RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480416.1

TNS1-215, Transcript of tensin 1, human

TSL 2

Gene TNS1, Length 335 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TNS1-215	ENST00000480416	GH2	P01242	217 aa		4.01	□□□□□ -1.77
TNS1-215	ENST00000480416	RPLP1	P05386	114 aa	Known RBP	4.01	□□□□□ -1.77
TNS1-215	ENST00000480416	ASNS	P08243	561 aa		4.01	□□□□□ -1.77
TNS1-215	ENST00000480416	NBPF7	P0C2Y1	421 aa	Predicted RBP	4.01	□□□□□ -1.77
TNS1-215	ENST00000480416	ADORA1	P30542	326 aa		4.01	□□□□□ -1.77
TNS1-215	ENST00000480416	GUCY1A2	P33402	732 aa		4.01	□□□□□ -1.77
TNS1-215	ENST00000480416	PHKA1	P46020	1223 aa		4.01	□□□□□ -1.77
TNS1-215	ENST00000480416	GJA9	P57773	515 aa		4.01	□□□□□ -1.77
TNS1-215	ENST00000480416	ERVK-21	P61565	698 aa		4.01	□□□□□ -1.77
TNS1-215	ENST00000480416	MECOM	Q03112	1051 aa		4.01	□□□□□ -1.77
TNS1-215	ENST00000480416	SIGLEC14	Q08ET2	396 aa		4.01	□□□□□ -1.77
TNS1-215	ENST00000480416	FKBP5	Q13451	457 aa	Predicted RBP	4.01	□□□□□ -1.77
TNS1-215	ENST00000480416	LRP8	Q14114	963 aa		4.01	□□□□□ -1.77
TNS1-215	ENST00000480416	PUM1	Q14671	1186 aa	Known RBP eCLIP	4.01	□□□□□ -1.77
TNS1-215	ENST00000480416	TMEM132B	Q14DG7	1078 aa		4.01	□□□□□ -1.77
TNS1-215	ENST00000480416	TTC39B	Q5VTQ0	682 aa	Predicted RBP	4.01	□□□□□ -1.77
TNS1-215	ENST00000480416	SHISA2	Q6UWI4	295 aa		4.01	□□□□□ -1.77
TNS1-215	ENST00000480416	RPAIN	Q86UA6	219 aa		4.01	□□□□□ -1.77
TNS1-215	ENST00000480416	TTC16	Q8NEE8	873 aa		4.01	□□□□□ -1.77
TNS1-215	ENST00000480416	PHOSPHO2	Q8TCD6	241 aa		4.01	□□□□□ -1.77
TNS1-215	ENST00000480416	SH3RF3	Q8TEJ3	882 aa	Predicted RBP	4.01	□□□□□ -1.77
TNS1-215	ENST00000480416	WFDC12	Q8WWY7	111 aa		4.01	□□□□□ -1.77
TNS1-215	ENST00000480416	TSR2	Q969E8	191 aa	Known RBP	4.01	□□□□□ -1.77
TNS1-215	ENST00000480416	PLD4	Q96BZ4	506 aa		4.01	□□□□□ -1.77
TNS1-215	ENST00000480416	PABPC5	Q96DU9	382 aa	Known RBP	4.01	□□□□□ -1.77
TNS1-215	ENST00000480416	CHAMP1	Q96JM3	812 aa		4.01	□□□□□ -1.77
TNS1-215	ENST00000480416	C12orf42	Q96LP6	360 aa		4.01	□□□□□ -1.77
TNS1-215	ENST00000480416	RIPOR3	Q96MK2	946 aa		4.01	□□□□□ -1.77
TNS1-215	ENST00000480416	SLC9A7	Q96T83	725 aa		4.01	□□□□□ -1.77
TNS1-215	ENST00000480416	SMOC2	Q9H3U7	446 aa		4.01	□□□□□ -1.77
TNS1-215	ENST00000480416	SH2B1	Q9NRF2	756 aa	Predicted RBP	4.01	□□□□□ -1.77
