RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460558.5

ECHDC1-211, Transcript of ethylmalonyl-CoA decarboxylase 1, humanhuman

TSL 5

Gene ECHDC1, Length 301 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC1-211ENST00000460558 TRERF1Q96PN7 1200 aa4.95□□□□□ -1.62
ECHDC1-211ENST00000460558 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP4.95□□□□□ -1.62
ECHDC1-211ENST00000460558 SPATC1LQ9H0A9 340 aa4.95□□□□□ -1.62
ECHDC1-211ENST00000460558 SIL1Q9H173 461 aa4.95□□□□□ -1.62
ECHDC1-211ENST00000460558 MUC3BQ9H195 1237 aa4.95□□□□□ -1.62
ECHDC1-211ENST00000460558 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
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ECHDC1-211ENST00000460558 STK31Q9BXU1 1019 aa4.94□□□□□ -1.62
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ECHDC1-211ENST00000460558 MBIPQ9NS73 344 aa4.94□□□□□ -1.62
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ECHDC1-211ENST00000460558 CD207Q9UJ71 328 aa4.94□□□□□ -1.62
ECHDC1-211ENST00000460558 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa4.94□□□□□ -1.62
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ECHDC1-211ENST00000460558 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
ECHDC1-211ENST00000460558 GHRHP01286 108 aa4.93□□□□□ -1.62
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ECHDC1-211ENST00000460558 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
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ECHDC1-211ENST00000460558 PTPN21Q16825 1174 aa4.93□□□□□ -1.62
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ECHDC1-211ENST00000460558 CXCL17Q6UXB2 119 aa4.93□□□□□ -1.62
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ECHDC1-211ENST00000460558 MMP19Q99542 508 aa4.93□□□□□ -1.62
ECHDC1-211ENST00000460558 RAD9AQ99638 391 aa4.93□□□□□ -1.62
ECHDC1-211ENST00000460558 HAUS7Q99871 368 aa4.93□□□□□ -1.62
ECHDC1-211ENST00000460558 LPIN3Q9BQK8 851 aa4.93□□□□□ -1.62
ECHDC1-211ENST00000460558 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
ECHDC1-211ENST00000460558 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
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ECHDC1-211ENST00000460558 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
ECHDC1-211ENST00000460558 EFR3BQ9Y2G0 817 aa4.93□□□□□ -1.62
ECHDC1-211ENST00000460558 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa4.93□□□□□ -1.62
ECHDC1-211ENST00000460558 MYH7BA7E2Y1 1941 aa4.93□□□□□ -1.62
ECHDC1-211ENST00000460558 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa4.93□□□□□ -1.62
ECHDC1-211ENST00000460558 ZEB2O60315 1214 aa4.92□□□□□ -1.62
ECHDC1-211ENST00000460558 GJB5O95377 273 aa4.92□□□□□ -1.62
ECHDC1-211ENST00000460558 SLC25A27O95847 323 aa4.92□□□□□ -1.62
ECHDC1-211ENST00000460558 PGK2P07205 417 aa4.92□□□□□ -1.62
ECHDC1-211ENST00000460558 BMP4P12644 408 aa4.92□□□□□ -1.62
ECHDC1-211ENST00000460558 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
ECHDC1-211ENST00000460558 NME2P22392 152 aa4.92□□□□□ -1.62
ECHDC1-211ENST00000460558 ADH6P28332 368 aa4.92□□□□□ -1.62
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