RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566515.5

CCNDBP1-208, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene CCNDBP1, Length 1,634 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-208ENST00000566515 P4HBP07237 508 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
CCNDBP1-208ENST00000566515 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
CCNDBP1-208ENST00000566515 PSMC5P62195 406 aa23.53■■□□□ 1.36
CCNDBP1-208ENST00000566515 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
CCNDBP1-208ENST00000566515 DYDC2Q96IM9 177 aa23.53■■□□□ 1.36
CCNDBP1-208ENST00000566515 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
CCNDBP1-208ENST00000566515 MYH15Q9Y2K3 1946 aa23.53■■□□□ 1.36
CCNDBP1-208ENST00000566515 RRN3P2A6NIE6 340 aa23.52■■□□□ 1.36
CCNDBP1-208ENST00000566515 LAD1O00515 517 aa23.52■■□□□ 1.36
CCNDBP1-208ENST00000566515 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
CCNDBP1-208ENST00000566515 QARSP47897 775 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
CCNDBP1-208ENST00000566515 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
CCNDBP1-208ENST00000566515 CYP4A11Q02928 519 aa23.52■■□□□ 1.36
CCNDBP1-208ENST00000566515 IL17AQ16552 155 aa23.52■■□□□ 1.36
CCNDBP1-208ENST00000566515 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP23.52■■□□□ 1.362e-7■□□□□ 10.2
CCNDBP1-208ENST00000566515 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
CCNDBP1-208ENST00000566515 TUBE1Q9UJT0 475 aa23.52■■□□□ 1.36
CCNDBP1-208ENST00000566515 TMEM150BA6NC51 233 aa23.51■■□□□ 1.35
CCNDBP1-208ENST00000566515 ZBTB42B2RXF5 422 aa23.51■■□□□ 1.35
CCNDBP1-208ENST00000566515 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
CCNDBP1-208ENST00000566515 CCL23P55773 120 aa23.51■■□□□ 1.35
CCNDBP1-208ENST00000566515 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
CCNDBP1-208ENST00000566515 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
CCNDBP1-208ENST00000566515 TMEM266Q2M3C6 531 aa23.51■■□□□ 1.35
CCNDBP1-208ENST00000566515 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
CCNDBP1-208ENST00000566515 RUFY4Q6ZNE9 571 aa23.51■■□□□ 1.35
CCNDBP1-208ENST00000566515 FAM167AQ96KS9 214 aa23.51■■□□□ 1.35
CCNDBP1-208ENST00000566515 LXNQ9BS40 222 aa23.51■■□□□ 1.35
CCNDBP1-208ENST00000566515 WNT8AQ9H1J5 351 aa23.51■■□□□ 1.35
CCNDBP1-208ENST00000566515 NRBP2Q9NSY0 501 aa23.51■■□□□ 1.35
CCNDBP1-208ENST00000566515 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
CCNDBP1-208ENST00000566515 SLITRK3O94933 977 aa23.51■■□□□ 1.35
CCNDBP1-208ENST00000566515 STBD1O95210 358 aa23.51■■□□□ 1.35
CCNDBP1-208ENST00000566515 PRPHP41219 470 aa23.51■■□□□ 1.35
CCNDBP1-208ENST00000566515 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP23.51■■□□□ 1.352e-6■□□□□ 9.9
CCNDBP1-208ENST00000566515 BFSP2Q13515 415 aa23.51■■□□□ 1.35
CCNDBP1-208ENST00000566515 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
CCNDBP1-208ENST00000566515 ZNF484Q5JVG2 852 aa23.51■■□□□ 1.35
CCNDBP1-208ENST00000566515 MFSD5Q6N075 450 aa23.51■■□□□ 1.35
CCNDBP1-208ENST00000566515 TPH2Q8IWU9 490 aa23.51■■□□□ 1.35
CCNDBP1-208ENST00000566515 HSD17B14Q9BPX1 270 aa23.51■■□□□ 1.35
CCNDBP1-208ENST00000566515 CLIC4Q9Y696 253 aa23.51■■□□□ 1.35
CCNDBP1-208ENST00000566515 EVPLQ92817 2033 aa23.51■■□□□ 1.35
CCNDBP1-208ENST00000566515 DDX11L8A8MPP1 907 aa23.5■■□□□ 1.35
CCNDBP1-208ENST00000566515 XKR3Q5GH77 459 aa23.5■■□□□ 1.35
CCNDBP1-208ENST00000566515 DTHD1Q6ZMT9 781 aa23.5■■□□□ 1.35
CCNDBP1-208ENST00000566515 CAGE1Q8TC20 777 aa23.5■■□□□ 1.35
CCNDBP1-208ENST00000566515 SCLYQ96I15 445 aa23.5■■□□□ 1.35
