RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000328379.5

PTRHD1-201, Transcript of peptidyl-tRNA hydrolase domain containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTRHD1, Length 1,105 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTRHD1-201ENST00000328379 EVCP57679 992 aa20.1■□□□□ 0.81
PTRHD1-201ENST00000328379 PPP2R2DQ66LE6 453 aa20.1■□□□□ 0.81
PTRHD1-201ENST00000328379 TM6SF1Q9BZW5 370 aa20.1■□□□□ 0.81
PTRHD1-201ENST00000328379 ERAP1Q9NZ08 941 aa20.1■□□□□ 0.81
PTRHD1-201ENST00000328379 PKD2L1Q9P0L9 805 aa20.1■□□□□ 0.81
PTRHD1-201ENST00000328379 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
PTRHD1-201ENST00000328379 KAT6AQ92794 2004 aa20.1■□□□□ 0.81
PTRHD1-201ENST00000328379 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa20.09■□□□□ 0.81
PTRHD1-201ENST00000328379 ESYT2A0FGR8 921 aa20.09■□□□□ 0.81
PTRHD1-201ENST00000328379 NBNO60934 754 aa20.09■□□□□ 0.81
PTRHD1-201ENST00000328379 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
PTRHD1-201ENST00000328379 HOXC8P31273 242 aa20.09■□□□□ 0.81
PTRHD1-201ENST00000328379 SREBF1P36956 1147 aa20.09■□□□□ 0.81
PTRHD1-201ENST00000328379 HIC1Q14526 733 aa20.09■□□□□ 0.81
PTRHD1-201ENST00000328379 GPNMBQ14956 572 aa20.09■□□□□ 0.81
PTRHD1-201ENST00000328379 HERC6Q8IVU3 1022 aa20.09■□□□□ 0.81
PTRHD1-201ENST00000328379 BICD2Q8TD16 824 aa20.09■□□□□ 0.81
PTRHD1-201ENST00000328379 ZBED2Q9BTP6 218 aa20.09■□□□□ 0.81
PTRHD1-201ENST00000328379 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
PTRHD1-201ENST00000328379 ZMYND12Q9H0C1 365 aa20.09■□□□□ 0.81
PTRHD1-201ENST00000328379 PRDM12Q9H4Q4 367 aa20.09■□□□□ 0.81
PTRHD1-201ENST00000328379 AZI2Q9H6S1 392 aa20.09■□□□□ 0.81
PTRHD1-201ENST00000328379 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
PTRHD1-201ENST00000328379 SLC9A2Q9UBY0 812 aa20.09■□□□□ 0.81
PTRHD1-201ENST00000328379 NFASCO94856 1347 aa20.08■□□□□ 0.81
PTRHD1-201ENST00000328379 DOCK5Q9H7D0 1870 aa20.08■□□□□ 0.81
PTRHD1-201ENST00000328379 MEIS1O00470 390 aa20.08■□□□□ 0.81
PTRHD1-201ENST00000328379 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
PTRHD1-201ENST00000328379 LGR5O75473 907 aa20.08■□□□□ 0.81
PTRHD1-201ENST00000328379 CLK2P49760 499 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
PTRHD1-201ENST00000328379 ARHGAP4P98171 946 aa20.08■□□□□ 0.81
PTRHD1-201ENST00000328379 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa20.08■□□□□ 0.81
PTRHD1-201ENST00000328379 NIPA1Q7RTP0 329 aa20.08■□□□□ 0.81
PTRHD1-201ENST00000328379 TRIM50Q86XT4 487 aa20.08■□□□□ 0.81
PTRHD1-201ENST00000328379 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP20.08■□□□□ 0.81
PTRHD1-201ENST00000328379 PGBD1Q96JS3 809 aa20.08■□□□□ 0.81
PTRHD1-201ENST00000328379 TMEM260Q9NX78 707 aa20.08■□□□□ 0.81
PTRHD1-201ENST00000328379 COL6A3P12111 3177 aa20.08■□□□□ 0.8
PTRHD1-201ENST00000328379 TET1Q8NFU7 2136 aa20.08■□□□□ 0.8
PTRHD1-201ENST00000328379 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
PTRHD1-201ENST00000328379 IFNAR1P17181 557 aa20.07■□□□□ 0.8
PTRHD1-201ENST00000328379 CCT2P78371 535 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
PTRHD1-201ENST00000328379 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
PTRHD1-201ENST00000328379 RSPH3Q86UC2 560 aa20.07■□□□□ 0.8
PTRHD1-201ENST00000328379 TRIM22Q8IYM9 498 aa20.07■□□□□ 0.8
PTRHD1-201ENST00000328379 CCDC148Q8NFR7 591 aa20.07■□□□□ 0.8
PTRHD1-201ENST00000328379 CYP2W1Q8TAV3 490 aa20.07■□□□□ 0.8
PTRHD1-201ENST00000328379 WNT8BQ93098 351 aa20.07■□□□□ 0.8
