RNA–Protein interactions for RNA: YGR212W

SLI1, Transcript of N-acetyltransferase, yeast

Gene SLI1, Length 1,407 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SLI1	YGR212W	ERP3	Q12403	225 aa		3.59	□□□□□ -1.84
SLI1	YGR212W	MYO1	P08964	1928 aa		3.59	□□□□□ -1.84
SLI1	YGR212W	SRV2	P17555	526 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
SLI1	YGR212W	CPR2	P23285	205 aa		3.58	□□□□□ -1.84
SLI1	YGR212W	PRP21	P32524	280 aa	Predicted RBP	3.58	□□□□□ -1.84
SLI1	YGR212W	DBP7	P36120	742 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
SLI1	YGR212W	PIM1	P36775	1133 aa		3.58	□□□□□ -1.84
SLI1	YGR212W	RTT107	P38850	1070 aa		3.58	□□□□□ -1.84
SLI1	YGR212W	TCB2	P48231	1178 aa		3.58	□□□□□ -1.84
SLI1	YGR212W	NCS2	P53923	493 aa	Predicted RBP	3.58	□□□□□ -1.84
SLI1	YGR212W	RPM2	Q02773	1202 aa		3.58	□□□□□ -1.84
SLI1	YGR212W	SPH1	Q06160	661 aa		3.58	□□□□□ -1.84
SLI1	YGR212W	SUE1	Q06524	206 aa		3.58	□□□□□ -1.84
SLI1	YGR212W	VAM3	Q12241	283 aa		3.58	□□□□□ -1.84
SLI1	YGR212W	MDH1	P17505	334 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.57	□□□□□ -1.84	not detected
SLI1	YGR212W	MCR1	P36060	302 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
SLI1	YGR212W	CCT2	P39076	527 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
SLI1	YGR212W	CIK1	Q01649	594 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SLI1	YGR212W	HSP31	Q04432	237 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SLI1	YGR212W	TIP41	Q12199	356 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SLI1	YGR212W	HSP42	Q12329	375 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SLI1	YGR212W	MRS3	P10566	314 aa		3.56	□□□□□ -1.84
SLI1	YGR212W	POT1	P27796	417 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.56	□□□□□ -1.84	not detected
SLI1	YGR212W	HIR2	P32480	875 aa		3.56	□□□□□ -1.84
SLI1	YGR212W	NDC1	P32500	655 aa		3.56	□□□□□ -1.84
SLI1	YGR212W	PTR2	P32901	601 aa		3.56	□□□□□ -1.84
SLI1	YGR212W	MYO3	P36006	1272 aa		3.56	□□□□□ -1.84
SLI1	YGR212W	RRT2	P38332	387 aa		3.56	□□□□□ -1.84
SLI1	YGR212W	LRP1	P38801	184 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
SLI1	YGR212W	NDT80	P38830	627 aa		3.56	□□□□□ -1.84
SLI1	YGR212W	YJL070C	P40361	888 aa		3.56	□□□□□ -1.84
SLI1	YGR212W	ELP2	P42935	788 aa		3.56	□□□□□ -1.84
SLI1	YGR212W	RPS0B	P46654	252 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
SLI1	YGR212W	HOT1	Q03213	719 aa		3.56	□□□□□ -1.84
SLI1	YGR212W	HCR1	Q05775	265 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
SLI1	YGR212W	DAP1	Q12091	152 aa		3.56	□□□□□ -1.84
SLI1	YGR212W	SEC63	P14906	663 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SLI1	YGR212W	MTF1	P14908	341 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
SLI1	YGR212W	URA4	P20051	364 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SLI1	YGR212W	SIN4	P32259	974 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SLI1	YGR212W	RSM22	P36056	628 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SLI1	YGR212W	FMP46	P36141	133 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
SLI1	YGR212W	SLM4	P38247	162 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SLI1	YGR212W	GWT1	P47026	490 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SLI1	YGR212W	DSL1	P53847	754 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SLI1	YGR212W	VPS9	P54787	451 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SLI1	YGR212W	ACL4	Q03771	387 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SLI1	YGR212W	YMR317W	Q04893	1140 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SLI1	YGR212W	RTT103	Q05543	409 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SLI1	YGR212W	YMR230W-A	Q3E7B5	62 