■■□□□ 1.01
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NISCH-209ENST00000485765 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
NISCH-209ENST00000485765 PADI3Q9ULW8 664 aa21.35■■□□□ 1.01
NISCH-209ENST00000485765 SMC3Q9UQE7 1217 aa21.35■■□□□ 1.01
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NISCH-209ENST00000485765 MAFO75444 373 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
NISCH-209ENST00000485765 LYPLA2O95372 231 aa21.34■■□□□ 1.01
NISCH-209ENST00000485765 VTNP04004 478 aa21.34■■□□□ 1.01
NISCH-209ENST00000485765 MTERF2Q49AM1 385 aa21.34■■□□□ 1.01
NISCH-209ENST00000485765 TTC38Q5R3I4 469 aa21.34■■□□□ 1.01
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