RNA–Protein interactions for RNA: YHR016C

YSC84, Transcript of Actin-binding protein, yeast

Gene YSC84, Length 1,407 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YSC84	YHR016C	DOT6	P40059	670 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
YSC84	YHR016C	YKE4	P40544	346 aa		11.13	□□□□□ -0.63
YSC84	YHR016C	ARX1	Q03862	593 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
YSC84	YHR016C	ARO10	Q06408	635 aa		11.13	□□□□□ -0.63
YSC84	YHR016C	DIN7	Q12086	430 aa		11.13	□□□□□ -0.63
YSC84	YHR016C	PDH1	Q12428	516 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
YSC84	YHR016C	PET9	P18239	318 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
YSC84	YHR016C	PHO84	P25297	587 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
YSC84	YHR016C	BUD5	P25300	642 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
YSC84	YHR016C	CTS1	P29029	562 aa		11.12	□□□□□ -0.63
YSC84	YHR016C	SBE22	P38814	852 aa		11.12	□□□□□ -0.63
YSC84	YHR016C	YPT35	P38815	214 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
YSC84	YHR016C	YHR177W	P38867	453 aa		11.12	□□□□□ -0.63
YSC84	YHR016C	YJR098C	P47139	656 aa		11.12	□□□□□ -0.63
YSC84	YHR016C	GAD1	Q04792	585 aa		11.12	□□□□□ -0.63
YSC84	YHR016C	NBA1	Q08229	501 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
YSC84	YHR016C	YPL066W	Q12194	479 aa		11.12	□□□□□ -0.63
YSC84	YHR016C	RPS21A	P0C0V8	87 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
YSC84	YHR016C	YSR3	P23501	404 aa		11.11	□□□□□ -0.63
YSC84	YHR016C	GUT1	P32190	709 aa		11.11	□□□□□ -0.63
YSC84	YHR016C	NDC1	P32500	655 aa		11.11	□□□□□ -0.63
YSC84	YHR016C	PET309	P32522	965 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
YSC84	YHR016C	PPQ1	P32945	549 aa		11.11	□□□□□ -0.63
YSC84	YHR016C	MBA1	P38300	278 aa		11.11	□□□□□ -0.63
YSC84	YHR016C	CTF8	P38877	133 aa		11.11	□□□□□ -0.63
YSC84	YHR016C	MDM31	P38880	579 aa		11.11	□□□□□ -0.63
YSC84	YHR016C	GGC1	P38988	300 aa		11.11	□□□□□ -0.63
YSC84	YHR016C	BUR6	P40096	142 aa		11.11	□□□□□ -0.63
YSC84	YHR016C	IRC7	P43623	340 aa		11.11	□□□□□ -0.63
YSC84	YHR016C	ZRG17	P53735	605 aa		11.11	□□□□□ -0.63
YSC84	YHR016C	PUN1	Q06991	263 aa		11.11	□□□□□ -0.63
YSC84	YHR016C	HAL9	Q12180	1030 aa		11.11	□□□□□ -0.63
YSC84	YHR016C	BET2	P20133	325 aa		11.1	□□□□□ -0.63
YSC84	YHR016C	ARE1	P25628	610 aa		11.1	□□□□□ -0.63
YSC84	YHR016C	SSO1	P32867	290 aa		11.1	□□□□□ -0.63
YSC84	YHR016C	ZTA1	P38230	334 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
YSC84	YHR016C	ATG14	P38270	344 aa		11.1	□□□□□ -0.63
YSC84	YHR016C	RCY1	P39531	840 aa		11.1	□□□□□ -0.63
YSC84	YHR016C	PSA1	P41940	361 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
YSC84	YHR016C	YAT1	P80235	687 aa		11.1	□□□□□ -0.63
YSC84	YHR016C	TIM11	P81449	96 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
YSC84	YHR016C	RIM13	Q03792	727 aa		11.1	□□□□□ -0.63
YSC84	YHR016C	FIN1	Q03898	291 aa		11.1	□□□□□ -0.63
YSC84	YHR016C	YMR087W	Q04299	284 aa		11.1	□□□□□ -0.63
YSC84	YHR016C	YPR1	Q12458	312 aa		11.1	□□□□□ -0.63
YSC84	YHR016C	MET2	P08465	486 aa		11.09	□□□□□ -0.63
YSC84	YHR016C	DBP3	P20447	523 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
