RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462322.2

SMKR1-201, Transcript of small lysine rich protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SMKR1, Length 1,035 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMKR1-201ENST00000462322 KRT25Q7Z3Z0 450 aa27.18■■□□□ 1.94
SMKR1-201ENST00000462322 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP27.18■■□□□ 1.94
SMKR1-201ENST00000462322 PBX4Q9BYU1 374 aa27.18■■□□□ 1.94
SMKR1-201ENST00000462322 SEMA6BQ9H3T3 888 aa27.18■■□□□ 1.94
SMKR1-201ENST00000462322 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa27.18■■□□□ 1.94
SMKR1-201ENST00000462322 TRPC6Q9Y210 931 aa27.18■■□□□ 1.94
SMKR1-201ENST00000462322 CAND2O75155 1236 aa27.17■■□□□ 1.94
SMKR1-201ENST00000462322 CXCL10P02778 98 aa27.17■■□□□ 1.94
SMKR1-201ENST00000462322 FDPSP14324 419 aaKnown RBP27.17■■□□□ 1.94
SMKR1-201ENST00000462322 PBX2P40425 430 aa27.17■■□□□ 1.94
SMKR1-201ENST00000462322 IGBP1P78318 339 aa27.17■■□□□ 1.94
SMKR1-201ENST00000462322 FAM160B1Q5W0V3 765 aa27.17■■□□□ 1.94
SMKR1-201ENST00000462322 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa27.17■■□□□ 1.94
SMKR1-201ENST00000462322 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP27.17■■□□□ 1.94
SMKR1-201ENST00000462322 TIFAQ96CG3 184 aa27.17■■□□□ 1.94
SMKR1-201ENST00000462322 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP27.17■■□□□ 1.94
SMKR1-201ENST00000462322 MSRAQ9UJ68 235 aa27.17■■□□□ 1.94
SMKR1-201ENST00000462322 TMEM265A0A087WTH1 108 aa27.16■■□□□ 1.94
SMKR1-201ENST00000462322 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa27.16■■□□□ 1.94
SMKR1-201ENST00000462322 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa27.16■■□□□ 1.94
SMKR1-201ENST00000462322 MSH4O15457 936 aa27.16■■□□□ 1.94
SMKR1-201ENST00000462322 CTSHP09668 335 aa27.16■■□□□ 1.94
SMKR1-201ENST00000462322 INSRRP14616 1297 aa27.16■■□□□ 1.94
SMKR1-201ENST00000462322 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP27.16■■□□□ 1.94
SMKR1-201ENST00000462322 KRT76Q01546 638 aa27.16■■□□□ 1.94
SMKR1-201ENST00000462322 MBTPS1Q14703 1052 aa27.16■■□□□ 1.94
SMKR1-201ENST00000462322 PLCB4Q15147 1175 aa27.16■■□□□ 1.94
SMKR1-201ENST00000462322 RAB30Q15771 203 aa27.16■■□□□ 1.94
SMKR1-201ENST00000462322 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP27.16■■□□□ 1.94
SMKR1-201ENST00000462322 CNKSR3Q6P9H4 555 aa27.16■■□□□ 1.94
SMKR1-201ENST00000462322 KIF2CQ99661 725 aa27.16■■□□□ 1.94
SMKR1-201ENST00000462322 TUBE1Q9UJT0 475 aa27.16■■□□□ 1.94
SMKR1-201ENST00000462322 RRN3P2A6NIE6 340 aa27.15■■□□□ 1.94
SMKR1-201ENST00000462322 BAIAP3O94812 1187 aa27.15■■□□□ 1.94
SMKR1-201ENST00000462322 SLC26A2P50443 739 aa27.15■■□□□ 1.94
SMKR1-201ENST00000462322 INF2Q27J81 1249 aa27.15■■□□□ 1.94
SMKR1-201ENST00000462322 TAF2Q6P1X5 1199 aa27.15■■□□□ 1.94
SMKR1-201ENST00000462322 ZNF302Q9NR11 478 aa27.15■■□□□ 1.94
SMKR1-201ENST00000462322 POTEB3A0JP26 581 aa27.14■■□□□ 1.94
SMKR1-201ENST00000462322 JAK2O60674 1132 aa27.14■■□□□ 1.94
SMKR1-201ENST00000462322 TDP2O95551 362 aa27.14■■□□□ 1.94
SMKR1-201ENST00000462322 RBM25P49756 843 aaKnown RBP27.14■■□□□ 1.94
SMKR1-201ENST00000462322 Q4G0T1 1027 aa27.14■■□□□ 1.94
SMKR1-201ENST00000462322 SWSAP1Q6NVH7 229 aa27.14■■□□□ 1.94
SMKR1-201ENST00000462322 POTEBQ6S5H4 581 aa27.14■■□□□ 1.94
SMKR1-201ENST00000462322 RUFY4Q6ZNE9 571 aa27.14■■□□□ 1.94
SMKR1-201ENST00000462322 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP27.14■■□□□ 1.94
SMKR1-201ENST00000462322 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP27.14■■□□□ 1.94
SMKR1-201ENST00000462322 OXER1Q8TDS5 423 aa27.14■■□□□ 1.94