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SLI1	YGR212W	RIF1	P29539	1916 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SLI1	YGR212W	MAS2	P11914	482 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SLI1	YGR212W	OPI1	P21957	404 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SLI1	YGR212W	GEX1	P25596	615 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SLI1	YGR212W	YCR022C	P25620	114 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SLI1	YGR212W	BRF1	P29056	596 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SLI1	YGR212W	BEM1	P29366	551 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SLI1	YGR212W	ANP1	P32629	500 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SLI1	YGR212W	FRE2	P36033	711 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SLI1	YGR212W	MMS4	P38257	691 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SLI1	YGR212W	RFC3	P38629	340 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SLI1	YGR212W	VPS45	P38932	577 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SLI1	YGR212W	ISC1	P40015	477 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
SLI1	YGR212W	SHO1	P40073	367 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SLI1	YGR212W	SAS2	P40963	338 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SLI1	YGR212W	RTT101	P47050	842 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SLI1	YGR212W	YDR387C	Q04162	555 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SLI1	YGR212W	YMR130W	Q04223	302 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SLI1	YGR212W	MDM30	Q05930	598 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SLI1	YGR212W	MMR1	Q06324	491 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SLI1	YGR212W	VPS54	Q12071	889 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SLI1	YGR212W	CLN1	P20437	546 aa		3.53	□□□□□ -1.84
SLI1	YGR212W	RHB1	P25378	209 aa		3.53	□□□□□ -1.84
SLI1	YGR212W	SPC110	P32380	944 aa		3.53	□□□□□ -1.84
SLI1	YGR212W	PRS1	P32895	427 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.84
SLI1	YGR212W	TVP23	P38962	199 aa		3.53	□□□□□ -1.84
SLI1	YGR212W	PES4	P39684	611 aa		3.53	□□□□□ -1.84
SLI1	YGR212W	HAT2	P39984	401 aa		3.53	□□□□□ -1.84
SLI1	YGR212W	YJR011C	P47086	261 aa	Predicted RBP	3.53	□□□□□ -1.84
SLI1	YGR212W	AZR1	P50080	613 aa		3.53	□□□□□ -1.84
SLI1	YGR212W	YGR111W	P53265	400 aa		3.53	□□□□□ -1.84
SLI1	YGR212W	YIF1	P53845	314 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.84
SLI1	YGR212W	PNG1	Q02890	363 aa		3.53	□□□□□ -1.84
SLI1	YGR212W	SXM1	Q04175	944 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.84
SLI1	YGR212W	GYL1	Q04322	720 aa		3.53	□□□□□ -1.84
SLI1	YGR212W	DIS3	Q08162	1001 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.84
SLI1	YGR212W	RKM1	Q08961	583 aa	Predicted RBP	3.53	□□□□□ -1.84
SLI1	YGR212W	MED2	Q12124	431 aa		3.53	□□□□□ -1.84
SLI1	YGR212W	CTF3	Q12748	733 aa		3.53	□□□□□ -1.84
SLI1	YGR212W	FKS1	P38631	1876 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.84
SLI1	YGR212W	RPL15A	P05748	204 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.85
SLI1	YGR212W	SNA3	P14359	133 aa		3.53	□□□□□ -1.85
SLI1	YGR212W	RPI1	P23250	407 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.85
SLI1	YGR212W	ATS1	P31386	333 aa		3.53	□□□□□ -1.85
SLI1	YGR212W	APE2	P32454	952 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.85
SLI1	YGR212W	ECM25	P32525	599 aa		3.53	□□□□□ -1.85
SLI1	YGR212W	MTC4	P38335	694 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.85
SLI1	YGR212W	ALG8	P40351	577 aa		3.53	□□□□□ -1.85
SLI1	YGR212W	TRS85	P46944	698 aa		3.53	□□□□□ -1.85
SLI1	YGR212W	LIF1	P53150	421 aa		3.53	□□□□□ -1.85

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