RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000330334.7

HDDC3-201, Transcript of HD domain containing 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HDDC3, Length 1,047 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDDC3-201ENST00000330334 SPRED2Q7Z698 418 aa20.15■□□□□ 0.82
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HDDC3-201ENST00000330334 ATP8B4Q8TF62 1192 aa20.15■□□□□ 0.82
HDDC3-201ENST00000330334 SAMD11Q96NU1 681 aa20.15■□□□□ 0.82
HDDC3-201ENST00000330334 CDY2AQ9Y6F7 541 aa20.15■□□□□ 0.82
HDDC3-201ENST00000330334 MICAL3Q7RTP6 2002 aa20.14■□□□□ 0.81
HDDC3-201ENST00000330334 BACH1O14867 736 aa20.14■□□□□ 0.81
HDDC3-201ENST00000330334 MTHFD1LQ6UB35 978 aa20.14■□□□□ 0.81
HDDC3-201ENST00000330334 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa20.14■□□□□ 0.81
HDDC3-201ENST00000330334 LENG9Q96B70 501 aa20.14■□□□□ 0.81
HDDC3-201ENST00000330334 C22orf23Q9BZE7 217 aa20.14■□□□□ 0.81
HDDC3-201ENST00000330334 ZNF302Q9NR11 478 aa20.14■□□□□ 0.81
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HDDC3-201ENST00000330334 COL1A2P08123 1366 aa20.13■□□□□ 0.81
HDDC3-201ENST00000330334 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa20.13■□□□□ 0.81
HDDC3-201ENST00000330334 ENPP3O14638 875 aa20.13■□□□□ 0.81
HDDC3-201ENST00000330334 CPLX1O14810 134 aa20.13■□□□□ 0.81
HDDC3-201ENST00000330334 DEXIO95424 95 aa20.13■□□□□ 0.81
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HDDC3-201ENST00000330334 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa20.13■□□□□ 0.81
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HDDC3-201ENST00000330334 NLRP5P59047 1200 aa20.12■□□□□ 0.81
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HDDC3-201ENST00000330334 RASGRP4Q8TDF6 673 aa20.12■□□□□ 0.81
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HDDC3-201ENST00000330334 FTHL17Q9BXU8 183 aa20.12■□□□□ 0.81
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HDDC3-201ENST00000330334 PCDHA4Q9UN74 947 aa20.12■□□□□ 0.81
HDDC3-201ENST00000330334 TRPV2Q9Y5S1 764 aa20.12■□□□□ 0.81
HDDC3-201ENST00000330334 COL4A6Q14031 1691 aa20.12■□□□□ 0.81
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HDDC3-201ENST00000330334 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa20.11■□□□□ 0.81
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HDDC3-201ENST00000330334 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa20.1■□□□□ 0.81
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HDDC3-201ENST00000330334 GDPD5Q8WTR4 605 aa20.1■□□□□ 0.81
HDDC3-201ENST00000330334 C17orf80Q9BSJ5 609 aa20.1■□□□□ 0.81
HDDC3-201ENST00000330334 MTUS1Q9ULD2 1270 aa20.1■□□□□ 0.81
HDDC3-201ENST00000330334 NCOR1O75376 2440 aa20.1■□□□□ 0.81
HDDC3-201ENST00000330334 MSH4O15457 936 aa20.09■□□□□ 0.81
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HDDC3-201ENST00000330334 CD52P31358 61 aa20.09■□□□□ 0.81
HDDC3-201ENST00000330334 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
HDDC3-201ENST00000330334 Q4G0T1 1027 aa20.09■□□□□ 0.81
HDDC3-201ENST00000330334 EPC2Q52LR7 807 aa20.09■□□□□ 0.81
HDDC3-201ENST00000330334 CRIPAKQ8N1N5 446 aa20.09■□□□□ 0.81
HDDC3-201ENST00000330334 SLC5A5Q92911 643 aa20.09■□□□□ 0.81
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HDDC3-201ENST00000330334 PADI3Q9ULW8 664 aa20.09■□□□□ 0.81
HDDC3-201ENST00000330334 CEP131Q9UPN4 1083 aa20.09■□□□□ 0.81
HDDC3-201ENST00000330334 WDR64B1ANS9 1081 aa20.08■□□□□ 0.81
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HDDC3-201ENST00000330334 ZNF710Q8N1W2 664 aa20.08■□□□□ 0.81
HDDC3-201ENST00000330334 TBCKQ8TEA7 893 aa20.08■□□□□ 0.81
HDDC3-201ENST00000330334 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
HDDC3-201ENST00000330334 FAM167AQ96KS9 214 aa20.08■□□□□ 0.81
HDDC3-201ENST00000330334 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
HDDC3-201ENST00000330334 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
HDDC3-201ENST00000330334 C5orf67F2Z3F1 127 aa20.07■□□□□ 0.8
HDDC3-201ENST00000330334 RB1P06400 928 aa20.07■□□□□ 0.8
HDDC3-201ENST00000330334 TMEM62Q0P6H9 643 aa20.07■□□□□ 0.8
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