RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588780.5

CAPNS1-205, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,035 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-205ENST00000588780 KRT23Q9C075 422 aa25.16■■□□□ 1.62
CAPNS1-205ENST00000588780 TUBE1Q9UJT0 475 aa25.16■■□□□ 1.62
CAPNS1-205ENST00000588780 LRFN2Q9ULH4 789 aa25.16■■□□□ 1.62
CAPNS1-205ENST00000588780 TELO2Q9Y4R8 837 aa25.16■■□□□ 1.62
CAPNS1-205ENST00000588780 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa25.16■■□□□ 1.62
CAPNS1-205ENST00000588780 CACNA1HO95180 2353 aa25.16■■□□□ 1.62
CAPNS1-205ENST00000588780 CD52P31358 61 aa25.15■■□□□ 1.62
CAPNS1-205ENST00000588780 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
CAPNS1-205ENST00000588780 MGAT3Q09327 533 aa25.15■■□□□ 1.62
CAPNS1-205ENST00000588780 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
CAPNS1-205ENST00000588780 TICAM2Q86XR7 235 aa25.15■■□□□ 1.62
CAPNS1-205ENST00000588780 NPAS4Q8IUM7 802 aa25.15■■□□□ 1.62
CAPNS1-205ENST00000588780 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
CAPNS1-205ENST00000588780 TTC3P53804 2025 aa25.15■■□□□ 1.62
CAPNS1-205ENST00000588780 PER2O15055 1255 aa25.14■■□□□ 1.62
CAPNS1-205ENST00000588780 GLP2RO95838 553 aa25.14■■□□□ 1.62
CAPNS1-205ENST00000588780 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.62
CAPNS1-205ENST00000588780 IGBP1P78318 339 aa25.14■■□□□ 1.62
CAPNS1-205ENST00000588780 GRIK4Q16099 956 aa25.14■■□□□ 1.62
CAPNS1-205ENST00000588780 MTMR8Q96EF0 704 aa25.14■■□□□ 1.62
CAPNS1-205ENST00000588780 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.62
CAPNS1-205ENST00000588780 MAD2L2Q9UI95 211 aa25.14■■□□□ 1.62
CAPNS1-205ENST00000588780 KMT2EQ8IZD2 1858 aa25.14■■□□□ 1.61
CAPNS1-205ENST00000588780 DOCK5Q9H7D0 1870 aa25.13■■□□□ 1.61
CAPNS1-205ENST00000588780 M0QZ92 97 aa25.13■■□□□ 1.61
CAPNS1-205ENST00000588780 SEMA3FQ13275 785 aa25.13■■□□□ 1.61
CAPNS1-205ENST00000588780 PTPN21Q16825 1174 aa25.13■■□□□ 1.61
CAPNS1-205ENST00000588780 GLG1Q92896 1179 aa25.13■■□□□ 1.61
CAPNS1-205ENST00000588780 ASIC4Q96FT7 647 aa25.13■■□□□ 1.61
CAPNS1-205ENST00000588780 FTHL17Q9BXU8 183 aa25.13■■□□□ 1.61
CAPNS1-205ENST00000588780 SDSP20132 328 aa25.12■■□□□ 1.61
CAPNS1-205ENST00000588780 SP100P23497 879 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
CAPNS1-205ENST00000588780 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
CAPNS1-205ENST00000588780 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
CAPNS1-205ENST00000588780 NLRX1Q86UT6 975 aa25.12■■□□□ 1.61
CAPNS1-205ENST00000588780 PIBF1Q8WXW3 757 aa25.12■■□□□ 1.61
CAPNS1-205ENST00000588780 NEK1Q96PY6 1258 aa25.12■■□□□ 1.61
CAPNS1-205ENST00000588780 CNNM2Q9H8M5 875 aa25.12■■□□□ 1.61
CAPNS1-205ENST00000588780 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
CAPNS1-205ENST00000588780 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa25.12■■□□□ 1.61
CAPNS1-205ENST00000588780 SRGAP2BP0DMP2 458 aa25.11■■□□□ 1.61
CAPNS1-205ENST00000588780 SCG2P13521 617 aa25.11■■□□□ 1.61
CAPNS1-205ENST00000588780 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
CAPNS1-205ENST00000588780 RBM10P98175 930 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
CAPNS1-205ENST00000588780 IER5Q5VY09 327 aa25.11■■□□□ 1.61
CAPNS1-205ENST00000588780 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
CAPNS1-205ENST00000588780 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa25.11■■□□□ 1.61
CAPNS1-205ENST00000588780 LINC01599Q8WXQ3 324 aa25.11■■□□□ 1.61