YSC84	YHR016C	IMG2	P25642	146 aa	Predicted RBP	11.09	□□□□□ -0.63
YSC84	YHR016C	NVJ1	P38881	321 aa		11.09	□□□□□ -0.63
YSC84	YHR016C	AZF1	P41696	914 aa		11.09	□□□□□ -0.63
YSC84	YHR016C	YFR020W	P43600	232 aa		11.09	□□□□□ -0.63
YSC84	YHR016C	PAC10	P48363	199 aa		11.09	□□□□□ -0.63
YSC84	YHR016C	PYK2	P52489	506 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
YSC84	YHR016C	SNZ1	Q03148	297 aa		11.09	□□□□□ -0.63
YSC84	YHR016C	RAD59	Q12223	238 aa		11.09	□□□□□ -0.63
YSC84	YHR016C	HTS1	P07263	546 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
YSC84	YHR016C	GRX2	P17695	143 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
YSC84	YHR016C	ASF2	P32448	525 aa	Predicted RBP	11.09	□□□□□ -0.63
YSC84	YHR016C	LYP1	P32487	611 aa		11.09	□□□□□ -0.63
YSC84	YHR016C	MKK1	P32490	508 aa		11.09	□□□□□ -0.63
YSC84	YHR016C	STE5	P32917	917 aa		11.09	□□□□□ -0.63
YSC84	YHR016C	PET112	P33893	541 aa		11.09	□□□□□ -0.63
YSC84	YHR016C	YKL097C	P34245	136 aa		11.09	□□□□□ -0.63
YSC84	YHR016C	SCO2	P38072	301 aa		11.09	□□□□□ -0.63
YSC84	YHR016C	DMA1	P38823	416 aa		11.09	□□□□□ -0.63
YSC84	YHR016C	AXL2	P38928	823 aa		11.09	□□□□□ -0.63
YSC84	YHR016C	YAE1	P47118	141 aa	Predicted RBP	11.09	□□□□□ -0.63
YSC84	YHR016C	YGR079W	P53249	370 aa		11.09	□□□□□ -0.63
YSC84	YHR016C	YHM2	Q04013	314 aa		11.09	□□□□□ -0.63
YSC84	YHR016C	YDR514C	Q04408	483 aa		11.09	□□□□□ -0.63
YSC84	YHR016C	HTZ1	Q12692	134 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
YSC84	YHR016C	PDE2	P06776	526 aa		11.08	□□□□□ -0.64
YSC84	YHR016C	KIN3	P22209	435 aa		11.08	□□□□□ -0.64
YSC84	YHR016C	YJU3	P28321	313 aa		11.08	□□□□□ -0.64
YSC84	YHR016C	KAP122	P32767	1081 aa		11.08	□□□□□ -0.64
YSC84	YHR016C	YRO2	P38079	344 aa		11.08	□□□□□ -0.64
YSC84	YHR016C	MED6	P38782	295 aa		11.08	□□□□□ -0.64
YSC84	YHR016C	TAT2	P38967	592 aa		11.08	□□□□□ -0.64
YSC84	YHR016C	GIM4	P40005	111 aa	Known RBP	11.08	□□□□□ -0.64
YSC84	YHR016C	ERG10	P41338	398 aa	Known RBP	11.08	□□□□□ -0.64
YSC84	YHR016C	LSG1	P53145	640 aa	Known RBP	11.08	□□□□□ -0.64
YSC84	YHR016C	KXD1	P53158	218 aa		11.08	□□□□□ -0.64
YSC84	YHR016C	COG7	P53195	279 aa		11.08	□□□□□ -0.64
YSC84	YHR016C	RBG2	P53295	368 aa	Known RBP	11.08	□□□□□ -0.64
YSC84	YHR016C	YNR065C	P53751	1116 aa		11.08	□□□□□ -0.64
YSC84	YHR016C	TPS1	Q00764	495 aa	Known RBP	11.08	□□□□□ -0.64
YSC84	YHR016C	YSA1	Q01976	231 aa		11.08	□□□□□ -0.64
YSC84	YHR016C	RNH202	Q05635	350 aa		11.08	□□□□□ -0.64
YSC84	YHR016C	OPT2	Q06593	877 aa		11.08	□□□□□ -0.64
YSC84	YHR016C	DCI1	Q08558	271 aa		11.08	□□□□□ -0.64
YSC84	YHR016C	YDR061W	Q12298	539 aa		11.08	□□□□□ -0.64
YSC84	YHR016C	RTN2	Q12443	393 aa		11.08	□□□□□ -0.64
YSC84	YHR016C	SUS1	Q6WNK7	96 aa		11.08	□□□□□ -0.64
YSC84	YHR016C	RPS17A	P02407	136 aa	Known RBP	11.07	□□□□□ -0.64
YSC84	YHR016C	RPS17B	P14127	136 aa	Known RBP	11.07	□□□□□ -0.64
YSC84	YHR016C	MGM101	P32787	269 aa	Known RBP	11.07	□□□□□ -0.64
YSC84	YHR016C	KKQ8	P36004	724 aa		11.07	□□□□□ -0.64
YSC84	YHR016C	MBP1	P39678	833 aa		11.07	□□□□□ -0.64
YSC84	YHR016C	FAU1	P40099	211 aa		11.07	□□□□□ -0.64
YSC84	YHR016C	YFR018C	P43599	363 aa		11.07	□□□□□ -0.64

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