RNA–Protein interactions for RNA: YJL089W

SIP4, Transcript of C6 zinc cluster transcriptional activator, yeast

Gene SIP4, Length 2,490 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SIP4	YJL089W	TVP15	Q03860	143 aa		1.08	□□□□□ -2.24
SIP4	YJL089W	RSM24	Q03976	319 aa		1.08	□□□□□ -2.24
SIP4	YJL089W	BUD22	Q04347	519 aa	Known RBP	1.08	□□□□□ -2.24
SIP4	YJL089W	APC4	Q04601	652 aa		1.08	□□□□□ -2.24
SIP4	YJL089W	SMA2	Q04658	369 aa		1.08	□□□□□ -2.24
SIP4	YJL089W	SSQ1	Q05931	657 aa	Predicted RBP	1.08	□□□□□ -2.24
SIP4	YJL089W	PDR8	Q06149	701 aa		1.08	□□□□□ -2.24
SIP4	YJL089W	YPR091C	Q06833	770 aa		1.08	□□□□□ -2.24
SIP4	YJL089W	YDL218W	Q07629	317 aa		1.08	□□□□□ -2.24
SIP4	YJL089W	HNT3	Q08702	217 aa		1.08	□□□□□ -2.24
SIP4	YJL089W	MCH5	Q08777	521 aa		1.08	□□□□□ -2.24
SIP4	YJL089W	YOR376W	Q08900	122 aa		1.08	□□□□□ -2.24
SIP4	YJL089W	YLR053C	Q12026	108 aa		1.08	□□□□□ -2.24
SIP4	YJL089W	CHS5	Q12114	671 aa	Known RBP	1.08	□□□□□ -2.24
SIP4	YJL089W	YPL245W	Q12179	454 aa	Known RBP	1.08	□□□□□ -2.24
SIP4	YJL089W	COX17	Q12287	69 aa		1.08	□□□□□ -2.24
SIP4	YJL089W	NOT5	Q12514	560 aa	Predicted RBP	1.08	□□□□□ -2.24
SIP4	YJL089W	MHT1	Q12525	324 aa		1.08	□□□□□ -2.24
SIP4	YJL089W	BRR2	P32639	2163 aa	Known RBP	1.08	□□□□□ -2.24
SIP4	YJL089W	CDC9	P04819	755 aa		1.08	□□□□□ -2.24
SIP4	YJL089W	COS2	P0CX12	379 aa		1.08	□□□□□ -2.24
SIP4	YJL089W	COS3	P0CX13	379 aa		1.08	□□□□□ -2.24
SIP4	YJL089W	MRP13	P12686	339 aa		1.08	□□□□□ -2.24
SIP4	YJL089W	RPB5	P20434	215 aa		1.08	□□□□□ -2.24
SIP4	YJL089W	VPS33	P20795	691 aa		1.08	□□□□□ -2.24
SIP4	YJL089W	ERG8	P24521	451 aa		1.08	□□□□□ -2.24
SIP4	YJL089W	AGP1	P25376	633 aa		1.08	□□□□□ -2.24
SIP4	YJL089W	CHA1	P25379	360 aa	Known RBP	1.08	□□□□□ -2.24
SIP4	YJL089W	PHO91	P27514	894 aa		1.08	□□□□□ -2.24
SIP4	YJL089W	DEP1	P31385	405 aa		1.08	□□□□□ -2.24
SIP4	YJL089W	PUP2	P32379	260 aa		1.08	□□□□□ -2.24
SIP4	YJL089W	LOS1	P33418	1100 aa	Predicted RBP	1.08	□□□□□ -2.24
SIP4	YJL089W	SDH3	P33421	198 aa		1.08	□□□□□ -2.24
SIP4	YJL089W	ASK1	P35734	292 aa		1.08	□□□□□ -2.24
SIP4	YJL089W	MNN2	P38069	597 aa		1.08	□□□□□ -2.24
SIP4	YJL089W	SCO2	P38072	301 aa		1.08	□□□□□ -2.24
SIP4	YJL089W	HSM3	P38348	480 aa		1.08	□□□□□ -2.24
SIP4	YJL089W	TRR2	P38816	342 aa		1.08	□□□□□ -2.24
SIP4	YJL089W	HRB1	P38922	454 aa	Known RBP RIP-Chip data	1.08	□□□□□ -2.24	not detected
SIP4	YJL089W	SCS2	P40075	244 aa	Known RBP	1.08	□□□□□ -2.24
SIP4	YJL089W	YJL068C	P40363	299 aa		1.08	□□□□□ -2.24
SIP4	YJL089W	AYR1	P40471	297 aa		1.08	□□□□□ -2.24
SIP4	YJL089W	CCT7	P42943	550 aa	Known RBP	1.08	□□□□□ -2.24
SIP4	YJL089W	COS4	P43542	379 aa		1.08	□□□□□ -2.24
SIP4	YJL089W	YGL176C	P46945	554 aa		1.08	□□□□□ -2.24
SIP4	YJL089W	BIT61	P47041	543 aa		1.08	□□□□□ -2.24
SIP4	YJL089W	GTO1	P48239	356 aa		1.08	□□□□□ -2.24
SIP4	YJL089W	RPS12	P48589	143 aa	Known RBP	1.08	□□□□□ -2.24
SIP4	YJL089W	BIO3	P50277	480 aa		1.08	□□□□□ -2.24