CCNDBP1-208ENST00000566515 SH2D3AQ9BRG2 576 aa23.5■■□□□ 1.35
CCNDBP1-208ENST00000566515 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
CCNDBP1-208ENST00000566515 SCN5AQ14524 2016 aa23.5■■□□□ 1.35
CCNDBP1-208ENST00000566515 COL1A2P08123 1366 aa23.49■■□□□ 1.35
CCNDBP1-208ENST00000566515 F13A1P00488 732 aa23.49■■□□□ 1.35
CCNDBP1-208ENST00000566515 CKBP12277 381 aa23.49■■□□□ 1.35
CCNDBP1-208ENST00000566515 KLRC1P26715 233 aa23.49■■□□□ 1.35
CCNDBP1-208ENST00000566515 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
CCNDBP1-208ENST00000566515 MTHFD1LQ6UB35 978 aa23.49■■□□□ 1.35
CCNDBP1-208ENST00000566515 CCDC155Q8N6L0 562 aa23.49■■□□□ 1.35
CCNDBP1-208ENST00000566515 RETREG2Q8NC44 543 aa23.49■■□□□ 1.35
CCNDBP1-208ENST00000566515 GDF15Q99988 308 aa23.49■■□□□ 1.35
CCNDBP1-208ENST00000566515 PITPNM1O00562 1244 aa23.48■■□□□ 1.35
CCNDBP1-208ENST00000566515 CSF2RAP15509 400 aa23.48■■□□□ 1.35
CCNDBP1-208ENST00000566515 THPOP40225 353 aa23.48■■□□□ 1.35
CCNDBP1-208ENST00000566515 CHRDL2Q6WN34 429 aa23.48■■□□□ 1.35
CCNDBP1-208ENST00000566515 ANO5Q75V66 913 aa23.48■■□□□ 1.35
CCNDBP1-208ENST00000566515 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa23.48■■□□□ 1.35
CCNDBP1-208ENST00000566515 LRWD1Q9UFC0 647 aa23.48■■□□□ 1.35
CCNDBP1-208ENST00000566515 TANC1Q9C0D5 1861 aa23.48■■□□□ 1.35
CCNDBP1-208ENST00000566515 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa23.48■■□□□ 1.35
CCNDBP1-208ENST00000566515 ZBTB39O15060 712 aa23.48■■□□□ 1.35
CCNDBP1-208ENST00000566515 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP23.48■■□□□ 1.35
CCNDBP1-208ENST00000566515 PDIA5Q14554 519 aa23.48■■□□□ 1.35
CCNDBP1-208ENST00000566515 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
CCNDBP1-208ENST00000566515 ZNF618Q5T7W0 954 aa23.48■■□□□ 1.35
CCNDBP1-208ENST00000566515 PLA2G4FQ68DD2 849 aa23.48■■□□□ 1.35
CCNDBP1-208ENST00000566515 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
CCNDBP1-208ENST00000566515 C4orf19Q8IY42 314 aa23.48■■□□□ 1.35
CCNDBP1-208ENST00000566515 TMEM199Q8N511 208 aa23.48■■□□□ 1.35
CCNDBP1-208ENST00000566515 IGSF22Q8N9C0 903 aa23.48■■□□□ 1.35
CCNDBP1-208ENST00000566515 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
CCNDBP1-208ENST00000566515 CEP131Q9UPN4 1083 aa23.48■■□□□ 1.35
CCNDBP1-208ENST00000566515 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa23.48■■□□□ 1.35
CCNDBP1-208ENST00000566515 VWA3AA6NCI4 1184 aa23.47■■□□□ 1.35
CCNDBP1-208ENST00000566515 MED24O75448 989 aa23.47■■□□□ 1.35
CCNDBP1-208ENST00000566515 BMP15O95972 392 aa23.47■■□□□ 1.35
CCNDBP1-208ENST00000566515 IQCF3P0C7M6 154 aa23.47■■□□□ 1.35
CCNDBP1-208ENST00000566515 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa23.47■■□□□ 1.35
CCNDBP1-208ENST00000566515 FPGSQ05932 587 aa23.47■■□□□ 1.35
CCNDBP1-208ENST00000566515 RBL2Q08999 1139 aa23.47■■□□□ 1.35
CCNDBP1-208ENST00000566515 MTERF2Q49AM1 385 aa23.47■■□□□ 1.35
CCNDBP1-208ENST00000566515 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
CCNDBP1-208ENST00000566515 TAF2Q6P1X5 1199 aa23.47■■□□□ 1.35
CCNDBP1-208ENST00000566515 CATSPER3Q86XQ3 398 aa23.47■■□□□ 1.35
CCNDBP1-208ENST00000566515 ERMNQ8TAM6 284 aa23.47■■□□□ 1.35
CCNDBP1-208ENST00000566515 NEK9Q8TD19 979 aa23.47■■□□□ 1.35
CCNDBP1-208ENST00000566515 DNAJB3Q8WWF6 145 aa23.47■■□□□ 1.35
CCNDBP1-208ENST00000566515 USP28Q96RU2 1077 aa23.47■■□□□ 1.35
CCNDBP1-208ENST00000566515 RAB34Q9BZG1 259 aa23.47■■□□□ 1.35
CCNDBP1-208ENST00000566515 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
CCNDBP1-208ENST00000566515 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.9 ms