RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472218.1

RPS18-231, Transcript of ribosomal protein S18, human

TSL 2

Gene RPS18, Length 1,109 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPS18-231	ENST00000472218	TRIM9	Q9C026	710 aa		12.08	□□□□□ -0.48
RPS18-231	ENST00000472218	RBSN	Q9H1K0	784 aa		12.08	□□□□□ -0.48
RPS18-231	ENST00000472218	ZSWIM4	Q9H7M6	989 aa		12.08	□□□□□ -0.48
RPS18-231	ENST00000472218	MAN1B1	Q9UKM7	699 aa		12.08	□□□□□ -0.48
RPS18-231	ENST00000472218	KIAA1024	Q9UPX6	916 aa		12.08	□□□□□ -0.48
RPS18-231	ENST00000472218	COL11A1	P12107	1806 aa	Predicted RBP	12.08	□□□□□ -0.48
RPS18-231	ENST00000472218	SMTNL1	A8MU46	457 aa		12.07	□□□□□ -0.48
RPS18-231	ENST00000472218	EML1	O00423	815 aa		12.07	□□□□□ -0.48
RPS18-231	ENST00000472218	IKBKB	O14920	756 aa		12.07	□□□□□ -0.48
RPS18-231	ENST00000472218	CA12	O43570	354 aa		12.07	□□□□□ -0.48
RPS18-231	ENST00000472218	MED24	O75448	989 aa		12.07	□□□□□ -0.48
RPS18-231	ENST00000472218	RGS20	O76081	388 aa		12.07	□□□□□ -0.48
RPS18-231	ENST00000472218	RHOBTB3	O94955	611 aa		12.07	□□□□□ -0.48
RPS18-231	ENST00000472218	RPN1	P04843	607 aa	Known RBP	12.07	□□□□□ -0.48
RPS18-231	ENST00000472218	PSMD2	Q13200	908 aa		12.07	□□□□□ -0.48
RPS18-231	ENST00000472218	C17orf99	Q6UX52	265 aa		12.07	□□□□□ -0.48
RPS18-231	ENST00000472218	MIER3	Q7Z3K6	550 aa		12.07	□□□□□ -0.48
RPS18-231	ENST00000472218	GPR142	Q7Z601	462 aa		12.07	□□□□□ -0.48
RPS18-231	ENST00000472218	SYT2	Q8N9I0	419 aa	Predicted RBP	12.07	□□□□□ -0.48
RPS18-231	ENST00000472218	NUDT12	Q9BQG2	462 aa		12.07	□□□□□ -0.48
RPS18-231	ENST00000472218	PORCN	Q9H237	461 aa		12.07	□□□□□ -0.48
RPS18-231	ENST00000472218	UNC45A	Q9H3U1	944 aa		12.07	□□□□□ -0.48
RPS18-231	ENST00000472218	EFCC1	Q9HA90	598 aa		12.07	□□□□□ -0.48
RPS18-231	ENST00000472218	JPH1	Q9HDC5	661 aa	Predicted RBP	12.07	□□□□□ -0.48
RPS18-231	ENST00000472218	VTA1	Q9NP79	307 aa		12.07	□□□□□ -0.48
RPS18-231	ENST00000472218	PCDHA10	Q9Y5I2	948 aa		12.07	□□□□□ -0.48
RPS18-231	ENST00000472218	ASTN1	O14525	1302 aa		12.07	□□□□□ -0.48
RPS18-231	ENST00000472218	FOXN1	O15353	648 aa		12.06	□□□□□ -0.48
RPS18-231	ENST00000472218	SLITRK3	O94933	977 aa		12.06	□□□□□ -0.48
RPS18-231	ENST00000472218	HOXC6	P09630	235 aa		12.06	□□□□□ -0.48
RPS18-231	ENST00000472218	PRR29	P0C7W0	189 aa		12.06	□□□□□ -0.48