SMKR1-201ENST00000462322 GUCD1Q96NT3 240 aa27.14■■□□□ 1.94
SMKR1-201ENST00000462322 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa27.13■■□□□ 1.93
SMKR1-201ENST00000462322 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP27.13■■□□□ 1.93
SMKR1-201ENST00000462322 CYP3A7P24462 503 aa27.13■■□□□ 1.93
SMKR1-201ENST00000462322 KCNJ6P48051 423 aa27.13■■□□□ 1.93
SMKR1-201ENST00000462322 RABGGTBP53611 331 aa27.13■■□□□ 1.93
SMKR1-201ENST00000462322 MARCH8Q5T0T0 291 aa27.13■■□□□ 1.93
SMKR1-201ENST00000462322 PDXDC2PQ6P474 469 aa27.13■■□□□ 1.93
SMKR1-201ENST00000462322 RSPH3Q86UC2 560 aa27.13■■□□□ 1.93
SMKR1-201ENST00000462322 SLC5A5Q92911 643 aa27.13■■□□□ 1.93
SMKR1-201ENST00000462322 SLC9A7Q96T83 725 aa27.13■■□□□ 1.93
SMKR1-201ENST00000462322 RIT2Q99578 217 aa27.13■■□□□ 1.93
SMKR1-201ENST00000462322 SAMM50Q9Y512 469 aa27.13■■□□□ 1.93
SMKR1-201ENST00000462322 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa27.13■■□□□ 1.93
SMKR1-201ENST00000462322 GAS7O60861 476 aa27.12■■□□□ 1.93
SMKR1-201ENST00000462322 PSAPP07602 524 aa27.12■■□□□ 1.93
SMKR1-201ENST00000462322 ST3GAL1Q11201 340 aa27.12■■□□□ 1.93
SMKR1-201ENST00000462322 LRCH2Q5VUJ6 765 aa27.12■■□□□ 1.93
SMKR1-201ENST00000462322 MOXD1Q6UVY6 613 aa27.12■■□□□ 1.93
SMKR1-201ENST00000462322 ZNF576Q9H609 170 aa27.12■■□□□ 1.93
SMKR1-201ENST00000462322 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP27.12■■□□□ 1.93
SMKR1-201ENST00000462322 BRMS1Q9HCU9 246 aa27.12■■□□□ 1.93
SMKR1-201ENST00000462322 IKBKEQ14164 716 aa27.11■■□□□ 1.93
SMKR1-201ENST00000462322 TCTN1Q2MV58 587 aa27.11■■□□□ 1.93
SMKR1-201ENST00000462322 LETM2Q2VYF4 491 aa27.11■■□□□ 1.93
SMKR1-201ENST00000462322 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa27.11■■□□□ 1.93
SMKR1-201ENST00000462322 CCDC83Q8IWF9 413 aa27.11■■□□□ 1.93
SMKR1-201ENST00000462322 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa27.11■■□□□ 1.93
SMKR1-201ENST00000462322 ATP8B4Q8TF62 1192 aa27.11■■□□□ 1.93
SMKR1-201ENST00000462322 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa27.11■■□□□ 1.93
SMKR1-201ENST00000462322 GJA10Q969M2 543 aa27.11■■□□□ 1.93
SMKR1-201ENST00000462322 ZBTB10Q96DT7 871 aa27.11■■□□□ 1.93
SMKR1-201ENST00000462322 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP27.11■■□□□ 1.93
SMKR1-201ENST00000462322 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP27.11■■□□□ 1.93
SMKR1-201ENST00000462322 TEKT3Q9BXF9 490 aa27.11■■□□□ 1.93
SMKR1-201ENST00000462322 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa27.11■■□□□ 1.93
SMKR1-201ENST00000462322 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa27.11■■□□□ 1.93
SMKR1-201ENST00000462322 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP27.11■■□□□ 1.93
SMKR1-201ENST00000462322 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa27.11■■□□□ 1.93
SMKR1-201ENST00000462322 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa27.1■■□□□ 1.93
SMKR1-201ENST00000462322 WDR64B1ANS9 1081 aa27.1■■□□□ 1.93
SMKR1-201ENST00000462322 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa27.1■■□□□ 1.93
SMKR1-201ENST00000462322 HBP1O60381 514 aa27.1■■□□□ 1.93
SMKR1-201ENST00000462322 KRT2P35908 639 aa27.1■■□□□ 1.93
SMKR1-201ENST00000462322 FOSBP53539 338 aa27.1■■□□□ 1.93
SMKR1-201ENST00000462322 WDR5P61964 334 aaKnown RBP27.1■■□□□ 1.93
SMKR1-201ENST00000462322 TRIM29Q14134 588 aa27.1■■□□□ 1.93
SMKR1-201ENST00000462322 FAM26DQ5JW98 314 aa27.1■■□□□ 1.93
SMKR1-201ENST00000462322 NEK8Q86SG6 692 aa27.1■■□□□ 1.93
SMKR1-201ENST00000462322 RPAINQ86UA6 219 aa27.1■■□□□ 1.93
SMKR1-201ENST00000462322 CKAP2LQ8IYA6 745 aa27.1■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 87.5 ms