RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469376.5

OPN3-204, Transcript of opsin 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene OPN3, Length 1,961 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN3-204ENST00000469376 KCTD1Q719H9 257 aa28.48■■■□□ 2.15
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OPN3-204ENST00000469376 ZNF541Q9H0D2 1346 aa28.47■■■□□ 2.15
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OPN3-204ENST00000469376 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP28.47■■■□□ 2.15
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OPN3-204ENST00000469376 C8orf74Q6P047 294 aa28.44■■■□□ 2.14
OPN3-204ENST00000469376 CAVIN3Q969G5 261 aa28.44■■■□□ 2.14
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OPN3-204ENST00000469376 USP17L15C9J2P7 530 aa28.42■■■□□ 2.14
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OPN3-204ENST00000469376 USP17L22D6RA61 530 aa28.42■■■□□ 2.14
OPN3-204ENST00000469376 USP17L17D6RBQ6 530 aa28.42■■■□□ 2.14
OPN3-204ENST00000469376 USP17L19D6RCP7 530 aa28.42■■■□□ 2.14
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OPN3-204ENST00000469376 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP28.42■■■□□ 2.14
OPN3-204ENST00000469376 USP17L24Q0WX57 530 aa28.42■■■□□ 2.14
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OPN3-204ENST00000469376 TBC1D5Q92609 795 aa28.42■■■□□ 2.14
OPN3-204ENST00000469376 PSMB7Q99436 277 aa28.42■■■□□ 2.14
OPN3-204ENST00000469376 SH3GL2Q99962 352 aa28.42■■■□□ 2.14
OPN3-204ENST00000469376 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP28.42■■■□□ 2.14
OPN3-204ENST00000469376 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa28.41■■■□□ 2.14
OPN3-204ENST00000469376 SHTN1A0MZ66 631 aa28.41■■■□□ 2.14
OPN3-204ENST00000469376 GOLGA6CA6NDK9 693 aa28.41■■■□□ 2.14
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