RPS18-231	ENST00000472218	PLA2G4B	P0C869	781 aa		12.06	□□□□□ -0.48
RPS18-231	ENST00000472218	ADORA2A	P29274	412 aa		12.06	□□□□□ -0.48
RPS18-231	ENST00000472218	QARS	P47897	775 aa	Known RBP	12.06	□□□□□ -0.48
RPS18-231	ENST00000472218	C1QTNF8	P60827	252 aa		12.06	□□□□□ -0.48
RPS18-231	ENST00000472218	PSMC5	P62195	406 aa		12.06	□□□□□ -0.48
RPS18-231	ENST00000472218	TPM4	P67936	248 aa		12.06	□□□□□ -0.48
RPS18-231	ENST00000472218	ZNF658	Q5TYW1	1059 aa	Predicted RBP	12.06	□□□□□ -0.48
RPS18-231	ENST00000472218	WDR78	Q5VTH9	848 aa		12.06	□□□□□ -0.48
RPS18-231	ENST00000472218	FOXR2	Q6PJQ5	311 aa		12.06	□□□□□ -0.48
RPS18-231	ENST00000472218	UNC13D	Q70J99	1090 aa		12.06	□□□□□ -0.48
RPS18-231	ENST00000472218	C4orf19	Q8IY42	314 aa		12.06	□□□□□ -0.48
RPS18-231	ENST00000472218	SOCS4	Q8WXH5	440 aa		12.06	□□□□□ -0.48
RPS18-231	ENST00000472218	GJA10	Q969M2	543 aa		12.06	□□□□□ -0.48
RPS18-231	ENST00000472218	FGD4	Q96M96	766 aa		12.06	□□□□□ -0.48
RPS18-231	ENST00000472218	PURB	Q96QR8	312 aa	Known RBP	12.06	□□□□□ -0.48
RPS18-231	ENST00000472218	TIPIN	Q9BVW5	301 aa		12.06	□□□□□ -0.48
RPS18-231	ENST00000472218	CFHR5	Q9BXR6	569 aa		12.06	□□□□□ -0.48
RPS18-231	ENST00000472218	DNAJC25	Q9H1X3	360 aa		12.06	□□□□□ -0.48
RPS18-231	ENST00000472218	SLC9A2	Q9UBY0	812 aa		12.06	□□□□□ -0.48
RPS18-231	ENST00000472218	DBR1	Q9UK59	544 aa	Known RBP	12.06	□□□□□ -0.48
RPS18-231	ENST00000472218	SYNGAP1	Q96PV0	1343 aa		12.06	□□□□□ -0.48
RPS18-231	ENST00000472218	POTEB3	A0JP26	581 aa		12.05	□□□□□ -0.48
RPS18-231	ENST00000472218	BECN2	A8MW95	431 aa		12.05	□□□□□ -0.48
RPS18-231	ENST00000472218	ATG7	O95352	703 aa		12.05	□□□□□ -0.48
RPS18-231	ENST00000472218	PSAP	P07602	524 aa		12.05	□□□□□ -0.48
RPS18-231	ENST00000472218	SLC12A3	P55017	1021 aa		12.05	□□□□□ -0.48
RPS18-231	ENST00000472218	STIM1	Q13586	685 aa		12.05	□□□□□ -0.48
RPS18-231	ENST00000472218	CUL4B	Q13620	913 aa		12.05	□□□□□ -0.48
RPS18-231	ENST00000472218	MCM6	Q14566	821 aa		12.05	□□□□□ -0.48
RPS18-231	ENST00000472218	IQCB1	Q15051	598 aa		12.05	□□□□□ -0.48
RPS18-231	ENST00000472218	ECM1	Q16610	540 aa		12.05	□□□□□ -0.48
RPS18-231	ENST00000472218	DEFB115	Q30KQ5	88 aa		12.05	□□□□□ -0.48
RPS18-231	ENST00000472218	DPCR1	Q3MIW9	517 aa		12.05	□□□□□ -0.48
RPS18-231	ENST00000472218	MIS18BP1	Q6P0N0	1132 aa		12.05	□□□□□ -0.48
RPS18-231	ENST00000472218	POTEB	Q6S5H4	581 aa		12.05	□□□□□ -0.48
