RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591994.1

RPRD1A-210, Transcript of regulation of nuclear pre-mRNA domain containing 1A, humanhuman

TSL 2

Gene RPRD1A, Length 2,484 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD1A-210ENST00000591994 DLX3O60479 287 aa3.52□□□□□ -1.85
RPRD1A-210ENST00000591994 FGFR1P11362 822 aa3.52□□□□□ -1.85
RPRD1A-210ENST00000591994 FAHP16930 419 aa3.52□□□□□ -1.85
RPRD1A-210ENST00000591994 ZNF568Q3ZCX4 644 aa3.52□□□□□ -1.85
RPRD1A-210ENST00000591994 DENND5AQ6IQ26 1287 aa3.52□□□□□ -1.85
RPRD1A-210ENST00000591994 NSMFQ6X4W1 530 aa3.52□□□□□ -1.85
RPRD1A-210ENST00000591994 OTOP3Q7RTS5 596 aa3.52□□□□□ -1.85
RPRD1A-210ENST00000591994 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa3.52□□□□□ -1.85
RPRD1A-210ENST00000591994 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
RPRD1A-210ENST00000591994 ZNF747Q9BV97 191 aa3.52□□□□□ -1.85
RPRD1A-210ENST00000591994 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
RPRD1A-210ENST00000591994 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa3.51□□□□□ -1.85
RPRD1A-210ENST00000591994 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP3.51□□□□□ -1.85
RPRD1A-210ENST00000591994 B4GALT4O60513 344 aa3.51□□□□□ -1.85
RPRD1A-210ENST00000591994 CDC45O75419 566 aa3.51□□□□□ -1.85
RPRD1A-210ENST00000591994 LCP1P13796 627 aa3.51□□□□□ -1.85
RPRD1A-210ENST00000591994 GPR85P60893 370 aa3.51□□□□□ -1.85
RPRD1A-210ENST00000591994 LONRF2Q1L5Z9 754 aa3.51□□□□□ -1.85
RPRD1A-210ENST00000591994 TKFCQ3LXA3 575 aa3.51□□□□□ -1.85
RPRD1A-210ENST00000591994 TMC5Q6UXY8 1006 aa3.51□□□□□ -1.85
RPRD1A-210ENST00000591994 PROSER1Q86XN7 944 aa3.51□□□□□ -1.85
RPRD1A-210ENST00000591994 IFNL3Q8IZI9 196 aa3.51□□□□□ -1.85
RPRD1A-210ENST00000591994 SYT3Q9BQG1 590 aa3.51□□□□□ -1.85
RPRD1A-210ENST00000591994 MRIQ9BWK5 157 aa3.51□□□□□ -1.85
RPRD1A-210ENST00000591994 ZDHHC9Q9Y397 364 aa3.51□□□□□ -1.85
RPRD1A-210ENST00000591994 H0Y858 1186 aa3.51□□□□□ -1.85
RPRD1A-210ENST00000591994 KNG1P01042 644 aa3.51□□□□□ -1.85
RPRD1A-210ENST00000591994 COL6A1P12109 1028 aa3.51□□□□□ -1.85
RPRD1A-210ENST00000591994 NAT1P18440 290 aa3.51□□□□□ -1.85
RPRD1A-210ENST00000591994 EPHA5P54756 1037 aa3.51□□□□□ -1.85
RPRD1A-210ENST00000591994 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
RPRD1A-210ENST00000591994 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
RPRD1A-210ENST00000591994 SPRED1Q7Z699 444 aa3.51□□□□□ -1.85
RPRD1A-210ENST00000591994 APPBP2Q92624 585 aa3.51□□□□□ -1.85
RPRD1A-210ENST00000591994 SCYL1Q96KG9 808 aa3.51□□□□□ -1.85
RPRD1A-210ENST00000591994 ZSWIM3Q96MP5 696 aa3.51□□□□□ -1.85
RPRD1A-210ENST00000591994 DHRS4Q9BTZ2 278 aa3.51□□□□□ -1.85
RPRD1A-210ENST00000591994 CDIP1Q9H305 208 aa3.51□□□□□ -1.85
RPRD1A-210ENST00000591994 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa3.51□□□□□ -1.85
RPRD1A-210ENST00000591994 FBXL7Q9UJT9 491 aa3.51□□□□□ -1.85
RPRD1A-210ENST00000591994 ENPP3O14638 875 aa3.5□□□□□ -1.85
RPRD1A-210ENST00000591994 KLHL18O94889 574 aa3.5□□□□□ -1.85
RPRD1A-210ENST00000591994 ASMTLO95671 621 aa3.5□□□□□ -1.85
RPRD1A-210ENST00000591994 TUSC3Q13454 348 aa3.5□□□□□ -1.85
RPRD1A-210ENST00000591994 USP10Q14694 798 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
RPRD1A-210ENST00000591994 LBX2Q6XYB7 198 aa3.5□□□□□ -1.85
RPRD1A-210ENST00000591994 HOMER1Q86YM7 354 aa3.5□□□□□ -1.85
RPRD1A-210ENST00000591994 SCUBE1Q8IWY4 988 aa3.5□□□□□ -1.85
RPRD1A-210ENST00000591994 NLGN4XQ8N0W4 816 aa3.5□□□□□ -1.85
RPRD1A-210ENST00000591994 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa3.5□□□□□ -1.85