TNS1-215	ENST00000480416	DLL3	Q9NYJ7	618 aa		4.01	□□□□□ -1.77
TNS1-215	ENST00000480416	PI4KB	Q9UBF8	816 aa		4.01	□□□□□ -1.77
TNS1-215	ENST00000480416	ZHX1	Q9UKY1	873 aa	Predicted RBP	4.01	□□□□□ -1.77
TNS1-215	ENST00000480416	FAM184B	Q9ULE4	1060 aa		4.01	□□□□□ -1.77
TNS1-215	ENST00000480416	PALD1	Q9ULE6	856 aa		4.01	□□□□□ -1.77
TNS1-215	ENST00000480416	PCDHGC5	Q9Y5F6	944 aa		4.01	□□□□□ -1.77
TNS1-215	ENST00000480416	ZNF236	Q9UL36	1845 aa		4	□□□□□ -1.77
TNS1-215	ENST00000480416	MROH7-TTC4	A0A0A0MT08	1334 aa		4	□□□□□ -1.77
TNS1-215	ENST00000480416	SALL1	Q9NSC2	1324 aa		4	□□□□□ -1.77
TNS1-215	ENST00000480416	ATG2A	Q2TAZ0	1938 aa		4	□□□□□ -1.77
TNS1-215	ENST00000480416	ZBTB42	B2RXF5	422 aa		4	□□□□□ -1.77
TNS1-215	ENST00000480416	LOC730098	B7Z3J9	87 aa		4	□□□□□ -1.77
TNS1-215	ENST00000480416	GRM8	O00222	908 aa		4	□□□□□ -1.77
TNS1-215	ENST00000480416	PI15	O43692	258 aa		4	□□□□□ -1.77
TNS1-215	ENST00000480416	PRMT3	O60678	531 aa		4	□□□□□ -1.77
TNS1-215	ENST00000480416	DUSP11	O75319	330 aa	Known RBP	4	□□□□□ -1.77
TNS1-215	ENST00000480416	SMNDC1	O75940	238 aa	Known RBP eCLIP	4	□□□□□ -1.77
TNS1-215	ENST00000480416	IFIT1	P09914	478 aa	Known RBP	4	□□□□□ -1.77
TNS1-215	ENST00000480416	IQCF3	P0C7M6	154 aa		4	□□□□□ -1.77
TNS1-215	ENST00000480416	PCSK2	P16519	638 aa		4	□□□□□ -1.77
TNS1-215	ENST00000480416	ITGB7	P26010	798 aa		4	□□□□□ -1.77
TNS1-215	ENST00000480416	CST5	P28325	142 aa	Predicted RBP	4	□□□□□ -1.77
TNS1-215	ENST00000480416	ATXN1	P54253	815 aa	Known RBP	4	□□□□□ -1.77
TNS1-215	ENST00000480416	WDR5	P61964	334 aa	Known RBP	4	□□□□□ -1.77
TNS1-215	ENST00000480416	HYAL2	Q12891	473 aa		4	□□□□□ -1.77
TNS1-215	ENST00000480416	ACVR2B	Q13705	512 aa		4	□□□□□ -1.77
TNS1-215	ENST00000480416	COG2	Q14746	738 aa		4	□□□□□ -1.77
TNS1-215	ENST00000480416	RAB3GAP1	Q15042	981 aa		4	□□□□□ -1.77
TNS1-215	ENST00000480416	PKN1	Q16512	942 aa		4	□□□□□ -1.77
TNS1-215	ENST00000480416	CCDC144B	Q3MJ40	725 aa		4	□□□□□ -1.77
TNS1-215	ENST00000480416	COX20	Q5RI15	118 aa		4	□□□□□ -1.77
TNS1-215	ENST00000480416	GDF6	Q6KF10	455 aa	Predicted RBP	4	□□□□□ -1.77
TNS1-215	ENST00000480416	METTL16	Q86W50	562 aa	Known RBP	4	□□□□□ -1.77
TNS1-215	ENST00000480416	DZIP1	Q86YF9	867 aa	Known RBP	4	□□□□□ -1.77
TNS1-215	ENST00000480416	MAPKAPK5	Q8IW41	473 aa		4	□□□□□ -1.77