CAPNS1-205ENST00000588780 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa25.11■■□□□ 1.61
CAPNS1-205ENST00000588780 ERAP1Q9NZ08 941 aa25.11■■□□□ 1.61
CAPNS1-205ENST00000588780 USP34Q70CQ2 3546 aa25.11■■□□□ 1.61
CAPNS1-205ENST00000588780 GATMP50440 423 aa25.1■■□□□ 1.61
CAPNS1-205ENST00000588780 PAK2Q13177 524 aa25.1■■□□□ 1.61
CAPNS1-205ENST00000588780 CUL5Q93034 780 aa25.1■■□□□ 1.61
CAPNS1-205ENST00000588780 SENP7Q9BQF6 1050 aa25.1■■□□□ 1.61
CAPNS1-205ENST00000588780 APOL5Q9BWW9 433 aa25.1■■□□□ 1.61
CAPNS1-205ENST00000588780 AAASQ9NRG9 546 aa25.1■■□□□ 1.61
CAPNS1-205ENST00000588780 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa25.09■■□□□ 1.61
CAPNS1-205ENST00000588780 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
CAPNS1-205ENST00000588780 TMEM62Q0P6H9 643 aa25.09■■□□□ 1.61
CAPNS1-205ENST00000588780 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
CAPNS1-205ENST00000588780 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa25.09■■□□□ 1.61
CAPNS1-205ENST00000588780 CFAP54Q96N23 3096 aa25.09■■□□□ 1.61
CAPNS1-205ENST00000588780 FSD2A1L4K1 749 aa25.08■■□□□ 1.61
CAPNS1-205ENST00000588780 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.61
CAPNS1-205ENST00000588780 SEPT1Q8WYJ6 367 aa25.08■■□□□ 1.61
CAPNS1-205ENST00000588780 ZBTB10Q96DT7 871 aa25.08■■□□□ 1.61
CAPNS1-205ENST00000588780 RIPOR3Q96MK2 946 aa25.08■■□□□ 1.61
CAPNS1-205ENST00000588780 PKD2L1Q9P0L9 805 aa25.08■■□□□ 1.61
CAPNS1-205ENST00000588780 PADI3Q9ULW8 664 aa25.08■■□□□ 1.61
CAPNS1-205ENST00000588780 TRPV2Q9Y5S1 764 aa25.08■■□□□ 1.61
CAPNS1-205ENST00000588780 SPTBN4Q9H254 2564 aa25.08■■□□□ 1.61
CAPNS1-205ENST00000588780 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
CAPNS1-205ENST00000588780 KIAA1671Q9BY89 1806 aa25.07■■□□□ 1.6
CAPNS1-205ENST00000588780 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
CAPNS1-205ENST00000588780 THNSL1Q8IYQ7 743 aa25.07■■□□□ 1.6
CAPNS1-205ENST00000588780 SUSD6Q92537 303 aa25.07■■□□□ 1.6
CAPNS1-205ENST00000588780 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
CAPNS1-205ENST00000588780 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa25.07■■□□□ 1.6
CAPNS1-205ENST00000588780 RIOX1Q9H6W3 641 aa25.07■■□□□ 1.6
CAPNS1-205ENST00000588780 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa25.07■■□□□ 1.6
CAPNS1-205ENST00000588780 FRMPD4Q14CM0 1322 aa25.07■■□□□ 1.6
CAPNS1-205ENST00000588780 LAMA4Q16363 1823 aa25.07■■□□□ 1.6
CAPNS1-205ENST00000588780 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
CAPNS1-205ENST00000588780 TECP42680 631 aa25.06■■□□□ 1.6
CAPNS1-205ENST00000588780 NUBP1P53384 320 aa25.06■■□□□ 1.6
CAPNS1-205ENST00000588780 UBE3AQ05086 875 aa25.06■■□□□ 1.6
CAPNS1-205ENST00000588780 GRM4Q14833 912 aa25.06■■□□□ 1.6
CAPNS1-205ENST00000588780 PCNX4Q63HM2 1172 aa25.06■■□□□ 1.6
CAPNS1-205ENST00000588780 ASCL5Q7RTU5 278 aa25.06■■□□□ 1.6
CAPNS1-205ENST00000588780 TMEM260Q9NX78 707 aa25.06■■□□□ 1.6
CAPNS1-205ENST00000588780 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
CAPNS1-205ENST00000588780 RRN3P2A6NIE6 340 aa25.05■■□□□ 1.6
CAPNS1-205ENST00000588780 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
CAPNS1-205ENST00000588780 SEC23AQ15436 765 aa25.05■■□□□ 1.6
CAPNS1-205ENST00000588780 DUSP6Q16828 381 aa25.05■■□□□ 1.6
CAPNS1-205ENST00000588780 SLC35G1Q2M3R5 365 aa25.05■■□□□ 1.6
CAPNS1-205ENST00000588780 MARCH8Q5T0T0 291 aa25.05■■□□□ 1.6
CAPNS1-205ENST00000588780 LLGL2Q6P1M3 1020 aa25.05■■□□□ 1.6
CAPNS1-205ENST00000588780 XRRA1Q6P2D8 792 aa25.05■■□□□ 1.6
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