SIP4	YJL089W	EXG2	P52911	562 aa		1.08	□□□□□ -2.24
SIP4	YJL089W	TAF6	P53040	516 aa		1.08	□□□□□ -2.24
SIP4	YJL089W	YGR079W	P53249	370 aa		1.08	□□□□□ -2.24
SIP4	YJL089W	ALG12	P53730	551 aa		1.08	□□□□□ -2.24
SIP4	YJL089W	YLR460C	P54007	376 aa		1.08	□□□□□ -2.24
SIP4	YJL089W	OAZ1	Q02803	292 aa		1.08	□□□□□ -2.24
SIP4	YJL089W	YML119W	Q03208	357 aa		1.08	□□□□□ -2.24
SIP4	YJL089W	MMT1	Q03218	510 aa		1.08	□□□□□ -2.24
SIP4	YJL089W	PFA5	Q03289	374 aa		1.08	□□□□□ -2.24
SIP4	YJL089W	YDR209C	Q03480	137 aa		1.08	□□□□□ -2.24
SIP4	YJL089W	GAS3	Q03655	524 aa		1.08	□□□□□ -2.24
SIP4	YJL089W	CSN9	Q03981	162 aa		1.08	□□□□□ -2.24
SIP4	YJL089W	YMR111C	Q04461	462 aa	Predicted RBP	1.08	□□□□□ -2.24
SIP4	YJL089W	YDR124W	Q04608	324 aa		1.08	□□□□□ -2.24
SIP4	YJL089W	YLR446W	Q06204	433 aa		1.08	□□□□□ -2.24
SIP4	YJL089W	VPS74	Q06385	345 aa		1.08	□□□□□ -2.24
SIP4	YJL089W	YPR174C	Q06616	221 aa	Predicted RBP	1.08	□□□□□ -2.24
SIP4	YJL089W	COS7	Q07788	383 aa		1.08	□□□□□ -2.24
SIP4	YJL089W	FDH1	Q08911	376 aa		1.08	□□□□□ -2.24
SIP4	YJL089W	UPC2	Q12151	913 aa		1.08	□□□□□ -2.24
SIP4	YJL089W	YOR214C	Q12282	236 aa		1.08	□□□□□ -2.24
SIP4	YJL089W	YPL247C	Q12523	523 aa		1.08	□□□□□ -2.24
SIP4	YJL089W	YBL113C	Q7M4S9	792 aa		1.08	□□□□□ -2.24
SIP4	YJL089W	SAS5	Q99314	248 aa		1.08	□□□□□ -2.24
SIP4	YJL089W	FMP27	Q06179	2628 aa		1.07	□□□□□ -2.24
SIP4	YJL089W	ARG4	P04076	463 aa	Predicted RBP	1.07	□□□□□ -2.24
SIP4	YJL089W	HXK2	P04807	486 aa	Known RBP	1.07	□□□□□ -2.24
SIP4	YJL089W	RAP1	P11938	827 aa		1.07	□□□□□ -2.24
SIP4	YJL089W	SRV2	P17555	526 aa	Known RBP	1.07	□□□□□ -2.24
SIP4	YJL089W	RVS161	P25343	265 aa	Known RBP	1.07	□□□□□ -2.24
SIP4	YJL089W	CTR86	P25355	563 aa		1.07	□□□□□ -2.24
SIP4	YJL089W	DMC1	P25453	334 aa		1.07	□□□□□ -2.24
SIP4	YJL089W	STP22	P25604	385 aa		1.07	□□□□□ -2.24
SIP4	YJL089W	SYP1	P25623	870 aa	Known RBP	1.07	□□□□□ -2.24
SIP4	YJL089W	ARE1	P25628	610 aa		1.07	□□□□□ -2.24
SIP4	YJL089W	YCR051W	P25631	222 aa		1.07	□□□□□ -2.24
SIP4	YJL089W	BUB2	P26448	306 aa	Predicted RBP	1.07	□□□□□ -2.24
SIP4	YJL089W	AAR2	P32357	355 aa	Predicted RBP	1.07	□□□□□ -2.24
SIP4	YJL089W	SSE1	P32589	693 aa	Known RBP	1.07	□□□□□ -2.24
SIP4	YJL089W	NRP1	P32770	719 aa	Known RBP RIP-Chip data	1.07	□□□□□ -2.24	not detected
SIP4	YJL089W	CAT2	P32796	670 aa	Known RBP	1.07	□□□□□ -2.24
SIP4	YJL089W	MRE11	P32829	692 aa		1.07	□□□□□ -2.24
SIP4	YJL089W	SSO1	P32867	290 aa		1.07	□□□□□ -2.24
SIP4	YJL089W	HIS7	P33734	552 aa	Known RBP	1.07	□□□□□ -2.24
SIP4	YJL089W	PTH2	P34222	208 aa		1.07	□□□□□ -2.24
SIP4	YJL089W	LOT5	P34234	306 aa		1.07	□□□□□ -2.24
SIP4	YJL089W	RRN3	P36070	627 aa		1.07	□□□□□ -2.24
SIP4	YJL089W	GLG1	P36143	616 aa		1.07	□□□□□ -2.24
SIP4	YJL089W	CBP4	P37267	147 aa		1.07	□□□□□ -2.24
SIP4	YJL089W	ARN1	P38731	627 aa		1.07	□□□□□ -2.24
SIP4	YJL089W	FAD1	P38913	306 aa		1.07	□□□□□ -2.24

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