PTRHD1-201ENST00000328379 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
PTRHD1-201ENST00000328379 TELO2Q9Y4R8 837 aa20.07■□□□□ 0.8
PTRHD1-201ENST00000328379 TANC1Q9C0D5 1861 aa20.07■□□□□ 0.8
PTRHD1-201ENST00000328379 NID2Q14112 1375 aa20.07■□□□□ 0.8
PTRHD1-201ENST00000328379 RRN3P2A6NIE6 340 aa20.06■□□□□ 0.8
PTRHD1-201ENST00000328379 DLL1O00548 723 aa20.06■□□□□ 0.8
PTRHD1-201ENST00000328379 CPLX1O14810 134 aa20.06■□□□□ 0.8
PTRHD1-201ENST00000328379 TLL1O43897 1013 aa20.06■□□□□ 0.8
PTRHD1-201ENST00000328379 ARP10275 920 aa20.06■□□□□ 0.8
PTRHD1-201ENST00000328379 MYOGP15173 224 aa20.06■□□□□ 0.8
PTRHD1-201ENST00000328379 WDR5P61964 334 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
PTRHD1-201ENST00000328379 NTRK3Q16288 839 aa20.06■□□□□ 0.8
PTRHD1-201ENST00000328379 PKN1Q16512 942 aa20.06■□□□□ 0.8
PTRHD1-201ENST00000328379 TAF2Q6P1X5 1199 aa20.06■□□□□ 0.8
PTRHD1-201ENST00000328379 TRAF7Q6Q0C0 670 aa20.06■□□□□ 0.8
PTRHD1-201ENST00000328379 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
PTRHD1-201ENST00000328379 PHKBQ93100 1093 aa20.06■□□□□ 0.8
PTRHD1-201ENST00000328379 SLC26A6Q9BXS9 759 aa20.06■□□□□ 0.8
PTRHD1-201ENST00000328379 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
PTRHD1-201ENST00000328379 CYP3A4P08684 503 aa20.05■□□□□ 0.8
PTRHD1-201ENST00000328379 IGFBP4P22692 258 aa20.05■□□□□ 0.8
PTRHD1-201ENST00000328379 ADAM17P78536 824 aa20.05■□□□□ 0.8
PTRHD1-201ENST00000328379 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
PTRHD1-201ENST00000328379 PPFIA1Q13136 1202 aa20.05■□□□□ 0.8
PTRHD1-201ENST00000328379 PLA2G4DQ86XP0 818 aa20.05■□□□□ 0.8
PTRHD1-201ENST00000328379 DBF4BQ8NFT6 615 aa20.05■□□□□ 0.8
PTRHD1-201ENST00000328379 LMBR1Q8WVP7 490 aa20.05■□□□□ 0.8
PTRHD1-201ENST00000328379 SEPT8Q92599 483 aa20.05■□□□□ 0.8
PTRHD1-201ENST00000328379 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
PTRHD1-201ENST00000328379 SH3GLB2Q9NR46 395 aa20.05■□□□□ 0.8
PTRHD1-201ENST00000328379 PDRG1Q9NUG6 133 aa20.05■□□□□ 0.8
PTRHD1-201ENST00000328379 CA3P07451 260 aa20.04■□□□□ 0.8
PTRHD1-201ENST00000328379 STAT5BP51692 787 aa20.04■□□□□ 0.8
PTRHD1-201ENST00000328379 ACTR2P61160 394 aa20.04■□□□□ 0.8
PTRHD1-201ENST00000328379 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
PTRHD1-201ENST00000328379 MBTPS1Q14703 1052 aa20.04■□□□□ 0.8
PTRHD1-201ENST00000328379 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa20.04■□□□□ 0.8
PTRHD1-201ENST00000328379 GBF1Q92538 1859 aa20.04■□□□□ 0.8
PTRHD1-201ENST00000328379 AMHP03971 560 aa20.03■□□□□ 0.8
PTRHD1-201ENST00000328379 MARK3P27448 753 aa20.03■□□□□ 0.8
PTRHD1-201ENST00000328379 SLC26A2P50443 739 aa20.03■□□□□ 0.8
PTRHD1-201ENST00000328379 GRIK4Q16099 956 aa20.03■□□□□ 0.8
PTRHD1-201ENST00000328379 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa20.03■□□□□ 0.8
PTRHD1-201ENST00000328379 FAM26DQ5JW98 314 aa20.03■□□□□ 0.8
PTRHD1-201ENST00000328379 RPAINQ86UA6 219 aa20.03■□□□□ 0.8
PTRHD1-201ENST00000328379 RAD9AQ99638 391 aa20.03■□□□□ 0.8
PTRHD1-201ENST00000328379 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
PTRHD1-201ENST00000328379 TBC1D22BQ9NU19 505 aa20.03■□□□□ 0.8
PTRHD1-201ENST00000328379 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa20.03■□□□□ 0.8
PTRHD1-201ENST00000328379 ATG7O95352 703 aa20.02■□□□□ 0.8
PTRHD1-201ENST00000328379 CTSHP09668 335 aa20.02■□□□□ 0.8
PTRHD1-201ENST00000328379 NLRP5P59047 1200 aa20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.3 ms