RPS18-231	ENST00000472218	METTL7B	Q6UX53	244 aa		12.05	□□□□□ -0.48
RPS18-231	ENST00000472218	GRAMD1C	Q8IYS0	662 aa		12.05	□□□□□ -0.48
RPS18-231	ENST00000472218	SCFD2	Q8WU76	684 aa		12.05	□□□□□ -0.48
RPS18-231	ENST00000472218	ATP6V0A1	Q93050	837 aa		12.05	□□□□□ -0.48
RPS18-231	ENST00000472218	CBX8	Q9HC52	389 aa		12.05	□□□□□ -0.48
RPS18-231	ENST00000472218	ANKEF1	Q9NU02	776 aa		12.05	□□□□□ -0.48
RPS18-231	ENST00000472218	PPME1	Q9Y570	386 aa		12.05	□□□□□ -0.48
RPS18-231	ENST00000472218	RBM47	A0AV96	593 aa	Known RBP	12.04	□□□□□ -0.48
RPS18-231	ENST00000472218	FRMD3	A2A2Y4	597 aa		12.04	□□□□□ -0.48
RPS18-231	ENST00000472218	POTEF	A5A3E0	1075 aa		12.04	□□□□□ -0.48
RPS18-231	ENST00000472218	GOLGA6L19	H0YKK7	550 aa		12.04	□□□□□ -0.48
RPS18-231	ENST00000472218	KLRC4	O43908	158 aa		12.04	□□□□□ -0.48
RPS18-231	ENST00000472218	PEX10	O60683	326 aa		12.04	□□□□□ -0.48
RPS18-231	ENST00000472218	ATP9A	O75110	1047 aa		12.04	□□□□□ -0.48
RPS18-231	ENST00000472218	KIF20A	O95235	890 aa		12.04	□□□□□ -0.48
RPS18-231	ENST00000472218	PGK2	P07205	417 aa		12.04	□□□□□ -0.48
RPS18-231	ENST00000472218	MAP2K2	P36507	400 aa		12.04	□□□□□ -0.48
RPS18-231	ENST00000472218	ASIC1	P78348	528 aa		12.04	□□□□□ -0.48
RPS18-231	ENST00000472218	TTLL4	Q14679	1199 aa		12.04	□□□□□ -0.48
RPS18-231	ENST00000472218	MORN1	Q5T089	497 aa		12.04	□□□□□ -0.48
RPS18-231	ENST00000472218	POTEG	Q6S5H5	508 aa		12.04	□□□□□ -0.48
RPS18-231	ENST00000472218	KCNK18	Q7Z418	384 aa		12.04	□□□□□ -0.48
RPS18-231	ENST00000472218	DPP9	Q86TI2	863 aa		12.04	□□□□□ -0.48
RPS18-231	ENST00000472218	TPH2	Q8IWU9	490 aa		12.04	□□□□□ -0.48
RPS18-231	ENST00000472218	CCDC65	Q8IXS2	484 aa		12.04	□□□□□ -0.48
RPS18-231	ENST00000472218	ENOX1	Q8TC92	643 aa	Known RBP	12.04	□□□□□ -0.48
RPS18-231	ENST00000472218	LRRC15	Q8TF66	581 aa		12.04	□□□□□ -0.48
RPS18-231	ENST00000472218	DDX12P	Q92771	950 aa		12.04	□□□□□ -0.48
RPS18-231	ENST00000472218	DYDC2	Q96IM9	177 aa		12.04	□□□□□ -0.48
RPS18-231	ENST00000472218	PLIN2	Q99541	437 aa		12.04	□□□□□ -0.48
RPS18-231	ENST00000472218	LXN	Q9BS40	222 aa		12.04	□□□□□ -0.48
RPS18-231	ENST00000472218	EXOC1	Q9NV70	894 aa		12.04	□□□□□ -0.48
RPS18-231	ENST00000472218	MYMK	A6NI61	221 aa		12.03	□□□□□ -0.48
RPS18-231	ENST00000472218	BIN1	O00499	593 aa		12.03	□□□□□ -0.48

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