RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439830.5

ANKRD28-203, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 5

Gene ANKRD28, Length 592 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-203ENST00000439830 GOLGA8AA7E2F4 631 aa28.9■■■□□ 2.22
ANKRD28-203ENST00000439830 GOLGA8BA8MQT2 603 aa28.9■■■□□ 2.22
ANKRD28-203ENST00000439830 RFXAPO00287 272 aa28.9■■■□□ 2.22
ANKRD28-203ENST00000439830 NLRC5Q86WI3 1866 aa28.9■■■□□ 2.22
ANKRD28-203ENST00000439830 TEX2Q8IWB9 1127 aa28.9■■■□□ 2.22
ANKRD28-203ENST00000439830 LMBR1Q8WVP7 490 aa28.9■■■□□ 2.22
ANKRD28-203ENST00000439830 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP28.9■■■□□ 2.22
ANKRD28-203ENST00000439830 JADE2Q9NQC1 790 aa28.9■■■□□ 2.22
ANKRD28-203ENST00000439830 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa28.89■■■□□ 2.22
ANKRD28-203ENST00000439830 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa28.89■■■□□ 2.22
ANKRD28-203ENST00000439830 LCHNA4D1U4 455 aa28.89■■■□□ 2.22
ANKRD28-203ENST00000439830 hCG_1984214I3L0E3 225 aa28.89■■■□□ 2.22
ANKRD28-203ENST00000439830 MAFGO15525 162 aa28.89■■■□□ 2.22
ANKRD28-203ENST00000439830 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP28.89■■■□□ 2.22
ANKRD28-203ENST00000439830 RCAN1P53805 252 aa28.89■■■□□ 2.22
ANKRD28-203ENST00000439830 ARHGAP4P98171 946 aa28.89■■■□□ 2.22
ANKRD28-203ENST00000439830 FUT2Q10981 343 aa28.89■■■□□ 2.22
ANKRD28-203ENST00000439830 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP28.89■■■□□ 2.22
ANKRD28-203ENST00000439830 DBF4BQ8NFT6 615 aa28.89■■■□□ 2.22
ANKRD28-203ENST00000439830 PKD2L1Q9P0L9 805 aa28.89■■■□□ 2.22
ANKRD28-203ENST00000439830 NRCAMQ92823 1304 aa28.89■■■□□ 2.21
ANKRD28-203ENST00000439830 CTSHP09668 335 aa28.88■■■□□ 2.21
ANKRD28-203ENST00000439830 FGD1P98174 961 aa28.88■■■□□ 2.21
ANKRD28-203ENST00000439830 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa28.88■■■□□ 2.21
ANKRD28-203ENST00000439830 TYW1BQ6NUM6 668 aa28.88■■■□□ 2.21
ANKRD28-203ENST00000439830 SEPT1Q8WYJ6 367 aa28.88■■■□□ 2.21
ANKRD28-203ENST00000439830 RAD9AQ99638 391 aa28.88■■■□□ 2.21
ANKRD28-203ENST00000439830 RIC8AQ9NPQ8 531 aa28.88■■■□□ 2.21
ANKRD28-203ENST00000439830 MTCH2Q9Y6C9 303 aa28.88■■■□□ 2.21
ANKRD28-203ENST00000439830 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP28.88■■■□□ 2.21
ANKRD28-203ENST00000439830 BRWD1Q9NSI6 2320 aa28.87■■■□□ 2.21
ANKRD28-203ENST00000439830 ADCY7P51828 1080 aa28.87■■■□□ 2.21
ANKRD28-203ENST00000439830 ADAM17P78536 824 aa28.87■■■□□ 2.21
ANKRD28-203ENST00000439830 CCDC136Q96JN2 1154 aa28.87■■■□□ 2.21
ANKRD28-203ENST00000439830 V9GY48 417 aaPredicted RBP28.87■■■□□ 2.21
ANKRD28-203ENST00000439830 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa28.86■■■□□ 2.21
ANKRD28-203ENST00000439830 FOSP01100 380 aaPredicted RBP28.86■■■□□ 2.21
ANKRD28-203ENST00000439830 AMHP03971 560 aa28.86■■■□□ 2.21
ANKRD28-203ENST00000439830 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP28.86■■■□□ 2.21
ANKRD28-203ENST00000439830 SEPT8Q92599 483 aa28.86■■■□□ 2.21
ANKRD28-203ENST00000439830 ASB2Q96Q27 587 aa28.86■■■□□ 2.21
ANKRD28-203ENST00000439830 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP28.86■■■□□ 2.21
ANKRD28-203ENST00000439830 ERAP1Q9NZ08 941 aa28.86■■■□□ 2.21
ANKRD28-203ENST00000439830 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP28.86■■■□□ 2.21
ANKRD28-203ENST00000439830 MUC3AQ02505 3323 aa28.86■■■□□ 2.21
ANKRD28-203ENST00000439830 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP28.85■■■□□ 2.21
ANKRD28-203ENST00000439830 STXBP3O00186 592 aa28.85■■■□□ 2.21
ANKRD28-203ENST00000439830 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP28.85■■■□□ 2.21