TNS1-215	ENST00000480416	IL22RA1	Q8N6P7	574 aa		4	□□□□□ -1.77
TNS1-215	ENST00000480416	ANKRD44	Q8N8A2	993 aa		4	□□□□□ -1.77
TNS1-215	ENST00000480416	PCSK9	Q8NBP7	692 aa	Known RBP	4	□□□□□ -1.77
TNS1-215	ENST00000480416	TGFBRAP1	Q8WUH2	860 aa		4	□□□□□ -1.77
TNS1-215	ENST00000480416	ATG4C	Q96DT6	458 aa		4	□□□□□ -1.77
TNS1-215	ENST00000480416	PRIMPOL	Q96LW4	560 aa		4	□□□□□ -1.77
TNS1-215	ENST00000480416	TGS1	Q96RS0	853 aa	Known RBP	4	□□□□□ -1.77
TNS1-215	ENST00000480416	MMP19	Q99542	508 aa		4	□□□□□ -1.77
TNS1-215	ENST00000480416	FTO	Q9C0B1	505 aa	Known RBP eCLIP	4	□□□□□ -1.77
TNS1-215	ENST00000480416	IRF2BPL	Q9H1B7	796 aa		4	□□□□□ -1.77
TNS1-215	ENST00000480416	BICC1	Q9H694	974 aa	Known RBP	4	□□□□□ -1.77
TNS1-215	ENST00000480416	AKTIP	Q9H8T0	292 aa		4	□□□□□ -1.77
TNS1-215	ENST00000480416	SAP30BP	Q9UHR5	308 aa	Known RBP	4	□□□□□ -1.77
TNS1-215	ENST00000480416	HERC5	Q9UII4	1024 aa	Known RBP	4	□□□□□ -1.77
TNS1-215	ENST00000480416	TNFRSF11A	Q9Y6Q6	616 aa	Predicted RBP	4	□□□□□ -1.77
TNS1-215	ENST00000480416	SI	P14410	1827 aa		4	□□□□□ -1.77
TNS1-215	ENST00000480416	GSC2	O15499	205 aa		3.99	□□□□□ -1.77
TNS1-215	ENST00000480416	MMP20	O60882	483 aa		3.99	□□□□□ -1.77
TNS1-215	ENST00000480416	TBX10	O75333	385 aa		3.99	□□□□□ -1.77
TNS1-215	ENST00000480416	ATG7	O95352	703 aa		3.99	□□□□□ -1.77
TNS1-215	ENST00000480416	FCER1A	P12319	257 aa		3.99	□□□□□ -1.77
TNS1-215	ENST00000480416	GRN	P28799	593 aa	Known RBP	3.99	□□□□□ -1.77
TNS1-215	ENST00000480416	RFX5	P48382	616 aa	Predicted RBP	3.99	□□□□□ -1.77
TNS1-215	ENST00000480416	TIMM10	P62072	90 aa		3.99	□□□□□ -1.77
TNS1-215	ENST00000480416	HYAL1	Q12794	435 aa		3.99	□□□□□ -1.77
TNS1-215	ENST00000480416	COL19A1	Q14993	1142 aa		3.99	□□□□□ -1.77
TNS1-215	ENST00000480416	PUM3	Q15397	648 aa	Known RBP	3.99	□□□□□ -1.77
TNS1-215	ENST00000480416	PI16	Q6UXB8	463 aa		3.99	□□□□□ -1.77
TNS1-215	ENST00000480416	LIN28B	Q6ZN17	250 aa	Known RBP eCLIP	3.99	□□□□□ -1.77
TNS1-215	ENST00000480416	ATG9A	Q7Z3C6	839 aa		3.99	□□□□□ -1.77
TNS1-215	ENST00000480416	FOXP4	Q8IVH2	680 aa	Predicted RBP	3.99	□□□□□ -1.77
TNS1-215	ENST00000480416	TEX11	Q8IYF3	940 aa		3.99	□□□□□ -1.77
TNS1-215	ENST00000480416	ABRA	Q8N0Z2	381 aa		3.99	□□□□□ -1.77
TNS1-215	ENST00000480416	TMEM130	Q8N3G9	435 aa		3.99	□□□□□ -1.77

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