RNA–Protein interactions for RNA: YKR063C

LAS1, Transcript of Protein required for pre-rRNA processing at both ends of ITS2, yeast

Gene LAS1, Length 1,509 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
LAS1	YKR063C	GMH1	P36125	273 aa		4.07	□□□□□ -1.76
LAS1	YKR063C	SPC34	P36131	295 aa		4.07	□□□□□ -1.76
LAS1	YKR063C	IML3	P38265	245 aa		4.07	□□□□□ -1.76
LAS1	YKR063C	YHR218W	P38899	603 aa		4.07	□□□□□ -1.76
LAS1	YKR063C	GET2	P40056	285 aa		4.07	□□□□□ -1.76
LAS1	YKR063C	OSW5	P40219	148 aa		4.07	□□□□□ -1.76
LAS1	YKR063C	GAB1	P41733	394 aa		4.07	□□□□□ -1.76
LAS1	YKR063C	ELP2	P42935	788 aa		4.07	□□□□□ -1.76
LAS1	YKR063C	AGP3	P43548	558 aa		4.07	□□□□□ -1.76
LAS1	YKR063C	YJR030C	P47101	745 aa		4.07	□□□□□ -1.76
LAS1	YKR063C	RMR1	P53060	241 aa		4.07	□□□□□ -1.76
LAS1	YKR063C	MPS2	P53159	387 aa		4.07	□□□□□ -1.76
LAS1	YKR063C	YGR015C	P53208	328 aa		4.07	□□□□□ -1.76
LAS1	YKR063C	DCP2	P53550	970 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
LAS1	YKR063C	ZRG17	P53735	605 aa		4.07	□□□□□ -1.76
LAS1	YKR063C	YNR068C	P53754	272 aa		4.07	□□□□□ -1.76
LAS1	YKR063C	GOR1	P53839	350 aa		4.07	□□□□□ -1.76
LAS1	YKR063C	TMA20	P89886	181 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
LAS1	YKR063C	VHS1	Q03785	461 aa		4.07	□□□□□ -1.76
LAS1	YKR063C	EMI1	Q04406	187 aa		4.07	□□□□□ -1.76
LAS1	YKR063C	ENT2	Q05785	613 aa		4.07	□□□□□ -1.76
LAS1	YKR063C	YOL159C	Q08300	171 aa		4.07	□□□□□ -1.76
LAS1	YKR063C	YLR125W	Q12138	136 aa		4.07	□□□□□ -1.76
LAS1	YKR063C	YPL245W	Q12179	454 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
LAS1	YKR063C	YOR342C	Q12182	319 aa		4.07	□□□□□ -1.76
LAS1	YKR063C	YPR011C	Q12251	326 aa		4.07	□□□□□ -1.76
LAS1	YKR063C	PST1	Q12355	444 aa		4.07	□□□□□ -1.76
LAS1	YKR063C	YDR034W-B	Q6Q5X2	51 aa		4.07	□□□□□ -1.76
LAS1	YKR063C	RAD7	P06779	565 aa		4.06	□□□□□ -1.76
LAS1	YKR063C	MSF1	P08425	469 aa		4.06	□□□□□ -1.76
LAS1	YKR063C	POL30	P15873	258 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
LAS1	YKR063C	FAR1	P21268	830 aa		4.06	□□□□□ -1.76
LAS1	YKR063C	SGV1	P23293	657 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
LAS1	YKR063C	RPL5	P26321	297 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
LAS1	YKR063C	RFA2	P26754	273 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
LAS1	YKR063C	HOG1	P32485	435 aa		4.06	□□□□□ -1.76
LAS1	YKR063C	ZUO1	P32527	433 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
LAS1	YKR063C	RPT5	P33297	434 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
LAS1	YKR063C	INM1	P38710	295 aa		4.06	□□□□□ -1.76
LAS1	YKR063C	YHR127W	P38833	243 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
LAS1	YKR063C	RBG1	P39729	369 aa		4.06	□□□□□ -1.76
LAS1	YKR063C	GIM4	P40005	111 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
LAS1	YKR063C	CAB2	P40506	365 aa		4.06	□□□□□ -1.76
LAS1	YKR063C	SER33	P40510	469 aa		4.06	□□□□□ -1.76
LAS1	YKR063C	PTR3	P43606	678 aa		4.06	□□□□□ -1.76
LAS1	YKR063C	STB2	P46679	850 aa		4.06	□□□□□ -1.76
LAS1	YKR063C	AIM22	P47051	409 aa		4.06	□□□□□ -1.76
LAS1	YKR063C	EMC2	P47133	292 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