ANKRD28-203ENST00000439830 PPFIA1Q13136 1202 aa28.85■■■□□ 2.21
ANKRD28-203ENST00000439830 FAM117BQ6P1L5 589 aa28.85■■■□□ 2.21
ANKRD28-203ENST00000439830 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP28.85■■■□□ 2.21
ANKRD28-203ENST00000439830 SPRED2Q7Z698 418 aa28.85■■■□□ 2.21
ANKRD28-203ENST00000439830 GLG1Q92896 1179 aa28.85■■■□□ 2.21
ANKRD28-203ENST00000439830 MXRA8Q9BRK3 442 aa28.85■■■□□ 2.21
ANKRD28-203ENST00000439830 ANO3Q9BYT9 981 aa28.85■■■□□ 2.21
ANKRD28-203ENST00000439830 GLT8D2Q9H1C3 349 aa28.85■■■□□ 2.21
ANKRD28-203ENST00000439830 BARHL2Q9NY43 387 aa28.85■■■□□ 2.21
ANKRD28-203ENST00000439830 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa28.85■■■□□ 2.21
ANKRD28-203ENST00000439830 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa28.84■■■□□ 2.21
ANKRD28-203ENST00000439830 MARK3P27448 753 aa28.84■■■□□ 2.21
ANKRD28-203ENST00000439830 CDC27P30260 824 aa28.84■■■□□ 2.21
ANKRD28-203ENST00000439830 GRB10Q13322 594 aa28.84■■■□□ 2.21
ANKRD28-203ENST00000439830 TAF2Q6P1X5 1199 aa28.84■■■□□ 2.21
ANKRD28-203ENST00000439830 MYOCDQ8IZQ8 938 aa28.84■■■□□ 2.21
ANKRD28-203ENST00000439830 KCNB2Q92953 911 aa28.84■■■□□ 2.21
ANKRD28-203ENST00000439830 PGBD1Q96JS3 809 aa28.84■■■□□ 2.21
ANKRD28-203ENST00000439830 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa28.84■■■□□ 2.21
ANKRD28-203ENST00000439830 KCNH7Q9NS40 1196 aa28.84■■■□□ 2.21
ANKRD28-203ENST00000439830 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP28.84■■■□□ 2.21
ANKRD28-203ENST00000439830 WDR81Q562E7 1941 aa28.83■■■□□ 2.21
ANKRD28-203ENST00000439830 SMCO2A6NFE2 343 aa28.83■■■□□ 2.21
ANKRD28-203ENST00000439830 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP28.83■■■□□ 2.21
ANKRD28-203ENST00000439830 AP3B2Q13367 1082 aa28.83■■■□□ 2.21
ANKRD28-203ENST00000439830 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP28.83■■■□□ 2.21
ANKRD28-203ENST00000439830 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP28.83■■■□□ 2.21
ANKRD28-203ENST00000439830 XIRP2A4UGR9 3374 aa28.82■■■□□ 2.2
ANKRD28-203ENST00000439830 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa28.82■■■□□ 2.2
ANKRD28-203ENST00000439830 LINC01553A4QN01 128 aa28.82■■■□□ 2.2
ANKRD28-203ENST00000439830 CPA1P15085 419 aa28.82■■■□□ 2.2
ANKRD28-203ENST00000439830 HSPA4P34932 840 aa28.82■■■□□ 2.2
ANKRD28-203ENST00000439830 FAM26DQ5JW98 314 aa28.82■■■□□ 2.2
ANKRD28-203ENST00000439830 KRT40Q6A162 431 aa28.82■■■□□ 2.2
ANKRD28-203ENST00000439830 IL27Q8NEV9 243 aa28.82■■■□□ 2.2
ANKRD28-203ENST00000439830 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP28.82■■■□□ 2.2
ANKRD28-203ENST00000439830 SDF4Q9BRK5 362 aa28.82■■■□□ 2.2
ANKRD28-203ENST00000439830 SLC9A2Q9UBY0 812 aa28.82■■■□□ 2.2
ANKRD28-203ENST00000439830 TUBE1Q9UJT0 475 aa28.82■■■□□ 2.2
ANKRD28-203ENST00000439830 INSL6Q9Y581 213 aa28.82■■■□□ 2.2
ANKRD28-203ENST00000439830 NFASCO94856 1347 aa28.81■■■□□ 2.2
ANKRD28-203ENST00000439830 LPXNO60711 386 aa28.81■■■□□ 2.2
ANKRD28-203ENST00000439830 GRIK4Q16099 956 aa28.81■■■□□ 2.2
ANKRD28-203ENST00000439830 CEP55Q53EZ4 464 aa28.81■■■□□ 2.2
ANKRD28-203ENST00000439830 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa28.81■■■□□ 2.2
ANKRD28-203ENST00000439830 Q6ZUG5 572 aa28.81■■■□□ 2.2
ANKRD28-203ENST00000439830 RPAINQ86UA6 219 aa28.81■■■□□ 2.2
ANKRD28-203ENST00000439830 GDPD5Q8WTR4 605 aa28.81■■■□□ 2.2
ANKRD28-203ENST00000439830 APBB2Q92870 758 aa28.81■■■□□ 2.2
ANKRD28-203ENST00000439830 MTUS1Q9ULD2 1270 aa28.81■■■□□ 2.2
ANKRD28-203ENST00000439830 COL4A6Q14031 1691 aa28.8■■■□□ 2.2
ANKRD28-203ENST00000439830 NID2Q14112 1375 aa28.8■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.6 ms