RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000400053.8

PTPRM-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRM, Length 5,292 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-202ENST00000400053 SYNE4Q8N205 404 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRM-202ENST00000400053 STK17AQ9UEE5 414 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRM-202ENST00000400053 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRM-202ENST00000400053 TNS3Q68CZ2 1445 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRM-202ENST00000400053 TFDP1Q14186 410 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRM-202ENST00000400053 DCAF15Q66K64 600 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRM-202ENST00000400053 C4orf50Q6ZRC1 276 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRM-202ENST00000400053 SGMS1Q86VZ5 419 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRM-202ENST00000400053 NME8Q8N427 588 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRM-202ENST00000400053 TEX12Q9BXU0 123 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRM-202ENST00000400053 SMYD2Q9NRG4 433 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRM-202ENST00000400053 GCNT4Q9P109 453 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRM-202ENST00000400053 USP21Q9UK80 565 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRM-202ENST00000400053 PPLO60437 1756 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRM-202ENST00000400053 GSTA4O15217 222 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRM-202ENST00000400053 DGKHQ86XP1 1220 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRM-202ENST00000400053 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
PTPRM-202ENST00000400053 DYDC2Q96IM9 177 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRM-202ENST00000400053 CEP19Q96LK0 163 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRM-202ENST00000400053 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
PTPRM-202ENST00000400053 ANLNQ9NQW6 1124 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRM-202ENST00000400053 DONSONQ9NYP3 566 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRM-202ENST00000400053 CSADQ9Y600 493 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRM-202ENST00000400053 CD163L1Q9NR16 1453 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRM-202ENST00000400053 ZNF609O15014 1411 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRM-202ENST00000400053 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRM-202ENST00000400053 MAPK13O15264 365 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRM-202ENST00000400053 CHEK2O96017 543 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRM-202ENST00000400053 FOSP01100 380 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
PTPRM-202ENST00000400053 RAP1GDS1P52306 607 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRM-202ENST00000400053 ADCY2Q08462 1091 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRM-202ENST00000400053 ATG16L1Q676U5 607 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRM-202ENST00000400053 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
PTPRM-202ENST00000400053 LARGE2Q8N3Y3 721 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRM-202ENST00000400053 NBPF3Q9H094 633 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRM-202ENST00000400053 LY9Q9HBG7 655 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRM-202ENST00000400053 KLC4Q9NSK0 619 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRM-202ENST00000400053 TLK1Q9UKI8 766 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRM-202ENST00000400053 NEDD4P46934 1319 aa9.52□□□□□ -0.88
PTPRM-202ENST00000400053 A0A0G2JND7 137 aa9.52□□□□□ -0.88
PTPRM-202ENST00000400053 TTC26A0AVF1 554 aa9.52□□□□□ -0.88
PTPRM-202ENST00000400053 MEIS1O00470 390 aa9.52□□□□□ -0.88
PTPRM-202ENST00000400053 DYNLT1P63172 113 aa9.52□□□□□ -0.88
PTPRM-202ENST00000400053 CCZ1BP86790 482 aa9.52□□□□□ -0.88
PTPRM-202ENST00000400053 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.88
PTPRM-202ENST00000400053 ASPRV1Q53RT3 343 aa9.52□□□□□ -0.88
PTPRM-202ENST00000400053 KRT80Q6KB66 452 aa9.52□□□□□ -0.88
PTPRM-202ENST00000400053 NT5C1BQ96P26 610 aa9.52□□□□□ -0.88
PTPRM-202ENST00000400053 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.88
PTPRM-202ENST00000400053 PLA2G12BQ9BX93 195 aa9.52□□□□□ -0.88
PTPRM-202ENST00000400053 ANO3Q9BYT9 981 aa9.52□□□□□ -0.88
PTPRM-202ENST00000400053 KRT82Q9NSB4 513 aa9.52□□□□□ -0.88
PTPRM-202ENST00000400053 EMILIN3Q9NT22 766 aa9.52□□□□□ -0.88
PTPRM-202ENST00000400053 SLC8A2Q9UPR5 921 aa9.52□□□□□ -0.88
PTPRM-202ENST00000400053 PREX1Q8TCU6 1659 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRM-202ENST00000400053 ANO9A1A5B4 782 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRM-202ENST00000400053 LGALS16A8MUM7 142 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRM-202ENST00000400053 FOXN1O15353 648 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRM-202ENST00000400053 NVLO15381 856 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
PTPRM-202ENST00000400053 TLR3O15455 904 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
PTPRM-202ENST00000400053 EFCAB14O75071 495 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRM-202ENST00000400053 SCARF1Q14162 830 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRM-202ENST00000400053 BBS9Q3SYG4 887 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRM-202ENST00000400053 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
PTPRM-202ENST00000400053 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
PTPRM-202ENST00000400053 PARP9Q8IXQ6 854 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRM-202ENST00000400053 SH2D3CQ8N5H7 860 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRM-202ENST00000400053 PARD3BQ8TEW8 1205 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRM-202ENST00000400053 TRIM15Q9C019 465 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRM-202ENST00000400053 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
PTPRM-202ENST00000400053 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
PTPRM-202ENST00000400053 MROH2AA6NES4 1674 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRM-202ENST00000400053 CCDC188H7C350 402 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRM-202ENST00000400053 hCG_1984214I3L0E3 225 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRM-202ENST00000400053 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
PTPRM-202ENST00000400053 EEF1DP29692 281 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
PTPRM-202ENST00000400053 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
PTPRM-202ENST00000400053 IL1RL1Q01638 556 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRM-202ENST00000400053 MECOMQ03112 1051 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRM-202ENST00000400053 DLGAP5Q15398 846 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRM-202ENST00000400053 FAM160B1Q5W0V3 765 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRM-202ENST00000400053 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
PTPRM-202ENST00000400053 FBXL13Q8NEE6 735 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRM-202ENST00000400053 CEP70Q8NHQ1 597 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRM-202ENST00000400053 MAML1Q92585 1016 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRM-202ENST00000400053 CCDC17Q96LX7 622 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRM-202ENST00000400053 PCIF1Q9H4Z3 704 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRM-202ENST00000400053 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
PTPRM-202ENST00000400053 SALL3Q9BXA9 1300 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRM-202ENST00000400053 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
PTPRM-202ENST00000400053 H0YIN7 160 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRM-202ENST00000400053 SNAP23O00161 211 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRM-202ENST00000400053 CFLARO15519 480 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRM-202ENST00000400053 SORBS3O60504 671 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRM-202ENST00000400053 PRR29P0C7W0 189 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRM-202ENST00000400053 CDC27P30260 824 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRM-202ENST00000400053 NUDCD1Q96RS6 583 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRM-202ENST00000400053 OSBPL9Q96SU4 736 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRM-202ENST00000400053 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
PTPRM-202ENST00000400053 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa9.52□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.4 ms