LAS1	YKR063C	MRK1	P50873	501 aa		4.06	□□□□□ -1.76
LAS1	YKR063C	YAP1802	P53309	568 aa		4.06	□□□□□ -1.76
LAS1	YKR063C	YHM2	Q04013	314 aa		4.06	□□□□□ -1.76
LAS1	YKR063C	YMR034C	Q05131	434 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
LAS1	YKR063C	GPI11	Q06636	219 aa		4.06	□□□□□ -1.76
LAS1	YKR063C	MCM21	Q06675	368 aa		4.06	□□□□□ -1.76
LAS1	YKR063C	RSA1	Q08932	381 aa		4.06	□□□□□ -1.76
LAS1	YKR063C	VIK1	Q12045	647 aa		4.06	□□□□□ -1.76
LAS1	YKR063C	MLH3	Q12083	715 aa		4.06	□□□□□ -1.76
LAS1	YKR063C	ATG29	Q12092	213 aa		4.06	□□□□□ -1.76
LAS1	YKR063C	GET4	Q12125	312 aa		4.06	□□□□□ -1.76
LAS1	YKR063C	RGT2	Q12300	763 aa		4.06	□□□□□ -1.76
LAS1	YKR063C	PFK27	Q12471	397 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
LAS1	YKR063C	MHF2	Q3E829	80 aa		4.06	□□□□□ -1.76
LAS1	YKR063C	MPD2	Q99316	277 aa		4.06	□□□□□ -1.76
LAS1	YKR063C	YKR104W	P0CE69	306 aa		4.05	□□□□□ -1.76
LAS1	YKR063C	KAR1	P11927	433 aa		4.05	□□□□□ -1.76
LAS1	YKR063C	RAP1	P11938	827 aa		4.05	□□□□□ -1.76
LAS1	YKR063C	KSS1	P14681	368 aa		4.05	□□□□□ -1.76
LAS1	YKR063C	FPR1	P20081	114 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
LAS1	YKR063C	POL4	P25615	582 aa		4.05	□□□□□ -1.76
LAS1	YKR063C	THI4	P32318	326 aa		4.05	□□□□□ -1.76
LAS1	YKR063C	APE2	P32454	952 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
LAS1	YKR063C	HXT4	P32467	576 aa		4.05	□□□□□ -1.76
LAS1	YKR063C	PMT1	P33775	817 aa		4.05	□□□□□ -1.76
LAS1	YKR063C	YBR071W	P38243	211 aa		4.05	□□□□□ -1.76
LAS1	YKR063C	COS111	P38308	924 aa		4.05	□□□□□ -1.76
LAS1	YKR063C	HXT6	P39003	570 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
LAS1	YKR063C	HXT7	P39004	570 aa		4.05	□□□□□ -1.76
LAS1	YKR063C	MTW1	P39731	289 aa		4.05	□□□□□ -1.76
LAS1	YKR063C	NDE1	P40215	560 aa		4.05	□□□□□ -1.76
LAS1	YKR063C	BNA3	P47039	444 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
LAS1	YKR063C	MPS1	P54199	764 aa		4.05	□□□□□ -1.76
LAS1	YKR063C	YDR239C	Q03780	787 aa		4.05	□□□□□ -1.76
LAS1	YKR063C	ARG7	Q04728	441 aa		4.05	□□□□□ -1.76
LAS1	YKR063C	ATG38	Q05789	226 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
LAS1	YKR063C	MFG1	Q07684	458 aa		4.05	□□□□□ -1.76
LAS1	YKR063C	LOT6	Q07923	191 aa		4.05	□□□□□ -1.76
LAS1	YKR063C	NMD4	Q12129	218 aa		4.05	□□□□□ -1.76
LAS1	YKR063C	DBP10	Q12389	995 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
LAS1	YKR063C	SNF8	Q12483	233 aa		4.05	□□□□□ -1.76
LAS1	YKR063C	MHT1	Q12525	324 aa		4.05	□□□□□ -1.76
LAS1	YKR063C	YOL159C-A	Q3E769	90 aa		4.05	□□□□□ -1.76
LAS1	YKR063C	YKL018C-A	Q3E7A7	99 aa		4.05	□□□□□ -1.76
LAS1	YKR063C	Q0010	Q9ZZX9	128 aa		4.05	□□□□□ -1.76
LAS1	YKR063C	GPH1	P06738	902 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
LAS1	YKR063C	ARP2	P32381	391 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
LAS1	YKR063C	EMP70	P32802	667 aa		4.05	□□□□□ -1.76
LAS1	YKR063C	TIF3	P34167	436 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
LAS1	YKR063C	APT2	P36973	181 aa		4.05	□□□□□ -1.76
LAS1	YKR063C	YPT35	P38815	214 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
LAS1	YKR063C	CCT6	P39079	546 aa		4.05	□□□□□ -1.76

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 75.8 ms