RPRD1A-210ENST00000591994 PHF20Q9BVI0 1012 aa3.5□□□□□ -1.85
RPRD1A-210ENST00000591994 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa3.5□□□□□ -1.85
RPRD1A-210ENST00000591994 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa3.5□□□□□ -1.85
RPRD1A-210ENST00000591994 SLC27A2O14975 620 aa3.5□□□□□ -1.85
RPRD1A-210ENST00000591994 GNAT1P11488 350 aa3.5□□□□□ -1.85
RPRD1A-210ENST00000591994 GRK2P25098 689 aa3.5□□□□□ -1.85
RPRD1A-210ENST00000591994 CSF2RBP32927 897 aa3.5□□□□□ -1.85
RPRD1A-210ENST00000591994 GRK3P35626 688 aa3.5□□□□□ -1.85
RPRD1A-210ENST00000591994 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
RPRD1A-210ENST00000591994 NTRK3Q16288 839 aa3.5□□□□□ -1.85
RPRD1A-210ENST00000591994 USP53Q70EK8 1073 aa3.5□□□□□ -1.85
RPRD1A-210ENST00000591994 CXXC5Q7LFL8 322 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
RPRD1A-210ENST00000591994 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
RPRD1A-210ENST00000591994 NUDT10Q8NFP7 164 aa3.5□□□□□ -1.85
RPRD1A-210ENST00000591994 NUDT11Q96G61 164 aa3.5□□□□□ -1.85
RPRD1A-210ENST00000591994 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
RPRD1A-210ENST00000591994 CD2APQ9Y5K6 639 aa3.5□□□□□ -1.85
RPRD1A-210ENST00000591994 RAPGEF3O95398 923 aa3.49□□□□□ -1.85
RPRD1A-210ENST00000591994 CNOT4O95628 575 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
RPRD1A-210ENST00000591994 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
RPRD1A-210ENST00000591994 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
RPRD1A-210ENST00000591994 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
RPRD1A-210ENST00000591994 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa3.49□□□□□ -1.85
RPRD1A-210ENST00000591994 C16orf86Q6ZW13 317 aa3.49□□□□□ -1.85
RPRD1A-210ENST00000591994 Q8TCH9 128 aa3.49□□□□□ -1.85
RPRD1A-210ENST00000591994 LMF1Q96S06 567 aa3.49□□□□□ -1.85
RPRD1A-210ENST00000591994 CARD11Q9BXL7 1154 aa3.49□□□□□ -1.85
RPRD1A-210ENST00000591994 MEGF9Q9H1U4 602 aa3.49□□□□□ -1.85
RPRD1A-210ENST00000591994 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
RPRD1A-210ENST00000591994 TRAF6Q9Y4K3 522 aa3.49□□□□□ -1.85
RPRD1A-210ENST00000591994 ZNF839A8K0R7 811 aa3.49□□□□□ -1.85
RPRD1A-210ENST00000591994 CKMP06732 381 aa3.49□□□□□ -1.85
RPRD1A-210ENST00000591994 HSD3B2P26439 372 aa3.49□□□□□ -1.85
RPRD1A-210ENST00000591994 ZC3H12BQ5HYM0 836 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
RPRD1A-210ENST00000591994 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa3.49□□□□□ -1.85
RPRD1A-210ENST00000591994 STYK1Q6J9G0 422 aa3.49□□□□□ -1.85
RPRD1A-210ENST00000591994 KCNT2Q6UVM3 1135 aa3.49□□□□□ -1.85
RPRD1A-210ENST00000591994 ZNF662Q6ZS27 426 aa3.49□□□□□ -1.85
RPRD1A-210ENST00000591994 PNPLA5Q7Z6Z6 429 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
RPRD1A-210ENST00000591994 CLEC4DQ8WXI8 215 aa3.49□□□□□ -1.85
RPRD1A-210ENST00000591994 EDAQ92838 391 aa3.49□□□□□ -1.85
RPRD1A-210ENST00000591994 ALG1Q9BT22 464 aa3.49□□□□□ -1.85
RPRD1A-210ENST00000591994 KATNBL1Q9H079 304 aa3.49□□□□□ -1.85
RPRD1A-210ENST00000591994 KCND1Q9NSA2 647 aa3.49□□□□□ -1.85
RPRD1A-210ENST00000591994 FBXO10Q9UK96 956 aa3.49□□□□□ -1.85
RPRD1A-210ENST00000591994 DSEQ9UL01 958 aa3.49□□□□□ -1.85
RPRD1A-210ENST00000591994 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa3.49□□□□□ -1.85
RPRD1A-210ENST00000591994 ASXL2Q76L83 1435 aa3.48□□□□□ -1.85
RPRD1A-210ENST00000591994 TCEA2Q15560 299 aa3.48□□□□□ -1.85
RPRD1A-210ENST00000591994 SKIDA1Q1XH10 827 aa3.48□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.5 ms